MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment b

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167351	AAAC	2	8	17	24	75 %	0 %	0 %	25 %	294679221
2	NT_167351	TTCA	2	8	116	123	25 %	50 %	0 %	25 %	294679221
3	NT_167351	CAAT	2	8	1555	1562	50 %	25 %	0 %	25 %	294679224
4	NT_167351	TCAA	2	8	1619	1626	50 %	25 %	0 %	25 %	294679224
5	NT_167351	AAAG	2	8	1908	1915	75 %	0 %	25 %	0 %	294679224
6	NT_167351	AAAT	2	8	2142	2149	75 %	25 %	0 %	0 %	294679224
7	NT_167351	AAAC	2	8	2218	2225	75 %	0 %	0 %	25 %	294679224
8	NT_167351	AAAT	2	8	2385	2392	75 %	25 %	0 %	0 %	294679224
9	NT_167351	CAAA	2	8	2422	2429	75 %	0 %	0 %	25 %	294679224
10	NT_167351	CAAT	2	8	2458	2465	50 %	25 %	0 %	25 %	294679224
11	NT_167351	AAAT	2	8	2512	2519	75 %	25 %	0 %	0 %	294679224
12	NT_167351	TAAA	2	8	3072	3079	75 %	25 %	0 %	0 %	294679225
13	NT_167351	TAAA	2	8	3403	3410	75 %	25 %	0 %	0 %	294679226
14	NT_167351	TAAT	2	8	3667	3674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167351	AAAG	2	8	3980	3987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NT_167351	TAAT	2	8	4057	4064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167351	TATT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_167351	AGAT	2	8	4923	4930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167351	AAAT	2	8	5041	5048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167351	ACAT	2	8	5066	5073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NT_167351	TAAA	3	12	5114	5125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_167351	ATCA	2	8	5136	5143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NT_167351	TGTT	2	8	5331	5338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NT_167351	AATC	2	8	5913	5920	50 %	25 %	0 %	25 %	294679229
25	NT_167351	TTAA	2	8	6133	6140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_167351	TAAA	3	12	6211	6222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_167351	AATA	2	8	6630	6637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_167351	CATA	2	8	6726	6733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NT_167351	ATTA	2	8	6770	6777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_167351	CGAA	2	8	8717	8724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NT_167351	TTAG	2	8	9129	9136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NT_167351	AATT	2	8	9205	9212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_167351	TATT	2	8	9262	9269	25 %	75 %	0 %	0 %	294679237
34	NT_167351	TATT	2	8	9650	9657	25 %	75 %	0 %	0 %	294679237
35	NT_167351	TCTT	2	8	10386	10393	0 %	75 %	0 %	25 %	294679238
36	NT_167351	TTAA	2	8	10419	10426	50 %	50 %	0 %	0 %	294679238
37	NT_167351	TAAA	2	8	10929	10936	75 %	25 %	0 %	0 %	294679239
38	NT_167351	TGAT	2	8	10954	10961	25 %	50 %	25 %	0 %	294679239
39	NT_167351	ATTT	2	8	10989	10996	25 %	75 %	0 %	0 %	294679239
40	NT_167351	ATTT	2	8	11259	11266	25 %	75 %	0 %	0 %	294679240
41	NT_167351	ATTT	2	8	11509	11516	25 %	75 %	0 %	0 %	294679240
42	NT_167351	TTGA	2	8	11935	11942	25 %	50 %	25 %	0 %	294679240
43	NT_167351	TTTA	2	8	12475	12482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_167351	TATT	2	8	12688	12695	25 %	75 %	0 %	0 %	294679241
45	NT_167351	ATTT	2	8	12773	12780	25 %	75 %	0 %	0 %	294679241
46	NT_167351	ATTT	2	8	12877	12884	25 %	75 %	0 %	0 %	294679241
47	NT_167351	TTAT	2	8	13431	13438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_167351	CTAT	2	8	14307	14314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NT_167351	TAAA	2	8	14598	14605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_167351	ATAA	2	8	14621	14628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_167351	AAGT	2	8	14863	14870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.