MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047L

Total Repeats: 352

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187140	TTG	2	6	131	136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187140	TAA	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187140	AAG	2	6	284	289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187140	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187140	AGA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187140	TGA	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187140	TTA	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187140	AGA	2	6	457	462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187140	TTC	2	6	474	479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187140	GGA	2	6	491	496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187140	TAT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187140	CAA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187140	ATT	2	6	612	617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187140	AGA	2	6	619	624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187140	ATT	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187140	AGA	2	6	735	740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187140	ATA	2	6	944	949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187140	ACC	2	6	987	992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NT_187140	TTA	2	6	1010	1015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
20	NT_187140	TCA	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202341
21	NT_187140	ATA	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
22	NT_187140	ATA	2	6	1220	1225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
23	NT_187140	TTC	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202341
24	NT_187140	ATA	2	6	1307	1312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
25	NT_187140	TTA	2	6	1329	1334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
26	NT_187140	CTT	2	6	1383	1388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202341
27	NT_187140	ATA	2	6	1392	1397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
28	NT_187140	TTA	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
29	NT_187140	TTA	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
30	NT_187140	ACT	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202341
31	NT_187140	TTC	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187140	TCA	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187140	TAT	2	6	1806	1811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187140	TAT	2	6	1821	1826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187140	TAT	2	6	1833	1838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187140	AGT	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187140	TAA	2	6	2050	2055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187140	TAA	2	6	2064	2069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187140	TGT	2	6	2076	2081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187140	ATT	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187140	CTA	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187140	TAA	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187140	AGT	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187140	TAG	2	6	2646	2651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187140	TTC	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187140	TGT	2	6	2838	2843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187140	ATC	2	6	2945	2950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187140	ATC	2	6	2999	3004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187140	TAT	3	9	3022	3030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187140	TTA	2	6	3039	3044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187140	TTC	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187140	ATC	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187140	CAT	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187140	TTC	2	6	3252	3257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187140	GTA	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187140	TTA	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187140	TGG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187140	GTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187140	TTA	2	6	3529	3534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187140	TCA	2	6	3583	3588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187140	TAG	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187140	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187140	TAA	2	6	3850	3855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187140	CTA	3	9	3994	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187140	ATA	2	6	4021	4026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187140	AAT	3	9	4166	4174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187140	TAA	2	6	4202	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187140	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187140	ACT	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187140	GCA	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187140	AAG	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187140	TCT	2	6	4408	4413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187140	CGG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187140	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187140	TTA	2	6	4561	4566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187140	CAG	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187140	TGA	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187140	GTT	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187140	GCT	2	6	4702	4707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187140	TGC	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187140	AGT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187140	TAT	2	6	4788	4793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187140	TAA	2	6	5000	5005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187140	ATA	2	6	5032	5037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187140	CAG	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187140	AAG	2	6	5179	5184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187140	ATA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187140	CTG	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187140	GTT	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187140	GTT	2	6	5570	5575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187140	GCT	2	6	5580	5585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187140	GCA	3	9	5589	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187140	AGT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187140	TAT	2	6	5666	5671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187140	TGA	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187140	AGG	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187140	AAT	3	9	5844	5852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187140	CAT	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187140	TTG	2	6	6078	6083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187140	TGA	2	6	6160	6165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187140	TGC	2	6	6232	6237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187140	GTT	2	6	6254	6259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187140	GAA	2	6	6263	6268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187140	GTA	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187140	TAA	2	6	6385	6390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187140	AGC	2	6	6397	6402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187140	GTT	2	6	6406	6411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187140	TGC	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187140	GCA	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187140	AAT	2	6	6548	6553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187140	TGA	2	6	6565	6570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187140	AGG	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187140	TGG	2	6	6646	6651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187140	GGT	2	6	6659	6664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187140	ATG	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187140	TGC	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187140	AAG	2	6	6780	6785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187140	CTA	3	9	6843	6851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187140	ATT	2	6	6866	6871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187140	ATA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187140	TGA	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187140	ATA	2	6	6976	6981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187140	TAA	2	6	7011	7016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187140	CAA	2	6	7118	7123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187140	AAG	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187140	TGA	2	6	7158	7163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187140	TGA	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187140	AAG	2	6	7403	7408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187140	GAC	2	6	7417	7422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187140	AGC	2	6	7431	7436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187140	ATA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187140	GCA	2	6	7495	7500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187140	TTA	2	6	7510	7515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187140	TGC	2	6	7527	7532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NT_187140	AGT	2	6	7619	7624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187140	AAT	2	6	7828	7833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187140	TAA	3	9	7892	7900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187140	AAT	3	9	7997	8005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202342
139	NT_187140	TAA	2	6	8033	8038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202342
140	NT_187140	GCA	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202342
141	NT_187140	AAG	2	6	8152	8157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202342
142	NT_187140	TGA	2	6	8180	8185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202342
143	NT_187140	ATG	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202342
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274	NT_187140	TAG	2	6	16421	16426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NT_187140	CAC	2	6	16537	16542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
276	NT_187140	CAT	2	6	16608	16613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NT_187140	AAT	3	9	16740	16748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202347
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352	NT_187140	TAA	2	6	21797	21802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202349

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.