MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
2	NC_001856	GTA	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
3	NC_001856	TAA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
4	NC_001856	AAG	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
5	NC_001856	ACT	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
6	NC_001856	TCC	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496844
7	NC_001856	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
8	NC_001856	CTA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
9	NC_001856	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
10	NC_001856	TTA	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496844
11	NC_001856	TAA	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
12	NC_001856	AAT	2	6	5086	5091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
13	NC_001856	ATG	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
14	NC_001856	CAT	2	6	5129	5134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
15	NC_001856	TAA	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
16	NC_001856	AAT	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
17	NC_001856	TGA	2	6	5217	5222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
18	NC_001856	ATT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496844
19	NC_001856	AGA	2	6	5379	5384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
20	NC_001856	CTT	3	9	5405	5413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496844
21	NC_001856	GAA	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
22	NC_001856	TAA	2	6	6099	6104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496832
23	NC_001856	TAC	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496832
24	NC_001856	ATC	2	6	6169	6174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496832
25	NC_001856	AAT	2	6	6188	6193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496832
26	NC_001856	TTA	2	6	6275	6280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496832
27	NC_001856	AAG	2	6	6303	6308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496832
28	NC_001856	ACA	2	6	6317	6322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496832
29	NC_001856	CTG	2	6	6396	6401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496832
30	NC_001856	CAA	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496832
31	NC_001856	AAG	2	6	6519	6524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496832
32	NC_001856	AGC	2	6	6541	6546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496832
33	NC_001856	CAA	2	6	6578	6583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496832
34	NC_001856	AGC	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496832
35	NC_001856	AAG	2	6	6834	6839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496832
36	NC_001856	AAT	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496846
37	NC_001856	CGC	2	6	7901	7906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	11496846
38	NC_001856	TAT	2	6	9041	9046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496848
39	NC_001856	CAA	2	6	9062	9067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496848
40	NC_001856	CAA	2	6	9150	9155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496848
41	NC_001856	AAT	2	6	10590	10595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496834
42	NC_001856	CTT	2	6	10760	10765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496834
43	NC_001856	ATA	2	6	10919	10924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496834
44	NC_001856	TAT	2	6	10943	10948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496834
45	NC_001856	ATC	2	6	10953	10958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496834
46	NC_001856	ATT	2	6	10989	10994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496834
47	NC_001856	TTC	2	6	11037	11042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496834
48	NC_001856	CTT	2	6	11075	11080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496834
49	NC_001856	CTT	2	6	11187	11192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496835
50	NC_001856	TAT	2	6	11250	11255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496835
51	NC_001856	AAT	2	6	11256	11261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496835
52	NC_001856	TAA	2	6	11337	11342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496835
53	NC_001856	ACA	2	6	11351	11356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496835
54	NC_001856	AAT	3	9	11440	11448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496835
55	NC_001856	GTA	2	6	11456	11461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496835
56	NC_001856	TTA	2	6	11573	11578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496835
57	NC_001856	TCA	2	6	11600	11605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496835
58	NC_001856	TAA	2	6	11683	11688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496835
59	NC_001856	ATA	2	6	12075	12080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496836
60	NC_001856	TAT	2	6	12104	12109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496836
61	NC_001856	TTG	2	6	12169	12174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496836
62	NC_001856	TCT	2	6	12175	12180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496836
63	NC_001856	TAA	2	6	12205	12210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496836
64	NC_001856	ATT	2	6	12219	12224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496836
65	NC_001856	TTC	2	6	12327	12332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496836
66	NC_001856	TAT	2	6	12374	12379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496836
67	NC_001856	CTT	2	6	12392	12397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496836
68	NC_001856	TTA	2	6	12404	12409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496836
69	NC_001856	TGT	2	6	12486	12491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496837
70	NC_001856	TCT	2	6	12674	12679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496837
71	NC_001856	TTC	2	6	12796	12801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496837
72	NC_001856	ATT	2	6	12826	12831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496837
73	NC_001856	TTA	2	6	12911	12916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496837
74	NC_001856	TCT	2	6	13166	13171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496837
75	NC_001856	TTA	2	6	13182	13187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496837
76	NC_001856	CTT	2	6	13203	13208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496837
77	NC_001856	TGA	3	9	13247	13255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496837
78	NC_001856	AGT	2	6	13385	13390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496837
79	NC_001856	TTG	2	6	13391	13396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496837
80	NC_001856	TGT	2	6	13407	13412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496837
81	NC_001856	ATA	2	6	13674	13679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556752
82	NC_001856	TAT	2	6	13693	13698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556752
83	NC_001856	AAC	2	6	13700	13705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556752
84	NC_001856	GTT	3	9	16533	16541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556748
85	NC_001856	ATT	2	6	16546	16551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556748
86	NC_001856	GTT	2	6	16562	16567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556748
87	NC_001856	TTA	2	6	16621	16626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556748
88	NC_001856	TGA	2	6	16660	16665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556748
89	NC_001856	TTG	2	6	16749	16754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556748
90	NC_001856	CTT	2	6	16772	16777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556748
91	NC_001856	TTC	2	6	16801	16806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556748
92	NC_001856	CTT	2	6	17192	17197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556748
93	NC_001856	AGA	2	6	17735	17740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496868
94	NC_001856	ATT	2	6	17758	17763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496868
95	NC_001856	AGA	2	6	17981	17986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496868
96	NC_001856	AGA	2	6	18057	18062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496868
97	NC_001856	ACT	2	6	18163	18168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496868
98	NC_001856	ATG	2	6	18272	18277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556749
99	NC_001856	AAT	2	6	18343	18348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556749
100	NC_001856	AAT	2	6	18355	18360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556749
101	NC_001856	ATT	2	6	18428	18433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556749
102	NC_001856	ATT	2	6	18578	18583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556749
103	NC_001856	TGA	2	6	18614	18619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556749
104	NC_001856	TGG	2	6	18651	18656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556749
105	NC_001856	TTA	2	6	18711	18716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556749
106	NC_001856	ATA	2	6	18773	18778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556749
107	NC_001856	TGT	2	6	18984	18989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556749
108	NC_001856	ATT	2	6	19014	19019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556749
109	NC_001856	ATT	2	6	19158	19163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556749
110	NC_001856	TTA	2	6	19228	19233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556749
111	NC_001856	AAT	2	6	19239	19244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556749
112	NC_001856	TAA	2	6	19345	19350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496838
113	NC_001856	ATT	2	6	19373	19378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496838
114	NC_001856	GAA	2	6	19691	19696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496838
115	NC_001856	GGA	2	6	19754	19759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496838
116	NC_001856	TAA	2	6	19809	19814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496838
117	NC_001856	AGA	2	6	19893	19898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496838
118	NC_001856	TAA	2	6	19948	19953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496838
119	NC_001856	TAG	2	6	20117	20122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556750
120	NC_001856	ATT	2	6	20182	20187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556750
121	NC_001856	GAA	2	6	20229	20234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556750
122	NC_001856	ATG	2	6	20272	20277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556750
123	NC_001856	TTC	2	6	20327	20332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556750
124	NC_001856	AGC	2	6	20385	20390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556750
125	NC_001856	TTA	2	6	20397	20402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556750
126	NC_001856	GTA	2	6	20452	20457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556750
127	NC_001856	CAG	2	6	20593	20598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556750
128	NC_001856	ATA	2	6	20599	20604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556750
129	NC_001856	TAC	2	6	20615	20620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556750
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131	NC_001856	TCT	2	6	20849	20854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556750
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258	NC_001856	TAC	2	6	35074	35079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496877
259	NC_001856	CAT	2	6	35118	35123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496877
260	NC_001856	AAT	2	6	35131	35136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496877
261	NC_001856	TCC	2	6	35167	35172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496877
262	NC_001856	CAT	2	6	35205	35210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496877
263	NC_001856	TAA	2	6	35385	35390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496877
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277	NC_001856	AAT	3	9	36187	36195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556751

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.