MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-6

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000951	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497225
2	NC_000951	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497225
3	NC_000951	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497225
4	NC_000951	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497225
5	NC_000951	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497225
6	NC_000951	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497225
7	NC_000951	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497225
8	NC_000951	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497225
9	NC_000951	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497225
10	NC_000951	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497225
11	NC_000951	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497225
12	NC_000951	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497225
13	NC_000951	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497225
14	NC_000951	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497225
15	NC_000951	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497225
16	NC_000951	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497225
17	NC_000951	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497225
18	NC_000951	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497225
19	NC_000951	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497226
20	NC_000951	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497226
21	NC_000951	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497226
22	NC_000951	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497226
23	NC_000951	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497226
24	NC_000951	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497226
25	NC_000951	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497227
26	NC_000951	TAG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497227
27	NC_000951	ACA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497227
28	NC_000951	TGG	3	9	2279	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497227
29	NC_000951	TGA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497228
30	NC_000951	GAA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497228
31	NC_000951	TAG	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497228
32	NC_000951	GTT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497228
33	NC_000951	AGA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497228
34	NC_000951	TAG	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497228
35	NC_000951	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497228
36	NC_000951	TGG	3	9	3152	3160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497228
37	NC_000951	CCA	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497228
38	NC_000951	TGG	2	6	3335	3340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497228
39	NC_000951	ATC	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556497
40	NC_000951	TGG	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556497
41	NC_000951	GAT	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556497
42	NC_000951	AAT	2	6	3730	3735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556497
43	NC_000951	TAG	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556497
44	NC_000951	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556497
45	NC_000951	CAC	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556497
46	NC_000951	ATT	2	6	3975	3980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
47	NC_000951	TGA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556495
48	NC_000951	ATT	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
49	NC_000951	TAA	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556495
50	NC_000951	ATT	2	6	4345	4350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
51	NC_000951	TTA	2	6	4355	4360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
52	NC_000951	CTT	2	6	4441	4446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556495
53	NC_000951	AGA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556495
54	NC_000951	GTG	2	6	4481	4486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556495
55	NC_000951	ATG	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556495
56	NC_000951	GCA	3	9	4621	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556495
57	NC_000951	GCA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556495
58	NC_000951	GGA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	364556495
59	NC_000951	TAA	2	6	4692	4697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556495
60	NC_000951	AGA	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556495
61	NC_000951	TTA	2	6	4772	4777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
62	NC_000951	AGG	2	6	4872	4877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	364556495
63	NC_000951	CTA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556495
64	NC_000951	GAA	3	9	4988	4996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497216
65	NC_000951	GTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497216
66	NC_000951	ATT	2	6	5262	5267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497216
67	NC_000951	TAG	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497216
68	NC_000951	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497216
69	NC_000951	GGC	2	6	5294	5299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11497216
70	NC_000951	TGT	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556496
71	NC_000951	TTC	2	6	5517	5522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556496
72	NC_000951	TTA	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556496
73	NC_000951	TGG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497218
74	NC_000951	AAT	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497218
75	NC_000951	TAT	2	6	6022	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497218
76	NC_000951	GTA	2	6	6085	6090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497218
77	NC_000951	GCA	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497218
78	NC_000951	TTG	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497218
79	NC_000951	AAT	2	6	6236	6241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497219
80	NC_000951	GCT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497219
81	NC_000951	ATA	2	6	6311	6316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497219
82	NC_000951	TTA	2	6	6609	6614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497219
83	NC_000951	AGG	2	6	6696	6701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497219
84	NC_000951	TAG	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497230
85	NC_000951	ATT	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497230
86	NC_000951	TAA	2	6	6818	6823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497230
87	NC_000951	TGC	2	6	6827	6832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497230
88	NC_000951	TAA	2	6	6860	6865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497230
89	NC_000951	GAA	2	6	6978	6983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497230
90	NC_000951	TGT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497230
91	NC_000951	TTA	2	6	7075	7080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497230
92	NC_000951	GAT	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497230
93	NC_000951	GAT	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497230
94	NC_000951	AAT	2	6	7251	7256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497230
95	NC_000951	TTG	2	6	7357	7362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497230
96	NC_000951	CTT	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497230
97	NC_000951	AAG	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497230
98	NC_000951	ATT	2	6	7524	7529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497230
99	NC_000951	TTA	2	6	7534	7539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497230
100	NC_000951	ATA	2	6	7665	7670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497230
101	NC_000951	TAC	2	6	7778	7783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497230
102	NC_000951	TGG	2	6	7876	7881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497231
103	NC_000951	ACA	2	6	7925	7930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497231
104	NC_000951	TAG	2	6	7942	7947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497231
105	NC_000951	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497231
106	NC_000951	TGA	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497231
107	NC_000951	ACA	2	6	8076	8081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497231
108	NC_000951	ATT	2	6	8144	8149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497231
109	NC_000951	AAG	2	6	8182	8187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497231
110	NC_000951	CTG	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497231
111	NC_000951	AAC	2	6	8255	8260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497231
112	NC_000951	TTA	2	6	8277	8282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497232
113	NC_000951	TTA	2	6	8512	8517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497232
114	NC_000951	TTG	2	6	8529	8534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497232
115	NC_000951	AAT	2	6	8536	8541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497232
116	NC_000951	AAT	2	6	8621	8626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497232
117	NC_000951	TTG	2	6	8637	8642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497232
118	NC_000951	TCA	2	6	8696	8701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497232
119	NC_000951	ATT	2	6	8834	8839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497233
120	NC_000951	TGC	2	6	9022	9027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497234
121	NC_000951	AGA	2	6	9269	9274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497234
122	NC_000951	TTG	2	6	9378	9383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497234
123	NC_000951	GGC	2	6	9446	9451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11497234
124	NC_000951	GAA	2	6	9479	9484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497234
125	NC_000951	ATG	2	6	9528	9533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497234
126	NC_000951	ATT	2	6	9563	9568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497234
127	NC_000951	AGA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497234
128	NC_000951	GTG	2	6	9717	9722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497234
129	NC_000951	AGC	2	6	9728	9733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497234
130	NC_000951	AAG	2	6	9800	9805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497234
131	NC_000951	AGA	2	6	9829	9834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497234
132	NC_000951	GAT	2	6	9892	9897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497234
133	NC_000951	AAT	2	6	9944	9949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497234
134	NC_000951	ACT	2	6	10007	10012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497234
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137	NC_000951	ATT	2	6	10131	10136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497234
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141	NC_000951	TAA	2	6	10435	10440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497235
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256	NC_000951	AGA	2	6	20142	20147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497205
257	NC_000951	ATG	2	6	20305	20310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497206
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.