MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	GTTT	2	8	198	205	0 %	75 %	25 %	0 %	11496795
2	NC_001855	TAAT	2	8	405	412	50 %	50 %	0 %	0 %	11496795
3	NC_001855	AATT	2	8	603	610	50 %	50 %	0 %	0 %	11496795
4	NC_001855	AGAT	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	11496795
5	NC_001855	TGAT	2	8	804	811	25 %	50 %	25 %	0 %	11496795
6	NC_001855	CTTT	2	8	840	847	0 %	75 %	0 %	25 %	11496795
7	NC_001855	CTCA	2	8	5345	5352	25 %	25 %	0 %	50 %	11496801
8	NC_001855	ATTA	2	8	5675	5682	50 %	50 %	0 %	0 %	11496801
9	NC_001855	TAAT	2	8	6644	6651	50 %	50 %	0 %	0 %	11496803
10	NC_001855	TAAT	2	8	8421	8428	50 %	50 %	0 %	0 %	364556720
11	NC_001855	ATAA	2	8	9406	9413	75 %	25 %	0 %	0 %	11496781
12	NC_001855	TAAA	2	8	9911	9918	75 %	25 %	0 %	0 %	11496781
13	NC_001855	ATAA	2	8	10294	10301	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
14	NC_001855	ATTT	2	8	10305	10312	25 %	75 %	0 %	0 %	11496787
15	NC_001855	ATAA	2	8	10589	10596	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
16	NC_001855	TAAA	2	8	10788	10795	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
17	NC_001855	GAAG	2	8	10964	10971	50 %	0 %	50 %	0 %	11496787
18	NC_001855	GCAT	2	8	11153	11160	25 %	25 %	25 %	25 %	11496787
19	NC_001855	ATAA	2	8	11255	11262	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
20	NC_001855	TGAT	2	8	11448	11455	25 %	50 %	25 %	0 %	11496787
21	NC_001855	TAGA	2	8	13158	13165	50 %	25 %	25 %	0 %	11496820
22	NC_001855	TTTC	2	8	13621	13628	0 %	75 %	0 %	25 %	11496789
23	NC_001855	AAAT	2	8	14068	14075	75 %	25 %	0 %	0 %	11496789
24	NC_001855	ATCA	2	8	14201	14208	50 %	25 %	0 %	25 %	11496789
25	NC_001855	ATTT	2	8	14325	14332	25 %	75 %	0 %	0 %	11496789
26	NC_001855	AAAT	2	8	14626	14633	75 %	25 %	0 %	0 %	11496790
27	NC_001855	AAGT	2	8	14673	14680	50 %	25 %	25 %	0 %	11496790
28	NC_001855	TTTG	2	8	14695	14702	0 %	75 %	25 %	0 %	11496790
29	NC_001855	ACTA	2	8	14713	14720	50 %	25 %	0 %	25 %	11496790
30	NC_001855	CTTT	2	8	15277	15284	0 %	75 %	0 %	25 %	11496822
31	NC_001855	TCTT	2	8	15303	15310	0 %	75 %	0 %	25 %	11496822
32	NC_001855	TTTA	2	8	15644	15651	25 %	75 %	0 %	0 %	11496822
33	NC_001855	GAAA	2	8	16283	16290	75 %	0 %	25 %	0 %	11496791
34	NC_001855	AAAT	2	8	16681	16688	75 %	25 %	0 %	0 %	11496791
35	NC_001855	ACAA	2	8	16704	16711	75 %	0 %	0 %	25 %	11496791
36	NC_001855	AATA	2	8	16878	16885	75 %	25 %	0 %	0 %	11496791
37	NC_001855	AGAA	2	8	20578	20585	75 %	0 %	25 %	0 %	11496782
38	NC_001855	AAGT	2	8	21230	21237	50 %	25 %	25 %	0 %	11496782
39	NC_001855	ATTT	2	8	21974	21981	25 %	75 %	0 %	0 %	11496814
40	NC_001855	TCTG	2	8	26069	26076	0 %	50 %	25 %	25 %	364556722
41	NC_001855	ATAA	2	8	26146	26153	75 %	25 %	0 %	0 %	364556722
42	NC_001855	CTTT	2	8	26328	26335	0 %	75 %	0 %	25 %	364556722
43	NC_001855	GCTT	2	8	26646	26653	0 %	50 %	25 %	25 %	11496827
44	NC_001855	TTTA	2	8	27419	27426	25 %	75 %	0 %	0 %	364556721
45	NC_001855	CTTT	2	8	28047	28054	0 %	75 %	0 %	25 %	364556721
46	NC_001855	ATGC	2	8	29559	29566	25 %	25 %	25 %	25 %	11496830
47	NC_001855	TTGC	2	8	29740	29747	0 %	50 %	25 %	25 %	11496830
48	NC_001855	ATTT	2	8	30091	30098	25 %	75 %	0 %	0 %	11496830
49	NC_001855	TAAG	2	8	31156	31163	50 %	25 %	25 %	0 %	11496794
50	NC_001855	GCTT	2	8	31181	31188	0 %	50 %	25 %	25 %	11496794
51	NC_001855	TGTA	2	8	31501	31508	25 %	50 %	25 %	0 %	11496794
52	NC_001855	AATA	2	8	31559	31566	75 %	25 %	0 %	0 %	11496794
53	NC_001855	ATTA	2	8	31571	31578	50 %	50 %	0 %	0 %	11496794
54	NC_001855	TTGC	2	8	32087	32094	0 %	50 %	25 %	25 %	11496817
55	NC_001855	ATTT	2	8	32450	32457	25 %	75 %	0 %	0 %	11496817
56	NC_001855	CTTT	2	8	33763	33770	0 %	75 %	0 %	25 %	11496783
57	NC_001855	CTTT	2	8	33817	33824	0 %	75 %	0 %	25 %	11496783
58	NC_001855	ATTT	2	8	33992	33999	25 %	75 %	0 %	0 %	11496783
59	NC_001855	TATT	2	8	34539	34546	25 %	75 %	0 %	0 %	364556725
60	NC_001855	TCAT	2	8	34595	34602	25 %	50 %	0 %	25 %	11496784
61	NC_001855	AATT	2	8	34867	34874	50 %	50 %	0 %	0 %	11496784
62	NC_001855	TATT	2	8	34939	34946	25 %	75 %	0 %	0 %	11496784
63	NC_001855	AAAG	2	8	35244	35251	75 %	0 %	25 %	0 %	11496784
64	NC_001855	TTGG	2	8	35877	35884	0 %	50 %	50 %	0 %	11496785
65	NC_001855	AGTG	2	8	36122	36129	25 %	25 %	50 %	0 %	11496785
66	NC_001855	TTCT	2	8	36156	36163	0 %	75 %	0 %	25 %	11496785

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.