MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens CC178

Total Repeats: 84032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_022653	CTTC	2	8	49633	49640	0 %	50 %	0 %	50 %	556555802
1003	NC_022653	TC	3	6	49667	49672	0 %	50 %	0 %	50 %	556555802
1004	NC_022653	T	7	7	49677	49683	0 %	100 %	0 %	0 %	556555802
1005	NC_022653	TA	3	6	49764	49769	50 %	50 %	0 %	0 %	556555803
1006	NC_022653	TC	3	6	49771	49776	0 %	50 %	0 %	50 %	556555803
1007	NC_022653	GAG	2	6	49778	49783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555803
1008	NC_022653	AGG	2	6	49785	49790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555803
1009	NC_022653	TCA	2	6	49797	49802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555803
1010	NC_022653	CA	3	6	49801	49806	50 %	0 %	0 %	50 %	556555803
1011	NC_022653	A	6	6	49806	49811	100 %	0 %	0 %	0 %	556555803
1012	NC_022653	A	6	6	49814	49819	100 %	0 %	0 %	0 %	556555803
1013	NC_022653	TAT	2	6	49867	49872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555803
1014	NC_022653	CTG	2	6	49874	49879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555803
1015	NC_022653	GTTTCT	2	12	49928	49939	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556555803
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1017	NC_022653	GAA	2	6	50120	50125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555803
1018	NC_022653	GAAC	2	8	50167	50174	50 %	0 %	25 %	25 %	556555803
1019	NC_022653	CAG	3	9	50211	50219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555803
1020	NC_022653	ATG	2	6	50280	50285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555803
1021	NC_022653	GAAA	2	8	50289	50296	75 %	0 %	25 %	0 %	556555803
1022	NC_022653	GAC	2	6	50308	50313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555803
1023	NC_022653	GCA	2	6	50341	50346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555803
1024	NC_022653	A	6	6	50404	50409	100 %	0 %	0 %	0 %	556555803
1025	NC_022653	A	6	6	50463	50468	100 %	0 %	0 %	0 %	556555803
1026	NC_022653	GAAA	2	8	50482	50489	75 %	0 %	25 %	0 %	556555803
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1029	NC_022653	GAAA	2	8	50515	50522	75 %	0 %	25 %	0 %	556555803
1030	NC_022653	AAG	2	6	50541	50546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555803
1031	NC_022653	TGT	2	6	50569	50574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555803
1032	NC_022653	AAG	2	6	50589	50594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555803
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1035	NC_022653	AGATC	2	10	50638	50647	40 %	20 %	20 %	20 %	556555803
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1039	NC_022653	T	7	7	51059	51065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022653	T	7	7	51143	51149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022653	GGA	2	6	51150	51155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022653	ATT	2	6	51175	51180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555804
1043	NC_022653	GC	3	6	51205	51210	0 %	0 %	50 %	50 %	556555804
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1073	NC_022653	ATTC	2	8	52656	52663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_022653	CTT	2	6	52724	52729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_022653	ATG	2	6	52732	52737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_022653	GATT	2	8	52894	52901	25 %	50 %	25 %	0 %	556555806
1077	NC_022653	GAAA	2	8	52957	52964	75 %	0 %	25 %	0 %	556555806
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1085	NC_022653	GCT	2	6	53219	53224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555806
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1090	NC_022653	GGA	2	6	53583	53588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555806
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1094	NC_022653	AAT	2	6	53753	53758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_022653	TTG	2	6	53760	53765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_022653	TTA	2	6	53774	53779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_022653	TTG	2	6	53821	53826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022653	CGG	2	6	53928	53933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555807
1099	NC_022653	CCG	2	6	53934	53939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555807
1100	NC_022653	CTGA	2	8	54055	54062	25 %	25 %	25 %	25 %	556555807
1101	NC_022653	TTTTG	2	10	54142	54151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022653	ATT	2	6	54170	54175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022653	GTT	2	6	54267	54272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_022653	CGT	2	6	54286	54291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1108	NC_022653	T	6	6	54498	54503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022653	AATC	2	8	54638	54645	50 %	25 %	0 %	25 %	556555809
1110	NC_022653	GAT	2	6	54695	54700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555809
1111	NC_022653	GAC	2	6	54704	54709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555809
1112	NC_022653	GAT	2	6	54792	54797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555809
1113	NC_022653	A	6	6	54852	54857	100 %	0 %	0 %	0 %	556555809
1114	NC_022653	CGG	2	6	54908	54913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555809
1115	NC_022653	AGC	2	6	54915	54920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555809
1116	NC_022653	CGA	2	6	55120	55125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555809
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1121	NC_022653	A	6	6	55216	55221	100 %	0 %	0 %	0 %	556555809
1122	NC_022653	GAT	2	6	55295	55300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555809
1123	NC_022653	AGCGGA	2	12	55344	55355	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	556555809
1124	NC_022653	GAT	2	6	55448	55453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555809
1125	NC_022653	TAT	2	6	55496	55501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_022653	ATT	2	6	55508	55513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_022653	TCG	2	6	55542	55547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555810
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1129	NC_022653	ATT	2	6	55574	55579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555810
1130	NC_022653	ATCA	2	8	55631	55638	50 %	25 %	0 %	25 %	556555810
1131	NC_022653	TCA	2	6	55645	55650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555810
1132	NC_022653	ATT	2	6	55669	55674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555810
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1150	NC_022653	TG	3	6	56697	56702	0 %	50 %	50 %	0 %	556555811
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1152	NC_022653	TGTA	2	8	56851	56858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_022653	A	7	7	56873	56879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_022653	TA	3	6	56937	56942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1155	NC_022653	GGT	2	6	56950	56955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1168	NC_022653	AT	3	6	57407	57412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1234	NC_022653	ATAA	2	8	61140	61147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1235	NC_022653	T	6	6	61174	61179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1240	NC_022653	AACAC	2	10	61408	61417	60 %	0 %	0 %	40 %	556555817
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1242	NC_022653	AG	3	6	61484	61489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_022653	ACA	2	6	61504	61509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555818
1244	NC_022653	AAAG	2	8	61524	61531	75 %	0 %	25 %	0 %	556555818
1245	NC_022653	GAT	2	6	61533	61538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555818
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1248	NC_022653	T	7	7	61735	61741	0 %	100 %	0 %	0 %	556555818
1249	NC_022653	TGAA	2	8	61750	61757	50 %	25 %	25 %	0 %	556555818
1250	NC_022653	TTC	2	6	61763	61768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555818
1251	NC_022653	GC	3	6	61796	61801	0 %	0 %	50 %	50 %	556555818
1252	NC_022653	GAA	2	6	61876	61881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555818
1253	NC_022653	CCG	2	6	61887	61892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555818
1254	NC_022653	AGC	2	6	61908	61913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555818
1255	NC_022653	CG	3	6	61961	61966	0 %	0 %	50 %	50 %	556555818
1256	NC_022653	CGG	2	6	62030	62035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555818
1257	NC_022653	TGA	2	6	62126	62131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555818
1258	NC_022653	ATC	2	6	62187	62192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555818
1259	NC_022653	GAA	2	6	62199	62204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555818
1260	NC_022653	ACAA	2	8	62269	62276	75 %	0 %	0 %	25 %	556555818
1261	NC_022653	TC	3	6	62357	62362	0 %	50 %	0 %	50 %	556555818
1262	NC_022653	GTT	2	6	62414	62419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555818
1263	NC_022653	GGA	2	6	62453	62458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555818
1264	NC_022653	AGA	2	6	62471	62476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555818
1265	NC_022653	CATT	2	8	62525	62532	25 %	50 %	0 %	25 %	556555818
1266	NC_022653	GCG	2	6	62567	62572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555818
1267	NC_022653	TATT	2	8	62579	62586	25 %	75 %	0 %	0 %	556555818
1268	NC_022653	ATT	2	6	62591	62596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555818
1269	NC_022653	CGT	2	6	62726	62731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555818
1270	NC_022653	GCTG	2	8	62777	62784	0 %	25 %	50 %	25 %	556555818
1271	NC_022653	TGA	2	6	62887	62892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555818
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1273	NC_022653	GTC	2	6	63015	63020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555818
1274	NC_022653	CATT	2	8	63098	63105	25 %	50 %	0 %	25 %	556555818
1275	NC_022653	GGC	2	6	63204	63209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555818
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1279	NC_022653	AAGC	2	8	63295	63302	50 %	0 %	25 %	25 %	556555818
1280	NC_022653	AG	3	6	63420	63425	50 %	0 %	50 %	0 %	556555818
1281	NC_022653	TTTGC	2	10	63440	63449	0 %	60 %	20 %	20 %	556555818
1282	NC_022653	CTT	2	6	63528	63533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555818
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1284	NC_022653	GCA	3	9	63554	63562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555818
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1286	NC_022653	AACGG	2	10	63669	63678	40 %	0 %	40 %	20 %	556555818
1287	NC_022653	GTC	2	6	63720	63725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555818
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1292	NC_022653	CGC	2	6	63901	63906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555818
1293	NC_022653	GC	3	6	63952	63957	0 %	0 %	50 %	50 %	556555818
1294	NC_022653	GC	3	6	63987	63992	0 %	0 %	50 %	50 %	556555818
1295	NC_022653	GGA	2	6	63993	63998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555818
1296	NC_022653	TGA	2	6	64046	64051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555818
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1300	NC_022653	GCAA	2	8	64615	64622	50 %	0 %	25 %	25 %	556555818
1301	NC_022653	A	6	6	64621	64626	100 %	0 %	0 %	0 %	556555818
1302	NC_022653	GAG	2	6	64665	64670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555818
1303	NC_022653	ATC	2	6	64692	64697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555818
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1309	NC_022653	TAAAG	2	10	65107	65116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1310	NC_022653	ATC	2	6	65140	65145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1311	NC_022653	AG	3	6	65153	65158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1312	NC_022653	AG	3	6	65164	65169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1313	NC_022653	CGT	2	6	65191	65196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555819
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1323	NC_022653	ATT	2	6	65718	65723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1325	NC_022653	TCATAT	2	12	65774	65785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1326	NC_022653	CT	3	6	65789	65794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1327	NC_022653	ATA	2	6	65821	65826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1334	NC_022653	CGCC	2	8	66225	66232	0 %	0 %	25 %	75 %	556555820
1335	NC_022653	ATGAT	2	10	66317	66326	40 %	40 %	20 %	0 %	556555820
1336	NC_022653	CTT	2	6	66358	66363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555820
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1342	NC_022653	A	6	6	66555	66560	100 %	0 %	0 %	0 %	556555820
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1362	NC_022653	CCTT	2	8	67395	67402	0 %	50 %	0 %	50 %	556555820
1363	NC_022653	GA	3	6	67434	67439	50 %	0 %	50 %	0 %	556555820
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1368	NC_022653	ACC	2	6	67557	67562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555821
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1373	NC_022653	TTTG	2	8	68053	68060	0 %	75 %	25 %	0 %	556555821
1374	NC_022653	AAAT	2	8	68079	68086	75 %	25 %	0 %	0 %	556555821
1375	NC_022653	CCG	2	6	68108	68113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555821
1376	NC_022653	A	6	6	68117	68122	100 %	0 %	0 %	0 %	556555821
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1378	NC_022653	TAT	2	6	68161	68166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555821
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1380	NC_022653	AAG	2	6	68228	68233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555821
1381	NC_022653	AGA	2	6	68299	68304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555821
1382	NC_022653	TGC	2	6	68331	68336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555821
1383	NC_022653	TGA	2	6	68374	68379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555821
1384	NC_022653	TCA	2	6	68382	68387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555821
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