MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 94743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002929	TGC	2	6	227722	227727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591461
5002	NC_002929	CGC	2	6	227738	227743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591461
5003	NC_002929	GCC	2	6	227757	227762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591461
5004	NC_002929	CTG	2	6	228066	228071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
5005	NC_002929	CAC	2	6	228077	228082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591462
5006	NC_002929	CGC	2	6	228127	228132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
5007	NC_002929	GACC	2	8	228134	228141	25 %	0 %	25 %	50 %	33591462
5008	NC_002929	CAT	2	6	228188	228193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
5009	NC_002929	CGG	2	6	228209	228214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591462
5010	NC_002929	CGG	2	6	228254	228259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591462
5011	NC_002929	ATC	2	6	228312	228317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
5012	NC_002929	GCC	3	9	228318	228326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
5013	NC_002929	GGCCTG	2	12	228348	228359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33591462
5014	NC_002929	CAC	2	6	228383	228388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591462
5015	NC_002929	ATC	2	6	228477	228482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
5016	NC_002929	GCT	2	6	228494	228499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
5017	NC_002929	GTC	2	6	228534	228539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
5018	NC_002929	AGC	2	6	228564	228569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591462
5019	NC_002929	GC	3	6	228568	228573	0 %	0 %	50 %	50 %	33591462
5020	NC_002929	CCG	2	6	228583	228588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
5021	NC_002929	CCG	2	6	228598	228603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
5022	NC_002929	GCC	2	6	228619	228624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
5023	NC_002929	AAC	2	6	228627	228632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591462
5024	NC_002929	CTG	2	6	228648	228653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
5025	NC_002929	CTG	2	6	228660	228665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
5026	NC_002929	ACCTGA	2	12	228712	228723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33591462
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5028	NC_002929	CAT	2	6	228749	228754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
5029	NC_002929	CTG	2	6	228756	228761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
5030	NC_002929	CAT	2	6	228818	228823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
5031	NC_002929	CAT	2	6	228848	228853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
5032	NC_002929	CAT	2	6	228857	228862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
5033	NC_002929	CAT	2	6	228866	228871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
5034	NC_002929	TGG	2	6	228886	228891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591462
5035	NC_002929	CCA	2	6	228892	228897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591462
5036	NC_002929	TCG	2	6	228910	228915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
5037	NC_002929	TCGCC	2	10	228919	228928	0 %	20 %	20 %	60 %	33591462
5038	NC_002929	TCGT	2	8	228960	228967	0 %	50 %	25 %	25 %	33591462
5039	NC_002929	CTT	2	6	228974	228979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591462
5040	NC_002929	CGGC	2	8	228988	228995	0 %	0 %	50 %	50 %	33591462
5041	NC_002929	CGC	2	6	229031	229036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
5042	NC_002929	GC	3	6	229051	229056	0 %	0 %	50 %	50 %	33591462
5043	NC_002929	ACC	2	6	229065	229070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591462
5044	NC_002929	GCCC	2	8	229127	229134	0 %	0 %	25 %	75 %	33591462
5045	NC_002929	TCA	2	6	229180	229185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
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5051	NC_002929	CGT	2	6	229569	229574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591463
5052	NC_002929	GGC	2	6	229611	229616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591463
5053	NC_002929	GC	3	6	229629	229634	0 %	0 %	50 %	50 %	33591463
5054	NC_002929	CG	4	8	229667	229674	0 %	0 %	50 %	50 %	33591463
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5057	NC_002929	CGCA	2	8	229846	229853	25 %	0 %	25 %	50 %	33591463
5058	NC_002929	CAT	2	6	229857	229862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591463
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5061	NC_002929	TG	3	6	229968	229973	0 %	50 %	50 %	0 %	33591463
5062	NC_002929	CGG	2	6	229974	229979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591463
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5069	NC_002929	CGA	2	6	230198	230203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591464
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5072	NC_002929	CGCC	2	8	230273	230280	0 %	0 %	25 %	75 %	33591464
5073	NC_002929	CAG	2	6	230349	230354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591464
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5076	NC_002929	AGGGC	2	10	230555	230564	20 %	0 %	60 %	20 %	33591464
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5079	NC_002929	CAG	2	6	230676	230681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591464
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5081	NC_002929	GC	3	6	230698	230703	0 %	0 %	50 %	50 %	33591464
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5084	NC_002929	CG	3	6	230881	230886	0 %	0 %	50 %	50 %	33591464
5085	NC_002929	GGC	2	6	231111	231116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591465
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5088	NC_002929	ACA	2	6	231193	231198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591465
5089	NC_002929	CAC	2	6	231212	231217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591465
5090	NC_002929	GCT	2	6	231230	231235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591465
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5092	NC_002929	ATC	2	6	231258	231263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591465
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5094	NC_002929	CTT	2	6	231395	231400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591465
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5098	NC_002929	CAT	2	6	231575	231580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591465
5099	NC_002929	GCGCG	2	10	231586	231595	0 %	0 %	60 %	40 %	33591465
5100	NC_002929	CGTGGC	2	12	231596	231607	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33591465
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5102	NC_002929	CGT	2	6	231653	231658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591465
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5104	NC_002929	CG	3	6	231703	231708	0 %	0 %	50 %	50 %	33591465
5105	NC_002929	AGC	2	6	231728	231733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591466
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5107	NC_002929	CGC	2	6	231754	231759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591466
5108	NC_002929	TGG	2	6	231822	231827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591466
5109	NC_002929	ACC	2	6	231831	231836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591466
5110	NC_002929	CCG	2	6	231840	231845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591466
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5115	NC_002929	TTCG	2	8	231991	231998	0 %	50 %	25 %	25 %	33591466
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5118	NC_002929	GCA	2	6	232054	232059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591466
5119	NC_002929	GC	3	6	232086	232091	0 %	0 %	50 %	50 %	33591466
5120	NC_002929	CCG	2	6	232104	232109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591466
5121	NC_002929	GCG	2	6	232113	232118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591466
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5123	NC_002929	CG	3	6	232239	232244	0 %	0 %	50 %	50 %	33591466
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5248	NC_002929	CGC	2	6	238329	238334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591474
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5371	NC_002929	TCG	2	6	243515	243520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591477
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5491	NC_002929	GGC	2	6	248837	248842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591482
5492	NC_002929	GTG	2	6	248864	248869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591482
5493	NC_002929	TGA	2	6	248884	248889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591482
5494	NC_002929	CGG	2	6	248917	248922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591482
5495	NC_002929	CCCAG	2	10	248986	248995	20 %	0 %	20 %	60 %	33591482
5496	NC_002929	GCAGCG	2	12	249016	249027	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33591482
5497	NC_002929	GGC	2	6	249077	249082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591482
5498	NC_002929	GGCC	2	8	249115	249122	0 %	0 %	50 %	50 %	33591482
5499	NC_002929	CG	3	6	249126	249131	0 %	0 %	50 %	50 %	33591482
5500	NC_002929	CGT	2	6	249148	249153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591482

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