MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 119926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002928	GCGCC	2	10	21664	21673	0 %	0 %	40 %	60 %	33594740
502	NC_002928	GCG	2	6	21682	21687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594740
503	NC_002928	GCC	2	6	21713	21718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594740
504	NC_002928	GGCGCA	2	12	21719	21730	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33594740
505	NC_002928	CGC	2	6	21743	21748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594740
506	NC_002928	GCC	2	6	21807	21812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594740
507	NC_002928	GCG	2	6	21893	21898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594740
508	NC_002928	GCCC	2	8	21907	21914	0 %	0 %	25 %	75 %	33594740
509	NC_002928	GTC	2	6	21951	21956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594740
510	NC_002928	GCC	2	6	21974	21979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594740
511	NC_002928	CACG	2	8	22025	22032	25 %	0 %	25 %	50 %	33594740
512	NC_002928	AGC	2	6	24366	24371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594741
513	NC_002928	GCCGGT	2	12	24380	24391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33594741
514	NC_002928	GTA	2	6	24497	24502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594741
515	NC_002928	GC	3	6	24517	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	33594741
516	NC_002928	CCGG	2	8	24548	24555	0 %	0 %	50 %	50 %	33594741
517	NC_002928	CAC	2	6	24560	24565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594741
518	NC_002928	CG	3	6	24583	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	33594741
519	NC_002928	TA	3	6	24599	24604	50 %	50 %	0 %	0 %	33594741
520	NC_002928	GCC	2	6	24644	24649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594741
521	NC_002928	GGC	2	6	24653	24658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594741
522	NC_002928	GC	4	8	24657	24664	0 %	0 %	50 %	50 %	33594741
523	NC_002928	G	6	6	24679	24684	0 %	0 %	100 %	0 %	33594741
524	NC_002928	GCA	2	6	24688	24693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594741
525	NC_002928	CGGCG	2	10	24770	24779	0 %	0 %	60 %	40 %	33594741
526	NC_002928	GCT	2	6	24824	24829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594741
527	NC_002928	GCT	2	6	24842	24847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594741
528	NC_002928	GCC	2	6	24923	24928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594741
529	NC_002928	CG	3	6	24937	24942	0 %	0 %	50 %	50 %	33594741
530	NC_002928	GGC	2	6	25016	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594741
531	NC_002928	TGC	2	6	25105	25110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594741
532	NC_002928	CGA	2	6	25114	25119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594741
533	NC_002928	CGG	2	6	25150	25155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594741
534	NC_002928	ACC	2	6	25176	25181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594741
535	NC_002928	GCC	2	6	25191	25196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594741
536	NC_002928	GTC	2	6	25256	25261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594741
537	NC_002928	GACC	2	8	25283	25290	25 %	0 %	25 %	50 %	33594741
538	NC_002928	TGCT	2	8	25315	25322	0 %	50 %	25 %	25 %	33594741
539	NC_002928	TC	3	6	25366	25371	0 %	50 %	0 %	50 %	33594741
540	NC_002928	GGGCT	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	33594741
541	NC_002928	GTC	2	6	25480	25485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594742
542	NC_002928	CGT	2	6	25491	25496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594742
543	NC_002928	CTGCGG	2	12	25501	25512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33594742
544	NC_002928	GCAACT	2	12	25581	25592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33594742
545	NC_002928	CG	3	6	25677	25682	0 %	0 %	50 %	50 %	33594742
546	NC_002928	A	6	6	25705	25710	100 %	0 %	0 %	0 %	33594742
547	NC_002928	GGC	2	6	25736	25741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594742
548	NC_002928	GCG	2	6	25843	25848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594742
549	NC_002928	GCC	2	6	25856	25861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594742
550	NC_002928	CG	3	6	25863	25868	0 %	0 %	50 %	50 %	33594742
551	NC_002928	CGG	2	6	25878	25883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594742
552	NC_002928	GTC	2	6	25906	25911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594742
553	NC_002928	GCCT	2	8	25915	25922	0 %	25 %	25 %	50 %	33594742
554	NC_002928	TCG	2	6	26018	26023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594742
555	NC_002928	GCC	2	6	26084	26089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594742
556	NC_002928	CTG	2	6	26146	26151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594742
557	NC_002928	TGC	2	6	26156	26161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594742
558	NC_002928	GC	4	8	26508	26515	0 %	0 %	50 %	50 %	33594743
559	NC_002928	GCCG	2	8	26538	26545	0 %	0 %	50 %	50 %	33594743
560	NC_002928	CGA	2	6	26606	26611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594743
561	NC_002928	CAT	2	6	26627	26632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594743
562	NC_002928	TGC	2	6	26641	26646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594743
563	NC_002928	TGAG	2	8	26701	26708	25 %	25 %	50 %	0 %	33594743
564	NC_002928	ACG	2	6	26716	26721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594743
565	NC_002928	TGG	2	6	26767	26772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594743
566	NC_002928	CAT	2	6	26801	26806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594743
567	NC_002928	GGC	2	6	26814	26819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594743
568	NC_002928	CTGC	2	8	26846	26853	0 %	25 %	25 %	50 %	33594743
569	NC_002928	GCCG	2	8	26882	26889	0 %	0 %	50 %	50 %	33594743
570	NC_002928	TGC	2	6	26911	26916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594743
571	NC_002928	GGCGC	2	10	26924	26933	0 %	0 %	60 %	40 %	33594743
572	NC_002928	CGA	2	6	26981	26986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594743
573	NC_002928	CGG	2	6	27029	27034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594743
574	NC_002928	GCTGTC	2	12	27041	27052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594743
575	NC_002928	CTG	3	9	27078	27086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594743
576	NC_002928	CGGC	2	8	27091	27098	0 %	0 %	50 %	50 %	33594743
577	NC_002928	GCTG	2	8	27131	27138	0 %	25 %	50 %	25 %	33594743
578	NC_002928	CGG	2	6	27148	27153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594743
579	NC_002928	GCA	2	6	27172	27177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594743
580	NC_002928	CGA	2	6	27356	27361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594744
581	NC_002928	CTGG	2	8	27377	27384	0 %	25 %	50 %	25 %	33594744
582	NC_002928	ACG	2	6	27405	27410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594744
583	NC_002928	CAG	2	6	27533	27538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594744
584	NC_002928	GC	3	6	27575	27580	0 %	0 %	50 %	50 %	33594744
585	NC_002928	ACG	2	6	27585	27590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594744
586	NC_002928	CAG	2	6	27647	27652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594744
587	NC_002928	CGA	2	6	27655	27660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594744
588	NC_002928	GTT	2	6	27716	27721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594744
589	NC_002928	GAT	2	6	27754	27759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594744
590	NC_002928	CCG	2	6	27789	27794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594744
591	NC_002928	AGC	2	6	27801	27806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594744
592	NC_002928	GC	3	6	27805	27810	0 %	0 %	50 %	50 %	33594744
593	NC_002928	GTCG	2	8	27869	27876	0 %	25 %	50 %	25 %	33594744
594	NC_002928	TAGGCA	2	12	28017	28028	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33594744
595	NC_002928	GGC	2	6	28031	28036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594744
596	NC_002928	CAA	2	6	28082	28087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594744
597	NC_002928	CGA	2	6	28114	28119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594744
598	NC_002928	CAT	2	6	28130	28135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594744
599	NC_002928	GAC	2	6	28151	28156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594744
600	NC_002928	TCG	2	6	28179	28184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594744
601	NC_002928	GCCG	2	8	28213	28220	0 %	0 %	50 %	50 %	33594744
602	NC_002928	GCG	2	6	28264	28269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594745
603	NC_002928	TGC	2	6	28299	28304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594745
604	NC_002928	GTCAG	2	10	28316	28325	20 %	20 %	40 %	20 %	33594745
605	NC_002928	TCG	2	6	28364	28369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594745
606	NC_002928	GC	3	6	28383	28388	0 %	0 %	50 %	50 %	33594745
607	NC_002928	GGC	2	6	28396	28401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594745
608	NC_002928	AGCG	2	8	28442	28449	25 %	0 %	50 %	25 %	33594745
609	NC_002928	CG	3	6	29135	29140	0 %	0 %	50 %	50 %	33594746
610	NC_002928	CAT	2	6	29148	29153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594746
611	NC_002928	CAAGAG	2	12	29154	29165	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	33594746
612	NC_002928	ACC	3	9	29218	29226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594746
613	NC_002928	AAG	2	6	29230	29235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594746
614	NC_002928	CGG	2	6	29304	29309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594746
615	NC_002928	GGT	2	6	29337	29342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594746
616	NC_002928	GAA	2	6	29469	29474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594746
617	NC_002928	CGT	2	6	29651	29656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594747
618	NC_002928	AAG	2	6	29747	29752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594747
619	NC_002928	CAT	2	6	29767	29772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594747
620	NC_002928	CAA	2	6	29842	29847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594747
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622	NC_002928	GCC	2	6	29874	29879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594747
623	NC_002928	GCC	2	6	29928	29933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594747
624	NC_002928	GCC	2	6	29963	29968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594747
625	NC_002928	AAG	2	6	29969	29974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594747
626	NC_002928	GAA	2	6	30049	30054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594747
627	NC_002928	CAA	2	6	30085	30090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594747
628	NC_002928	ACC	4	12	30202	30213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594748
629	NC_002928	CCA	2	6	30275	30280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594748
630	NC_002928	TGGA	2	8	30286	30293	25 %	25 %	50 %	0 %	33594748
631	NC_002928	GCAAGA	2	12	30294	30305	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	33594748
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633	NC_002928	ACG	2	6	30334	30339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594748
634	NC_002928	CAT	2	6	30387	30392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594748
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637	NC_002928	CAA	2	6	30555	30560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594748
638	NC_002928	CTT	2	6	30582	30587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594748
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645	NC_002928	TGA	2	6	30830	30835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594748
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650	NC_002928	CGA	2	6	31059	31064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594748
651	NC_002928	TGA	2	6	31097	31102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594748
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663	NC_002928	CGA	2	6	31620	31625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594748
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742	NC_002928	GAA	2	6	35199	35204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594752
743	NC_002928	CAA	2	6	35222	35227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594752
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746	NC_002928	GCCTGG	2	12	35353	35364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33594752
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752	NC_002928	GTC	2	6	35888	35893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594754
753	NC_002928	CGCTG	2	10	35923	35932	0 %	20 %	40 %	40 %	33594754
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