MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp9

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001904	ACA	2	6	204	209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497057
2	NC_001904	ATA	2	6	257	262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497057
3	NC_001904	AAC	2	6	384	389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497057
4	NC_001904	ATA	2	6	587	592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497057
5	NC_001904	ATA	2	6	596	601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497057
6	NC_001904	AGA	2	6	606	611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497057
7	NC_001904	ATA	2	6	734	739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497057
8	NC_001904	ATA	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497057
9	NC_001904	TAT	2	6	957	962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497057
10	NC_001904	CAA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497057
11	NC_001904	AAC	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497057
12	NC_001904	ATT	2	6	1193	1198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497057
13	NC_001904	ATT	2	6	1203	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497057
14	NC_001904	TAA	2	6	1214	1219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497057
15	NC_001904	AAT	2	6	1320	1325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497049
16	NC_001904	TTA	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497049
17	NC_001904	TAA	2	6	1371	1376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497049
18	NC_001904	ATG	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497049
19	NC_001904	TAA	2	6	1722	1727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497049
20	NC_001904	GTT	2	6	1907	1912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497050
21	NC_001904	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497050
22	NC_001904	AAG	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497050
23	NC_001904	AGA	2	6	2203	2208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497050
24	NC_001904	GAA	2	6	2381	2386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497050
25	NC_001904	CTT	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497050
26	NC_001904	GAA	2	6	2435	2440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497050
27	NC_001904	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497058
28	NC_001904	ATT	2	6	2626	2631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497058
29	NC_001904	AAT	2	6	2822	2827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497051
30	NC_001904	CAA	2	6	3038	3043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497051
31	NC_001904	TGT	2	6	3052	3057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497051
32	NC_001904	AAT	2	6	3137	3142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497051
33	NC_001904	TGT	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497051
34	NC_001904	TCA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497051
35	NC_001904	TAG	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497051
36	NC_001904	TAT	2	6	3374	3379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497051
37	NC_001904	ATG	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497051
38	NC_001904	TAA	2	6	3580	3585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497051
39	NC_001904	TAA	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497051
40	NC_001904	ACG	2	6	3630	3635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497051
41	NC_001904	TAA	2	6	3710	3715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497051
42	NC_001904	TTC	2	6	3928	3933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497052
43	NC_001904	AAT	2	6	4002	4007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497052
44	NC_001904	TAA	2	6	4056	4061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497052
45	NC_001904	GTT	2	6	4076	4081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497052
46	NC_001904	TAA	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497052
47	NC_001904	TCT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497052
48	NC_001904	TAA	2	6	4518	4523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497059
49	NC_001904	ATA	2	6	4532	4537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497059
50	NC_001904	AAT	2	6	4549	4554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497059
51	NC_001904	TTA	2	6	4569	4574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497059
52	NC_001904	TCA	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497059
53	NC_001904	TTA	2	6	4775	4780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497059
54	NC_001904	TAT	2	6	5596	5601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497053
55	NC_001904	ATG	2	6	5616	5621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497053
56	NC_001904	TTA	2	6	5713	5718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497053
57	NC_001904	TGC	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497053
58	NC_001904	ATT	2	6	5874	5879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497053
59	NC_001904	AAT	2	6	5965	5970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497053
60	NC_001904	TCT	2	6	6285	6290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497054
61	NC_001904	TAT	2	6	6302	6307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497054
62	NC_001904	CTA	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497054
63	NC_001904	ATC	2	6	6434	6439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497054
64	NC_001904	TTC	2	6	6545	6550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497054
65	NC_001904	TCT	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497054
66	NC_001904	TAA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497054
67	NC_001904	TCA	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497054
68	NC_001904	ATA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497054
69	NC_001904	TTG	3	9	6694	6702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497054
70	NC_001904	TTG	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497054
71	NC_001904	TAT	2	6	6728	6733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497054
72	NC_001904	AAT	2	6	6756	6761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497054
73	NC_001904	TAC	2	6	7053	7058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497055
74	NC_001904	ATA	2	6	7061	7066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497055
75	NC_001904	TAA	2	6	7254	7259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497055
76	NC_001904	ACA	2	6	7341	7346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497055
77	NC_001904	TAC	2	6	7375	7380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497055
78	NC_001904	TTC	2	6	7678	7683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497055
79	NC_001904	ATA	2	6	7698	7703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497055
80	NC_001904	ATT	2	6	8028	8033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497056
81	NC_001904	TCA	2	6	8188	8193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497056
82	NC_001904	ATT	2	6	8319	8324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497056
83	NC_001904	TAA	2	6	8340	8345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497056
84	NC_001904	TTA	2	6	8404	8409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497056
85	NC_001904	ATT	2	6	8439	8444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497056
86	NC_001904	TTA	2	6	8470	8475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497056
87	NC_001904	ATA	2	6	8541	8546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497056
88	NC_001904	TAC	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497056
89	NC_001904	ACT	2	6	8604	8609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497056
90	NC_001904	ATT	3	9	8658	8666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497056
91	NC_001904	TTG	2	6	8684	8689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497056
92	NC_001904	TAA	2	6	8798	8803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497056
93	NC_001904	TCA	2	6	8900	8905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497056
94	NC_001904	ACC	2	6	8925	8930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497056
95	NC_001904	ATT	2	6	9168	9173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497056

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.