MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 119926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002928	CCTT	2	8	131263	131270	0 %	50 %	0 %	50 %	33594842
3002	NC_002928	TGG	2	6	131281	131286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594842
3003	NC_002928	CGATG	2	10	131293	131302	20 %	20 %	40 %	20 %	33594842
3004	NC_002928	GTC	2	6	131337	131342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594842
3005	NC_002928	CAA	2	6	131366	131371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594842
3006	NC_002928	T	6	6	131382	131387	0 %	100 %	0 %	0 %	33594842
3007	NC_002928	ATC	2	6	131431	131436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594842
3008	NC_002928	GCCG	2	8	131441	131448	0 %	0 %	50 %	50 %	33594842
3009	NC_002928	GCG	2	6	131574	131579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594842
3010	NC_002928	GGC	2	6	131610	131615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594842
3011	NC_002928	GTT	2	6	131831	131836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594843
3012	NC_002928	GC	3	6	131879	131884	0 %	0 %	50 %	50 %	33594843
3013	NC_002928	GTG	2	6	131984	131989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594843
3014	NC_002928	GCC	2	6	132106	132111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594843
3015	NC_002928	GTG	3	9	132172	132180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594843
3016	NC_002928	TGG	2	6	132319	132324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594843
3017	NC_002928	GCG	2	6	132336	132341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594843
3018	NC_002928	GTC	2	6	132345	132350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594843
3019	NC_002928	GCGG	2	8	132497	132504	0 %	0 %	75 %	25 %	33594843
3020	NC_002928	TTGG	2	8	132533	132540	0 %	50 %	50 %	0 %	33594843
3021	NC_002928	GC	3	6	132598	132603	0 %	0 %	50 %	50 %	33594843
3022	NC_002928	GGC	2	6	132627	132632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594843
3023	NC_002928	ATCGAG	2	12	132663	132674	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33594843
3024	NC_002928	GAT	2	6	132684	132689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594843
3025	NC_002928	GGC	2	6	132690	132695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594843
3026	NC_002928	GCG	2	6	132716	132721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594843
3027	NC_002928	TCG	2	6	132723	132728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594843
3028	NC_002928	CGG	2	6	132732	132737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594843
3029	NC_002928	GCG	2	6	132773	132778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594844
3030	NC_002928	TGC	2	6	132843	132848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594844
3031	NC_002928	GCC	2	6	132947	132952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594844
3032	NC_002928	GC	3	6	132954	132959	0 %	0 %	50 %	50 %	33594844
3033	NC_002928	TACT	2	8	132994	133001	25 %	50 %	0 %	25 %	33594844
3034	NC_002928	TGC	2	6	133008	133013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594844
3035	NC_002928	CTG	2	6	133031	133036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594844
3036	NC_002928	GCATC	2	10	133081	133090	20 %	20 %	20 %	40 %	33594844
3037	NC_002928	TCG	2	6	133124	133129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594844
3038	NC_002928	TGC	2	6	133233	133238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594844
3039	NC_002928	AGC	2	6	133239	133244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594844
3040	NC_002928	TTC	2	6	133286	133291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594844
3041	NC_002928	GGC	2	6	133366	133371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594844
3042	NC_002928	TGG	2	6	133406	133411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594844
3043	NC_002928	ACA	2	6	133518	133523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594844
3044	NC_002928	TTTC	2	8	133600	133607	0 %	75 %	0 %	25 %	33594845
3045	NC_002928	GCT	2	6	133710	133715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594845
3046	NC_002928	CAA	2	6	133767	133772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594845
3047	NC_002928	CTG	2	6	133774	133779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594845
3048	NC_002928	CCG	2	6	133781	133786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594845
3049	NC_002928	GTT	2	6	133893	133898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594845
3050	NC_002928	GAT	2	6	134017	134022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594845
3051	NC_002928	GCCG	2	8	134156	134163	0 %	0 %	50 %	50 %	33594845
3052	NC_002928	GCGT	2	8	134213	134220	0 %	25 %	50 %	25 %	33594845
3053	NC_002928	A	6	6	134231	134236	100 %	0 %	0 %	0 %	33594845
3054	NC_002928	TGG	2	6	134240	134245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594845
3055	NC_002928	CTG	2	6	134286	134291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594846
3056	NC_002928	GAT	2	6	134379	134384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594846
3057	NC_002928	TGC	2	6	134396	134401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594846
3058	NC_002928	GC	3	6	134400	134405	0 %	0 %	50 %	50 %	33594846
3059	NC_002928	TGG	2	6	134449	134454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594846
3060	NC_002928	TGC	2	6	134519	134524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594846
3061	NC_002928	TGCC	2	8	134591	134598	0 %	25 %	25 %	50 %	33594846
3062	NC_002928	TGG	2	6	134653	134658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594846
3063	NC_002928	ATC	2	6	134710	134715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594846
3064	NC_002928	TGGA	2	8	134742	134749	25 %	25 %	50 %	0 %	33594846
3065	NC_002928	CGC	2	6	134758	134763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594846
3066	NC_002928	GTT	2	6	134765	134770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594846
3067	NC_002928	CGA	2	6	134828	134833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594846
3068	NC_002928	CGGA	2	8	134872	134879	25 %	0 %	50 %	25 %	33594846
3069	NC_002928	TGT	2	6	134909	134914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594846
3070	NC_002928	CGG	2	6	135008	135013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594846
3071	NC_002928	TGGC	2	8	135040	135047	0 %	25 %	50 %	25 %	33594846
3072	NC_002928	GCG	2	6	135085	135090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594846
3073	NC_002928	GTC	2	6	135097	135102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594846
3074	NC_002928	CGG	2	6	135121	135126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594846
3075	NC_002928	GCTCG	2	10	135168	135177	0 %	20 %	40 %	40 %	33594846
3076	NC_002928	GAC	2	6	135207	135212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3077	NC_002928	GGCT	2	8	135230	135237	0 %	25 %	50 %	25 %	33594847
3078	NC_002928	TCG	2	6	135242	135247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3079	NC_002928	GCCA	2	8	135273	135280	25 %	0 %	25 %	50 %	33594847
3080	NC_002928	CGC	2	6	135312	135317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594847
3081	NC_002928	TCCG	2	8	135323	135330	0 %	25 %	25 %	50 %	33594847
3082	NC_002928	AT	3	6	135333	135338	50 %	50 %	0 %	0 %	33594847
3083	NC_002928	GC	3	6	135350	135355	0 %	0 %	50 %	50 %	33594847
3084	NC_002928	ATG	2	6	135398	135403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594847
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3086	NC_002928	ACG	2	6	135515	135520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3087	NC_002928	TGC	2	6	135534	135539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3088	NC_002928	GCT	2	6	135540	135545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3089	NC_002928	ATG	2	6	135590	135595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594847
3090	NC_002928	GAC	2	6	135628	135633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3091	NC_002928	TCG	2	6	135653	135658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3092	NC_002928	GGC	2	6	135753	135758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594847
3093	NC_002928	CTTG	2	8	135759	135766	0 %	50 %	25 %	25 %	33594847
3094	NC_002928	GAA	2	6	135810	135815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594847
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3096	NC_002928	CGG	2	6	135827	135832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594847
3097	NC_002928	GC	3	6	135888	135893	0 %	0 %	50 %	50 %	33594847
3098	NC_002928	GGA	2	6	135910	135915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33594847
3099	NC_002928	GCGG	2	8	135931	135938	0 %	0 %	75 %	25 %	33594847
3100	NC_002928	GCG	2	6	135990	135995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594847
3101	NC_002928	TG	3	6	136001	136006	0 %	50 %	50 %	0 %	33594847
3102	NC_002928	CTGG	2	8	136008	136015	0 %	25 %	50 %	25 %	33594847
3103	NC_002928	AGG	2	6	136016	136021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33594847
3104	NC_002928	GC	3	6	136041	136046	0 %	0 %	50 %	50 %	33594848
3105	NC_002928	CTT	2	6	136070	136075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594848
3106	NC_002928	TGC	2	6	136123	136128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594848
3107	NC_002928	GAT	3	9	136181	136189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594848
3108	NC_002928	GCA	2	6	136332	136337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594848
3109	NC_002928	AG	3	6	136344	136349	50 %	0 %	50 %	0 %	33594848
3110	NC_002928	ATGA	2	8	136377	136384	50 %	25 %	25 %	0 %	33594848
3111	NC_002928	AGT	2	6	136452	136457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594848
3112	NC_002928	TTGA	2	8	136509	136516	25 %	50 %	25 %	0 %	33594848
3113	NC_002928	CGTT	2	8	136538	136545	0 %	50 %	25 %	25 %	33594848
3114	NC_002928	TG	3	6	136549	136554	0 %	50 %	50 %	0 %	33594848
3115	NC_002928	ATG	2	6	136654	136659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594848
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3118	NC_002928	GTGCT	2	10	136748	136757	0 %	40 %	40 %	20 %	33594849
3119	NC_002928	AAG	2	6	136795	136800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594849
3120	NC_002928	GGCTG	2	10	136934	136943	0 %	20 %	60 %	20 %	33594849
3121	NC_002928	GAA	2	6	137029	137034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594849
3122	NC_002928	AGC	2	6	137045	137050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594849
3123	NC_002928	AT	3	6	137084	137089	50 %	50 %	0 %	0 %	33594849
3124	NC_002928	AAG	2	6	137197	137202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594849
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3127	NC_002928	GT	3	6	137275	137280	0 %	50 %	50 %	0 %	33594849
3128	NC_002928	G	6	6	137383	137388	0 %	0 %	100 %	0 %	33594849
3129	NC_002928	GAT	2	6	137407	137412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594849
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3231	NC_002928	GGC	2	6	143687	143692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594853
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3234	NC_002928	GCATC	2	10	143729	143738	20 %	20 %	20 %	40 %	33594853
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3236	NC_002928	TGC	2	6	143888	143893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594854
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3239	NC_002928	GCC	2	6	143998	144003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594854
3240	NC_002928	CG	3	6	144014	144019	0 %	0 %	50 %	50 %	33594854
3241	NC_002928	GGC	2	6	144036	144041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594854
3242	NC_002928	ATG	2	6	144044	144049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594854
3243	NC_002928	ATT	2	6	144055	144060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33594854
3244	NC_002928	TG	3	6	144232	144237	0 %	50 %	50 %	0 %	33594854
3245	NC_002928	TCC	2	6	144264	144269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33594854
3246	NC_002928	GAC	3	9	144342	144350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594854
3247	NC_002928	CGA	2	6	144441	144446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594854
3248	NC_002928	CTTCGA	2	12	144585	144596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33594854
3249	NC_002928	GCG	2	6	144617	144622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594854
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3493	NC_002928	TTC	2	6	157613	157618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594863
3494	NC_002928	ACG	2	6	157674	157679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594863
3495	NC_002928	ACGC	2	8	157736	157743	25 %	0 %	25 %	50 %	33594863
3496	NC_002928	GCG	2	6	157744	157749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594863
3497	NC_002928	CG	3	6	157757	157762	0 %	0 %	50 %	50 %	33594863
3498	NC_002928	AT	3	6	157804	157809	50 %	50 %	0 %	0 %	33594863
3499	NC_002928	GTG	2	6	157850	157855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594863
3500	NC_002928	GAG	2	6	157862	157867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33594863

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