MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	ATT	2	6	214	219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496795
2	NC_001855	GGA	2	6	224	229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496795
3	NC_001855	AAT	2	6	287	292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496795
4	NC_001855	AAG	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
5	NC_001855	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
6	NC_001855	CTA	2	6	525	530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496795
7	NC_001855	GAA	2	6	533	538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
8	NC_001855	GCA	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496795
9	NC_001855	AGA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
10	NC_001855	TAA	2	6	645	650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496795
11	NC_001855	ATG	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496795
12	NC_001855	CAT	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496795
13	NC_001855	TTG	2	6	752	757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496795
14	NC_001855	AAT	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496795
15	NC_001855	AGC	2	6	789	794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496795
16	NC_001855	ATT	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496795
17	NC_001855	ATA	2	6	906	911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496795
18	NC_001855	AAG	2	6	955	960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
19	NC_001855	GAA	2	6	1019	1024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
20	NC_001855	TTA	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496795
21	NC_001855	ATT	2	6	5291	5296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496801
22	NC_001855	TGC	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496801
23	NC_001855	GTC	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496801
24	NC_001855	TAC	2	6	5473	5478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496801
25	NC_001855	TTC	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496801
26	NC_001855	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496801
27	NC_001855	GAG	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496801
28	NC_001855	ATC	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496801
29	NC_001855	TCA	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496801
30	NC_001855	ATT	2	6	6000	6005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496801
31	NC_001855	AAT	2	6	6455	6460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496803
32	NC_001855	ATA	2	6	8173	8178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556720
33	NC_001855	GAA	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556720
34	NC_001855	CTG	2	6	8463	8468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556720
35	NC_001855	ATT	2	6	8638	8643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556720
36	NC_001855	TTA	2	6	8648	8653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556720
37	NC_001855	AGA	2	6	8701	8706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556720
38	NC_001855	TGA	2	6	8800	8805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556720
39	NC_001855	TAA	3	9	9426	9434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496781
40	NC_001855	AGA	2	6	9546	9551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496781
41	NC_001855	AAG	2	6	9652	9657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496781
42	NC_001855	TAA	2	6	9663	9668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496781
43	NC_001855	AAT	2	6	9714	9719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496781
44	NC_001855	TTA	2	6	9754	9759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496781
45	NC_001855	AAC	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496781
46	NC_001855	ATT	2	6	9843	9848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496781
47	NC_001855	ATT	2	6	9905	9910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496781
48	NC_001855	ATT	2	6	9985	9990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496781
49	NC_001855	TAA	2	6	10342	10347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
50	NC_001855	TGC	2	6	10431	10436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496787
51	NC_001855	TAG	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
52	NC_001855	CTT	2	6	10635	10640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496787
53	NC_001855	TGA	2	6	10710	10715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
54	NC_001855	GAT	2	6	10721	10726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
55	NC_001855	TAA	2	6	10816	10821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
56	NC_001855	GTT	2	6	10823	10828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496787
57	NC_001855	AGA	2	6	10915	10920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496787
58	NC_001855	TGA	2	6	11053	11058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
59	NC_001855	GTT	2	6	11194	11199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496787
60	NC_001855	CTG	2	6	11214	11219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496787
61	NC_001855	ATG	2	6	11292	11297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
62	NC_001855	TAA	2	6	11316	11321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
63	NC_001855	GAT	2	6	11395	11400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
64	NC_001855	ATT	2	6	11429	11434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496787
65	NC_001855	TAA	2	6	11517	11522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
66	NC_001855	CAT	2	6	11623	11628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496787
67	NC_001855	TTG	2	6	11631	11636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496787
68	NC_001855	ATG	2	6	11643	11648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
69	NC_001855	ATC	2	6	11675	11680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496787
70	NC_001855	TAA	2	6	11724	11729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
71	NC_001855	TGA	2	6	11836	11841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
72	NC_001855	GGT	2	6	11875	11880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11496787
73	NC_001855	ATT	2	6	11940	11945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496787
74	NC_001855	TAT	2	6	12613	12618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496820
75	NC_001855	TAA	2	6	12820	12825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496820
76	NC_001855	AGA	2	6	12854	12859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496820
77	NC_001855	CTT	2	6	12881	12886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496820
78	NC_001855	AAT	3	9	12923	12931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496820
79	NC_001855	TTA	2	6	12971	12976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496820
80	NC_001855	ATA	2	6	12987	12992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496820
81	NC_001855	GCG	2	6	13077	13082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11496820
82	NC_001855	GAT	2	6	13100	13105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496820
83	NC_001855	GAA	2	6	13181	13186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496820
84	NC_001855	GAA	2	6	13190	13195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496820
85	NC_001855	AGA	3	9	13198	13206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496820
86	NC_001855	TAA	2	6	13614	13619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496789
87	NC_001855	AAG	2	6	13630	13635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496789
88	NC_001855	CTT	2	6	13723	13728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496789
89	NC_001855	TAA	2	6	13756	13761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496789
90	NC_001855	ATT	2	6	13814	13819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496789
91	NC_001855	CTA	2	6	13926	13931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496789
92	NC_001855	TAT	2	6	13943	13948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496789
93	NC_001855	AAT	2	6	14000	14005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496789
94	NC_001855	ATC	2	6	14021	14026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496789
95	NC_001855	TTA	2	6	14163	14168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496789
96	NC_001855	AAG	2	6	14173	14178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496789
97	NC_001855	CTC	2	6	14275	14280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496789
98	NC_001855	TAT	2	6	14538	14543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496790
99	NC_001855	GAA	2	6	14635	14640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496790
100	NC_001855	TTA	2	6	14657	14662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496790
101	NC_001855	CTA	2	6	14753	14758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496790
102	NC_001855	TTC	2	6	14764	14769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496790
103	NC_001855	ATT	2	6	14876	14881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496822
104	NC_001855	TAG	2	6	14935	14940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496822
105	NC_001855	AAT	2	6	15088	15093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496822
106	NC_001855	TAA	2	6	15113	15118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496822
107	NC_001855	TTA	2	6	15204	15209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496822
108	NC_001855	TAT	2	6	15229	15234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496822
109	NC_001855	TGA	3	9	15561	15569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496822
110	NC_001855	ATA	2	6	15657	15662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496822
111	NC_001855	ATT	2	6	15669	15674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496822
112	NC_001855	TTA	2	6	15705	15710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496822
113	NC_001855	ATA	2	6	16366	16371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496791
114	NC_001855	TAA	2	6	16387	16392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496791
115	NC_001855	GAT	2	6	16434	16439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496791
116	NC_001855	ATG	2	6	16504	16509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496791
117	NC_001855	AAG	2	6	16690	16695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496791
118	NC_001855	TAA	2	6	16738	16743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496791
119	NC_001855	TTA	2	6	17396	17401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556723
120	NC_001855	GTT	2	6	17407	17412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556723
121	NC_001855	AGA	2	6	17487	17492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556723
122	NC_001855	TAA	2	6	20646	20651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496782
123	NC_001855	GAA	2	6	20686	20691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496782
124	NC_001855	ATT	2	6	20706	20711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496782
125	NC_001855	ACA	2	6	20751	20756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496782
126	NC_001855	GTG	2	6	20810	20815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11496782
127	NC_001855	GGA	2	6	20820	20825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496782
128	NC_001855	TGA	2	6	20925	20930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496782
129	NC_001855	TAT	2	6	20956	20961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496782
130	NC_001855	ATG	2	6	20972	20977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496782
131	NC_001855	ATT	2	6	21093	21098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496782
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.