MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 33792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33003	NC_021289	TCG	2	6	1247324	1247329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519495
33004	NC_021289	CGC	2	6	1247362	1247367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519495
33005	NC_021289	GCA	2	6	1247388	1247393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519495
33006	NC_021289	CCG	2	6	1247406	1247411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519495
33007	NC_021289	CGA	2	6	1247454	1247459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519495
33008	NC_021289	CGT	2	6	1247478	1247483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519495
33009	NC_021289	CGTGC	2	10	1247494	1247503	0 %	20 %	40 %	40 %	507519495
33010	NC_021289	GC	4	8	1247545	1247552	0 %	0 %	50 %	50 %	507519495
33011	NC_021289	ATC	2	6	1247558	1247563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519495
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33013	NC_021289	TTG	2	6	1247615	1247620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33014	NC_021289	GCAA	2	8	1247684	1247691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33015	NC_021289	CGG	3	9	1247693	1247701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33016	NC_021289	GCTT	2	8	1247802	1247809	0 %	50 %	25 %	25 %	507519496
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33018	NC_021289	CGA	2	6	1247822	1247827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519496
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33020	NC_021289	GCG	2	6	1247968	1247973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519496
33021	NC_021289	GCG	2	6	1247993	1247998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519496
33022	NC_021289	CGG	2	6	1248036	1248041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519496
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33053	NC_021289	CGA	2	6	1248793	1248798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519497
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33102	NC_021289	GC	4	8	1250399	1250406	0 %	0 %	50 %	50 %	507519499
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33119	NC_021289	CGA	2	6	1251023	1251028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519499
33120	NC_021289	CCG	2	6	1251034	1251039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519499
33121	NC_021289	GAT	2	6	1251053	1251058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519499
33122	NC_021289	AAG	2	6	1251087	1251092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507519499
33123	NC_021289	GTG	2	6	1251120	1251125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507519499
33124	NC_021289	AAC	2	6	1251150	1251155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507519499
33125	NC_021289	CG	3	6	1251239	1251244	0 %	0 %	50 %	50 %	507519499
33126	NC_021289	CG	3	6	1251271	1251276	0 %	0 %	50 %	50 %	507519499
33127	NC_021289	CGC	2	6	1251316	1251321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519499
33128	NC_021289	CGAT	2	8	1251328	1251335	25 %	25 %	25 %	25 %	507519499
33129	NC_021289	AGGGCC	2	12	1251367	1251378	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507519499
33130	NC_021289	ACA	2	6	1251403	1251408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507519499
33131	NC_021289	CG	3	6	1251460	1251465	0 %	0 %	50 %	50 %	507519499
33132	NC_021289	CG	4	8	1251472	1251479	0 %	0 %	50 %	50 %	507519499
33133	NC_021289	GC	3	6	1251535	1251540	0 %	0 %	50 %	50 %	507519499
33134	NC_021289	GGC	2	6	1251546	1251551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519499
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33138	NC_021289	CGA	2	6	1251611	1251616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519499
33139	NC_021289	CG	3	6	1251622	1251627	0 %	0 %	50 %	50 %	507519499
33140	NC_021289	ATC	2	6	1251663	1251668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519499
33141	NC_021289	CG	3	6	1251677	1251682	0 %	0 %	50 %	50 %	507519499
33142	NC_021289	ATC	2	6	1251696	1251701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519499
33143	NC_021289	CGAG	2	8	1251709	1251716	25 %	0 %	50 %	25 %	507519499
33144	NC_021289	CGG	2	6	1251785	1251790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519499
33145	NC_021289	AGGA	2	8	1251814	1251821	50 %	0 %	50 %	0 %	507519499
33146	NC_021289	ATC	2	6	1251822	1251827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519499
33147	NC_021289	GGC	2	6	1251863	1251868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519499
33148	NC_021289	ACGA	2	8	1251888	1251895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33149	NC_021289	GA	4	8	1251904	1251911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33150	NC_021289	ACG	2	6	1251922	1251927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519500
33151	NC_021289	GCGCC	2	10	1251944	1251953	0 %	0 %	40 %	60 %	507519500
33152	NC_021289	CGC	2	6	1251954	1251959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519500
33153	NC_021289	ACG	2	6	1251973	1251978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519500
33154	NC_021289	CGG	2	6	1252031	1252036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519500
33155	NC_021289	TGC	2	6	1252040	1252045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519500
33156	NC_021289	CTG	2	6	1252057	1252062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519500
33157	NC_021289	ACGG	2	8	1252084	1252091	25 %	0 %	50 %	25 %	507519500
33158	NC_021289	TTC	2	6	1252093	1252098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519500
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33184	NC_021289	GCG	2	6	1252775	1252780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519500
33185	NC_021289	TCG	2	6	1252790	1252795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519500
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33187	NC_021289	TGC	2	6	1252844	1252849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519500
33188	NC_021289	CAT	2	6	1252875	1252880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519500
33189	NC_021289	ATC	2	6	1252894	1252899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519500
33190	NC_021289	TCGA	2	8	1252913	1252920	25 %	25 %	25 %	25 %	507519500
33191	NC_021289	A	6	6	1252995	1253000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33192	NC_021289	ACA	3	9	1253014	1253022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507519501
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33195	NC_021289	CG	3	6	1253165	1253170	0 %	0 %	50 %	50 %	507519501
33196	NC_021289	GTC	2	6	1253225	1253230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519501
33197	NC_021289	CAT	2	6	1253291	1253296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519501
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33199	NC_021289	ATC	2	6	1253361	1253366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519501
33200	NC_021289	GCC	2	6	1253388	1253393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519501
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33202	NC_021289	GGCG	2	8	1253429	1253436	0 %	0 %	75 %	25 %	507519501
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33211	NC_021289	GC	3	6	1253776	1253781	0 %	0 %	50 %	50 %	507519501
33212	NC_021289	GAT	2	6	1253795	1253800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519501
33213	NC_021289	GCA	2	6	1253837	1253842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519501
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33215	NC_021289	AAG	2	6	1253877	1253882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507519501
33216	NC_021289	GAT	2	6	1253894	1253899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519501
33217	NC_021289	GTC	2	6	1253954	1253959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519501
33218	NC_021289	GAG	2	6	1253968	1253973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507519501
33219	NC_021289	ATCGG	2	10	1253978	1253987	20 %	20 %	40 %	20 %	507519502
33220	NC_021289	GC	3	6	1253999	1254004	0 %	0 %	50 %	50 %	507519502
33221	NC_021289	CCA	2	6	1254032	1254037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507519502
33222	NC_021289	CGC	2	6	1254071	1254076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519502
33223	NC_021289	GCG	2	6	1254077	1254082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519502
33224	NC_021289	CGG	2	6	1254092	1254097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519502
33225	NC_021289	CG	3	6	1254116	1254121	0 %	0 %	50 %	50 %	507519502
33226	NC_021289	TGC	2	6	1254128	1254133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519502
33227	NC_021289	GC	3	6	1254143	1254148	0 %	0 %	50 %	50 %	507519502
33228	NC_021289	GCG	2	6	1254233	1254238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519502
33229	NC_021289	GC	4	8	1254247	1254254	0 %	0 %	50 %	50 %	507519502
33230	NC_021289	GACC	2	8	1254329	1254336	25 %	0 %	25 %	50 %	507519502
33231	NC_021289	CG	3	6	1254392	1254397	0 %	0 %	50 %	50 %	507519502
33232	NC_021289	TTACGC	2	12	1254401	1254412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507519502
33233	NC_021289	CGGC	2	8	1254419	1254426	0 %	0 %	50 %	50 %	507519502
33234	NC_021289	GC	3	6	1254425	1254430	0 %	0 %	50 %	50 %	507519502
33235	NC_021289	GCC	2	6	1254465	1254470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519502
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33339	NC_021289	CGGCG	2	10	1258077	1258086	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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33353	NC_021289	CGG	2	6	1258602	1258607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
33354	NC_021289	CGC	2	6	1258614	1258619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519507
33355	NC_021289	CGGC	2	8	1258676	1258683	0 %	0 %	50 %	50 %	507519507
33356	NC_021289	CGG	2	6	1258695	1258700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
33357	NC_021289	GCT	2	6	1258737	1258742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
33358	NC_021289	CGT	2	6	1258745	1258750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
33359	NC_021289	CGGCAT	2	12	1258791	1258802	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507519507
33360	NC_021289	TCG	2	6	1258853	1258858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
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33364	NC_021289	GCG	2	6	1258970	1258975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
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33373	NC_021289	ATC	2	6	1259590	1259595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519507
33374	NC_021289	GGCC	2	8	1259715	1259722	0 %	0 %	50 %	50 %	507519507
33375	NC_021289	CG	3	6	1259746	1259751	0 %	0 %	50 %	50 %	507519507
33376	NC_021289	ATGGGC	2	12	1259752	1259763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	507519507
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33379	NC_021289	CGA	2	6	1259805	1259810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519507
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33381	NC_021289	GGC	2	6	1259886	1259891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
33382	NC_021289	GGA	2	6	1259895	1259900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507519507
33383	NC_021289	CATCCG	2	12	1259917	1259928	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507519507
33384	NC_021289	GGC	2	6	1259952	1259957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
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33386	NC_021289	GTCGAT	2	12	1260033	1260044	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507519508
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33390	NC_021289	GTCC	2	8	1260179	1260186	0 %	25 %	25 %	50 %	507519508
33391	NC_021289	CAT	2	6	1260195	1260200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519508
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33414	NC_021289	TGC	2	6	1260897	1260902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
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33424	NC_021289	TCG	3	9	1261189	1261197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
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33455	NC_021289	CTG	2	6	1262202	1262207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
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33457	NC_021289	TCG	2	6	1262239	1262244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
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33463	NC_021289	GC	3	6	1262490	1262495	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
33464	NC_021289	CGA	2	6	1262510	1262515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519508
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33466	NC_021289	CGAAGC	2	12	1262564	1262575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519508
33467	NC_021289	GCCG	2	8	1262690	1262697	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
33468	NC_021289	GC	4	8	1262753	1262760	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
33469	NC_021289	ACG	2	6	1262878	1262883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519508
33470	NC_021289	ATG	2	6	1262884	1262889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519508
33471	NC_021289	GTC	2	6	1262890	1262895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
33472	NC_021289	GC	3	6	1262977	1262982	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
33473	NC_021289	CG	3	6	1263000	1263005	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
33474	NC_021289	CGG	2	6	1263014	1263019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519508
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33478	NC_021289	GCG	2	6	1263113	1263118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519508
33479	NC_021289	CGG	2	6	1263155	1263160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519508
33480	NC_021289	GCTTCG	2	12	1263164	1263175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
33481	NC_021289	TCG	2	6	1263202	1263207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
33482	NC_021289	GCC	2	6	1263254	1263259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519508
33483	NC_021289	CGA	2	6	1263338	1263343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519508
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33487	NC_021289	TCG	2	6	1263418	1263423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
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33489	NC_021289	ATT	2	6	1263529	1263534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33490	NC_021289	T	6	6	1263533	1263538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33491	NC_021289	CAT	2	6	1263556	1263561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33492	NC_021289	CACG	2	8	1263574	1263581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33493	NC_021289	GC	3	6	1263667	1263672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33494	NC_021289	CG	3	6	1263689	1263694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33495	NC_021289	CGG	2	6	1263769	1263774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33496	NC_021289	GGC	2	6	1263970	1263975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519509
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