MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1050

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187142	TTTTA	2	10	107	116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187142	AGAAT	2	10	401	410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187142	TTGTA	2	10	808	817	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187142	ACTTT	2	10	1422	1431	20 %	60 %	0 %	20 %	426202359
5	NT_187142	AAAAT	2	10	1653	1662	80 %	20 %	0 %	0 %	426202359
6	NT_187142	TTGTT	2	10	1779	1788	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187142	TCAGT	2	10	2101	2110	20 %	40 %	20 %	20 %	426202360
8	NT_187142	GAATT	2	10	2130	2139	40 %	40 %	20 %	0 %	426202360
9	NT_187142	ACTTA	2	10	3584	3593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NT_187142	AGTTC	2	10	3825	3834	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NT_187142	ATATT	2	10	7818	7827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187142	AATTT	2	10	9061	9070	40 %	60 %	0 %	0 %	426202365
13	NT_187142	TCTTT	2	10	9520	9529	0 %	80 %	0 %	20 %	426202366
14	NT_187142	TTTTG	2	10	9572	9581	0 %	80 %	20 %	0 %	426202366
15	NT_187142	CTTTT	2	10	9736	9745	0 %	80 %	0 %	20 %	426202366
16	NT_187142	TTTTA	2	10	11032	11041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187142	GATAA	2	10	12168	12177	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187142	TTTAA	2	10	13120	13129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187142	CAACA	2	10	13350	13359	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NT_187142	TTTCC	2	10	14167	14176	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NT_187142	GATTT	2	10	23750	23759	20 %	60 %	20 %	0 %	426202371

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.