MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1050

Total Repeats: 393

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187142	GGT	2	6	80	85	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187142	AAG	2	6	179	184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187142	ATA	2	6	318	323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187142	TAA	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187142	TAC	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187142	TCT	2	6	376	381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187142	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187142	TAA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187142	ATG	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187142	CTT	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187142	ATT	2	6	1209	1214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187142	TCA	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202359
13	NT_187142	TTA	2	6	1458	1463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202359
14	NT_187142	TCA	2	6	1464	1469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202359
15	NT_187142	TGT	2	6	1562	1567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202359
16	NT_187142	ACT	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202359
17	NT_187142	TAG	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202359
18	NT_187142	TAA	2	6	1643	1648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202359
19	NT_187142	TGT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187142	AAG	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202360
21	NT_187142	TGA	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202360
22	NT_187142	TGT	2	6	1879	1884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202360
23	NT_187142	GAG	2	6	1976	1981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202360
24	NT_187142	AGA	2	6	2206	2211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202360
25	NT_187142	ATA	2	6	2229	2234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202360
26	NT_187142	ATA	2	6	2244	2249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202360
27	NT_187142	GAA	2	6	2285	2290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202360
28	NT_187142	AAG	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202360
29	NT_187142	TAT	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202360
30	NT_187142	AGC	2	6	2516	2521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187142	AAT	3	9	2595	2603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187142	GGT	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187142	AAT	2	6	2715	2720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187142	CAT	2	6	2827	2832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187142	TGG	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187142	TAT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187142	ACA	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187142	TTA	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187142	AAG	2	6	3139	3144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187142	ATA	2	6	3302	3307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187142	TAT	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187142	ACT	2	6	3383	3388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187142	TAT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187142	AAT	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187142	AAG	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187142	TAA	3	9	3606	3614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187142	TTA	2	6	3632	3637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187142	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187142	TAG	2	6	4083	4088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187142	AGT	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187142	AGA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187142	AAT	2	6	4267	4272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187142	TTA	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187142	ACA	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187142	AAT	3	9	4661	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202361
56	NT_187142	TAA	2	6	4697	4702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202361
57	NT_187142	GCA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202361
58	NT_187142	AAG	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202361
59	NT_187142	ATG	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202361
60	NT_187142	GTA	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202361
61	NT_187142	ACA	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202361
62	NT_187142	TGA	3	9	5102	5110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202361
63	NT_187142	ATA	2	6	5134	5139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202361
64	NT_187142	AGT	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187142	TAT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187142	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187142	AAT	2	6	5513	5518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187142	AAT	2	6	5579	5584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187142	AAT	3	9	5683	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202362
70	NT_187142	TAA	2	6	5719	5724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202362
71	NT_187142	GCA	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202362
72	NT_187142	AAG	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202362
73	NT_187142	AGA	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202362
74	NT_187142	CTG	2	6	6045	6050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202362
75	NT_187142	GTG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202362
76	NT_187142	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202362
77	NT_187142	TGA	2	6	6124	6129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202362
78	NT_187142	AGC	2	6	6139	6144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202362
79	NT_187142	CTA	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202362
80	NT_187142	CAG	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202362
81	NT_187142	AAG	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187142	TTA	2	6	6332	6337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187142	TTA	2	6	6347	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187142	AAG	2	6	6395	6400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187142	AAT	2	6	6535	6540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187142	AAT	2	6	6601	6606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187142	AAT	3	9	6705	6713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202363
88	NT_187142	TAA	2	6	6741	6746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202363
89	NT_187142	GCA	2	6	6847	6852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202363
90	NT_187142	AAG	2	6	6860	6865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202363
91	NT_187142	TGC	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202363
92	NT_187142	GAT	2	6	6940	6945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202363
93	NT_187142	GTA	2	6	6953	6958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202363
94	NT_187142	GCT	2	6	7147	7152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202363
95	NT_187142	GTT	2	6	7248	7253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202363
96	NT_187142	AAT	2	6	7346	7351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187142	ATT	2	6	7358	7363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187142	ATT	2	6	7370	7375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187142	AGG	2	6	7452	7457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187142	TTA	2	6	7703	7708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187142	AAC	2	6	7860	7865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202364
102	NT_187142	ACA	2	6	7876	7881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202364
103	NT_187142	TGC	2	6	7927	7932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202364
104	NT_187142	ATA	2	6	8112	8117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202364
105	NT_187142	TTG	2	6	8319	8324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187142	AGA	2	6	8438	8443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187142	ATT	2	6	8534	8539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187142	ATG	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187142	TTC	2	6	8689	8694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187142	TGT	2	6	8729	8734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187142	TTG	2	6	8874	8879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202365
112	NT_187142	CTT	2	6	8908	8913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202365
113	NT_187142	CAT	2	6	9031	9036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202365
114	NT_187142	AAG	2	6	9051	9056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202365
115	NT_187142	CTT	2	6	9121	9126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202365
116	NT_187142	GTC	2	6	9143	9148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202365
117	NT_187142	ATT	2	6	9207	9212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202365
118	NT_187142	TAA	2	6	9215	9220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202365
119	NT_187142	ATT	2	6	9222	9227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202365
120	NT_187142	TAA	2	6	9238	9243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202365
121	NT_187142	TTA	2	6	9362	9367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202366
122	NT_187142	TTG	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202366
123	NT_187142	GAA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202366
124	NT_187142	CAT	2	6	9444	9449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202366
125	NT_187142	AAG	2	6	9533	9538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202366
126	NT_187142	ATC	2	6	9715	9720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202366
127	NT_187142	TCA	2	6	9749	9754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202366
128	NT_187142	ATT	2	6	9769	9774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202366
129	NT_187142	CTA	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202366
130	NT_187142	CAA	2	6	9842	9847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202366
131	NT_187142	AAT	2	6	9851	9856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202366
132	NT_187142	ATT	3	9	9985	9993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187142	TAG	2	6	10004	10009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187142	TAA	2	6	10059	10064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187142	AAT	3	9	10101	10109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202367
136	NT_187142	TAA	2	6	10137	10142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202367
137	NT_187142	CGA	2	6	10164	10169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202367
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.