MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-1

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000948	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497090
2	NC_000948	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497090
3	NC_000948	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	11497091
4	NC_000948	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	11497091
5	NC_000948	AAAG	2	8	2379	2386	75 %	0 %	25 %	0 %	11497092
6	NC_000948	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	11497092
7	NC_000948	TGCT	2	8	2528	2535	0 %	50 %	25 %	25 %	11497092
8	NC_000948	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	11497093
9	NC_000948	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	11497093
10	NC_000948	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	11497093
11	NC_000948	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	11497093
12	NC_000948	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	364556427
13	NC_000948	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	364556427
14	NC_000948	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	364556428
15	NC_000948	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	364556428
16	NC_000948	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	11497067
17	NC_000948	AGAA	2	8	7216	7223	75 %	0 %	25 %	0 %	11497095
18	NC_000948	GCTG	2	8	7330	7337	0 %	25 %	50 %	25 %	11497095
19	NC_000948	ATTT	2	8	8493	8500	25 %	75 %	0 %	0 %	11497097
20	NC_000948	TGAG	2	8	8597	8604	25 %	25 %	50 %	0 %	11497097
21	NC_000948	CTTG	2	8	8795	8802	0 %	50 %	25 %	25 %	11497098
22	NC_000948	AATT	2	8	8941	8948	50 %	50 %	0 %	0 %	11497098
23	NC_000948	CAAG	2	8	9610	9617	50 %	0 %	25 %	25 %	11497099
24	NC_000948	TAAT	2	8	10088	10095	50 %	50 %	0 %	0 %	11497099
25	NC_000948	TGGA	2	8	10155	10162	25 %	25 %	50 %	0 %	11497099
26	NC_000948	AGAA	2	8	10386	10393	75 %	0 %	25 %	0 %	11497100
27	NC_000948	GGCA	2	8	11362	11369	25 %	0 %	50 %	25 %	11497101
28	NC_000948	GAAT	2	8	11945	11952	50 %	25 %	25 %	0 %	11497102
29	NC_000948	TCAA	2	8	12168	12175	50 %	25 %	0 %	25 %	11497102
30	NC_000948	AATT	2	8	12432	12439	50 %	50 %	0 %	0 %	11497102
31	NC_000948	GTTT	2	8	12452	12459	0 %	75 %	25 %	0 %	11497102
32	NC_000948	TAAT	2	8	12993	13000	50 %	50 %	0 %	0 %	11497070
33	NC_000948	AGAT	2	8	13672	13679	50 %	25 %	25 %	0 %	11497070
34	NC_000948	TATC	2	8	13884	13891	25 %	50 %	0 %	25 %	11497071
35	NC_000948	AAAC	2	8	14076	14083	75 %	0 %	0 %	25 %	11497071
36	NC_000948	ATTT	2	8	14092	14099	25 %	75 %	0 %	0 %	11497071
37	NC_000948	ATTA	2	8	14611	14618	50 %	50 %	0 %	0 %	11497072
38	NC_000948	TACA	2	8	15007	15014	50 %	25 %	0 %	25 %	11497072
39	NC_000948	AATA	2	8	15616	15623	75 %	25 %	0 %	0 %	11497074
40	NC_000948	TCAA	2	8	15651	15658	50 %	25 %	0 %	25 %	11497074
41	NC_000948	AGGA	2	8	15723	15730	50 %	0 %	50 %	0 %	11497074
42	NC_000948	CTAT	2	8	15735	15742	25 %	50 %	0 %	25 %	11497074
43	NC_000948	TAAC	2	8	15805	15812	50 %	25 %	0 %	25 %	11497075
44	NC_000948	TAAT	2	8	16575	16582	50 %	50 %	0 %	0 %	11497077
45	NC_000948	ATTT	2	8	16890	16897	25 %	75 %	0 %	0 %	11497077
46	NC_000948	TTTC	2	8	16973	16980	0 %	75 %	0 %	25 %	11497077
47	NC_000948	CAAA	2	8	17591	17598	75 %	0 %	0 %	25 %	11497078
48	NC_000948	CTTG	2	8	18215	18222	0 %	50 %	25 %	25 %	11497079
49	NC_000948	AAGA	3	12	19568	19579	75 %	0 %	25 %	0 %	11497080
50	NC_000948	AAAT	2	8	19722	19729	75 %	25 %	0 %	0 %	11497080
51	NC_000948	TAAA	2	8	19748	19755	75 %	25 %	0 %	0 %	11497080
52	NC_000948	AGAA	2	8	19808	19815	75 %	0 %	25 %	0 %	11497080
53	NC_000948	TTGA	2	8	20305	20312	25 %	50 %	25 %	0 %	11497081
54	NC_000948	AAAT	2	8	20537	20544	75 %	25 %	0 %	0 %	11497081
55	NC_000948	TTTA	2	8	20682	20689	25 %	75 %	0 %	0 %	11497081
56	NC_000948	ATTA	2	8	21554	21561	50 %	50 %	0 %	0 %	364556431
57	NC_000948	AAAG	2	8	21993	22000	75 %	0 %	25 %	0 %	364556431
58	NC_000948	AGAT	2	8	22321	22328	50 %	25 %	25 %	0 %	11497084
59	NC_000948	ATAG	2	8	22551	22558	50 %	25 %	25 %	0 %	11497084
60	NC_000948	AGAT	2	8	22624	22631	50 %	25 %	25 %	0 %	11497084
61	NC_000948	TAAG	2	8	23370	23377	50 %	25 %	25 %	0 %	11497085
62	NC_000948	AAAC	2	8	23455	23462	75 %	0 %	0 %	25 %	11497085
63	NC_000948	AATC	2	8	24242	24249	50 %	25 %	0 %	25 %	11497085
64	NC_000948	AGAT	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	11497085
65	NC_000948	TAAA	2	8	25204	25211	75 %	25 %	0 %	0 %	11497087
66	NC_000948	ACCA	2	8	25573	25580	50 %	0 %	0 %	50 %	11497087
67	NC_000948	AAAC	2	8	27230	27237	75 %	0 %	0 %	25 %	11497062
68	NC_000948	AAGA	2	8	27313	27320	75 %	0 %	25 %	0 %	11497062
69	NC_000948	AAGA	2	8	27340	27347	75 %	0 %	25 %	0 %	11497062
70	NC_000948	TAGA	2	8	27568	27575	50 %	25 %	25 %	0 %	11497062
71	NC_000948	AAGG	2	8	28389	28396	50 %	0 %	50 %	0 %	364556432
72	NC_000948	TTTG	2	8	28455	28462	0 %	75 %	25 %	0 %	364556432
73	NC_000948	ATGA	2	8	28596	28603	50 %	25 %	25 %	0 %	364556432
74	NC_000948	TAAA	2	8	29205	29212	75 %	25 %	0 %	0 %	11497089
75	NC_000948	CAAG	2	8	29230	29237	50 %	0 %	25 %	25 %	11497089
76	NC_000948	AATT	2	8	29251	29258	50 %	50 %	0 %	0 %	11497089
77	NC_000948	CAAA	2	8	29410	29417	75 %	0 %	0 %	25 %	11497063
78	NC_000948	AAAT	2	8	29448	29455	75 %	25 %	0 %	0 %	11497063
79	NC_000948	AATT	2	8	29499	29506	50 %	50 %	0 %	0 %	11497063
80	NC_000948	TGAT	2	8	29813	29820	25 %	50 %	25 %	0 %	11497063
81	NC_000948	AGCA	2	8	30174	30181	50 %	0 %	25 %	25 %	11497063
82	NC_000948	AAAT	2	8	30200	30207	75 %	25 %	0 %	0 %	11497063

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.