MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 2

Total Repeats: 108112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022658	GCA	2	6	312851	312856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573092
10002	NC_022658	TCG	3	9	312880	312888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573092
10003	NC_022658	ATC	2	6	312949	312954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556573092
10004	NC_022658	CGG	2	6	312983	312988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573092
10005	NC_022658	GCC	2	6	313138	313143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573092
10006	NC_022658	CTC	2	6	313228	313233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_022658	TCAA	2	8	313252	313259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_022658	TCGAC	2	10	313334	313343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10009	NC_022658	GA	3	6	313365	313370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_022658	AATAA	2	10	313371	313380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_022658	GAAA	2	8	313406	313413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_022658	GCC	2	6	313436	313441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_022658	GCC	2	6	313564	313569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573121
10014	NC_022658	ACGC	2	8	313591	313598	25 %	0 %	25 %	50 %	556573121
10015	NC_022658	GC	3	6	313607	313612	0 %	0 %	50 %	50 %	556573121
10016	NC_022658	GTT	2	6	313647	313652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556573121
10017	NC_022658	ACG	2	6	313682	313687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573121
10018	NC_022658	GC	3	6	313711	313716	0 %	0 %	50 %	50 %	556573121
10019	NC_022658	CGC	2	6	313725	313730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573121
10020	NC_022658	CT	3	6	313737	313742	0 %	50 %	0 %	50 %	556573121
10021	NC_022658	ATC	2	6	313786	313791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556573121
10022	NC_022658	GC	3	6	313911	313916	0 %	0 %	50 %	50 %	556573121
10023	NC_022658	ATC	2	6	313939	313944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556573121
10024	NC_022658	ACG	2	6	313991	313996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573121
10025	NC_022658	CTG	2	6	314008	314013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573121
10026	NC_022658	GCCG	2	8	314031	314038	0 %	0 %	50 %	50 %	556573121
10027	NC_022658	GCT	2	6	314055	314060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573121
10028	NC_022658	GCG	2	6	314089	314094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573121
10029	NC_022658	TC	3	6	314095	314100	0 %	50 %	0 %	50 %	556573121
10030	NC_022658	TGA	2	6	314114	314119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556573121
10031	NC_022658	GGT	2	6	314309	314314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556573121
10032	NC_022658	GCC	2	6	314324	314329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573121
10033	NC_022658	TTGC	2	8	314362	314369	0 %	50 %	25 %	25 %	556573121
10034	NC_022658	GC	3	6	314414	314419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_022658	CGG	2	6	314436	314441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_022658	GCT	2	6	314442	314447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_022658	CG	3	6	314508	314513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10038	NC_022658	GTC	2	6	314560	314565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_022658	TGG	2	6	314609	314614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_022658	CGC	2	6	314628	314633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_022658	TCG	2	6	314707	314712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_022658	GC	3	6	314779	314784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_022658	GCG	2	6	314839	314844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_022658	CGC	2	6	314952	314957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_022658	GCA	2	6	314959	314964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_022658	ACG	2	6	314971	314976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_022658	ACG	2	6	315014	315019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_022658	GGT	2	6	315162	315167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_022658	TCA	2	6	315172	315177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_022658	CGTT	2	8	315190	315197	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_022658	TCAG	2	8	315241	315248	25 %	25 %	25 %	25 %	556574189
10052	NC_022658	GC	3	6	315301	315306	0 %	0 %	50 %	50 %	556574189
10053	NC_022658	GGC	2	6	315315	315320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574189
10054	NC_022658	TGA	2	6	315395	315400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556574189
10055	NC_022658	CGA	2	6	315403	315408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574189
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10057	NC_022658	CTT	2	6	315499	315504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556574189
10058	NC_022658	GCT	2	6	315514	315519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574189
10059	NC_022658	GGC	2	6	315533	315538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574189
10060	NC_022658	CCGC	2	8	315570	315577	0 %	0 %	25 %	75 %	556574189
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10063	NC_022658	GAA	2	6	315718	315723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574189
10064	NC_022658	GGCT	2	8	315727	315734	0 %	25 %	50 %	25 %	556574189
10065	NC_022658	GCT	2	6	315736	315741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574189
10066	NC_022658	CGA	2	6	315756	315761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574189
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10073	NC_022658	GCCT	2	8	316249	316256	0 %	25 %	25 %	50 %	556574189
10074	NC_022658	CGG	2	6	316338	316343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574189
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10081	NC_022658	GTC	2	6	316639	316644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574189
10082	NC_022658	CGA	2	6	316659	316664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574189
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10087	NC_022658	CG	3	6	317266	317271	0 %	0 %	50 %	50 %	556574189
10088	NC_022658	GTT	2	6	317401	317406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556574189
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10092	NC_022658	CGG	2	6	317700	317705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_022658	ACG	2	6	317842	317847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10095	NC_022658	CTG	2	6	317998	318003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573747
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10103	NC_022658	CGC	2	6	318460	318465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572461
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10105	NC_022658	TCG	2	6	318568	318573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
10106	NC_022658	CTG	2	6	318596	318601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
10107	NC_022658	TCCT	2	8	318640	318647	0 %	50 %	0 %	50 %	556572461
10108	NC_022658	CGA	2	6	318692	318697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572461
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10110	NC_022658	GTC	2	6	318752	318757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
10111	NC_022658	GC	4	8	318780	318787	0 %	0 %	50 %	50 %	556572461
10112	NC_022658	CTG	2	6	318818	318823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
10113	NC_022658	GGTG	2	8	318887	318894	0 %	25 %	75 %	0 %	556572461
10114	NC_022658	CG	3	6	318906	318911	0 %	0 %	50 %	50 %	556572461
10115	NC_022658	GACC	2	8	318919	318926	25 %	0 %	25 %	50 %	556572461
10116	NC_022658	CG	3	6	318942	318947	0 %	0 %	50 %	50 %	556572461
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10120	NC_022658	CG	3	6	319142	319147	0 %	0 %	50 %	50 %	556572461
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10122	NC_022658	GCC	2	6	319205	319210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572461
10123	NC_022658	TCG	2	6	319212	319217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
10124	NC_022658	CAG	2	6	319247	319252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572461
10125	NC_022658	TCG	2	6	319302	319307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
10126	NC_022658	TGA	2	6	319315	319320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556572461
10127	NC_022658	CTG	2	6	319322	319327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
10128	NC_022658	TCG	2	6	319351	319356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
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10130	NC_022658	GTGCA	2	10	319415	319424	20 %	20 %	40 %	20 %	556572461
10131	NC_022658	TCGA	2	8	319470	319477	25 %	25 %	25 %	25 %	556572461
10132	NC_022658	GCT	2	6	319492	319497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
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10134	NC_022658	GGC	2	6	319511	319516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572461
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10138	NC_022658	TTGC	2	8	319682	319689	0 %	50 %	25 %	25 %	556572461
10139	NC_022658	GCT	2	6	319690	319695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
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10142	NC_022658	CGG	2	6	319744	319749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572461
10143	NC_022658	GCG	2	6	319777	319782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572461
10144	NC_022658	ACG	2	6	319803	319808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572461
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10152	NC_022658	TCG	2	6	320032	320037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572461
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10162	NC_022658	CCG	2	6	320382	320387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572461
10163	NC_022658	GCCG	2	8	320409	320416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10164	NC_022658	GAA	2	6	320519	320524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10165	NC_022658	CTCCG	2	10	320525	320534	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10166	NC_022658	CGG	2	6	320560	320565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10169	NC_022658	ATTT	2	8	320673	320680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10171	NC_022658	TCA	2	6	320749	320754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10172	NC_022658	ACC	2	6	320791	320796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10175	NC_022658	ACC	2	6	320885	320890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10176	NC_022658	GCCA	2	8	320897	320904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10177	NC_022658	ACG	2	6	320921	320926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10179	NC_022658	CGG	2	6	320951	320956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10180	NC_022658	ATA	2	6	321018	321023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10181	NC_022658	GTG	2	6	321082	321087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10182	NC_022658	TGGA	2	8	321379	321386	25 %	25 %	50 %	0 %	556572341
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10187	NC_022658	GC	3	6	321528	321533	0 %	0 %	50 %	50 %	556572341
10188	NC_022658	ACC	2	6	321592	321597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556572341
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10197	NC_022658	GGCA	2	8	322163	322170	25 %	0 %	50 %	25 %	556572990
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10217	NC_022658	ACCAT	2	10	323128	323137	40 %	20 %	0 %	40 %	556572990
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10220	NC_022658	GCC	2	6	323263	323268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574112
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10222	NC_022658	TCG	2	6	323289	323294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574112
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10229	NC_022658	AATTTG	2	12	323599	323610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	556572906
10230	NC_022658	T	6	6	323631	323636	0 %	100 %	0 %	0 %	556572906
10231	NC_022658	TG	3	6	323901	323906	0 %	50 %	50 %	0 %	556572906
10232	NC_022658	CCG	2	6	323928	323933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572906
10233	NC_022658	CCG	2	6	323970	323975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572906
10234	NC_022658	CGG	2	6	324058	324063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572906
10235	NC_022658	GCC	2	6	324069	324074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572906
10236	NC_022658	TCG	2	6	324174	324179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572906
10237	NC_022658	TCA	2	6	324207	324212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572906
10238	NC_022658	CCT	2	6	324267	324272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556572906
10239	NC_022658	GTG	2	6	324321	324326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556572906
10240	NC_022658	TGG	2	6	324397	324402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556572906
10241	NC_022658	GTC	2	6	324491	324496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572906
10242	NC_022658	CCG	2	6	324528	324533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572906
10243	NC_022658	GGC	2	6	324686	324691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572906
10244	NC_022658	CTGTTG	2	12	324736	324747	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10245	NC_022658	CCG	2	6	324752	324757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10246	NC_022658	CG	3	6	324777	324782	0 %	0 %	50 %	50 %	556572658
10247	NC_022658	TGAT	2	8	324820	324827	25 %	50 %	25 %	0 %	556572658
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10254	NC_022658	G	7	7	325139	325145	0 %	0 %	100 %	0 %	556572658
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10318	NC_022658	CGC	2	6	328343	328348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10319	NC_022658	CGAC	2	8	328371	328378	25 %	0 %	25 %	50 %	556574247
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10342	NC_022658	CTC	2	6	329506	329511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10343	NC_022658	AGA	2	6	329566	329571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556572981
10344	NC_022658	CTTC	2	8	329602	329609	0 %	50 %	0 %	50 %	556572981
10345	NC_022658	CTC	2	6	329708	329713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556572981
10346	NC_022658	CGG	2	6	329783	329788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572981
10347	NC_022658	CGG	2	6	329807	329812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572981
10348	NC_022658	GAAA	2	8	329829	329836	75 %	0 %	25 %	0 %	556572981
10349	NC_022658	CG	3	6	329846	329851	0 %	0 %	50 %	50 %	556572981
10350	NC_022658	CGG	2	6	329958	329963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572981
10351	NC_022658	CGA	2	6	330020	330025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572981
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10353	NC_022658	GTA	2	6	330119	330124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556572981
10354	NC_022658	CAG	2	6	330200	330205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572981
10355	NC_022658	CCT	2	6	330226	330231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556572981
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10357	NC_022658	TCC	2	6	330285	330290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556572981
10358	NC_022658	CGTA	2	8	330298	330305	25 %	25 %	25 %	25 %	556572981
10359	NC_022658	ATC	2	6	330309	330314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572981
10360	NC_022658	CGGT	2	8	330328	330335	0 %	25 %	50 %	25 %	556572981
10361	NC_022658	GT	3	6	330435	330440	0 %	50 %	50 %	0 %	556572981
10362	NC_022658	TTC	2	6	330522	330527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556572981
10363	NC_022658	TGG	2	6	330627	330632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556572981
10364	NC_022658	CCT	2	6	330656	330661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10365	NC_022658	TTAAT	2	10	330720	330729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10366	NC_022658	GCG	2	6	330744	330749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572832
10367	NC_022658	GCA	2	6	330752	330757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572832
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10379	NC_022658	CGG	2	6	331562	331567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10484	NC_022658	CCT	2	6	336983	336988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10485	NC_022658	TAAT	2	8	337023	337030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10486	NC_022658	GCC	2	6	337070	337075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572930
10487	NC_022658	CCT	2	6	337173	337178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556572930
10488	NC_022658	GAG	2	6	337184	337189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556572930
10489	NC_022658	GCT	2	6	337206	337211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572930
10490	NC_022658	CCA	2	6	337233	337238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556572930
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10492	NC_022658	GCC	2	6	337271	337276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572930
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