MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 94743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002929	GGGCT	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	33591292
502	NC_002929	CA	3	6	25420	25425	50 %	0 %	0 %	50 %	33591292
503	NC_002929	GC	4	8	26510	26517	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
504	NC_002929	GCCG	2	8	26540	26547	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
505	NC_002929	CGA	2	6	26608	26613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591293
506	NC_002929	CAT	2	6	26629	26634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591293
507	NC_002929	GCA	2	6	26636	26641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591293
508	NC_002929	TGC	2	6	26643	26648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591293
509	NC_002929	TGAG	2	8	26703	26710	25 %	25 %	50 %	0 %	33591293
510	NC_002929	ACG	2	6	26718	26723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591293
511	NC_002929	TGG	2	6	26769	26774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591293
512	NC_002929	CAT	2	6	26803	26808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591293
513	NC_002929	GGC	2	6	26816	26821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591293
514	NC_002929	CGCC	2	8	26836	26843	0 %	0 %	25 %	75 %	33591293
515	NC_002929	CTGC	2	8	26848	26855	0 %	25 %	25 %	50 %	33591293
516	NC_002929	GCG	2	6	26859	26864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591293
517	NC_002929	GCCG	2	8	26884	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
518	NC_002929	TGC	2	6	26913	26918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591293
519	NC_002929	GGCGC	2	10	26926	26935	0 %	0 %	60 %	40 %	33591293
520	NC_002929	CGA	3	9	26983	26991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591293
521	NC_002929	CGG	2	6	27034	27039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591293
522	NC_002929	GCTGTC	2	12	27046	27057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591293
523	NC_002929	CTG	3	9	27083	27091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591293
524	NC_002929	CGGC	2	8	27096	27103	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
525	NC_002929	GCTG	2	8	27136	27143	0 %	25 %	50 %	25 %	33591293
526	NC_002929	CGG	2	6	27153	27158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591293
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528	NC_002929	GC	3	6	27341	27346	0 %	0 %	50 %	50 %	33591294
529	NC_002929	TGG	2	6	27356	27361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591294
530	NC_002929	GTG	2	6	27379	27384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591294
531	NC_002929	GCG	2	6	27548	27553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591294
532	NC_002929	GTA	2	6	27622	27627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591294
533	NC_002929	TCG	2	6	27671	27676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591294
534	NC_002929	ACGAAG	2	12	27722	27733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	33591294
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536	NC_002929	GCA	2	6	27825	27830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591294
537	NC_002929	CAC	2	6	27859	27864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591294
538	NC_002929	CGGC	2	8	27870	27877	0 %	0 %	50 %	50 %	33591294
539	NC_002929	GCTG	2	8	27931	27938	0 %	25 %	50 %	25 %	33591294
540	NC_002929	GC	3	6	27961	27966	0 %	0 %	50 %	50 %	33591294
541	NC_002929	GCG	2	6	27982	27987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591294
542	NC_002929	CA	3	6	28150	28155	50 %	0 %	0 %	50 %	33591294
543	NC_002929	GC	3	6	28716	28721	0 %	0 %	50 %	50 %	33591295
544	NC_002929	CGAA	2	8	28727	28734	50 %	0 %	25 %	25 %	33591295
545	NC_002929	GGC	2	6	28772	28777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591295
546	NC_002929	CGA	2	6	28818	28823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591295
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548	NC_002929	GGCC	2	8	28963	28970	0 %	0 %	50 %	50 %	33591295
549	NC_002929	GGC	2	6	28980	28985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591295
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551	NC_002929	CAGC	2	8	29177	29184	25 %	0 %	25 %	50 %	33591296
552	NC_002929	CCG	2	6	29188	29193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591296
553	NC_002929	GCC	2	6	29219	29224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591296
554	NC_002929	GC	3	6	29231	29236	0 %	0 %	50 %	50 %	33591296
555	NC_002929	AGCC	2	8	29320	29327	25 %	0 %	25 %	50 %	33591296
556	NC_002929	TCC	2	6	29419	29424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33591296
557	NC_002929	ATG	2	6	29425	29430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591296
558	NC_002929	CCG	2	6	29480	29485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591296
559	NC_002929	GGCG	2	8	29513	29520	0 %	0 %	75 %	25 %	33591296
560	NC_002929	CGG	2	6	29525	29530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591296
561	NC_002929	GA	3	6	29562	29567	50 %	0 %	50 %	0 %	33591296
562	NC_002929	CGTG	2	8	29612	29619	0 %	25 %	50 %	25 %	33591296
563	NC_002929	ACC	2	6	29686	29691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591296
564	NC_002929	CCG	2	6	29707	29712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591296
565	NC_002929	GCG	2	6	29733	29738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591296
566	NC_002929	AG	3	6	29763	29768	50 %	0 %	50 %	0 %	33591296
567	NC_002929	CG	3	6	29775	29780	0 %	0 %	50 %	50 %	33591296
568	NC_002929	GAT	2	6	29816	29821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591296
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570	NC_002929	TCT	2	6	29863	29868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591296
571	NC_002929	CGC	2	6	29901	29906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591296
572	NC_002929	CAGGG	2	10	29916	29925	20 %	0 %	60 %	20 %	33591296
573	NC_002929	GTCGGC	2	12	29958	29969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33591296
574	NC_002929	CGA	2	6	29993	29998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591296
575	NC_002929	GC	3	6	30038	30043	0 %	0 %	50 %	50 %	33591296
576	NC_002929	GGCC	2	8	30044	30051	0 %	0 %	50 %	50 %	33591296
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579	NC_002929	AT	3	6	30152	30157	50 %	50 %	0 %	0 %	33591296
580	NC_002929	CGC	2	6	30258	30263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591296
581	NC_002929	TGGAT	2	10	30274	30283	20 %	40 %	40 %	0 %	33591296
582	NC_002929	CGG	2	6	30332	30337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591296
583	NC_002929	CATGGC	2	12	30351	30362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33591296
584	NC_002929	ACTCC	2	10	30437	30446	20 %	20 %	0 %	60 %	33591297
585	NC_002929	CAC	2	6	30455	30460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591297
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588	NC_002929	AATC	2	8	30635	30642	50 %	25 %	0 %	25 %	33591297
589	NC_002929	CAC	2	6	30761	30766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591297
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593	NC_002929	CGG	2	6	31141	31146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591298
594	NC_002929	CG	3	6	31153	31158	0 %	0 %	50 %	50 %	33591298
595	NC_002929	AGCA	2	8	31239	31246	50 %	0 %	25 %	25 %	33591298
596	NC_002929	CCT	2	6	31273	31278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33591298
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598	NC_002929	CAG	2	6	31403	31408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591298
599	NC_002929	CAC	3	9	31460	31468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591298
600	NC_002929	CGC	2	6	31501	31506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591298
601	NC_002929	GGC	2	6	31577	31582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591298
602	NC_002929	CCA	2	6	31609	31614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591298
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604	NC_002929	GC	3	6	31673	31678	0 %	0 %	50 %	50 %	33591298
605	NC_002929	GC	3	6	31731	31736	0 %	0 %	50 %	50 %	33591298
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611	NC_002929	CCA	2	6	32306	32311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591299
612	NC_002929	CGT	2	6	32349	32354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591299
613	NC_002929	ACG	2	6	32357	32362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591299
614	NC_002929	CCGGCG	2	12	32390	32401	0 %	0 %	50 %	50 %	33591299
615	NC_002929	CGG	2	6	32414	32419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591299
616	NC_002929	GCG	2	6	32420	32425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591299
617	NC_002929	CGT	2	6	32433	32438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591299
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619	NC_002929	ACA	2	6	32504	32509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591299
620	NC_002929	ACGGC	2	10	32546	32555	20 %	0 %	40 %	40 %	33591299
621	NC_002929	GCC	2	6	32650	32655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591299
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626	NC_002929	GC	3	6	32762	32767	0 %	0 %	50 %	50 %	33591299
627	NC_002929	CG	3	6	32768	32773	0 %	0 %	50 %	50 %	33591299
628	NC_002929	TCGC	2	8	32791	32798	0 %	25 %	25 %	50 %	33591299
629	NC_002929	CG	3	6	32839	32844	0 %	0 %	50 %	50 %	33591299
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