MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	A	7	7	4649	4655	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
2	NC_001856	A	7	7	4733	4739	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
3	NC_001856	A	8	8	4925	4932	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
4	NC_001856	A	7	7	4938	4944	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
5	NC_001856	A	7	7	5122	5128	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
6	NC_001856	A	6	6	5139	5144	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
7	NC_001856	T	6	6	5275	5280	0 %	100 %	0 %	0 %	11496844
8	NC_001856	A	6	6	6092	6097	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
9	NC_001856	A	7	7	6241	6247	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
10	NC_001856	A	6	6	6424	6429	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
11	NC_001856	A	6	6	6468	6473	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
12	NC_001856	A	6	6	6582	6587	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
13	NC_001856	T	6	6	7928	7933	0 %	100 %	0 %	0 %	11496846
14	NC_001856	T	6	6	9050	9055	0 %	100 %	0 %	0 %	11496848
15	NC_001856	T	6	6	10514	10519	0 %	100 %	0 %	0 %	11496834
16	NC_001856	T	6	6	10521	10526	0 %	100 %	0 %	0 %	11496834
17	NC_001856	T	7	7	10528	10534	0 %	100 %	0 %	0 %	11496834
18	NC_001856	T	6	6	10583	10588	0 %	100 %	0 %	0 %	11496834
19	NC_001856	T	6	6	11168	11173	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
20	NC_001856	T	7	7	11385	11391	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
21	NC_001856	T	6	6	11471	11476	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
22	NC_001856	T	6	6	11779	11784	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
23	NC_001856	T	7	7	11875	11881	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
24	NC_001856	T	6	6	11908	11913	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
25	NC_001856	T	7	7	12003	12009	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
26	NC_001856	T	7	7	12084	12090	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
27	NC_001856	A	9	9	12118	12126	100 %	0 %	0 %	0 %	11496836
28	NC_001856	T	8	8	12211	12218	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
29	NC_001856	T	7	7	12311	12317	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
30	NC_001856	A	6	6	12339	12344	100 %	0 %	0 %	0 %	11496836
31	NC_001856	T	7	7	12414	12420	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
32	NC_001856	T	7	7	12525	12531	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
33	NC_001856	T	6	6	12679	12684	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
34	NC_001856	T	8	8	12762	12769	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
35	NC_001856	T	6	6	12816	12821	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
36	NC_001856	T	6	6	12830	12835	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
37	NC_001856	T	6	6	12844	12849	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
38	NC_001856	T	6	6	12857	12862	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
39	NC_001856	T	7	7	12864	12870	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
40	NC_001856	T	6	6	12883	12888	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
41	NC_001856	T	6	6	12992	12997	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
42	NC_001856	T	9	9	13125	13133	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
43	NC_001856	T	8	8	13315	13322	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
44	NC_001856	T	7	7	13359	13365	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
45	NC_001856	T	6	6	13612	13617	0 %	100 %	0 %	0 %	364556752
46	NC_001856	T	7	7	13627	13633	0 %	100 %	0 %	0 %	364556752
47	NC_001856	A	6	6	13655	13660	100 %	0 %	0 %	0 %	364556752
48	NC_001856	A	6	6	15283	15288	100 %	0 %	0 %	0 %	364556753
49	NC_001856	A	6	6	15352	15357	100 %	0 %	0 %	0 %	364556753
50	NC_001856	T	6	6	16540	16545	0 %	100 %	0 %	0 %	364556748
51	NC_001856	A	9	9	16651	16659	100 %	0 %	0 %	0 %	364556748
52	NC_001856	T	7	7	16738	16744	0 %	100 %	0 %	0 %	364556748
53	NC_001856	A	6	6	16884	16889	100 %	0 %	0 %	0 %	364556748
54	NC_001856	G	6	6	17083	17088	0 %	0 %	100 %	0 %	364556748
55	NC_001856	A	6	6	17320	17325	100 %	0 %	0 %	0 %	364556748
56	NC_001856	T	7	7	17407	17413	0 %	100 %	0 %	0 %	11496868
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59	NC_001856	A	7	7	18083	18089	100 %	0 %	0 %	0 %	11496868
60	NC_001856	T	7	7	18408	18414	0 %	100 %	0 %	0 %	364556749
61	NC_001856	T	7	7	18481	18487	0 %	100 %	0 %	0 %	364556749
62	NC_001856	A	6	6	19035	19040	100 %	0 %	0 %	0 %	364556749
63	NC_001856	A	6	6	19207	19212	100 %	0 %	0 %	0 %	364556749
64	NC_001856	A	6	6	19349	19354	100 %	0 %	0 %	0 %	11496838
65	NC_001856	A	6	6	19733	19738	100 %	0 %	0 %	0 %	11496838
66	NC_001856	A	6	6	19936	19941	100 %	0 %	0 %	0 %	11496838
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68	NC_001856	A	6	6	20482	20487	100 %	0 %	0 %	0 %	364556750
69	NC_001856	A	8	8	20733	20740	100 %	0 %	0 %	0 %	364556750
70	NC_001856	T	6	6	20953	20958	0 %	100 %	0 %	0 %	364556750
71	NC_001856	A	6	6	21052	21057	100 %	0 %	0 %	0 %	364556750
72	NC_001856	T	6	6	21160	21165	0 %	100 %	0 %	0 %	364556750
73	NC_001856	A	6	6	21333	21338	100 %	0 %	0 %	0 %	364556745
74	NC_001856	A	6	6	21378	21383	100 %	0 %	0 %	0 %	364556745
75	NC_001856	A	6	6	22106	22111	100 %	0 %	0 %	0 %	364556746
76	NC_001856	T	7	7	22114	22120	0 %	100 %	0 %	0 %	364556746
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78	NC_001856	T	6	6	22579	22584	0 %	100 %	0 %	0 %	364556746
79	NC_001856	T	7	7	22607	22613	0 %	100 %	0 %	0 %	364556746
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82	NC_001856	A	6	6	23888	23893	100 %	0 %	0 %	0 %	11496853
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91	NC_001856	T	8	8	27479	27486	0 %	100 %	0 %	0 %	11496858
92	NC_001856	A	7	7	27718	27724	100 %	0 %	0 %	0 %	11496858
93	NC_001856	T	8	8	27734	27741	0 %	100 %	0 %	0 %	11496858
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103	NC_001856	T	8	8	30628	30635	0 %	100 %	0 %	0 %	11496839
104	NC_001856	T	6	6	30657	30662	0 %	100 %	0 %	0 %	11496839
105	NC_001856	A	6	6	30959	30964	100 %	0 %	0 %	0 %	11496872
106	NC_001856	A	6	6	31236	31241	100 %	0 %	0 %	0 %	11496873
107	NC_001856	T	7	7	31244	31250	0 %	100 %	0 %	0 %	11496873
108	NC_001856	T	6	6	31500	31505	0 %	100 %	0 %	0 %	11496873
109	NC_001856	T	6	6	31709	31714	0 %	100 %	0 %	0 %	11496873
110	NC_001856	T	7	7	31737	31743	0 %	100 %	0 %	0 %	11496873
111	NC_001856	T	6	6	31904	31909	0 %	100 %	0 %	0 %	11496873
112	NC_001856	T	6	6	32015	32020	0 %	100 %	0 %	0 %	11496873
113	NC_001856	A	6	6	33018	33023	100 %	0 %	0 %	0 %	11496875
114	NC_001856	T	7	7	34382	34388	0 %	100 %	0 %	0 %	11496876
115	NC_001856	T	7	7	34409	34415	0 %	100 %	0 %	0 %	11496876
116	NC_001856	T	7	7	34439	34445	0 %	100 %	0 %	0 %	11496876
117	NC_001856	T	7	7	34471	34477	0 %	100 %	0 %	0 %	11496876
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119	NC_001856	T	6	6	35016	35021	0 %	100 %	0 %	0 %	11496877
120	NC_001856	A	6	6	35487	35492	100 %	0 %	0 %	0 %	11496877
121	NC_001856	A	6	6	35523	35528	100 %	0 %	0 %	0 %	11496877
122	NC_001856	T	6	6	35683	35688	0 %	100 %	0 %	0 %	364556751
123	NC_001856	A	6	6	35830	35835	100 %	0 %	0 %	0 %	364556751
124	NC_001856	T	6	6	35841	35846	0 %	100 %	0 %	0 %	364556751

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.