MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 128872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022659	TCGC	2	8	88798	88805	0 %	25 %	25 %	50 %	556577706
3002	NC_022659	ACG	2	6	88831	88836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577706
3003	NC_022659	ACG	2	6	88868	88873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577706
3004	NC_022659	GATC	2	8	88913	88920	25 %	25 %	25 %	25 %	556577706
3005	NC_022659	GC	4	8	88953	88960	0 %	0 %	50 %	50 %	556577706
3006	NC_022659	GC	3	6	88963	88968	0 %	0 %	50 %	50 %	556577706
3007	NC_022659	CGC	2	6	88994	88999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577706
3008	NC_022659	CGA	2	6	89013	89018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577706
3009	NC_022659	ATCGC	2	10	89044	89053	20 %	20 %	20 %	40 %	556577706
3010	NC_022659	GCC	3	9	89064	89072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577706
3011	NC_022659	CGC	2	6	89073	89078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577706
3012	NC_022659	CGA	2	6	89126	89131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577706
3013	NC_022659	TCT	2	6	89168	89173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556577706
3014	NC_022659	GCT	2	6	89196	89201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577706
3015	NC_022659	GGC	2	6	89217	89222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577706
3016	NC_022659	GGC	2	6	89224	89229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577706
3017	NC_022659	GGA	2	6	89233	89238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556577706
3018	NC_022659	GCG	2	6	89248	89253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3019	NC_022659	CG	3	6	89252	89257	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3020	NC_022659	GGC	2	6	89268	89273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3021	NC_022659	GC	3	6	89289	89294	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3022	NC_022659	CGC	2	6	89296	89301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574741
3023	NC_022659	TCC	2	6	89338	89343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556574741
3024	NC_022659	GC	3	6	89344	89349	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3025	NC_022659	TGACG	2	10	89371	89380	20 %	20 %	40 %	20 %	556574741
3026	NC_022659	CGG	2	6	89421	89426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3027	NC_022659	GC	3	6	89436	89441	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3028	NC_022659	GC	3	6	89451	89456	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3029	NC_022659	GACCCG	2	12	89486	89497	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556574741
3030	NC_022659	TGG	2	6	89501	89506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556574741
3031	NC_022659	TCG	2	6	89538	89543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3032	NC_022659	GC	3	6	89545	89550	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3033	NC_022659	TGC	2	6	89583	89588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3034	NC_022659	GC	5	10	89600	89609	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3035	NC_022659	GC	3	6	89614	89619	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3036	NC_022659	GGC	2	6	89620	89625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3037	NC_022659	GC	3	6	89647	89652	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3038	NC_022659	CGG	2	6	89704	89709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3039	NC_022659	GC	3	6	89736	89741	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3040	NC_022659	CGC	2	6	89748	89753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574741
3041	NC_022659	GGCGCG	3	18	89771	89788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3042	NC_022659	GCG	2	6	89896	89901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3043	NC_022659	GGC	2	6	89911	89916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3044	NC_022659	GC	3	6	89919	89924	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3045	NC_022659	ACG	2	6	89952	89957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3046	NC_022659	GCT	2	6	89959	89964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3047	NC_022659	GCGCG	2	10	90004	90013	0 %	0 %	60 %	40 %	556574741
3048	NC_022659	CGA	2	6	90046	90051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3049	NC_022659	CGT	2	6	90061	90066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3050	NC_022659	CG	3	6	90075	90080	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3051	NC_022659	GC	3	6	90086	90091	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3052	NC_022659	CGAG	2	8	90102	90109	25 %	0 %	50 %	25 %	556574741
3053	NC_022659	CG	3	6	90130	90135	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3054	NC_022659	GC	4	8	90148	90155	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3055	NC_022659	CAG	2	6	90173	90178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3056	NC_022659	GCT	2	6	90184	90189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3057	NC_022659	GC	3	6	90228	90233	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3058	NC_022659	CGA	2	6	90235	90240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3059	NC_022659	CG	4	8	90255	90262	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3060	NC_022659	CCG	2	6	90275	90280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574741
3061	NC_022659	CG	3	6	90310	90315	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3062	NC_022659	CCG	2	6	90316	90321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574741
3063	NC_022659	CG	3	6	90335	90340	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3064	NC_022659	CCG	2	6	90363	90368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574741
3065	NC_022659	CG	4	8	90429	90436	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3066	NC_022659	ACGC	2	8	90437	90444	25 %	0 %	25 %	50 %	556574741
3067	NC_022659	GC	3	6	90443	90448	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3068	NC_022659	GCG	2	6	90516	90521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3069	NC_022659	TCG	2	6	90525	90530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3070	NC_022659	CAGGCG	2	12	90557	90568	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556574741
3071	NC_022659	GC	3	6	90583	90588	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3072	NC_022659	TGC	2	6	90591	90596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3073	NC_022659	CGC	2	6	90625	90630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574741
3074	NC_022659	GACC	2	8	90637	90644	25 %	0 %	25 %	50 %	556574741
3075	NC_022659	CGG	2	6	90672	90677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3076	NC_022659	CCG	2	6	90678	90683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574741
3077	NC_022659	ACG	2	6	90689	90694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3078	NC_022659	CG	4	8	90703	90710	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3079	NC_022659	GC	3	6	90776	90781	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3080	NC_022659	GAC	2	6	90811	90816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3081	NC_022659	TCTCG	2	10	90820	90829	0 %	40 %	20 %	40 %	556574741
3082	NC_022659	CGG	3	9	90844	90852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574741
3083	NC_022659	GCCG	2	8	90865	90872	0 %	0 %	50 %	50 %	556574741
3084	NC_022659	CGCCCG	2	12	90879	90890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574741
3085	NC_022659	CGC	2	6	90918	90923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574741
3086	NC_022659	CGA	2	6	90944	90949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574741
3087	NC_022659	CGT	2	6	90983	90988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_022659	CG	3	6	90992	90997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_022659	ATCG	2	8	91025	91032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_022659	TCG	2	6	91048	91053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_022659	GGCC	2	8	91155	91162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_022659	CGC	2	6	91186	91191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_022659	CG	4	8	91206	91213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_022659	TTGTGC	2	12	91329	91340	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	556575491
3095	NC_022659	TGC	2	6	91357	91362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575491
3096	NC_022659	GTCATC	2	12	91386	91397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556575491
3097	NC_022659	CAC	2	6	91415	91420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556575491
3098	NC_022659	CG	3	6	91429	91434	0 %	0 %	50 %	50 %	556575491
3099	NC_022659	CGCC	2	8	91477	91484	0 %	0 %	25 %	75 %	556575491
3100	NC_022659	CGTG	2	8	91492	91499	0 %	25 %	50 %	25 %	556575491
3101	NC_022659	CGA	2	6	91501	91506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575491
3102	NC_022659	GCC	2	6	91510	91515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575491
3103	NC_022659	CGG	2	6	91525	91530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575491
3104	NC_022659	GC	4	8	91534	91541	0 %	0 %	50 %	50 %	556575491
3105	NC_022659	TCG	2	6	91548	91553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575491
3106	NC_022659	CGC	2	6	91558	91563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575491
3107	NC_022659	GC	3	6	91582	91587	0 %	0 %	50 %	50 %	556575491
3108	NC_022659	CGG	2	6	91696	91701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575491
3109	NC_022659	GCT	2	6	91705	91710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575491
3110	NC_022659	TGA	2	6	91729	91734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556575491
3111	NC_022659	AGC	2	6	91758	91763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575491
3112	NC_022659	AGC	2	6	91767	91772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575491
3113	NC_022659	CCG	2	6	91774	91779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575491
3114	NC_022659	CGA	2	6	91795	91800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575491
3115	NC_022659	CAG	2	6	91841	91846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575491
3116	NC_022659	GTC	2	6	91859	91864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575491
3117	NC_022659	TCC	2	6	91895	91900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556577135
3118	NC_022659	CGC	2	6	91909	91914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577135
3119	NC_022659	CG	3	6	91918	91923	0 %	0 %	50 %	50 %	556577135
3120	NC_022659	CGCAG	2	10	91942	91951	20 %	0 %	40 %	40 %	556577135
3121	NC_022659	CGC	2	6	91987	91992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577135
3122	NC_022659	CG	5	10	91997	92006	0 %	0 %	50 %	50 %	556577135
3123	NC_022659	CGCC	2	8	92008	92015	0 %	0 %	25 %	75 %	556577135
3124	NC_022659	CAG	2	6	92018	92023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577135
3125	NC_022659	TGG	2	6	92025	92030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556577135
3126	NC_022659	TCG	2	6	92034	92039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577135
3127	NC_022659	AGC	2	6	92040	92045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577135
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3251	NC_022659	ACG	2	6	95739	95744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576052
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3347	NC_022659	CGA	2	6	98564	98569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575835
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3355	NC_022659	TAA	2	6	98676	98681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556576633
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3362	NC_022659	CG	4	8	98854	98861	0 %	0 %	50 %	50 %	556576633
3363	NC_022659	CCG	2	6	98862	98867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576633
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3370	NC_022659	GC	3	6	99091	99096	0 %	0 %	50 %	50 %	556576633
3371	NC_022659	GCA	2	6	99121	99126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576633
3372	NC_022659	CGGCC	2	10	99133	99142	0 %	0 %	40 %	60 %	556576633
3373	NC_022659	CGC	2	6	99155	99160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576633
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3375	NC_022659	CGC	2	6	99225	99230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3376	NC_022659	GC	3	6	99237	99242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3377	NC_022659	GC	3	6	99266	99271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3378	NC_022659	AGCG	2	8	99321	99328	25 %	0 %	50 %	25 %	556577452
3379	NC_022659	TTG	2	6	99343	99348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556577452
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