MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 39518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021294	GGGC	2	8	39689	39696	0 %	0 %	75 %	25 %	507525675
1002	NC_021294	TCG	2	6	39710	39715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1003	NC_021294	CGAG	2	8	39753	39760	25 %	0 %	50 %	25 %	507525675
1004	NC_021294	ACG	2	6	39814	39819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1005	NC_021294	CAG	2	6	39828	39833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1006	NC_021294	GCC	2	6	39915	39920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525675
1007	NC_021294	ATC	3	9	39922	39930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507525675
1008	NC_021294	CGA	2	6	39962	39967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1009	NC_021294	CGA	2	6	39986	39991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1010	NC_021294	ACC	2	6	40000	40005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507525675
1011	NC_021294	CGC	2	6	40065	40070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525675
1012	NC_021294	TCG	2	6	40079	40084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1013	NC_021294	CGA	2	6	40085	40090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1014	NC_021294	TCA	2	6	40103	40108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507525675
1015	NC_021294	CTTC	2	8	40226	40233	0 %	50 %	0 %	50 %	507525675
1016	NC_021294	GAT	2	6	40236	40241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507525675
1017	NC_021294	CAG	2	6	40269	40274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1018	NC_021294	CGG	3	9	40343	40351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507525675
1019	NC_021294	ATC	2	6	40432	40437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507525675
1020	NC_021294	GCA	2	6	40487	40492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1021	NC_021294	GAG	2	6	40497	40502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507525675
1022	NC_021294	TCG	2	6	40556	40561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1023	NC_021294	CAG	2	6	40587	40592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1024	NC_021294	CGTG	2	8	40607	40614	0 %	25 %	50 %	25 %	507525675
1025	NC_021294	CG	3	6	40651	40656	0 %	0 %	50 %	50 %	507525675
1026	NC_021294	GAT	2	6	40689	40694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507525675
1027	NC_021294	GAA	2	6	40719	40724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507525675
1028	NC_021294	GCC	3	9	40744	40752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525675
1029	NC_021294	AAG	2	6	40765	40770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507525675
1030	NC_021294	GCCGA	2	10	40786	40795	20 %	0 %	40 %	40 %	507525675
1031	NC_021294	TTC	2	6	40816	40821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507525675
1032	NC_021294	GCT	2	6	40833	40838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507525675
1033	NC_021294	GCG	2	6	40915	40920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021294	CGCA	2	8	41022	41029	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_021294	CGA	2	6	41203	41208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525676
1036	NC_021294	CG	3	6	41215	41220	0 %	0 %	50 %	50 %	507525676
1037	NC_021294	GCC	2	6	41237	41242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525676
1038	NC_021294	CGG	2	6	41265	41270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507525676
1039	NC_021294	CGC	2	6	41273	41278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525676
1040	NC_021294	CGC	2	6	41340	41345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525676
1041	NC_021294	TGC	2	6	41349	41354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507525676
1042	NC_021294	GC	3	6	41381	41386	0 %	0 %	50 %	50 %	507525676
1043	NC_021294	GCA	2	6	41413	41418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525676
1044	NC_021294	GAT	2	6	41428	41433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507525676
1045	NC_021294	TCA	2	6	41478	41483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507525676
1046	NC_021294	CG	3	6	41485	41490	0 %	0 %	50 %	50 %	507525676
1047	NC_021294	CG	3	6	41502	41507	0 %	0 %	50 %	50 %	507525676
1048	NC_021294	TGA	2	6	41508	41513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507525676
1049	NC_021294	GC	4	8	41532	41539	0 %	0 %	50 %	50 %	507525676
1050	NC_021294	GCCG	2	8	41542	41549	0 %	0 %	50 %	50 %	507525676
1051	NC_021294	CGGG	2	8	41559	41566	0 %	0 %	75 %	25 %	507525676
1052	NC_021294	CGC	2	6	41640	41645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525676
1053	NC_021294	CAA	2	6	41656	41661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507525676
1054	NC_021294	GC	3	6	41690	41695	0 %	0 %	50 %	50 %	507525676
1055	NC_021294	AGC	2	6	41718	41723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525676
1056	NC_021294	GTG	2	6	41780	41785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507525676
1057	NC_021294	GCG	2	6	41786	41791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507525676
1058	NC_021294	GACG	2	8	41821	41828	25 %	0 %	50 %	25 %	507525676
1059	NC_021294	GGC	2	6	41830	41835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507525676
1060	NC_021294	CG	3	6	41916	41921	0 %	0 %	50 %	50 %	507525677
1061	NC_021294	TCC	2	6	41941	41946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507525677
1062	NC_021294	GAG	2	6	42007	42012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507525677
1063	NC_021294	TCG	2	6	42020	42025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507525677
1064	NC_021294	CA	3	6	42119	42124	50 %	0 %	0 %	50 %	507525677
1065	NC_021294	GCA	2	6	42126	42131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525677
1066	NC_021294	CGAC	2	8	42137	42144	25 %	0 %	25 %	50 %	507525677
1067	NC_021294	CG	4	8	42197	42204	0 %	0 %	50 %	50 %	507525677
1068	NC_021294	CGA	2	6	42275	42280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525677
1069	NC_021294	GAT	2	6	42296	42301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507525677
1070	NC_021294	AGC	2	6	42307	42312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525677
1071	NC_021294	TCGC	2	8	42314	42321	0 %	25 %	25 %	50 %	507525677
1072	NC_021294	GCG	2	6	42386	42391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507525677
1073	NC_021294	TCG	2	6	42397	42402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507525677
1074	NC_021294	GTCGAT	2	12	42455	42466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1075	NC_021294	TGG	2	6	42521	42526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021294	GGGC	2	8	42608	42615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_021294	AAAGGG	2	12	42754	42765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021294	CGAAT	2	10	42788	42797	40 %	20 %	20 %	20 %	507525678
1079	NC_021294	CGC	2	6	42813	42818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525678
1080	NC_021294	CTT	2	6	42825	42830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507525678
1081	NC_021294	CTCG	2	8	42866	42873	0 %	25 %	25 %	50 %	507525678
1082	NC_021294	CGATG	2	10	43016	43025	20 %	20 %	40 %	20 %	507525678
1083	NC_021294	AGC	2	6	43093	43098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525678
1084	NC_021294	TC	3	6	43109	43114	0 %	50 %	0 %	50 %	507525678
1085	NC_021294	GCA	2	6	43145	43150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525678
1086	NC_021294	CAG	2	6	43215	43220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525678
1087	NC_021294	GCGAT	2	10	43234	43243	20 %	20 %	40 %	20 %	507525678
1088	NC_021294	CAT	2	6	43269	43274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507525678
1089	NC_021294	CGGAC	2	10	43296	43305	20 %	0 %	40 %	40 %	507525678
1090	NC_021294	CGA	2	6	43313	43318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_021294	CAC	3	9	43319	43327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_021294	GCCC	2	8	43359	43366	0 %	0 %	25 %	75 %	507525679
1093	NC_021294	GC	3	6	43398	43403	0 %	0 %	50 %	50 %	507525679
1094	NC_021294	CCG	2	6	43404	43409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525679
1095	NC_021294	CG	3	6	43413	43418	0 %	0 %	50 %	50 %	507525679
1096	NC_021294	GAC	2	6	43430	43435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525679
1097	NC_021294	CCG	2	6	43467	43472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525679
1098	NC_021294	GAT	2	6	43555	43560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507525679
1099	NC_021294	GC	3	6	43581	43586	0 %	0 %	50 %	50 %	507525679
1100	NC_021294	ACG	2	6	43592	43597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525679
1101	NC_021294	GC	4	8	43626	43633	0 %	0 %	50 %	50 %	507525679
1102	NC_021294	CAG	3	9	43642	43650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525679
1103	NC_021294	GAA	2	6	43657	43662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507525679
1104	NC_021294	GCC	2	6	43663	43668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525679
1105	NC_021294	CG	4	8	43723	43730	0 %	0 %	50 %	50 %	507525679
1106	NC_021294	CGCC	2	8	43743	43750	0 %	0 %	25 %	75 %	507525679
1107	NC_021294	GCC	3	9	43793	43801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525679
1108	NC_021294	GTTGCA	2	12	43812	43823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507525679
1109	NC_021294	CTGA	2	8	43843	43850	25 %	25 %	25 %	25 %	507525679
1110	NC_021294	GCG	2	6	43862	43867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507525679
1111	NC_021294	CGA	2	6	43887	43892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525679
1112	NC_021294	GAT	2	6	43927	43932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507525679
1113	NC_021294	GCC	3	9	43937	43945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525679
1114	NC_021294	CCG	2	6	43967	43972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525679
1115	NC_021294	AGA	2	6	43985	43990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507525679
1116	NC_021294	GCC	2	6	44012	44017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525679
1117	NC_021294	CAT	2	6	44032	44037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507525679
1118	NC_021294	AGA	3	9	44047	44055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507525680
1119	NC_021294	TCG	2	6	44057	44062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507525680
1120	NC_021294	CATG	2	8	44098	44105	25 %	25 %	25 %	25 %	507525680
1121	NC_021294	ATCGG	2	10	44158	44167	20 %	20 %	40 %	20 %	507525680
1122	NC_021294	GC	3	6	44216	44221	0 %	0 %	50 %	50 %	507525680
1123	NC_021294	ACG	2	6	44245	44250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507525680
1124	NC_021294	CCG	2	6	44254	44259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525680
1125	NC_021294	CG	3	6	44291	44296	0 %	0 %	50 %	50 %	507525680
1126	NC_021294	CATAGC	2	12	44387	44398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	507525680
1127	NC_021294	CGC	2	6	44435	44440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507525680
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1130	NC_021294	CGT	2	6	44498	44503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507525680
1131	NC_021294	GCC	2	6	44542	44547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1133	NC_021294	GAA	2	6	44579	44584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_021294	GC	5	10	44693	44702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1141	NC_021294	GCG	3	9	44966	44974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507525682
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1151	NC_021294	GAC	2	6	45339	45344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1155	NC_021294	CG	3	6	45434	45439	0 %	0 %	50 %	50 %	507525683
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1491	NC_021294	TCT	2	6	57065	57070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507525695
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1494	NC_021294	CGC	2	6	57235	57240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1495	NC_021294	GCCGC	2	10	57372	57381	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1496	NC_021294	CG	3	6	57396	57401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1497	NC_021294	CTCTCA	2	12	57417	57428	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1498	NC_021294	GCC	2	6	57488	57493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1499	NC_021294	TCA	3	9	57538	57546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507525696
1500	NC_021294	GC	3	6	57550	57555	0 %	0 %	50 %	50 %	507525696

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