MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 128872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022659	CGG	2	6	138339	138344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576164
4502	NC_022659	CG	3	6	138352	138357	0 %	0 %	50 %	50 %	556576164
4503	NC_022659	CGA	2	6	138363	138368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576164
4504	NC_022659	CGC	2	6	138375	138380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576164
4505	NC_022659	GC	4	8	138379	138386	0 %	0 %	50 %	50 %	556576164
4506	NC_022659	GC	3	6	138395	138400	0 %	0 %	50 %	50 %	556576164
4507	NC_022659	GCC	2	6	138431	138436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576164
4508	NC_022659	TGC	2	6	138455	138460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576164
4509	NC_022659	CCA	2	6	138489	138494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556576164
4510	NC_022659	GCC	2	6	138495	138500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576164
4511	NC_022659	CG	4	8	138506	138513	0 %	0 %	50 %	50 %	556576164
4512	NC_022659	CGC	2	6	138557	138562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576164
4513	NC_022659	GCG	2	6	138567	138572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576164
4514	NC_022659	CGG	2	6	138573	138578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576164
4515	NC_022659	CCG	2	6	138580	138585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576164
4516	NC_022659	ACG	2	6	138674	138679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576164
4517	NC_022659	CGAC	2	8	138680	138687	25 %	0 %	25 %	50 %	556576164
4518	NC_022659	GCC	2	6	138768	138773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_022659	GCC	2	6	138788	138793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577651
4520	NC_022659	CG	3	6	138825	138830	0 %	0 %	50 %	50 %	556577651
4521	NC_022659	G	6	6	138849	138854	0 %	0 %	100 %	0 %	556577651
4522	NC_022659	GCCG	2	8	138862	138869	0 %	0 %	50 %	50 %	556577651
4523	NC_022659	GCG	2	6	138872	138877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577651
4524	NC_022659	CG	3	6	138909	138914	0 %	0 %	50 %	50 %	556577651
4525	NC_022659	GCC	2	6	138915	138920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577651
4526	NC_022659	TCG	2	6	138921	138926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577651
4527	NC_022659	CG	3	6	139030	139035	0 %	0 %	50 %	50 %	556577651
4528	NC_022659	CGG	2	6	139045	139050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577651
4529	NC_022659	GC	3	6	139128	139133	0 %	0 %	50 %	50 %	556577651
4530	NC_022659	GCG	2	6	139148	139153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577651
4531	NC_022659	GCG	2	6	139164	139169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577651
4532	NC_022659	CG	3	6	139174	139179	0 %	0 %	50 %	50 %	556577651
4533	NC_022659	CG	3	6	139183	139188	0 %	0 %	50 %	50 %	556577651
4534	NC_022659	CGA	2	6	139198	139203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577651
4535	NC_022659	ACG	2	6	139305	139310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577651
4536	NC_022659	CCCGA	2	10	139354	139363	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4537	NC_022659	GCTCGC	2	12	139402	139413	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556574886
4538	NC_022659	CGA	2	6	139434	139439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574886
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4541	NC_022659	ACC	2	6	139481	139486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556574886
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4544	NC_022659	CCG	3	9	139509	139517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574886
4545	NC_022659	GC	3	6	139560	139565	0 %	0 %	50 %	50 %	556574886
4546	NC_022659	CGA	2	6	139585	139590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574886
4547	NC_022659	GCAC	2	8	139628	139635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_022659	GCC	2	6	139650	139655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_022659	CGGCG	2	10	139661	139670	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4550	NC_022659	GCG	2	6	139686	139691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_022659	CGC	2	6	139727	139732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_022659	GCG	3	9	139737	139745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_022659	CG	4	8	139755	139762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_022659	CGGC	2	8	139768	139775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_022659	GC	3	6	139785	139790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_022659	GC	3	6	139814	139819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_022659	GC	4	8	139860	139867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_022659	CG	3	6	139892	139897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_022659	GCCGCG	2	12	139898	139909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_022659	CG	3	6	139926	139931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_022659	CCG	2	6	139953	139958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_022659	GC	3	6	140010	140015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_022659	GC	4	8	140017	140024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_022659	CGG	2	6	140030	140035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_022659	TGCG	2	8	140050	140057	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_022659	AGGC	2	8	140058	140065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_022659	CAG	2	6	140116	140121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575600
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4570	NC_022659	GCG	2	6	140359	140364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575600
4571	NC_022659	TC	3	6	140437	140442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_022659	TTGC	2	8	140447	140454	0 %	50 %	25 %	25 %	556574792
4573	NC_022659	CGA	2	6	140485	140490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574792
4574	NC_022659	CGT	2	6	140510	140515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574792
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4576	NC_022659	CAG	2	6	140594	140599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574792
4577	NC_022659	GTC	2	6	140607	140612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574792
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4579	NC_022659	CGAC	2	8	140638	140645	25 %	0 %	25 %	50 %	556574792
4580	NC_022659	ACG	3	9	140658	140666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574792
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4583	NC_022659	CG	3	6	140808	140813	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4584	NC_022659	GCG	2	6	140815	140820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574792
4585	NC_022659	GGCGC	2	10	140852	140861	0 %	0 %	60 %	40 %	556574792
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4589	NC_022659	GC	3	6	140928	140933	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4590	NC_022659	CG	3	6	140942	140947	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4591	NC_022659	CG	3	6	140952	140957	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4592	NC_022659	CG	3	6	140971	140976	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
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4596	NC_022659	CG	3	6	141026	141031	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4597	NC_022659	CAGC	2	8	141032	141039	25 %	0 %	25 %	50 %	556574792
4598	NC_022659	CG	4	8	141091	141098	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4599	NC_022659	CG	3	6	141110	141115	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4600	NC_022659	GC	4	8	141118	141125	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4601	NC_022659	CGGA	2	8	141133	141140	25 %	0 %	50 %	25 %	556574792
4602	NC_022659	CG	3	6	141143	141148	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4603	NC_022659	GC	3	6	141172	141177	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4604	NC_022659	ACG	2	6	141186	141191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574792
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4609	NC_022659	GC	4	8	141415	141422	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4610	NC_022659	CG	3	6	141436	141441	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4611	NC_022659	GCC	2	6	141475	141480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574792
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4617	NC_022659	GCC	2	6	141585	141590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574792
4618	NC_022659	GCAG	2	8	141661	141668	25 %	0 %	50 %	25 %	556574792
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4625	NC_022659	GCGCGA	2	12	141856	141867	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556574792
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4627	NC_022659	AGC	2	6	141882	141887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574792
4628	NC_022659	GC	3	6	141886	141891	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4629	NC_022659	CGT	2	6	141907	141912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574792
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4631	NC_022659	GC	4	8	141925	141932	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
4632	NC_022659	GC	4	8	141940	141947	0 %	0 %	50 %	50 %	556574792
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4734	NC_022659	CGGC	2	8	145630	145637	0 %	0 %	50 %	50 %	556577679
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4739	NC_022659	TCG	2	6	145819	145824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577679
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4742	NC_022659	TTCAT	2	10	146034	146043	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4743	NC_022659	TGC	2	6	146074	146079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4744	NC_022659	ATTT	2	8	146087	146094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4745	NC_022659	GATTT	2	10	146183	146192	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4746	NC_022659	CGC	2	6	146201	146206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4747	NC_022659	TCG	2	6	146224	146229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4748	NC_022659	TCG	2	6	146237	146242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4749	NC_022659	GCCC	2	8	146247	146254	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4750	NC_022659	CCG	2	6	146274	146279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4751	NC_022659	CGC	2	6	146322	146327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4753	NC_022659	CG	3	6	146388	146393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4782	NC_022659	CG	3	6	147286	147291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4858	NC_022659	AT	3	6	149755	149760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4862	NC_022659	CGG	2	6	149988	149993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4863	NC_022659	CGC	2	6	149996	150001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4865	NC_022659	GGT	2	6	150018	150023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4866	NC_022659	CGC	2	6	150050	150055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4867	NC_022659	GCG	2	6	150089	150094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4868	NC_022659	CGGCG	4	20	150090	150109	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4869	NC_022659	ACG	2	6	150140	150145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576231
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4871	NC_022659	TCA	2	6	150177	150182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576231
4872	NC_022659	CGA	2	6	150189	150194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576231
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4874	NC_022659	CGGC	2	8	150204	150211	0 %	0 %	50 %	50 %	556576231
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4876	NC_022659	CGA	2	6	150267	150272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576231
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4878	NC_022659	CGC	2	6	150310	150315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576231
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4897	NC_022659	CG	3	6	151242	151247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4900	NC_022659	CG	3	6	151330	151335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4901	NC_022659	GC	3	6	151337	151342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4902	NC_022659	CCGG	2	8	151433	151440	0 %	0 %	50 %	50 %	556577454
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4949	NC_022659	GCGT	2	8	152926	152933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4950	NC_022659	CGCC	2	8	152937	152944	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4951	NC_022659	CG	3	6	152949	152954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4952	NC_022659	CG	3	6	152958	152963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4953	NC_022659	CAA	2	6	152976	152981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4954	NC_022659	A	7	7	152980	152986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4955	NC_022659	ACGG	2	8	153017	153024	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4956	NC_022659	G	6	6	153023	153028	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4957	NC_022659	GA	3	6	153042	153047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4958	NC_022659	AC	3	6	153061	153066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4959	NC_022659	CGA	2	6	153073	153078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4962	NC_022659	ACGA	2	8	153145	153152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4964	NC_022659	GC	3	6	153160	153165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4967	NC_022659	CTT	2	6	153206	153211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4968	NC_022659	TCG	2	6	153246	153251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4973	NC_022659	CCG	2	6	153486	153491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4974	NC_022659	CCGG	2	8	153511	153518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4975	NC_022659	ATTCG	2	10	153541	153550	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4976	NC_022659	TCG	2	6	153599	153604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4978	NC_022659	GAC	2	6	153634	153639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4980	NC_022659	GGCGAT	2	12	153652	153663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4981	NC_022659	GGCGGT	2	12	153664	153675	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4982	NC_022659	CGACAG	2	12	153690	153701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4983	NC_022659	GCATC	2	10	153711	153720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4984	NC_022659	CGTG	2	8	153721	153728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4985	NC_022659	CG	3	6	153735	153740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4986	NC_022659	GC	4	8	153762	153769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4987	NC_022659	CG	3	6	153779	153784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4988	NC_022659	GCC	2	6	153817	153822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4991	NC_022659	GCG	2	6	154186	154191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4992	NC_022659	CGC	2	6	154195	154200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4993	NC_022659	GCC	3	9	154269	154277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4994	NC_022659	CGC	2	6	154351	154356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4995	NC_022659	AAAC	2	8	154357	154364	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4996	NC_022659	CTG	2	6	154422	154427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575074
4997	NC_022659	CGCC	2	8	154480	154487	0 %	0 %	25 %	75 %	556575074
4998	NC_022659	CGG	2	6	154495	154500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575074
4999	NC_022659	CCG	2	6	154538	154543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575074
5000	NC_022659	CAT	2	6	154567	154572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556575074

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