MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-1

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000948	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497090
2	NC_000948	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	11497091
3	NC_000948	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	11497092
4	NC_000948	GAAAA	2	10	6915	6924	80 %	0 %	20 %	0 %	11497095
5	NC_000948	CACTT	2	10	8676	8685	20 %	40 %	0 %	40 %	11497097
6	NC_000948	CAAAA	2	10	9480	9489	80 %	0 %	0 %	20 %	11497099
7	NC_000948	GAAAA	2	10	10346	10355	80 %	0 %	20 %	0 %	11497100
8	NC_000948	AATCT	2	10	12262	12271	40 %	40 %	0 %	20 %	11497102
9	NC_000948	CAAAC	2	10	12314	12323	60 %	0 %	0 %	40 %	11497102
10	NC_000948	GGACT	2	10	12636	12645	20 %	20 %	40 %	20 %	11497069
11	NC_000948	TACTT	2	10	13279	13288	20 %	60 %	0 %	20 %	11497070
12	NC_000948	GAAAA	2	10	13357	13366	80 %	0 %	20 %	0 %	11497070
13	NC_000948	AAAGT	2	10	13379	13388	60 %	20 %	20 %	0 %	11497070
14	NC_000948	ATTAA	2	10	15224	15233	60 %	40 %	0 %	0 %	11497073
15	NC_000948	AGTAA	2	10	15861	15870	60 %	20 %	20 %	0 %	11497075
16	NC_000948	TCACT	2	10	16018	16027	20 %	40 %	0 %	40 %	11497075
17	NC_000948	TTGTT	2	10	16115	16124	0 %	80 %	20 %	0 %	364556430
18	NC_000948	TAAAA	2	10	17507	17516	80 %	20 %	0 %	0 %	11497078
19	NC_000948	GATTT	2	10	21436	21445	20 %	60 %	20 %	0 %	11497082
20	NC_000948	ATTTT	2	10	21487	21496	20 %	80 %	0 %	0 %	11497082
21	NC_000948	CAAAA	2	10	21949	21958	80 %	0 %	0 %	20 %	364556431
22	NC_000948	TTTTG	2	10	22217	22226	0 %	80 %	20 %	0 %	11497084
23	NC_000948	GAGTT	2	10	24174	24183	20 %	40 %	40 %	0 %	11497085
24	NC_000948	ATAAA	2	10	24619	24628	80 %	20 %	0 %	0 %	11497086
25	NC_000948	ATTTT	2	10	25719	25728	20 %	80 %	0 %	0 %	11497087
26	NC_000948	AGCAA	2	10	26329	26338	60 %	0 %	20 %	20 %	364556426
27	NC_000948	AAGAA	2	10	26441	26450	80 %	0 %	20 %	0 %	364556426
28	NC_000948	ATAAA	2	10	26995	27004	80 %	20 %	0 %	0 %	11497062
29	NC_000948	GAAAA	2	10	28334	28343	80 %	0 %	20 %	0 %	364556432
30	NC_000948	ATTTT	2	10	28539	28548	20 %	80 %	0 %	0 %	364556432

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.