MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 119926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_002928	GTC	2	6	253509	253514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594958
6003	NC_002928	GCC	3	9	253554	253562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594958
6004	NC_002928	GC	3	6	253577	253582	0 %	0 %	50 %	50 %	33594958
6005	NC_002928	CGC	2	6	253585	253590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594958
6006	NC_002928	CGAC	2	8	253627	253634	25 %	0 %	25 %	50 %	33594958
6007	NC_002928	CTG	2	6	253662	253667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594958
6008	NC_002928	GAC	3	9	253725	253733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594958
6009	NC_002928	GTG	2	6	253740	253745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594958
6010	NC_002928	GCC	2	6	253791	253796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594958
6011	NC_002928	GC	3	6	253815	253820	0 %	0 %	50 %	50 %	33594958
6012	NC_002928	GC	3	6	253822	253827	0 %	0 %	50 %	50 %	33594958
6013	NC_002928	TCA	2	6	253828	253833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594958
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6015	NC_002928	GGC	2	6	253929	253934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594958
6016	NC_002928	CGCGC	2	10	253961	253970	0 %	0 %	40 %	60 %	33594958
6017	NC_002928	CGA	2	6	253976	253981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594958
6018	NC_002928	TGG	2	6	254004	254009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594958
6019	NC_002928	CGC	2	6	254064	254069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594958
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6021	NC_002928	GC	3	6	254156	254161	0 %	0 %	50 %	50 %	33594958
6022	NC_002928	TGG	2	6	254197	254202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594958
6023	NC_002928	ATC	2	6	254218	254223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594958
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6026	NC_002928	CG	4	8	254318	254325	0 %	0 %	50 %	50 %	33594958
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6033	NC_002928	CGA	2	6	254836	254841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594959
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6037	NC_002928	CG	3	6	254905	254910	0 %	0 %	50 %	50 %	33594959
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6053	NC_002928	TGG	3	9	255437	255445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161610403
6054	NC_002928	CTG	2	6	255520	255525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161610403
6055	NC_002928	TGGCG	2	10	255532	255541	0 %	20 %	60 %	20 %	161610403
6056	NC_002928	GC	3	6	255555	255560	0 %	0 %	50 %	50 %	161610403
6057	NC_002928	GGCG	2	8	255567	255574	0 %	0 %	75 %	25 %	161610403
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6061	NC_002928	GC	3	6	255659	255664	0 %	0 %	50 %	50 %	161610403
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6081	NC_002928	GC	3	6	256287	256292	0 %	0 %	50 %	50 %	33594961
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6089	NC_002928	GTT	2	6	256496	256501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594961
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6118	NC_002928	CATGC	2	10	257407	257416	20 %	20 %	20 %	40 %	33594962
6119	NC_002928	CGGCG	2	10	257429	257438	0 %	0 %	60 %	40 %	33594963
6120	NC_002928	GCG	2	6	257486	257491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594963
6121	NC_002928	CCA	2	6	257498	257503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594963
6122	NC_002928	CAGC	2	8	257541	257548	25 %	0 %	25 %	50 %	33594963
6123	NC_002928	GCCG	2	8	257559	257566	0 %	0 %	50 %	50 %	33594963
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6125	NC_002928	TCGAT	2	10	257588	257597	20 %	40 %	20 %	20 %	33594963
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6240	NC_002928	ATCG	2	8	262938	262945	25 %	25 %	25 %	25 %	33594969
6241	NC_002928	TCG	2	6	262950	262955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594969
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6245	NC_002928	TCCA	2	8	263087	263094	25 %	25 %	0 %	50 %	33594969
6246	NC_002928	GC	3	6	263111	263116	0 %	0 %	50 %	50 %	33594969
6247	NC_002928	TGG	2	6	263139	263144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594969
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6497	NC_002928	CCGGG	2	10	272124	272133	0 %	0 %	60 %	40 %	33594977
6498	NC_002928	CCG	2	6	272138	272143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594977
6499	NC_002928	GC	3	6	272155	272160	0 %	0 %	50 %	50 %	33594977
6500	NC_002928	GAC	2	6	272176	272181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594977

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