MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia pseudomallei MSHR305 chromosome 1

Total Repeats: 4165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021877	GGGCG	2	10	38	47	0 %	0 %	80 %	20 %	526459012
2	NC_021877	GAATC	2	10	343	352	40 %	20 %	20 %	20 %	526459012
3	NC_021877	CGGCG	2	10	470	479	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_021877	GCGTC	2	10	1372	1381	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021877	CGGCG	2	10	1610	1619	0 %	0 %	60 %	40 %	526457160
6	NC_021877	CGTCG	2	10	1808	1817	0 %	20 %	40 %	40 %	526457160
7	NC_021877	GCGCG	2	10	1850	1859	0 %	0 %	60 %	40 %	526457160
8	NC_021877	GCAGC	2	10	2722	2731	20 %	0 %	40 %	40 %	526458289
9	NC_021877	GGCGC	2	10	3040	3049	0 %	0 %	60 %	40 %	526458289
10	NC_021877	GCGCG	2	10	3070	3079	0 %	0 %	60 %	40 %	526458289
11	NC_021877	GATCG	2	10	5129	5138	20 %	20 %	40 %	20 %	526458591
12	NC_021877	CCGCG	2	10	6070	6079	0 %	0 %	40 %	60 %	526458591
13	NC_021877	GCCGC	2	10	6163	6172	0 %	0 %	40 %	60 %	526458591
14	NC_021877	TCGGC	2	10	8749	8758	0 %	20 %	40 %	40 %	526458978
15	NC_021877	GCGCG	2	10	10174	10183	0 %	0 %	60 %	40 %	526457458
16	NC_021877	TCGCG	2	10	10281	10290	0 %	20 %	40 %	40 %	526457458
17	NC_021877	GCAAC	2	10	11255	11264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021877	CCGCG	2	10	11869	11878	0 %	0 %	40 %	60 %	526458857
19	NC_021877	GCGCG	2	10	13031	13040	0 %	0 %	60 %	40 %	526458713
20	NC_021877	GGCGC	2	10	13414	13423	0 %	0 %	60 %	40 %	526458713
21	NC_021877	CGGCG	2	10	13844	13853	0 %	0 %	60 %	40 %	526458713
22	NC_021877	GCGCG	2	10	14941	14950	0 %	0 %	60 %	40 %	526458713
23	NC_021877	GCGCG	2	10	15524	15533	0 %	0 %	60 %	40 %	526458713
24	NC_021877	TGCGC	2	10	15544	15553	0 %	20 %	40 %	40 %	526458713
25	NC_021877	GGATC	2	10	17104	17113	20 %	20 %	40 %	20 %	526458713
26	NC_021877	ACGCG	2	10	17404	17413	20 %	0 %	40 %	40 %	526458713
27	NC_021877	GCGCG	2	10	19349	19358	0 %	0 %	60 %	40 %	526458713
28	NC_021877	GCCGC	2	10	20031	20040	0 %	0 %	40 %	60 %	526458713
29	NC_021877	GCGCG	2	10	20245	20254	0 %	0 %	60 %	40 %	526458713
30	NC_021877	CGTGC	2	10	21692	21701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_021877	CGGCG	2	10	21967	21976	0 %	0 %	60 %	40 %	526457281
32	NC_021877	GGGCG	2	10	22395	22404	0 %	0 %	80 %	20 %	526457281
33	NC_021877	GCCGC	2	10	22803	22812	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_021877	CCGCG	2	10	24302	24311	0 %	0 %	40 %	60 %	526458920
35	NC_021877	CGATT	2	10	24752	24761	20 %	40 %	20 %	20 %	526458920
36	NC_021877	ACGCG	2	10	25678	25687	20 %	0 %	40 %	40 %	526457054
37	NC_021877	CGGCG	2	10	26059	26068	0 %	0 %	60 %	40 %	526457054
38	NC_021877	CCGCG	2	10	27354	27363	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_021877	CGCGG	2	10	27473	27482	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_021877	CACAC	2	10	27684	27693	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_021877	GCCGC	2	10	28867	28876	0 %	0 %	40 %	60 %	526458618
42	NC_021877	CCGGC	2	10	29877	29886	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_021877	CGGCG	2	10	29887	29896	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_021877	CGAGC	2	10	30170	30179	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_021877	CGCGA	2	10	30299	30308	20 %	0 %	40 %	40 %	526458034
46	NC_021877	GCGTC	2	10	31092	31101	0 %	20 %	40 %	40 %	526458470
47	NC_021877	CCGGC	2	10	31141	31150	0 %	0 %	40 %	60 %	526458470
48	NC_021877	TGATC	2	10	31518	31527	20 %	40 %	20 %	20 %	526458470
49	NC_021877	CGCGC	2	10	32119	32128	0 %	0 %	40 %	60 %	526456850
50	NC_021877	CGCGA	2	10	33079	33088	20 %	0 %	40 %	40 %	526459118
51	NC_021877	GACGC	2	10	34180	34189	20 %	0 %	40 %	40 %	526459118
52	NC_021877	ACGCG	2	10	35181	35190	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_021877	CTGTT	2	10	36763	36772	0 %	60 %	20 %	20 %	526458333
54	NC_021877	CGCTG	2	10	37764	37773	0 %	20 %	40 %	40 %	526458401
55	NC_021877	GCGCG	2	10	37789	37798	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021877	CATGA	2	10	37934	37943	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021877	GCGCG	2	10	39472	39481	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_021877	GCGCG	2	10	39613	39622	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_021877	GCCGC	2	10	39803	39812	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_021877	CGAGC	2	10	40583	40592	20 %	0 %	40 %	40 %	526459021
61	NC_021877	GCGGG	2	10	41075	41084	0 %	0 %	80 %	20 %	526459021
62	NC_021877	GCCGG	2	10	41487	41496	0 %	0 %	60 %	40 %	526458846
63	NC_021877	TCGCG	2	10	42547	42556	0 %	20 %	40 %	40 %	526457134
64	NC_021877	CGGCG	2	10	42739	42748	0 %	0 %	60 %	40 %	526457134
65	NC_021877	GCGAC	2	10	43195	43204	20 %	0 %	40 %	40 %	526457134
66	NC_021877	TGCGC	2	10	43672	43681	0 %	20 %	40 %	40 %	526457134
67	NC_021877	CGCGC	2	10	44139	44148	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_021877	GCGCC	2	10	45514	45523	0 %	0 %	40 %	60 %	526457024
69	NC_021877	TTGAT	2	10	45788	45797	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021877	GGGCG	2	10	45916	45925	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021877	ACGCG	2	10	46148	46157	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_021877	CCGCG	2	10	46198	46207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_021877	GCCGG	2	10	46220	46229	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_021877	GCGTC	2	10	47108	47117	0 %	20 %	40 %	40 %	526457918
75	NC_021877	GCACG	2	10	47715	47724	20 %	0 %	40 %	40 %	526458316
76	NC_021877	CGGGC	2	10	47763	47772	0 %	0 %	60 %	40 %	526458316
77	NC_021877	GCATC	2	10	48368	48377	20 %	20 %	20 %	40 %	526458316
78	NC_021877	CGCGG	2	10	49330	49339	0 %	0 %	60 %	40 %	526458221
79	NC_021877	CGGCG	2	10	49612	49621	0 %	0 %	60 %	40 %	526457251
80	NC_021877	CCGCG	2	10	49979	49988	0 %	0 %	40 %	60 %	526457190
81	NC_021877	TGCCG	2	10	51080	51089	0 %	20 %	40 %	40 %	526459292
82	NC_021877	GCGCC	2	10	51946	51955	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_021877	GGTCG	2	10	52056	52065	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021877	CTGCG	2	10	53975	53984	0 %	20 %	40 %	40 %	526458654
85	NC_021877	TCGTC	2	10	54159	54168	0 %	40 %	20 %	40 %	526458654
86	NC_021877	GCGCG	2	10	55650	55659	0 %	0 %	60 %	40 %	526458654
87	NC_021877	CGGCG	2	10	57829	57838	0 %	0 %	60 %	40 %	526459119
88	NC_021877	CCGCG	2	10	59433	59442	0 %	0 %	40 %	60 %	526458436
89	NC_021877	GCGCG	2	10	59733	59742	0 %	0 %	60 %	40 %	526458436
90	NC_021877	TCGCG	2	10	60423	60432	0 %	20 %	40 %	40 %	526458436
91	NC_021877	CGGGC	2	10	60454	60463	0 %	0 %	60 %	40 %	526458436
92	NC_021877	GCACG	2	10	62783	62792	20 %	0 %	40 %	40 %	526458759
93	NC_021877	CGGCG	2	10	62813	62822	0 %	0 %	60 %	40 %	526458759
94	NC_021877	GCGCG	2	10	62906	62915	0 %	0 %	60 %	40 %	526458759
95	NC_021877	CGCGC	2	10	63902	63911	0 %	0 %	40 %	60 %	526456996
96	NC_021877	GCCGC	2	10	63916	63925	0 %	0 %	40 %	60 %	526456996
97	NC_021877	CGCGG	2	10	64218	64227	0 %	0 %	60 %	40 %	526456996
98	NC_021877	CGGCG	2	10	64749	64758	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_021877	CGCTG	2	10	66093	66102	0 %	20 %	40 %	40 %	526459257
100	NC_021877	CGCGC	2	10	66955	66964	0 %	0 %	40 %	60 %	526459257
101	NC_021877	GCGCG	3	15	67127	67141	0 %	0 %	60 %	40 %	526459257
102	NC_021877	CGTGC	2	10	68117	68126	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021877	GCGCG	2	10	68339	68348	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021877	TCGTG	2	10	69713	69722	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021877	CGAAT	2	10	70521	70530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021877	GGGAG	2	10	71309	71318	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021877	CTCAT	2	10	73307	73316	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_021877	GCTTC	2	10	74200	74209	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021877	GCTTC	2	10	74534	74543	0 %	40 %	20 %	40 %	526458264
110	NC_021877	TCGCG	2	10	75183	75192	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_021877	TCGGC	2	10	76931	76940	0 %	20 %	40 %	40 %	526459154
112	NC_021877	CGCGG	2	10	77134	77143	0 %	0 %	60 %	40 %	526459154
113	NC_021877	CGCTT	2	10	78645	78654	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_021877	GCGCG	2	10	78762	78771	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_021877	GGCGA	2	10	79119	79128	20 %	0 %	60 %	20 %	526458672
116	NC_021877	CGGCG	2	10	81315	81324	0 %	0 %	60 %	40 %	526457930
117	NC_021877	GCGCC	2	10	82416	82425	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_021877	TGCGC	2	10	82676	82685	0 %	20 %	40 %	40 %	526457435
119	NC_021877	CGCGC	2	10	83594	83603	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_021877	ACGGC	2	10	85512	85521	20 %	0 %	40 %	40 %	526458167
121	NC_021877	CGTTG	2	10	87335	87344	0 %	40 %	40 %	20 %	526459267
122	NC_021877	GCGCG	2	10	88107	88116	0 %	0 %	60 %	40 %	526458603
123	NC_021877	CGCGG	2	10	88127	88136	0 %	0 %	60 %	40 %	526458603
124	NC_021877	GCGCG	2	10	89578	89587	0 %	0 %	60 %	40 %	526457657
125	NC_021877	TTTCC	2	10	91170	91179	0 %	60 %	0 %	40 %	526457932
126	NC_021877	TTCGA	2	10	91790	91799	20 %	40 %	20 %	20 %	526456925
127	NC_021877	GCGCG	2	10	92137	92146	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_021877	TCGTC	2	10	96080	96089	0 %	40 %	20 %	40 %	526458370
129	NC_021877	GGCGA	2	10	99611	99620	20 %	0 %	60 %	20 %	526457465
130	NC_021877	GCGCG	2	10	99696	99705	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_021877	CGAAG	2	10	100115	100124	40 %	0 %	40 %	20 %	526458858
132	NC_021877	CCGGG	2	10	100248	100257	0 %	0 %	60 %	40 %	526457150
133	NC_021877	CAATT	2	10	100868	100877	40 %	40 %	0 %	20 %	526457150
134	NC_021877	CGCGG	2	10	101930	101939	0 %	0 %	60 %	40 %	526457150
135	NC_021877	AAGTG	2	10	102457	102466	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021877	GCCCA	2	10	102871	102880	20 %	0 %	20 %	60 %	526458245
137	NC_021877	ACGGC	2	10	103732	103741	20 %	0 %	40 %	40 %	526458487
138	NC_021877	ATGGG	2	10	105992	106001	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021877	CCGCG	2	10	107065	107074	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_021877	ACGCC	2	10	107250	107259	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_021877	CGTCG	2	10	108682	108691	0 %	20 %	40 %	40 %	526458310
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251	NC_021877	CGGCG	2	10	195958	195967	0 %	0 %	60 %	40 %	526458512
252	NC_021877	GCGCG	2	10	196062	196071	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
253	NC_021877	GATCG	2	10	196800	196809	20 %	20 %	40 %	20 %	526457027
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255	NC_021877	TCGAC	2	10	200465	200474	20 %	20 %	20 %	40 %	526457598
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263	NC_021877	CGCGG	2	10	206978	206987	0 %	0 %	60 %	40 %	526458950
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265	NC_021877	CGGCA	2	10	209487	209496	20 %	0 %	40 %	40 %	526457183
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268	NC_021877	TGCGG	2	10	213384	213393	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
269	NC_021877	GGCGC	2	10	214294	214303	0 %	0 %	60 %	40 %	526458021
270	NC_021877	ATCGA	2	10	214647	214656	40 %	20 %	20 %	20 %	526458021
271	NC_021877	GCGCG	2	10	215048	215057	0 %	0 %	60 %	40 %	526458021
272	NC_021877	TCGCG	2	10	215101	215110	0 %	20 %	40 %	40 %	526458021
273	NC_021877	TGGGC	2	10	217200	217209	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
274	NC_021877	TTCGA	2	10	217212	217221	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_021877	CGCAT	2	10	219890	219899	20 %	20 %	20 %	40 %	526457433
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278	NC_021877	CGACG	2	10	221536	221545	20 %	0 %	40 %	40 %	526457915
279	NC_021877	GACGC	2	10	221702	221711	20 %	0 %	40 %	40 %	526457915
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281	NC_021877	GACGC	2	10	223505	223514	20 %	0 %	40 %	40 %	526458102
282	NC_021877	CTCGG	2	10	225908	225917	0 %	20 %	40 %	40 %	526458102
283	NC_021877	TCGAT	2	10	226734	226743	20 %	40 %	20 %	20 %	526458102
284	NC_021877	ATCGA	2	10	228210	228219	40 %	20 %	20 %	20 %	526457694
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288	NC_021877	GGATC	2	10	230152	230161	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
289	NC_021877	CTTCG	2	10	230822	230831	0 %	40 %	20 %	40 %	526458248
290	NC_021877	CGCGC	2	10	232303	232312	0 %	0 %	40 %	60 %	526457940
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319	NC_021877	CGGCG	2	10	252409	252418	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
320	NC_021877	CGCGC	2	10	252453	252462	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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384	NC_021877	GCTCG	2	10	311826	311835	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
385	NC_021877	GCACC	2	10	311918	311927	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
386	NC_021877	GCGCG	2	10	312275	312284	0 %	0 %	60 %	40 %	526456930
387	NC_021877	CGACG	2	10	314222	314231	20 %	0 %	40 %	40 %	526457124
388	NC_021877	CCGAT	2	10	314585	314594	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
389	NC_021877	AGCCG	2	10	314978	314987	20 %	0 %	40 %	40 %	526458119
390	NC_021877	ACGAC	2	10	315109	315118	40 %	0 %	20 %	40 %	526458119
391	NC_021877	CGGCA	2	10	319046	319055	20 %	0 %	40 %	40 %	526459271
392	NC_021877	TGAAC	2	10	319574	319583	40 %	20 %	20 %	20 %	526458247
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394	NC_021877	CGCGC	2	10	320385	320394	0 %	0 %	40 %	60 %	526458247
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397	NC_021877	GCCCG	2	10	322435	322444	0 %	0 %	40 %	60 %	526457891
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400	NC_021877	CCGCG	2	10	325691	325700	0 %	0 %	40 %	60 %	526458448
401	NC_021877	GCTCG	2	10	326212	326221	0 %	20 %	40 %	40 %	526458448
402	NC_021877	ACGCA	2	10	327296	327305	40 %	0 %	20 %	40 %	526457608
403	NC_021877	CGAGC	2	10	328404	328413	20 %	0 %	40 %	40 %	526459051
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405	NC_021877	TCCGA	2	10	328607	328616	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_021877	GGCGA	2	10	419550	419559	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

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