MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 142491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002927	GCCC	2	8	21853	21860	0 %	0 %	25 %	75 %	33599010
502	NC_002927	GTC	2	6	21897	21902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599010
503	NC_002927	GCC	2	6	21920	21925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
504	NC_002927	CACG	2	8	21971	21978	25 %	0 %	25 %	50 %	33599010
505	NC_002927	GCA	2	6	22034	22039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
506	NC_002927	CGG	2	6	22052	22057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
507	NC_002927	TGA	2	6	22079	22084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599011
508	NC_002927	CGGCC	2	10	22088	22097	0 %	0 %	40 %	60 %	33599011
509	NC_002927	GCC	2	6	22146	22151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599011
510	NC_002927	TTCG	2	8	22155	22162	0 %	50 %	25 %	25 %	33599011
511	NC_002927	CGG	2	6	22166	22171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
512	NC_002927	CG	3	6	22178	22183	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
513	NC_002927	CGT	2	6	22232	22237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
514	NC_002927	CACG	2	8	22268	22275	25 %	0 %	25 %	50 %	33599011
515	NC_002927	CGGA	2	8	22298	22305	25 %	0 %	50 %	25 %	33599011
516	NC_002927	CAG	2	6	22326	22331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
517	NC_002927	GCA	2	6	22349	22354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
518	NC_002927	GTC	2	6	22359	22364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
519	NC_002927	CG	6	12	22415	22426	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
520	NC_002927	TCG	2	6	22441	22446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
521	NC_002927	GCA	2	6	22457	22462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
522	NC_002927	CG	3	6	22506	22511	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
523	NC_002927	TCG	2	6	22528	22533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
524	NC_002927	CTG	2	6	22587	22592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
525	NC_002927	CCA	2	6	22622	22627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599011
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527	NC_002927	CG	3	6	22650	22655	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
528	NC_002927	TCG	2	6	22759	22764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
529	NC_002927	GC	3	6	22775	22780	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
530	NC_002927	GCG	2	6	22856	22861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
531	NC_002927	TCG	2	6	22900	22905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
532	NC_002927	GC	3	6	22912	22917	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
533	NC_002927	CGG	2	6	22928	22933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
534	NC_002927	GGCGC	2	10	22946	22955	0 %	0 %	60 %	40 %	33599011
535	NC_002927	GC	4	8	22952	22959	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
536	NC_002927	CGC	2	6	22986	22991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599011
537	NC_002927	GCCG	2	8	23009	23016	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
538	NC_002927	CG	3	6	23015	23020	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
539	NC_002927	GCGTC	2	10	23033	23042	0 %	20 %	40 %	40 %	33599011
540	NC_002927	CG	3	6	23090	23095	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
541	NC_002927	CAG	2	6	23145	23150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
542	NC_002927	CGG	2	6	23178	23183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
543	NC_002927	GCA	2	6	23225	23230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
544	NC_002927	CCAGCA	2	12	23273	23284	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	33599011
545	NC_002927	CGG	2	6	23295	23300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
546	NC_002927	GCC	2	6	23380	23385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599011
547	NC_002927	CAG	3	9	23415	23423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
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549	NC_002927	GC	3	6	23487	23492	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
550	NC_002927	GCA	2	6	23498	23503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
551	NC_002927	GAT	2	6	23511	23516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599011
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553	NC_002927	CCA	2	6	23594	23599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599011
554	NC_002927	GCA	2	6	23642	23647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
555	NC_002927	G	7	7	23679	23685	0 %	0 %	100 %	0 %	33599011
556	NC_002927	GGCC	2	8	23708	23715	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
557	NC_002927	CGC	2	6	23756	23761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599011
558	NC_002927	TCA	2	6	23768	23773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599011
559	NC_002927	GCA	2	6	23834	23839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
560	NC_002927	TGA	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599011
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562	NC_002927	GCG	2	6	23906	23911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
563	NC_002927	CG	4	8	23925	23932	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
564	NC_002927	CAC	2	6	23946	23951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599011
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567	NC_002927	GAT	2	6	24036	24041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599011
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569	NC_002927	CAG	2	6	24078	24083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
570	NC_002927	GTC	3	9	24135	24143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
571	NC_002927	GCTG	2	8	24168	24175	0 %	25 %	50 %	25 %	33599011
572	NC_002927	GCCG	2	8	24176	24183	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
573	NC_002927	GCC	2	6	24231	24236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599011
574	NC_002927	CAG	2	6	24246	24251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
575	NC_002927	ATG	2	6	24283	24288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599011
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577	NC_002927	GCCA	2	8	24301	24308	25 %	0 %	25 %	50 %	33599011
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601	NC_002927	ACC	2	6	25175	25180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599012
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607	NC_002927	GGGCT	2	10	25384	25393	0 %	20 %	60 %	20 %	33599012
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611	NC_002927	GCAACT	2	12	25580	25591	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33599013
612	NC_002927	CG	3	6	25676	25681	0 %	0 %	50 %	50 %	33599013
613	NC_002927	A	6	6	25704	25709	100 %	0 %	0 %	0 %	33599013
614	NC_002927	GGC	2	6	25735	25740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599013
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618	NC_002927	CGG	2	6	25877	25882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599013
619	NC_002927	GTC	2	6	25905	25910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599013
620	NC_002927	GCCT	2	8	25914	25921	0 %	25 %	25 %	50 %	33599013
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625	NC_002927	GC	4	8	26507	26514	0 %	0 %	50 %	50 %	33599014
626	NC_002927	GCCG	2	8	26537	26544	0 %	0 %	50 %	50 %	33599014
627	NC_002927	CGA	2	6	26605	26610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599014
628	NC_002927	CAT	2	6	26626	26631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599014
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630	NC_002927	TGAG	2	8	26700	26707	25 %	25 %	50 %	0 %	33599014
631	NC_002927	ACG	2	6	26715	26720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599014
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645	NC_002927	CGG	2	6	27147	27152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599014
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755	NC_002927	GAGACG	2	12	32521	32532	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	33599020
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757	NC_002927	TGC	2	6	32595	32600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599020
758	NC_002927	TGG	2	6	32621	32626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599020
759	NC_002927	CG	3	6	32657	32662	0 %	0 %	50 %	50 %	33599020
760	NC_002927	CAT	2	6	32700	32705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599020
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762	NC_002927	GCT	2	6	32745	32750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599020
763	NC_002927	TGG	2	6	32756	32761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599020
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765	NC_002927	GC	3	6	32928	32933	0 %	0 %	50 %	50 %	33599020
766	NC_002927	GGT	2	6	32994	32999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599020
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