MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei MSHR305 chromosome 1

Total Repeats: 108525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021877	TAT	2	6	88574	88579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021877	TC	3	6	88686	88691	0 %	50 %	0 %	50 %	526457657
3003	NC_021877	GGT	2	6	88693	88698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526457657
3004	NC_021877	CGG	2	6	88705	88710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457657
3005	NC_021877	TGT	2	6	88872	88877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526457657
3006	NC_021877	GCA	2	6	88906	88911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526457657
3007	NC_021877	CG	3	6	88926	88931	0 %	0 %	50 %	50 %	526457657
3008	NC_021877	CTG	2	6	88985	88990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457657
3009	NC_021877	TCGA	2	8	89069	89076	25 %	25 %	25 %	25 %	526457657
3010	NC_021877	GCC	2	6	89101	89106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457657
3011	NC_021877	TCG	2	6	89121	89126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457657
3012	NC_021877	TCG	2	6	89157	89162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457657
3013	NC_021877	GC	3	6	89163	89168	0 %	0 %	50 %	50 %	526457657
3014	NC_021877	CTG	2	6	89174	89179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457657
3015	NC_021877	CAG	2	6	89180	89185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526457657
3016	NC_021877	CGC	2	6	89190	89195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457657
3017	NC_021877	CGA	2	6	89206	89211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526457657
3018	NC_021877	GGC	2	6	89253	89258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457657
3019	NC_021877	CACG	2	8	89296	89303	25 %	0 %	25 %	50 %	526457657
3020	NC_021877	CGG	2	6	89325	89330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457657
3021	NC_021877	TGA	2	6	89334	89339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526457657
3022	NC_021877	CGC	2	6	89374	89379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457657
3023	NC_021877	GC	3	6	89410	89415	0 %	0 %	50 %	50 %	526457657
3024	NC_021877	GCC	2	6	89497	89502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457657
3025	NC_021877	GC	3	6	89509	89514	0 %	0 %	50 %	50 %	526457657
3026	NC_021877	TCG	2	6	89517	89522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457657
3027	NC_021877	TCG	2	6	89529	89534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457657
3028	NC_021877	AACG	2	8	89546	89553	50 %	0 %	25 %	25 %	526457657
3029	NC_021877	GCGCG	2	10	89578	89587	0 %	0 %	60 %	40 %	526457657
3030	NC_021877	GC	3	6	89629	89634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_021877	CG	3	6	89659	89664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_021877	GCC	2	6	89689	89694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_021877	CGC	2	6	89873	89878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_021877	A	6	6	89902	89907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021877	CG	3	6	89958	89963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_021877	CGC	2	6	89966	89971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_021877	CG	3	6	89989	89994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_021877	GC	3	6	89995	90000	0 %	0 %	50 %	50 %	526458665
3039	NC_021877	GCC	2	6	90048	90053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458665
3040	NC_021877	GCC	2	6	90061	90066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458665
3041	NC_021877	CG	3	6	90108	90113	0 %	0 %	50 %	50 %	526458665
3042	NC_021877	GC	3	6	90159	90164	0 %	0 %	50 %	50 %	526458665
3043	NC_021877	GTC	2	6	90192	90197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458665
3044	NC_021877	CG	4	8	90270	90277	0 %	0 %	50 %	50 %	526458665
3045	NC_021877	ATG	2	6	90297	90302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526458665
3046	NC_021877	CGA	2	6	90353	90358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458665
3047	NC_021877	GCG	2	6	90359	90364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458665
3048	NC_021877	TCA	2	6	90380	90385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526458665
3049	NC_021877	TCG	4	12	90394	90405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458665
3050	NC_021877	CG	5	10	90448	90457	0 %	0 %	50 %	50 %	526457932
3051	NC_021877	GAC	2	6	90482	90487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526457932
3052	NC_021877	GCG	2	6	90535	90540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457932
3053	NC_021877	GGC	2	6	90543	90548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457932
3054	NC_021877	ACG	2	6	90551	90556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526457932
3055	NC_021877	CG	3	6	90565	90570	0 %	0 %	50 %	50 %	526457932
3056	NC_021877	CGA	2	6	90606	90611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526457932
3057	NC_021877	TCGA	2	8	90665	90672	25 %	25 %	25 %	25 %	526457932
3058	NC_021877	AGC	2	6	90698	90703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526457932
3059	NC_021877	CGA	2	6	90738	90743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526457932
3060	NC_021877	TGC	2	6	90753	90758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457932
3061	NC_021877	GCC	2	6	90781	90786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457932
3062	NC_021877	CG	3	6	90794	90799	0 %	0 %	50 %	50 %	526457932
3063	NC_021877	TGG	3	9	90884	90892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526457932
3064	NC_021877	CGG	2	6	90894	90899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457932
3065	NC_021877	CCT	2	6	90900	90905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526457932
3066	NC_021877	AGCGCG	2	12	90914	90925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526457932
3067	NC_021877	CGA	3	9	90943	90951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526457932
3068	NC_021877	TCG	2	6	90980	90985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457932
3069	NC_021877	TGA	2	6	91059	91064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526457932
3070	NC_021877	GAG	2	6	91096	91101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526457932
3071	NC_021877	CGCGAT	2	12	91102	91113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526457932
3072	NC_021877	TTTCC	2	10	91170	91179	0 %	60 %	0 %	40 %	526457932
3073	NC_021877	TTG	2	6	91180	91185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021877	TTTC	2	8	91186	91193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3076	NC_021877	GC	3	6	91247	91252	0 %	0 %	50 %	50 %	526456925
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3081	NC_021877	GC	3	6	91353	91358	0 %	0 %	50 %	50 %	526456925
3082	NC_021877	CGA	3	9	91380	91388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526456925
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3085	NC_021877	CCTT	2	8	91475	91482	0 %	50 %	0 %	50 %	526456925
3086	NC_021877	CGA	2	6	91488	91493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526456925
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3089	NC_021877	GC	3	6	91518	91523	0 %	0 %	50 %	50 %	526456925
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3093	NC_021877	GCGCCG	2	12	91671	91682	0 %	0 %	50 %	50 %	526456925
3094	NC_021877	GCG	2	6	91713	91718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526456925
3095	NC_021877	GGGCGC	2	12	91720	91731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526456925
3096	NC_021877	GCCG	2	8	91741	91748	0 %	0 %	50 %	50 %	526456925
3097	NC_021877	GC	3	6	91761	91766	0 %	0 %	50 %	50 %	526456925
3098	NC_021877	TTCGA	2	10	91790	91799	20 %	40 %	20 %	20 %	526456925
3099	NC_021877	CGT	2	6	91815	91820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526456925
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3101	NC_021877	CAG	2	6	91843	91848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526456925
3102	NC_021877	GCG	3	9	91968	91976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_021877	GC	3	6	91985	91990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_021877	TGC	2	6	91998	92003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_021877	GCGCG	2	10	92137	92146	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3106	NC_021877	CG	4	8	92143	92150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_021877	CGC	2	6	92172	92177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_021877	GCC	2	6	92182	92187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458151
3109	NC_021877	GCA	2	6	92304	92309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458151
3110	NC_021877	TTC	2	6	92337	92342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526458151
3111	NC_021877	ATG	2	6	92416	92421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526458151
3112	NC_021877	ATT	2	6	92448	92453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021877	T	6	6	92493	92498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021877	GCG	2	6	92537	92542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_021877	CGG	2	6	92559	92564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457917
3116	NC_021877	GCG	2	6	92570	92575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457917
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3119	NC_021877	GCCG	2	8	92652	92659	0 %	0 %	50 %	50 %	526457917
3120	NC_021877	TCG	2	6	92664	92669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457917
3121	NC_021877	GCG	2	6	92685	92690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457917
3122	NC_021877	CCGG	2	8	92691	92698	0 %	0 %	50 %	50 %	526457917
3123	NC_021877	GGCG	2	8	92704	92711	0 %	0 %	75 %	25 %	526457917
3124	NC_021877	CG	3	6	92710	92715	0 %	0 %	50 %	50 %	526457917
3125	NC_021877	TCG	2	6	92726	92731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457917
3126	NC_021877	CG	4	8	92736	92743	0 %	0 %	50 %	50 %	526457917
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3128	NC_021877	CGC	2	6	92809	92814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457917
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3489	NC_021877	GTCG	2	8	105680	105687	0 %	25 %	50 %	25 %	526459174
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3492	NC_021877	TAG	2	6	105925	105930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3497	NC_021877	CAG	2	6	106370	106375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3498	NC_021877	A	6	6	106446	106451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_021877	TTA	2	6	106464	106469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_021877	AAT	2	6	106481	106486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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