MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment b

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167351	ATA	2	6	28	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679221
2	NT_167351	ATT	2	6	152	157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679221
3	NT_167351	AGC	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679221
4	NT_167351	TAA	2	6	203	208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679222
5	NT_167351	CAA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679222
6	NT_167351	TAA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_167351	TCT	2	6	472	477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_167351	ATT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167351	GTA	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_167351	TAA	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167351	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_167351	TAT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167351	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_167351	TAT	2	6	819	824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167351	TAA	2	6	953	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_167351	ATT	2	6	1019	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167351	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_167351	TGT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679223
19	NT_167351	ATT	2	6	1173	1178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167351	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167351	TTC	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_167351	TAA	2	6	1319	1324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_167351	TAT	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_167351	AGG	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NT_167351	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
26	NT_167351	TAA	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
27	NT_167351	ATT	2	6	1638	1643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679224
28	NT_167351	AAC	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679224
29	NT_167351	TAT	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679224
30	NT_167351	CTA	2	6	1720	1725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679224
31	NT_167351	TAA	2	6	1837	1842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
32	NT_167351	GAG	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679224
33	NT_167351	TAA	3	9	1873	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
34	NT_167351	ATA	2	6	1884	1889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
35	NT_167351	AAG	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679224
36	NT_167351	TAA	2	6	1924	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
37	NT_167351	CAA	2	6	1969	1974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679224
38	NT_167351	TAT	2	6	1987	1992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679224
39	NT_167351	ACA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679224
40	NT_167351	TAA	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
41	NT_167351	TAA	2	6	2245	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
42	NT_167351	TAA	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679225
43	NT_167351	ATG	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679225
44	NT_167351	ATT	2	6	2834	2839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679225
45	NT_167351	AAG	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679225
46	NT_167351	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679225
47	NT_167351	AAG	2	6	3024	3029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679225
48	NT_167351	GGA	2	6	3062	3067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679225
49	NT_167351	AAT	2	6	3099	3104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679225
50	NT_167351	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_167351	ATT	2	6	3151	3156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_167351	TAT	2	6	3230	3235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_167351	TTG	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_167351	ATA	2	6	3340	3345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679226
55	NT_167351	ATT	2	6	3359	3364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679226
56	NT_167351	TAA	2	6	3439	3444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_167351	TTG	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_167351	AGA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_167351	AAG	2	6	3585	3590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_167351	AAT	2	6	3599	3604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_167351	CTT	2	6	3605	3610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_167351	ATA	3	9	3763	3771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679227
63	NT_167351	TAA	2	6	3837	3842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_167351	AAG	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NT_167351	TAA	2	6	4037	4042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_167351	TAT	2	6	4153	4158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_167351	TAA	2	6	4229	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_167351	TCA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679228
69	NT_167351	TAG	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679228
70	NT_167351	AAC	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679228
71	NT_167351	AAT	2	6	4489	4494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679228
72	NT_167351	TTA	2	6	4540	4545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679228
73	NT_167351	ACC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679228
74	NT_167351	TAA	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679228
75	NT_167351	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679228
76	NT_167351	TTA	2	6	4799	4804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679228
77	NT_167351	ATC	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_167351	ATT	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_167351	AAT	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_167351	ATA	3	9	5083	5091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_167351	TAA	2	6	5099	5104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_167351	ATT	3	9	5207	5215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_167351	AAG	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_167351	TGA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NT_167351	AGA	2	6	5567	5572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NT_167351	ATA	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_167351	CAG	2	6	5763	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_167351	TAT	2	6	5800	5805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_167351	ATT	3	9	5899	5907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679229
90	NT_167351	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679229
91	NT_167351	GAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679229
92	NT_167351	AGG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679229
93	NT_167351	ATT	2	6	6275	6280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_167351	ATT	4	12	6355	6366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_167351	TAA	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_167351	ATT	2	6	6622	6627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_167351	ATA	2	6	6647	6652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_167351	AAT	2	6	6844	6849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_167351	AAT	2	6	6878	6883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_167351	CTA	2	6	6974	6979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_167351	ATT	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_167351	CCA	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679231
103	NT_167351	GAA	2	6	7461	7466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679231
104	NT_167351	GCT	2	6	7497	7502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679232
105	NT_167351	GAG	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679232
106	NT_167351	ATT	2	6	7659	7664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_167351	AGC	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NT_167351	ATG	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679234
109	NT_167351	CAA	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_167351	TAA	2	6	8010	8015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_167351	CTT	2	6	8031	8036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_167351	AAG	2	6	8235	8240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679235
113	NT_167351	TGA	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679235
114	NT_167351	AGA	2	6	8418	8423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679235
115	NT_167351	GAA	2	6	8518	8523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_167351	GAA	2	6	8580	8585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NT_167351	TAG	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_167351	ATT	2	6	9027	9032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_167351	AGA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NT_167351	AAT	2	6	9081	9086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_167351	GTT	2	6	9296	9301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679237
122	NT_167351	AAG	2	6	9327	9332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679237
123	NT_167351	CTT	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679237
124	NT_167351	ATC	2	6	9669	9674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679237
125	NT_167351	TTC	2	6	9729	9734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679237
126	NT_167351	CTT	2	6	9754	9759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679237
127	NT_167351	TAT	3	9	9774	9782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679237
128	NT_167351	TAA	2	6	9888	9893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679238
129	NT_167351	AAT	2	6	10055	10060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679238
130	NT_167351	ATT	2	6	10082	10087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679238
131	NT_167351	TTA	2	6	10108	10113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679238
132	NT_167351	TGA	2	6	10199	10204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679238
133	NT_167351	GGA	2	6	10212	10217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679238
134	NT_167351	AAT	2	6	10249	10254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679238
135	NT_167351	CTT	2	6	10297	10302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679238
136	NT_167351	AAC	2	6	10364	10369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679238
137	NT_167351	GAT	2	6	10438	10443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679238
138	NT_167351	TTA	2	6	10512	10517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679238
139	NT_167351	ATT	2	6	10533	10538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679238
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.