MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 119926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002928	TCG	2	6	48940	48945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594776
1002	NC_002928	GC	4	8	48948	48955	0 %	0 %	50 %	50 %	33594776
1003	NC_002928	CCG	2	6	49024	49029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594776
1004	NC_002928	CGT	3	9	49033	49041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594776
1005	NC_002928	CGC	2	6	49095	49100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594777
1006	NC_002928	GC	4	8	49126	49133	0 %	0 %	50 %	50 %	33594777
1007	NC_002928	CGCT	2	8	49134	49141	0 %	25 %	25 %	50 %	33594777
1008	NC_002928	CGT	2	6	49305	49310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594777
1009	NC_002928	GCT	2	6	49337	49342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594777
1010	NC_002928	CGT	2	6	49361	49366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594777
1011	NC_002928	CG	4	8	49390	49397	0 %	0 %	50 %	50 %	33594777
1012	NC_002928	CCG	2	6	49447	49452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594777
1013	NC_002928	AAG	2	6	49509	49514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594777
1014	NC_002928	GTGG	2	8	49568	49575	0 %	25 %	75 %	0 %	33594777
1015	NC_002928	GTC	2	6	49659	49664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594777
1016	NC_002928	CTG	2	6	50029	50034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1017	NC_002928	TCG	2	6	50035	50040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1018	NC_002928	CCGA	2	8	50056	50063	25 %	0 %	25 %	50 %	33594778
1019	NC_002928	GTG	2	6	50080	50085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594778
1020	NC_002928	GTC	2	6	50122	50127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1021	NC_002928	CTG	2	6	50134	50139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1022	NC_002928	GTG	2	6	50152	50157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594778
1023	NC_002928	CGA	2	6	50175	50180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1024	NC_002928	TGC	2	6	50192	50197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1025	NC_002928	GGCGCC	2	12	50206	50217	0 %	0 %	50 %	50 %	33594778
1026	NC_002928	GTG	2	6	50218	50223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594778
1027	NC_002928	ACG	2	6	50246	50251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1028	NC_002928	ATC	2	6	50257	50262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594778
1029	NC_002928	GC	4	8	50358	50365	0 %	0 %	50 %	50 %	33594778
1030	NC_002928	CGCA	2	8	50377	50384	25 %	0 %	25 %	50 %	33594778
1031	NC_002928	AGC	2	6	50465	50470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1032	NC_002928	GCC	2	6	50613	50618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594778
1033	NC_002928	CGC	2	6	50630	50635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594778
1034	NC_002928	GATC	2	8	50637	50644	25 %	25 %	25 %	25 %	33594778
1035	NC_002928	TGC	3	9	50648	50656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1036	NC_002928	CGA	2	6	50664	50669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594778
1037	NC_002928	CTA	2	6	50718	50723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594778
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1039	NC_002928	CAG	2	6	51080	51085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594779
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1042	NC_002928	CGG	2	6	51314	51319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594779
1043	NC_002928	GGC	2	6	51581	51586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594780
1044	NC_002928	GC	3	6	51585	51590	0 %	0 %	50 %	50 %	33594780
1045	NC_002928	GCG	2	6	51631	51636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594780
1046	NC_002928	AGGTC	2	10	51646	51655	20 %	20 %	40 %	20 %	33594780
1047	NC_002928	GACGT	2	10	51678	51687	20 %	20 %	40 %	20 %	33594780
1048	NC_002928	TGGGCA	2	12	51714	51725	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33594780
1049	NC_002928	GGCA	2	8	51836	51843	25 %	0 %	50 %	25 %	33594780
1050	NC_002928	GATG	2	8	51904	51911	25 %	25 %	50 %	0 %	33594780
1051	NC_002928	GGC	2	6	51928	51933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594780
1052	NC_002928	TGG	2	6	51939	51944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594780
1053	NC_002928	GAC	2	6	52122	52127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594781
1054	NC_002928	TGC	2	6	52159	52164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594781
1055	NC_002928	GCC	2	6	52206	52211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594781
1056	NC_002928	TG	3	6	52212	52217	0 %	50 %	50 %	0 %	33594781
1057	NC_002928	CTGT	2	8	52236	52243	0 %	50 %	25 %	25 %	33594781
1058	NC_002928	CGA	2	6	52274	52279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594781
1059	NC_002928	GGT	2	6	52322	52327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594781
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1061	NC_002928	CGG	2	6	52388	52393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594781
1062	NC_002928	AGC	2	6	52428	52433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594781
1063	NC_002928	AG	3	6	52450	52455	50 %	0 %	50 %	0 %	33594781
1064	NC_002928	ATG	2	6	52462	52467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594782
1065	NC_002928	GCCGC	2	10	52514	52523	0 %	0 %	40 %	60 %	33594782
1066	NC_002928	GCTG	2	8	52535	52542	0 %	25 %	50 %	25 %	33594782
1067	NC_002928	GTT	2	6	52569	52574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594782
1068	NC_002928	CGCC	2	8	52575	52582	0 %	0 %	25 %	75 %	33594782
1069	NC_002928	GCC	2	6	52588	52593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594782
1070	NC_002928	GAC	2	6	52603	52608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594782
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1072	NC_002928	GCC	2	6	52642	52647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594782
1073	NC_002928	TAC	2	6	52696	52701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594782
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1089	NC_002928	CTGGC	2	10	53297	53306	0 %	20 %	40 %	40 %	33594782
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1096	NC_002928	GGCG	2	8	53526	53533	0 %	0 %	75 %	25 %	33594782
1097	NC_002928	GCG	2	6	53573	53578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
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1111	NC_002928	GC	5	10	53953	53962	0 %	0 %	50 %	50 %	33594782
1112	NC_002928	CGG	2	6	53963	53968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
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1123	NC_002928	CGG	2	6	54482	54487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594783
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1131	NC_002928	GCT	2	6	54766	54771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594783
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