MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 94743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002929	CCA	2	6	249160	249165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591482
5502	NC_002929	TCGGCC	2	12	249189	249200	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33591482
5503	NC_002929	CG	5	10	249221	249230	0 %	0 %	50 %	50 %	33591482
5504	NC_002929	CGGGC	2	10	249250	249259	0 %	0 %	60 %	40 %	33591482
5505	NC_002929	GCA	2	6	249271	249276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591482
5506	NC_002929	GCCG	2	8	249293	249300	0 %	0 %	50 %	50 %	33591482
5507	NC_002929	GCCC	2	8	249318	249325	0 %	0 %	25 %	75 %	33591482
5508	NC_002929	GCC	2	6	249345	249350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591482
5509	NC_002929	GTT	2	6	249380	249385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33591482
5510	NC_002929	GCGCAG	3	18	249388	249405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33591482
5511	NC_002929	GAA	2	6	249406	249411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591482
5512	NC_002929	AGC	3	9	249417	249425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591482
5513	NC_002929	CG	3	6	249784	249789	0 %	0 %	50 %	50 %	33591483
5514	NC_002929	GGCA	2	8	249811	249818	25 %	0 %	50 %	25 %	33591483
5515	NC_002929	CGG	2	6	249820	249825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591483
5516	NC_002929	GAA	2	6	249850	249855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591483
5517	NC_002929	ACT	2	6	250014	250019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591483
5518	NC_002929	CGG	2	6	250047	250052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591483
5519	NC_002929	GGT	2	6	250057	250062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591483
5520	NC_002929	CG	4	8	250072	250079	0 %	0 %	50 %	50 %	33591483
5521	NC_002929	GC	3	6	250098	250103	0 %	0 %	50 %	50 %	33591483
5522	NC_002929	CGG	2	6	250108	250113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591483
5523	NC_002929	CCG	2	6	250119	250124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591483
5524	NC_002929	CAT	2	6	250198	250203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591483
5525	NC_002929	GTG	2	6	250232	250237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591483
5526	NC_002929	GCG	2	6	250254	250259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591483
5527	NC_002929	GC	3	6	250300	250305	0 %	0 %	50 %	50 %	33591483
5528	NC_002929	GC	4	8	250308	250315	0 %	0 %	50 %	50 %	33591483
5529	NC_002929	GGC	2	6	250393	250398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591483
5530	NC_002929	CGGCC	2	10	250411	250420	0 %	0 %	40 %	60 %	33591483
5531	NC_002929	CGG	3	9	250444	250452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591483
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5533	NC_002929	CGGCAT	2	12	250597	250608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33591483
5534	NC_002929	TGG	2	6	250614	250619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591483
5535	NC_002929	CGG	2	6	250623	250628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591483
5536	NC_002929	CGC	2	6	250645	250650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591483
5537	NC_002929	GCA	2	6	250702	250707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591483
5538	NC_002929	CGT	2	6	250726	250731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591483
5539	NC_002929	GC	3	6	250880	250885	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5540	NC_002929	GAT	2	6	250910	250915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591484
5541	NC_002929	GC	4	8	250930	250937	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5542	NC_002929	GCC	2	6	250974	250979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591484
5543	NC_002929	CG	4	8	250990	250997	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5544	NC_002929	CG	3	6	251088	251093	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5545	NC_002929	GCC	2	6	251124	251129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591484
5546	NC_002929	GC	3	6	251156	251161	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5547	NC_002929	CG	3	6	251171	251176	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5548	NC_002929	CGC	2	6	251227	251232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591484
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5551	NC_002929	GGC	2	6	251275	251280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591484
5552	NC_002929	GC	4	8	251290	251297	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5553	NC_002929	GCTG	2	8	251305	251312	0 %	25 %	50 %	25 %	33591484
5554	NC_002929	GC	3	6	251327	251332	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5555	NC_002929	CCAGC	2	10	251378	251387	20 %	0 %	20 %	60 %	33591484
5556	NC_002929	CG	3	6	251388	251393	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5557	NC_002929	GC	4	8	251394	251401	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5558	NC_002929	GC	3	6	251412	251417	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5559	NC_002929	GTA	2	6	251468	251473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591484
5560	NC_002929	GCC	2	6	251483	251488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591484
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5562	NC_002929	CG	4	8	251509	251516	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5563	NC_002929	CGG	2	6	251557	251562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591484
5564	NC_002929	CAG	2	6	251594	251599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591484
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5567	NC_002929	TGG	2	6	251668	251673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591484
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5570	NC_002929	GGCC	2	8	251752	251759	0 %	0 %	50 %	50 %	33591484
5571	NC_002929	GAT	2	6	251765	251770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591484
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5983	NC_002929	CTGT	2	8	268612	268619	0 %	50 %	25 %	25 %	33591498
5984	NC_002929	GGT	2	6	268620	268625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591498
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5987	NC_002929	GCCGGC	2	12	268707	268718	0 %	0 %	50 %	50 %	33591498
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5992	NC_002929	CG	3	6	268935	268940	0 %	0 %	50 %	50 %	33591498
5993	NC_002929	CTG	2	6	268981	268986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591498
5994	NC_002929	CGA	2	6	269022	269027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591498
5995	NC_002929	GGC	2	6	269040	269045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591498
5996	NC_002929	TGG	2	6	269096	269101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591498
5997	NC_002929	TTC	2	6	269125	269130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591498
5998	NC_002929	GGCGT	2	10	269131	269140	0 %	20 %	60 %	20 %	33591498
5999	NC_002929	CTGG	2	8	269142	269149	0 %	25 %	50 %	25 %	33591498
6000	NC_002929	CG	3	6	269153	269158	0 %	0 %	50 %	50 %	33591498

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