MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1050

Total Repeats: 624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187142	TAC	2	6	19200	19205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202369
502	NT_187142	ATAA	2	8	19220	19227	75 %	25 %	0 %	0 %	426202369
503	NT_187142	ATT	3	9	19232	19240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202369
504	NT_187142	T	7	7	19260	19266	0 %	100 %	0 %	0 %	426202369
505	NT_187142	CCT	2	6	19272	19277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NT_187142	GCATTA	2	12	19288	19299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
507	NT_187142	TCA	2	6	19300	19305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NT_187142	TAA	2	6	19320	19325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NT_187142	TTA	2	6	19363	19368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NT_187142	TAG	5	15	19371	19385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NT_187142	CTT	2	6	19443	19448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NT_187142	T	8	8	19473	19480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NT_187142	CTG	2	6	19527	19532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NT_187142	ACC	2	6	19588	19593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NT_187142	AGC	2	6	19654	19659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NT_187142	TAG	2	6	19662	19667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NT_187142	GCT	2	6	19748	19753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NT_187142	T	7	7	19753	19759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NT_187142	AGC	2	6	19783	19788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NT_187142	CAC	2	6	19809	19814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NT_187142	ATT	2	6	19819	19824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NT_187142	T	6	6	19849	19854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NT_187142	CTTC	2	8	19874	19881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NT_187142	TAG	2	6	19962	19967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NT_187142	TAT	2	6	20032	20037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NT_187142	TAT	2	6	20049	20054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NT_187142	TTA	2	6	20129	20134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NT_187142	ATG	2	6	20245	20250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NT_187142	A	6	6	20262	20267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NT_187142	ATAA	2	8	20352	20359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NT_187142	ATT	3	9	20364	20372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NT_187142	T	7	7	20392	20398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NT_187142	CCT	2	6	20404	20409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NT_187142	GTA	2	6	20483	20488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NT_187142	TTA	2	6	20493	20498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NT_187142	CTT	2	6	20572	20577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NT_187142	TAA	2	6	20630	20635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NT_187142	TAC	2	6	20643	20648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NT_187142	AAC	2	6	20669	20674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NT_187142	AGCATC	2	12	20681	20692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NT_187142	TAT	2	6	20717	20722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NT_187142	CAT	2	6	20778	20783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NT_187142	AGC	2	6	20800	20805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NT_187142	CTT	2	6	20893	20898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NT_187142	TAC	2	6	20935	20940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NT_187142	GGT	2	6	21020	21025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NT_187142	TGG	2	6	21055	21060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NT_187142	AGC	3	9	21061	21069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NT_187142	GAA	2	6	21074	21079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NT_187142	ATT	2	6	21095	21100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NT_187142	A	7	7	21110	21116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NT_187142	TAT	2	6	21211	21216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NT_187142	TGC	2	6	21226	21231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NT_187142	G	8	8	21233	21240	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
555	NT_187142	AAT	2	6	21340	21345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NT_187142	AAG	2	6	21381	21386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NT_187142	ACT	2	6	21413	21418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NT_187142	CAAC	2	8	21449	21456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NT_187142	TAAA	2	8	21460	21467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NT_187142	TCA	2	6	21468	21473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NT_187142	CTT	3	9	21506	21514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NT_187142	AGG	2	6	21585	21590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NT_187142	A	6	6	21596	21601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NT_187142	AAT	3	9	21621	21629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NT_187142	TTTA	2	8	21633	21640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NT_187142	TAA	2	6	21647	21652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NT_187142	TA	3	6	21699	21704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NT_187142	GAA	2	6	21728	21733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NT_187142	AGC	2	6	21745	21750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NT_187142	T	7	7	21786	21792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NT_187142	TTG	2	6	21800	21805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NT_187142	TGC	2	6	21816	21821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NT_187142	TAA	2	6	21822	21827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NT_187142	TGA	2	6	21868	21873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NT_187142	ATA	2	6	21874	21879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NT_187142	A	7	7	21931	21937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NT_187142	GTT	3	9	21960	21968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NT_187142	GAA	2	6	22002	22007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NT_187142	TA	3	6	22081	22086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NT_187142	TG	3	6	22098	22103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NT_187142	TAG	2	6	22137	22142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NT_187142	AATA	2	8	22167	22174	75 %	25 %	0 %	0 %	426202370
583	NT_187142	TAA	2	6	22189	22194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202370
584	NT_187142	ATA	2	6	22214	22219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202370
585	NT_187142	TAT	2	6	22284	22289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202370
586	NT_187142	TGT	2	6	22326	22331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202370
587	NT_187142	TAT	2	6	22338	22343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202370
588	NT_187142	ATT	2	6	22456	22461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202370
589	NT_187142	ATT	2	6	22543	22548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202370
590	NT_187142	ATT	2	6	22630	22635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202370
591	NT_187142	ATT	2	6	22717	22722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202370
592	NT_187142	GCTT	2	8	22771	22778	0 %	50 %	25 %	25 %	426202370
593	NT_187142	AGT	2	6	22804	22809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202370
594	NT_187142	TAAG	2	8	22832	22839	50 %	25 %	25 %	0 %	426202370
595	NT_187142	ATA	2	6	22849	22854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202370
596	NT_187142	TTG	2	6	22921	22926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202370
597	NT_187142	TAT	2	6	22970	22975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NT_187142	GA	3	6	23001	23006	50 %	0 %	50 %	0 %	426202371
599	NT_187142	GTT	2	6	23010	23015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202371
600	NT_187142	TAAT	2	8	23039	23046	50 %	50 %	0 %	0 %	426202371
601	NT_187142	GTT	2	6	23052	23057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202371
602	NT_187142	TAT	2	6	23109	23114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202371
603	NT_187142	TAT	2	6	23160	23165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202371
604	NT_187142	GTAT	2	8	23195	23202	25 %	50 %	25 %	0 %	426202371
605	NT_187142	TAA	2	6	23223	23228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202371
606	NT_187142	AGT	2	6	23257	23262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202371
607	NT_187142	T	6	6	23333	23338	0 %	100 %	0 %	0 %	426202371
608	NT_187142	GGA	2	6	23344	23349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202371
609	NT_187142	T	6	6	23410	23415	0 %	100 %	0 %	0 %	426202371
610	NT_187142	CAAG	2	8	23435	23442	50 %	0 %	25 %	25 %	426202371
611	NT_187142	TAG	2	6	23445	23450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202371
612	NT_187142	T	6	6	23459	23464	0 %	100 %	0 %	0 %	426202371
613	NT_187142	AGA	2	6	23530	23535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202371
614	NT_187142	ATA	2	6	23549	23554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202371
615	NT_187142	AG	3	6	23617	23622	50 %	0 %	50 %	0 %	426202371
616	NT_187142	AAT	2	6	23667	23672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202371
617	NT_187142	AGAA	2	8	23679	23686	75 %	0 %	25 %	0 %	426202371
618	NT_187142	ATTT	2	8	23701	23708	25 %	75 %	0 %	0 %	426202371
619	NT_187142	GTA	2	6	23720	23725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202371
620	NT_187142	TAA	2	6	23736	23741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202371
621	NT_187142	T	6	6	23743	23748	0 %	100 %	0 %	0 %	426202371
622	NT_187142	GATTT	2	10	23750	23759	20 %	60 %	20 %	0 %	426202371
623	NT_187142	T	6	6	23771	23776	0 %	100 %	0 %	0 %	426202371
624	NT_187142	AT	4	8	23797	23804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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