MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment c

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167352	ACT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679247
2	NT_167352	TAA	2	6	301	306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
3	NT_167352	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679247
4	NT_167352	AAT	3	9	342	350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
5	NT_167352	ATA	2	6	620	625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
6	NT_167352	TTC	2	6	692	697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_167352	AAT	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_167352	TAT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167352	TAT	3	9	1200	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_167352	GTA	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167352	AAT	2	6	1243	1248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_167352	AAT	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167352	ATC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679249
14	NT_167352	TAT	2	6	1744	1749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679249
15	NT_167352	AAT	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679249
16	NT_167352	TAT	2	6	1912	1917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167352	CTT	2	6	1918	1923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_167352	GAA	2	6	1931	1936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167352	AAT	3	9	1945	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167352	TAT	2	6	1960	1965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167352	ATA	2	6	2044	2049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_167352	TTC	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_167352	TTA	2	6	2171	2176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_167352	TTA	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_167352	CTA	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_167352	ATT	2	6	2527	2532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_167352	TAT	2	6	2612	2617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
28	NT_167352	TAT	2	6	2635	2640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
29	NT_167352	TTC	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679250
30	NT_167352	TAC	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679250
31	NT_167352	AGA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
32	NT_167352	TAG	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679250
33	NT_167352	TAA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
34	NT_167352	AGA	2	6	2853	2858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
35	NT_167352	CTC	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679250
36	NT_167352	AAT	2	6	2922	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
37	NT_167352	ATA	2	6	2980	2985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
38	NT_167352	ATT	2	6	3047	3052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
39	NT_167352	GAG	3	9	3070	3078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679250
40	NT_167352	AGA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
41	NT_167352	AGA	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
42	NT_167352	GAA	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
43	NT_167352	GAA	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
44	NT_167352	AGA	3	9	3191	3199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
45	NT_167352	AAT	2	6	3279	3284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_167352	AAG	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_167352	TAT	2	6	3347	3352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_167352	TAA	2	6	3357	3362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_167352	CTA	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_167352	GAA	2	6	3420	3425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_167352	TAT	2	6	3431	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_167352	AAG	2	6	3552	3557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_167352	ATA	2	6	3797	3802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_167352	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_167352	TTA	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_167352	GTA	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_167352	TTC	2	6	4128	4133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_167352	CTT	2	6	4143	4148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_167352	TTA	2	6	4255	4260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679252
60	NT_167352	TAT	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679252
61	NT_167352	TAG	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679252
62	NT_167352	TAA	2	6	4491	4496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_167352	ATT	2	6	4537	4542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_167352	TTA	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_167352	CTT	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_167352	TTA	2	6	4766	4771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_167352	TAA	2	6	4778	4783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_167352	ATT	3	9	4791	4799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_167352	ATT	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_167352	AAT	2	6	4907	4912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_167352	ATT	2	6	4929	4934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_167352	ATG	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679253
73	NT_167352	AGA	2	6	5293	5298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679253
74	NT_167352	TAA	2	6	5406	5411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679253
75	NT_167352	TAT	2	6	5519	5524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679254
76	NT_167352	ATG	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679254
77	NT_167352	AAT	2	6	5577	5582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679254
78	NT_167352	GAA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679254
79	NT_167352	TAG	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679254
80	NT_167352	TTA	2	6	5681	5686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_167352	ACC	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NT_167352	TGT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NT_167352	ATC	2	6	5867	5872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_167352	AAT	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_167352	CAA	2	6	5932	5937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_167352	TTG	2	6	6221	6226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679255
87	NT_167352	ATT	2	6	6245	6250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679255
88	NT_167352	TCA	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679255
89	NT_167352	TCA	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679255
90	NT_167352	AAT	2	6	6527	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679255
91	NT_167352	TAT	2	6	6535	6540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679255
92	NT_167352	ATA	2	6	6543	6548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679255
93	NT_167352	TAA	3	9	6596	6604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679255
94	NT_167352	ATT	2	6	6725	6730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_167352	AAT	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.