MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	AAAT	2	8	385	392	75 %	25 %	0 %	0 %	11496704
2	NC_001853	AAAG	2	8	568	575	75 %	0 %	25 %	0 %	11496704
3	NC_001853	ATAC	2	8	741	748	50 %	25 %	0 %	25 %	11496704
4	NC_001853	AATA	2	8	1174	1181	75 %	25 %	0 %	0 %	11496698
5	NC_001853	ATTA	2	8	1261	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	11496698
6	NC_001853	ATTT	2	8	2365	2372	25 %	75 %	0 %	0 %	11496710
7	NC_001853	AATT	2	8	2641	2648	50 %	50 %	0 %	0 %	11496710
8	NC_001853	TTAA	2	8	3892	3899	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
9	NC_001853	TATC	2	8	4545	4552	25 %	50 %	0 %	25 %	11496712
10	NC_001853	CTTT	2	8	4568	4575	0 %	75 %	0 %	25 %	11496712
11	NC_001853	TTAA	2	8	4754	4761	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
12	NC_001853	TAGT	2	8	5051	5058	25 %	50 %	25 %	0 %	11496712
13	NC_001853	TTAA	2	8	5627	5634	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
14	NC_001853	CTTT	2	8	6059	6066	0 %	75 %	0 %	25 %	11496712
15	NC_001853	TTTC	2	8	6298	6305	0 %	75 %	0 %	25 %	11496712
16	NC_001853	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	11496712
17	NC_001853	TCTT	2	8	7078	7085	0 %	75 %	0 %	25 %	11496712
18	NC_001853	TAAA	2	8	7101	7108	75 %	25 %	0 %	0 %	11496712
19	NC_001853	GCAA	2	8	8122	8129	50 %	0 %	25 %	25 %	364556673
20	NC_001853	AGGA	2	8	8344	8351	50 %	0 %	50 %	0 %	364556673
21	NC_001853	TAAA	2	8	9133	9140	75 %	25 %	0 %	0 %	364556674
22	NC_001853	ATCT	2	8	10052	10059	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
23	NC_001853	ATCT	2	8	10106	10113	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
24	NC_001853	ATCT	2	8	10160	10167	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
25	NC_001853	ATCT	2	8	10214	10221	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
26	NC_001853	ATCT	2	8	10268	10275	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
27	NC_001853	ATTA	2	8	12007	12014	50 %	50 %	0 %	0 %	11496733
28	NC_001853	AAGA	2	8	15634	15641	75 %	0 %	25 %	0 %	11496722
29	NC_001853	GTGA	2	8	15778	15785	25 %	25 %	50 %	0 %	11496722
30	NC_001853	TCAT	2	8	15802	15809	25 %	50 %	0 %	25 %	11496722
31	NC_001853	TAAA	2	8	16618	16625	75 %	25 %	0 %	0 %	11496723
32	NC_001853	ACTT	2	8	16942	16949	25 %	50 %	0 %	25 %	11496723
33	NC_001853	AGAA	2	8	16966	16973	75 %	0 %	25 %	0 %	11496723
34	NC_001853	CTTT	2	8	17062	17069	0 %	75 %	0 %	25 %	11496723
35	NC_001853	TAAA	2	8	17323	17330	75 %	25 %	0 %	0 %	11496723
36	NC_001853	ATGG	2	8	17681	17688	25 %	25 %	50 %	0 %	11496705
37	NC_001853	AAAG	2	8	17836	17843	75 %	0 %	25 %	0 %	11496705
38	NC_001853	AATG	2	8	18171	18178	50 %	25 %	25 %	0 %	11496706
39	NC_001853	AGAA	2	8	18471	18478	75 %	0 %	25 %	0 %	11496706
40	NC_001853	AAAT	2	8	19246	19253	75 %	25 %	0 %	0 %	11496707
41	NC_001853	TTTG	3	12	21496	21507	0 %	75 %	25 %	0 %	11496708
42	NC_001853	TAAG	2	8	21557	21564	50 %	25 %	25 %	0 %	11496708
43	NC_001853	GTAT	2	8	21731	21738	25 %	50 %	25 %	0 %	11496708
44	NC_001853	TTTG	2	8	22011	22018	0 %	75 %	25 %	0 %	11496708
45	NC_001853	CTAG	2	8	22734	22741	25 %	25 %	25 %	25 %	11496726
46	NC_001853	ACTT	2	8	25437	25444	25 %	50 %	0 %	25 %	11496730
47	NC_001853	GCTT	2	8	25949	25956	0 %	50 %	25 %	25 %	11496730
48	NC_001853	TGGT	2	8	26025	26032	0 %	50 %	50 %	0 %	11496730
49	NC_001853	TCTT	2	8	27322	27329	0 %	75 %	0 %	25 %	11496700
50	NC_001853	CATT	2	8	27437	27444	25 %	50 %	0 %	25 %	11496700
51	NC_001853	TAAT	2	8	27620	27627	50 %	50 %	0 %	0 %	11496701
52	NC_001853	AAAT	2	8	27753	27760	75 %	25 %	0 %	0 %	11496701
53	NC_001853	AAAT	2	8	27962	27969	75 %	25 %	0 %	0 %	11496701
54	NC_001853	TGAA	2	8	28077	28084	50 %	25 %	25 %	0 %	11496701

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.