MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3 plasmid pBamNAU-B3a

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022531	ATC	2	6	6	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022531	TTG	2	6	126	131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022531	ATG	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022531	GCA	2	6	267	272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022531	CGG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022531	GGA	2	6	394	399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022531	GAA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022531	GTA	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700064
9	NC_022531	TGC	2	6	888	893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
10	NC_022531	TTC	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
11	NC_022531	CAA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549700064
12	NC_022531	TTG	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
13	NC_022531	CTT	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
14	NC_022531	TTG	2	6	1314	1319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
15	NC_022531	TGT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
16	NC_022531	GTC	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
17	NC_022531	CGT	2	6	1487	1492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
18	NC_022531	AGT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700064
19	NC_022531	ACA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549700064
20	NC_022531	TTC	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
21	NC_022531	CTG	2	6	1574	1579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
22	NC_022531	CTT	3	9	1598	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
23	NC_022531	TGT	2	6	1649	1654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
24	NC_022531	CAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549700064
25	NC_022531	TGT	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
26	NC_022531	TCT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
27	NC_022531	CCA	2	6	2057	2062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022531	TTG	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022531	CAA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022531	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022531	TGC	2	6	2581	2586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022531	CGG	2	6	2628	2633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022531	AGC	2	6	3118	3123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
34	NC_022531	ATC	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549700065
35	NC_022531	TGT	2	6	3181	3186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700065
36	NC_022531	GAT	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700065
37	NC_022531	AAG	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
38	NC_022531	CAG	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
39	NC_022531	GCA	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
40	NC_022531	GGC	2	6	3668	3673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549700065
41	NC_022531	GAA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
42	NC_022531	GAG	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549700065
43	NC_022531	GCG	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549700065
44	NC_022531	GAA	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
45	NC_022531	AGA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
46	NC_022531	GCT	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700065
47	NC_022531	TTC	2	6	4300	4305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
48	NC_022531	CCA	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549700066
49	NC_022531	TTC	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
50	NC_022531	TCG	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700066
51	NC_022531	TTC	2	6	4677	4682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
52	NC_022531	TAT	2	6	4829	4834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022531	GTT	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022531	AGG	2	6	5044	5049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022531	GTA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022531	AGA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700067
57	NC_022531	AGA	3	9	5180	5188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700067
58	NC_022531	GGA	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022531	TGG	2	6	5421	5426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022531	CCT	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022531	TGT	2	6	5668	5673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022531	GTA	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022531	CAA	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022531	TTA	2	6	5947	5952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
65	NC_022531	TAT	2	6	5956	5961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
66	NC_022531	TGA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
67	NC_022531	TTC	2	6	6015	6020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700068
68	NC_022531	TGA	2	6	6198	6203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
69	NC_022531	TAT	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
70	NC_022531	AAG	2	6	6307	6312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
71	NC_022531	GAT	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
72	NC_022531	GAA	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
73	NC_022531	TTA	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
74	NC_022531	TTG	2	6	6694	6699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700068
75	NC_022531	ATT	2	6	6714	6719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
76	NC_022531	AAG	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
77	NC_022531	TGC	2	6	6937	6942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022531	CGG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022531	TAC	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022531	TAC	2	6	7366	7371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022531	GCT	2	6	7440	7445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022531	AAT	2	6	7604	7609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022531	GAA	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022531	ACA	2	6	7777	7782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022531	TAT	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022531	GAA	2	6	7998	8003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022531	AGA	2	6	8045	8050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022531	ATA	2	6	8225	8230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022531	AGA	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022531	GTA	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022531	ATG	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022531	GAA	2	6	8431	8436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.