MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047L

Total Repeats: 593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187140	TAAA	2	8	18461	18468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NT_187140	CTT	2	6	18508	18513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NT_187140	AAGGG	2	10	18526	18535	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
504	NT_187140	TTTTA	2	10	18549	18558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NT_187140	A	7	7	18558	18564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NT_187140	TAA	2	6	18569	18574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NT_187140	ACA	2	6	18587	18592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NT_187140	A	6	6	18640	18645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NT_187140	TTA	2	6	18757	18762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NT_187140	AAG	2	6	18804	18809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NT_187140	TACT	2	8	18853	18860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NT_187140	AGT	2	6	18909	18914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NT_187140	AAAT	2	8	18940	18947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NT_187140	TAT	2	6	18954	18959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NT_187140	ATATT	2	10	19041	19050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NT_187140	T	7	7	19067	19073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NT_187140	T	6	6	19196	19201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NT_187140	AGA	2	6	19225	19230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NT_187140	TTTTTA	2	12	19243	19254	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NT_187140	T	8	8	19257	19264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NT_187140	AAT	2	6	19291	19296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NT_187140	AAT	2	6	19327	19332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NT_187140	ATT	2	6	19347	19352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NT_187140	TAAAT	2	10	19362	19371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NT_187140	TA	3	6	19374	19379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NT_187140	ATAA	2	8	19383	19390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NT_187140	TTATT	2	10	19391	19400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NT_187140	AAT	2	6	19416	19421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NT_187140	AGG	2	6	19440	19445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NT_187140	GAA	2	6	19453	19458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
531	NT_187140	GTAT	2	8	19472	19479	25 %	50 %	25 %	0 %	426202348
532	NT_187140	TGTT	2	8	19493	19500	0 %	75 %	25 %	0 %	426202348
533	NT_187140	A	8	8	19568	19575	100 %	0 %	0 %	0 %	426202348
534	NT_187140	TA	3	6	19589	19594	50 %	50 %	0 %	0 %	426202348
535	NT_187140	AAG	2	6	19614	19619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
536	NT_187140	ATA	2	6	19658	19663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202348
537	NT_187140	CAA	2	6	19664	19669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202348
538	NT_187140	CAA	2	6	19721	19726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202348
539	NT_187140	ATATT	2	10	19735	19744	40 %	60 %	0 %	0 %	426202348
540	NT_187140	AAG	2	6	19746	19751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
541	NT_187140	AGA	2	6	19768	19773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
542	NT_187140	AGA	2	6	19795	19800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
543	NT_187140	GAAGCA	2	12	19805	19816	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	426202348
544	NT_187140	AATT	2	8	19863	19870	50 %	50 %	0 %	0 %	426202348
545	NT_187140	AGAT	2	8	19891	19898	50 %	25 %	25 %	0 %	426202348
546	NT_187140	A	6	6	19935	19940	100 %	0 %	0 %	0 %	426202348
547	NT_187140	GAG	2	6	20030	20035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202348
548	NT_187140	GAA	2	6	20111	20116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
549	NT_187140	A	6	6	20121	20126	100 %	0 %	0 %	0 %	426202348
550	NT_187140	AAG	2	6	20133	20138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
551	NT_187140	AG	3	6	20155	20160	50 %	0 %	50 %	0 %	426202348
552	NT_187140	AGA	2	6	20186	20191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
553	NT_187140	ACG	2	6	20230	20235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202348
554	NT_187140	TCT	3	9	20267	20275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202348
555	NT_187140	AAT	2	6	20281	20286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202348
556	NT_187140	T	8	8	20339	20346	0 %	100 %	0 %	0 %	426202348
557	NT_187140	AGATAG	2	12	20360	20371	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	426202348
558	NT_187140	AAG	2	6	20406	20411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NT_187140	CT	3	6	20430	20435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NT_187140	TAAA	2	8	20447	20454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NT_187140	AAT	2	6	20463	20468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NT_187140	ATTT	2	8	20491	20498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NT_187140	T	7	7	20496	20502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NT_187140	ATT	2	6	20523	20528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NT_187140	TAT	3	9	20564	20572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NT_187140	AAT	2	6	20575	20580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NT_187140	A	6	6	20624	20629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NT_187140	GA	3	6	20630	20635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NT_187140	AAT	2	6	20667	20672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NT_187140	TA	4	8	20681	20688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NT_187140	TTAT	2	8	20704	20711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NT_187140	TTTAA	2	10	20726	20735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NT_187140	AGT	2	6	20772	20777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202349
574	NT_187140	TTC	2	6	20800	20805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
575	NT_187140	ACTT	2	8	20880	20887	25 %	50 %	0 %	25 %	426202349
576	NT_187140	GCAA	2	8	20896	20903	50 %	0 %	25 %	25 %	426202349
577	NT_187140	TTC	2	6	21015	21020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
578	NT_187140	TCT	2	6	21046	21051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
579	NT_187140	TTA	2	6	21064	21069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202349
580	NT_187140	TTC	2	6	21205	21210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
581	NT_187140	CTT	2	6	21266	21271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
582	NT_187140	TCGTCT	2	12	21274	21285	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	426202349
583	NT_187140	GTT	2	6	21339	21344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202349
584	NT_187140	GAT	2	6	21450	21455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202349
585	NT_187140	TAAT	2	8	21517	21524	50 %	50 %	0 %	0 %	426202349
586	NT_187140	T	6	6	21591	21596	0 %	100 %	0 %	0 %	426202349
587	NT_187140	T	7	7	21630	21636	0 %	100 %	0 %	0 %	426202349
588	NT_187140	T	6	6	21649	21654	0 %	100 %	0 %	0 %	426202349
589	NT_187140	TGA	2	6	21679	21684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202349
590	NT_187140	TAA	2	6	21797	21802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202349
591	NT_187140	AAGCTT	2	12	21814	21825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426202349
592	NT_187140	AT	3	6	21847	21852	50 %	50 %	0 %	0 %	426202349
593	NT_187140	TC	3	6	21859	21864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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