MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 142491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002927	CAT	2	6	45089	45094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599040
1002	NC_002927	CG	3	6	45150	45155	0 %	0 %	50 %	50 %	33599040
1003	NC_002927	GCG	2	6	45163	45168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599040
1004	NC_002927	CCG	3	9	45190	45198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599040
1005	NC_002927	TGG	2	6	45202	45207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599040
1006	NC_002927	AAGGCC	2	12	45225	45236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599040
1007	NC_002927	CG	4	8	45311	45318	0 %	0 %	50 %	50 %	33599040
1008	NC_002927	CTA	2	6	45358	45363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599041
1009	NC_002927	CGC	2	6	45380	45385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599041
1010	NC_002927	ACG	3	9	45397	45405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599041
1011	NC_002927	GAT	2	6	45419	45424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599041
1012	NC_002927	GGT	2	6	45456	45461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599041
1013	NC_002927	GTG	2	6	45489	45494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599041
1014	NC_002927	GGCGAT	2	12	45495	45506	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33599041
1015	NC_002927	GGGCAA	2	12	45521	45532	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	33599041
1016	NC_002927	CGC	2	6	45579	45584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599041
1017	NC_002927	GAA	2	6	45605	45610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599041
1018	NC_002927	GTG	2	6	45630	45635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599041
1019	NC_002927	GCCG	2	8	45668	45675	0 %	0 %	50 %	50 %	33599041
1020	NC_002927	CGG	2	6	45698	45703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599041
1021	NC_002927	GC	3	6	45710	45715	0 %	0 %	50 %	50 %	33599041
1022	NC_002927	GC	3	6	45809	45814	0 %	0 %	50 %	50 %	33599041
1023	NC_002927	CGG	2	6	45826	45831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599041
1024	NC_002927	TGC	2	6	45836	45841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599041
1025	NC_002927	GGCCTG	2	12	45960	45971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33599042
1026	NC_002927	CAG	2	6	45983	45988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599042
1027	NC_002927	GAT	2	6	46022	46027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599042
1028	NC_002927	CGTCTC	2	12	46046	46057	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	33599042
1029	NC_002927	CCG	2	6	46108	46113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599043
1030	NC_002927	GCA	2	6	46117	46122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599043
1031	NC_002927	CCG	2	6	46174	46179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599043
1032	NC_002927	GGC	2	6	46212	46217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599043
1033	NC_002927	GGC	2	6	46239	46244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599043
1034	NC_002927	CGC	2	6	46285	46290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599043
1035	NC_002927	GCGT	2	8	46396	46403	0 %	25 %	50 %	25 %	33599043
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1039	NC_002927	CGC	2	6	46481	46486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599043
1040	NC_002927	GCTT	2	8	46508	46515	0 %	50 %	25 %	25 %	33599043
1041	NC_002927	TGG	2	6	46614	46619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599044
1042	NC_002927	CATC	2	8	46788	46795	25 %	25 %	0 %	50 %	33599044
1043	NC_002927	GGT	3	9	46813	46821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599044
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1045	NC_002927	GGCC	2	8	46855	46862	0 %	0 %	50 %	50 %	33599044
1046	NC_002927	TGT	2	6	46977	46982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33599044
1047	NC_002927	TCG	2	6	47100	47105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599044
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1050	NC_002927	CAA	2	6	47278	47283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599044
1051	NC_002927	CCG	2	6	47342	47347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599044
1052	NC_002927	CGT	2	6	47355	47360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599044
1053	NC_002927	GCG	2	6	47403	47408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599044
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1055	NC_002927	TCT	2	6	47496	47501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599044
1056	NC_002927	GAA	2	6	47554	47559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599044
1057	NC_002927	GCG	2	6	47562	47567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599044
1058	NC_002927	TCCG	2	8	47583	47590	0 %	25 %	25 %	50 %	33599044
1059	NC_002927	CG	3	6	47602	47607	0 %	0 %	50 %	50 %	33599044
1060	NC_002927	GCTG	2	8	47638	47645	0 %	25 %	50 %	25 %	33599044
1061	NC_002927	TGCT	2	8	47669	47676	0 %	50 %	25 %	25 %	33599044
1062	NC_002927	GGT	2	6	47720	47725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599044
1063	NC_002927	ATT	2	6	47738	47743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33599044
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1065	NC_002927	ATG	2	6	47786	47791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599044
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1073	NC_002927	CG	3	6	48357	48362	0 %	0 %	50 %	50 %	33599047
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1089	NC_002927	GCCCCG	2	12	48930	48941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599048
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1109	NC_002927	GTC	2	6	50132	50137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599050
1110	NC_002927	CTG	2	6	50144	50149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599050
1111	NC_002927	GTG	2	6	50162	50167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599050
1112	NC_002927	CGA	2	6	50185	50190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599050
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1119	NC_002927	CGCA	2	8	50387	50394	25 %	0 %	25 %	50 %	33599050
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1122	NC_002927	CGC	2	6	50640	50645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599050
1123	NC_002927	GATC	2	8	50647	50654	25 %	25 %	25 %	25 %	33599050
1124	NC_002927	TGC	3	9	50658	50666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599050
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1251	NC_002927	CGC	2	6	55639	55644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599056
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1253	NC_002927	CGG	2	6	55756	55761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599056
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1377	NC_002927	TGCC	2	8	61033	61040	0 %	25 %	25 %	50 %	33599060
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