MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp26

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001903	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556794
2	NC_001903	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556794
3	NC_001903	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556794
4	NC_001903	ATT	2	6	222	227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556794
5	NC_001903	TAT	2	6	316	321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556794
6	NC_001903	CTG	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497029
7	NC_001903	ATT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
8	NC_001903	ATC	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497028
9	NC_001903	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497028
10	NC_001903	TAT	2	6	1139	1144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
11	NC_001903	GTT	2	6	1195	1200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497028
12	NC_001903	AAT	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497028
13	NC_001903	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
14	NC_001903	TAT	2	6	1361	1366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
15	NC_001903	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497028
16	NC_001903	AAC	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497028
17	NC_001903	ATT	2	6	1500	1505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
18	NC_001903	GAC	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497028
19	NC_001903	ATT	2	6	1663	1668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
20	NC_001903	TCA	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497028
21	NC_001903	TTC	2	6	1892	1897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497028
22	NC_001903	TAT	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
23	NC_001903	ATT	2	6	1972	1977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
24	NC_001903	ATT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
25	NC_001903	TAA	2	6	2517	2522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
26	NC_001903	AAT	3	9	2552	2560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
27	NC_001903	AAT	2	6	2656	2661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
28	NC_001903	CAA	2	6	2685	2690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556793
29	NC_001903	ATA	2	6	2762	2767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
30	NC_001903	CAT	2	6	2842	2847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556793
31	NC_001903	CAC	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556793
32	NC_001903	AAG	2	6	2992	2997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556793
33	NC_001903	AAT	2	6	3001	3006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
34	NC_001903	ATA	2	6	3036	3041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
35	NC_001903	ATT	2	6	3119	3124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556793
36	NC_001903	CAA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556793
37	NC_001903	CAG	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556793
38	NC_001903	AGC	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556793
39	NC_001903	AAT	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
40	NC_001903	AGC	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556793
41	NC_001903	TCC	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	364556793
42	NC_001903	ACA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556793
43	NC_001903	ATA	2	6	3542	3547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
44	NC_001903	AGT	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556793
45	NC_001903	AGA	2	6	4107	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497018
46	NC_001903	TGT	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497018
47	NC_001903	ATA	2	6	4279	4284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497018
48	NC_001903	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497018
49	NC_001903	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497018
50	NC_001903	CAA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556792
51	NC_001903	GTT	2	6	4569	4574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556792
52	NC_001903	GTT	2	6	4587	4592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556792
53	NC_001903	CAC	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556792
54	NC_001903	TAA	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556792
55	NC_001903	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556792
56	NC_001903	AAT	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556792
57	NC_001903	ATT	2	6	4820	4825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
58	NC_001903	TAT	2	6	4954	4959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
59	NC_001903	ATT	2	6	5031	5036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
60	NC_001903	GAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497016
61	NC_001903	AAT	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
62	NC_001903	ACA	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497016
63	NC_001903	ATT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
64	NC_001903	TTA	2	6	5310	5315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
65	NC_001903	TAA	2	6	5320	5325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
66	NC_001903	AGA	2	6	5329	5334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497016
67	NC_001903	AAG	2	6	5355	5360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497016
68	NC_001903	AAG	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497016
69	NC_001903	AAT	2	6	5560	5565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
70	NC_001903	TAC	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497016
71	NC_001903	AAT	2	6	5642	5647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
72	NC_001903	TTC	2	6	5704	5709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497016
73	NC_001903	AAT	2	6	5762	5767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
74	NC_001903	ATG	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497016
75	NC_001903	ATA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
76	NC_001903	AAG	2	6	6792	6797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497026
77	NC_001903	ATA	2	6	6803	6808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
78	NC_001903	ATA	2	6	6822	6827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
79	NC_001903	TCA	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497026
80	NC_001903	GAA	2	6	6941	6946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497026
81	NC_001903	ATT	2	6	6954	6959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497026
82	NC_001903	TAA	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
83	NC_001903	TAA	2	6	7129	7134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
84	NC_001903	ATA	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
85	NC_001903	ATT	2	6	7272	7277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497026
86	NC_001903	ATT	2	6	7303	7308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497026
87	NC_001903	ATT	2	6	7359	7364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497026
88	NC_001903	ATG	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497026
89	NC_001903	CCT	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497026
90	NC_001903	CTT	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497026
91	NC_001903	AAG	2	6	7662	7667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497026
92	NC_001903	CAA	2	6	7853	7858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497015
93	NC_001903	TAA	2	6	7868	7873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
94	NC_001903	AGT	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497015
95	NC_001903	ACT	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497015
96	NC_001903	TGT	2	6	7964	7969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497015
97	NC_001903	ATA	2	6	8235	8240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
98	NC_001903	GAA	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
99	NC_001903	TAA	2	6	8294	8299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
100	NC_001903	AGA	2	6	8337	8342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
101	NC_001903	AGA	2	6	8417	8422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
102	NC_001903	GAA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
103	NC_001903	GAA	2	6	8508	8513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
104	NC_001903	TAA	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
105	NC_001903	TAA	2	6	8725	8730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
106	NC_001903	ATA	2	6	9296	9301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497013
107	NC_001903	ACA	2	6	9338	9343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497013
108	NC_001903	TAA	2	6	9379	9384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497013
109	NC_001903	ATT	2	6	9388	9393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497013
110	NC_001903	CAA	2	6	9519	9524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497013
111	NC_001903	ATA	3	9	9534	9542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497013
112	NC_001903	GAA	2	6	9584	9589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497013
113	NC_001903	TAT	2	6	9655	9660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497013
114	NC_001903	AAT	2	6	9695	9700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497013
115	NC_001903	ATC	2	6	9707	9712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497013
116	NC_001903	TAA	2	6	9771	9776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497013
117	NC_001903	TGA	2	6	9787	9792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497013
118	NC_001903	TAA	2	6	9825	9830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497013
119	NC_001903	AGA	2	6	9955	9960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497013
120	NC_001903	ATT	2	6	9978	9983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497013
121	NC_001903	ATA	2	6	10276	10281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497012
122	NC_001903	ACT	2	6	10347	10352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497012
123	NC_001903	AAT	2	6	10455	10460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497012
124	NC_001903	CTT	2	6	10565	10570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497012
125	NC_001903	TAT	2	6	10584	10589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497012
126	NC_001903	ACT	2	6	10601	10606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497012
127	NC_001903	TCT	2	6	10999	11004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497011
128	NC_001903	CCT	2	6	11024	11029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497011
129	NC_001903	AAG	2	6	11039	11044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497011
130	NC_001903	TCT	3	9	11047	11055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497011
131	NC_001903	ATC	2	6	11059	11064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497011
132	NC_001903	ATG	2	6	11093	11098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497011
133	NC_001903	AAT	2	6	11099	11104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497011
134	NC_001903	TTA	2	6	11128	11133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497011
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261	NC_001903	GTA	2	6	20701	20706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556795
262	NC_001903	TTA	2	6	20868	20873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497034
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264	NC_001903	TAA	2	6	20959	20964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497034
265	NC_001903	TAA	2	6	20980	20985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497034
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288	NC_001903	TTA	2	6	23260	23265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497030
289	NC_001903	TAT	2	6	23387	23392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497030
290	NC_001903	TAT	2	6	23413	23418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497030
291	NC_001903	TTA	2	6	23434	23439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497030
292	NC_001903	ATT	2	6	23455	23460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497030
293	NC_001903	AGA	2	6	23461	23466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497030
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332	NC_001903	ATA	2	6	26419	26424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497021

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.