MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 128872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022659	CGC	2	6	16345	16350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577888
502	NC_022659	CGC	2	6	16366	16371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577888
503	NC_022659	CGC	2	6	16380	16385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577888
504	NC_022659	CTCGCG	2	12	16403	16414	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556577888
505	NC_022659	GC	3	6	16417	16422	0 %	0 %	50 %	50 %	556577888
506	NC_022659	GGCC	2	8	16423	16430	0 %	0 %	50 %	50 %	556577888
507	NC_022659	GCT	2	6	16432	16437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577888
508	NC_022659	CGC	2	6	16516	16521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577888
509	NC_022659	TGC	2	6	16536	16541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577888
510	NC_022659	CG	5	10	16573	16582	0 %	0 %	50 %	50 %	556577888
511	NC_022659	GAT	2	6	16594	16599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577888
512	NC_022659	TCG	3	9	16623	16631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577888
513	NC_022659	GTC	2	6	16637	16642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577888
514	NC_022659	CG	3	6	16662	16667	0 %	0 %	50 %	50 %	556577888
515	NC_022659	CGA	2	6	16708	16713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577888
516	NC_022659	CGA	2	6	16771	16776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577888
517	NC_022659	GGC	2	6	16795	16800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577888
518	NC_022659	GC	3	6	16809	16814	0 %	0 %	50 %	50 %	556577888
519	NC_022659	GCG	2	6	16878	16883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577888
520	NC_022659	CGA	2	6	16999	17004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577888
521	NC_022659	GCC	2	6	17021	17026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577888
522	NC_022659	GC	4	8	17044	17051	0 %	0 %	50 %	50 %	556577888
523	NC_022659	GGC	2	6	17056	17061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577888
524	NC_022659	TGA	2	6	17079	17084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577888
525	NC_022659	TGC	2	6	17097	17102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577888
526	NC_022659	CGC	2	6	17108	17113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_022659	GAG	2	6	17127	17132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022659	TCG	2	6	17215	17220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575587
529	NC_022659	GCG	2	6	17265	17270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575587
530	NC_022659	GTC	2	6	17295	17300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575587
531	NC_022659	TAC	2	6	17322	17327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556575587
532	NC_022659	GC	3	6	17341	17346	0 %	0 %	50 %	50 %	556575587
533	NC_022659	CGC	4	12	17366	17377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575587
534	NC_022659	AAC	2	6	17400	17405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556575587
535	NC_022659	CCGG	2	8	17421	17428	0 %	0 %	50 %	50 %	556575587
536	NC_022659	ACG	2	6	17448	17453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575587
537	NC_022659	ACG	2	6	17482	17487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575587
538	NC_022659	CGG	2	6	17488	17493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575587
539	NC_022659	CGC	2	6	17510	17515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575587
540	NC_022659	CGGG	2	8	17566	17573	0 %	0 %	75 %	25 %	556575587
541	NC_022659	TCG	2	6	17583	17588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575587
542	NC_022659	GAGG	2	8	17609	17616	25 %	0 %	75 %	0 %	556575587
543	NC_022659	GAGG	2	8	17621	17628	25 %	0 %	75 %	0 %	556575587
544	NC_022659	CGC	2	6	17639	17644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575587
545	NC_022659	GC	3	6	17653	17658	0 %	0 %	50 %	50 %	556575587
546	NC_022659	GGA	2	6	17672	17677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556575587
547	NC_022659	CGG	2	6	17680	17685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575587
548	NC_022659	CGC	2	6	17688	17693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575587
549	NC_022659	CGCC	2	8	17704	17711	0 %	0 %	25 %	75 %	556575587
550	NC_022659	CGC	2	6	17726	17731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575587
551	NC_022659	CGG	2	6	17734	17739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575587
552	NC_022659	CGCGC	2	10	17768	17777	0 %	0 %	40 %	60 %	556575587
553	NC_022659	CGCGCT	2	12	17780	17791	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556575587
554	NC_022659	CCGC	2	8	17800	17807	0 %	0 %	25 %	75 %	556575587
555	NC_022659	CGA	2	6	17848	17853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575587
556	NC_022659	TCG	2	6	17854	17859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575587
557	NC_022659	CAC	2	6	17865	17870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556575587
558	NC_022659	GC	3	6	17879	17884	0 %	0 %	50 %	50 %	556575587
559	NC_022659	CGA	2	6	17906	17911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575587
560	NC_022659	CGGC	2	8	17920	17927	0 %	0 %	50 %	50 %	556575587
561	NC_022659	TCA	2	6	17929	17934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556575587
562	NC_022659	GCC	2	6	17957	17962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575587
563	NC_022659	CATACG	2	12	17985	17996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556575587
564	NC_022659	CG	3	6	18025	18030	0 %	0 %	50 %	50 %	556575587
565	NC_022659	GTC	2	6	18105	18110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575587
566	NC_022659	GCCG	2	8	18173	18180	0 %	0 %	50 %	50 %	556576068
567	NC_022659	CGGC	2	8	18189	18196	0 %	0 %	50 %	50 %	556576068
568	NC_022659	ACGC	2	8	18201	18208	25 %	0 %	25 %	50 %	556576068
569	NC_022659	GCACCG	2	12	18209	18220	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556576068
570	NC_022659	GC	3	6	18221	18226	0 %	0 %	50 %	50 %	556576068
571	NC_022659	GCT	2	6	18230	18235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576068
572	NC_022659	CG	3	6	18246	18251	0 %	0 %	50 %	50 %	556576068
573	NC_022659	CG	3	6	18260	18265	0 %	0 %	50 %	50 %	556576068
574	NC_022659	AGCGCG	2	12	18292	18303	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556576068
575	NC_022659	CGC	3	9	18449	18457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_022659	GC	3	6	18456	18461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_022659	CGG	2	6	18464	18469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_022659	GCC	2	6	18499	18504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575651
579	NC_022659	TCG	2	6	18505	18510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575651
580	NC_022659	TCG	2	6	18532	18537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575651
581	NC_022659	TCA	2	6	18608	18613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556575651
582	NC_022659	GCA	2	6	18686	18691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575651
583	NC_022659	ATGCCC	2	12	18697	18708	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556575651
584	NC_022659	CGG	3	9	18753	18761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575651
585	NC_022659	CCA	2	6	18794	18799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556575651
586	NC_022659	GCG	2	6	18875	18880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575651
587	NC_022659	TGC	2	6	18886	18891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575651
588	NC_022659	CG	3	6	18902	18907	0 %	0 %	50 %	50 %	556575651
589	NC_022659	GAC	2	6	18915	18920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575651
590	NC_022659	CGA	3	9	18977	18985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575651
591	NC_022659	TCG	2	6	19003	19008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575651
592	NC_022659	GC	3	6	19146	19151	0 %	0 %	50 %	50 %	556575651
593	NC_022659	TCGC	2	8	19159	19166	0 %	25 %	25 %	50 %	556575651
594	NC_022659	CGCC	2	8	19226	19233	0 %	0 %	25 %	75 %	556575651
595	NC_022659	CGT	2	6	19254	19259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575651
596	NC_022659	AGA	2	6	19267	19272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556575651
597	NC_022659	CG	4	8	19305	19312	0 %	0 %	50 %	50 %	556575651
598	NC_022659	GTC	2	6	19324	19329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575651
599	NC_022659	GCT	2	6	19337	19342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575651
600	NC_022659	GCC	2	6	19348	19353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575651
601	NC_022659	TTG	2	6	19440	19445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022659	CAA	2	6	19456	19461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_022659	TAT	2	6	19462	19467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022659	A	7	7	19521	19527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022659	TAA	2	6	19625	19630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022659	GCG	2	6	19705	19710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576050
607	NC_022659	CGG	2	6	19715	19720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576050
608	NC_022659	TGG	2	6	19753	19758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556576050
609	NC_022659	CG	3	6	19759	19764	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
610	NC_022659	CGC	2	6	19794	19799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576050
611	NC_022659	TCGC	2	8	19801	19808	0 %	25 %	25 %	50 %	556576050
612	NC_022659	TCGC	2	8	19819	19826	0 %	25 %	25 %	50 %	556576050
613	NC_022659	CGC	3	9	19824	19832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576050
614	NC_022659	TCGC	2	8	19858	19865	0 %	25 %	25 %	50 %	556576050
615	NC_022659	GC	3	6	19864	19869	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
616	NC_022659	GAG	2	6	19882	19887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556576050
617	NC_022659	GGCCCG	2	12	19951	19962	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
618	NC_022659	AAC	2	6	19984	19989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556576050
619	NC_022659	ACC	2	6	20012	20017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556576050
620	NC_022659	GC	4	8	20052	20059	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
621	NC_022659	GC	4	8	20068	20075	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
622	NC_022659	CG	3	6	20077	20082	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
623	NC_022659	CG	3	6	20088	20093	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
624	NC_022659	AGCTCG	2	12	20102	20113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556576050
625	NC_022659	CGT	2	6	20121	20126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576050
626	NC_022659	GC	3	6	20127	20132	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
627	NC_022659	GAA	2	6	20148	20153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556576050
628	NC_022659	CTC	2	6	20161	20166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556576050
629	NC_022659	GC	3	6	20215	20220	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
630	NC_022659	GC	3	6	20229	20234	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
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635	NC_022659	CG	3	6	20385	20390	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
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637	NC_022659	GCT	2	6	20445	20450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576050
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641	NC_022659	GC	3	6	20500	20505	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
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643	NC_022659	GC	3	6	20579	20584	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
644	NC_022659	GC	3	6	20601	20606	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
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647	NC_022659	CGGC	2	8	20661	20668	0 %	0 %	50 %	50 %	556576050
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650	NC_022659	TCG	2	6	20735	20740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576050
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661	NC_022659	GCC	2	6	21145	21150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576050
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719	NC_022659	GCG	2	6	22845	22850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574744
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731	NC_022659	CG	3	6	23238	23243	0 %	0 %	50 %	50 %	556574744
732	NC_022659	CGA	2	6	23259	23264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574744
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745	NC_022659	GC	4	8	23511	23518	0 %	0 %	50 %	50 %	556574744
746	NC_022659	ACCG	2	8	23525	23532	25 %	0 %	25 %	50 %	556574744
747	NC_022659	TCA	2	6	23543	23548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556574744
748	NC_022659	CG	3	6	23555	23560	0 %	0 %	50 %	50 %	556574689
749	NC_022659	CGT	2	6	23592	23597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574689
750	NC_022659	GATC	2	8	23634	23641	25 %	25 %	25 %	25 %	556574689
751	NC_022659	CGT	2	6	23670	23675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574689
752	NC_022659	GCG	2	6	23720	23725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574689
753	NC_022659	TCG	2	6	23790	23795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575063
754	NC_022659	TCG	2	6	23814	23819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575063
755	NC_022659	GC	3	6	23887	23892	0 %	0 %	50 %	50 %	556575063
756	NC_022659	GTC	2	6	23930	23935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575063
757	NC_022659	GATC	2	8	23989	23996	25 %	25 %	25 %	25 %	556575063
758	NC_022659	GCAGGC	2	12	24022	24033	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556575063
759	NC_022659	CGC	2	6	24040	24045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575063
760	NC_022659	CCG	2	6	24046	24051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575063
761	NC_022659	CG	3	6	24050	24055	0 %	0 %	50 %	50 %	556575063
762	NC_022659	GCGCC	2	10	24067	24076	0 %	0 %	40 %	60 %	556575063
763	NC_022659	CGC	2	6	24079	24084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575063
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765	NC_022659	CG	3	6	24089	24094	0 %	0 %	50 %	50 %	556575063
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770	NC_022659	CG	3	6	24222	24227	0 %	0 %	50 %	50 %	556575063
771	NC_022659	TCG	2	6	24312	24317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575063
772	NC_022659	CG	3	6	24366	24371	0 %	0 %	50 %	50 %	556575063
773	NC_022659	TGA	2	6	24402	24407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556575063
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776	NC_022659	TCG	2	6	24486	24491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575063
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779	NC_022659	TCG	2	6	24609	24614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575063
780	NC_022659	CGG	3	9	24622	24630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575063
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782	NC_022659	CG	4	8	24673	24680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
783	NC_022659	CG	5	10	24706	24715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
784	NC_022659	CGGC	2	8	24726	24733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
785	NC_022659	GCCG	2	8	24746	24753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
786	NC_022659	CAG	2	6	24806	24811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
787	NC_022659	CGG	2	6	24817	24822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
788	NC_022659	CGG	2	6	24828	24833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_022659	G	6	6	24832	24837	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
790	NC_022659	TCG	2	6	24848	24853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
791	NC_022659	GCG	2	6	24860	24865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
792	NC_022659	CGA	2	6	24872	24877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
793	NC_022659	CGG	2	6	24894	24899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
794	NC_022659	GC	3	6	24916	24921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
795	NC_022659	CCG	2	6	24942	24947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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797	NC_022659	GCCG	2	8	24985	24992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
798	NC_022659	CGC	2	6	25011	25016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575378
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801	NC_022659	CG	3	6	25081	25086	0 %	0 %	50 %	50 %	556575378
802	NC_022659	GCG	3	9	25084	25092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575378
803	NC_022659	CGA	2	6	25103	25108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575378
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810	NC_022659	CGAC	2	8	25301	25308	25 %	0 %	25 %	50 %	556575378
811	NC_022659	GCGA	2	8	25357	25364	25 %	0 %	50 %	25 %	556575378
812	NC_022659	CTCG	2	8	25371	25378	0 %	25 %	25 %	50 %	556575378
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848	NC_022659	CG	3	6	26430	26435	0 %	0 %	50 %	50 %	556575378
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850	NC_022659	CGA	2	6	26528	26533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575378
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853	NC_022659	CGT	2	6	26559	26564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575378
854	NC_022659	GCGCG	2	10	26578	26587	0 %	0 %	60 %	40 %	556575378
855	NC_022659	CGCGG	2	10	26588	26597	0 %	0 %	60 %	40 %	556575378
856	NC_022659	CGTCG	2	10	26631	26640	0 %	20 %	40 %	40 %	556575378
857	NC_022659	TCTGA	2	10	26696	26705	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
858	NC_022659	TGC	2	6	26706	26711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
859	NC_022659	GGC	2	6	26721	26726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
860	NC_022659	CG	3	6	26748	26753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
861	NC_022659	T	7	7	26785	26791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
862	NC_022659	CG	3	6	26857	26862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
863	NC_022659	GC	3	6	26877	26882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
864	NC_022659	CG	4	8	26889	26896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
865	NC_022659	CGTGC	2	10	26979	26988	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
866	NC_022659	CCGT	2	8	27057	27064	0 %	25 %	25 %	50 %	556574698
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869	NC_022659	CCG	3	9	27094	27102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574698
870	NC_022659	TCA	2	6	27238	27243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556574698
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873	NC_022659	CGTTCC	2	12	27382	27393	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	556574698
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878	NC_022659	CG	3	6	27458	27463	0 %	0 %	50 %	50 %	556574698
879	NC_022659	CGGC	2	8	27476	27483	0 %	0 %	50 %	50 %	556574698
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