MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 33792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021289	TCG	2	6	51206	51211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518347
1502	NC_021289	CGG	2	6	51225	51230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518347
1503	NC_021289	GCGG	2	8	51247	51254	0 %	0 %	75 %	25 %	507518347
1504	NC_021289	CGG	2	6	51294	51299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518347
1505	NC_021289	TCG	2	6	51317	51322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518348
1506	NC_021289	CG	3	6	51347	51352	0 %	0 %	50 %	50 %	507518348
1507	NC_021289	CAG	2	6	51399	51404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518348
1508	NC_021289	CAG	2	6	51414	51419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518348
1509	NC_021289	CGG	2	6	51420	51425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518348
1510	NC_021289	GGCCCA	2	12	51435	51446	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507518348
1511	NC_021289	GAA	2	6	51495	51500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518348
1512	NC_021289	GAA	2	6	51732	51737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518348
1513	NC_021289	GC	3	6	51750	51755	0 %	0 %	50 %	50 %	507518348
1514	NC_021289	GCGT	2	8	51757	51764	0 %	25 %	50 %	25 %	507518348
1515	NC_021289	TCT	2	6	51799	51804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518348
1516	NC_021289	CGC	2	6	51820	51825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518348
1517	NC_021289	CG	3	6	51844	51849	0 %	0 %	50 %	50 %	507518348
1518	NC_021289	GC	3	6	51857	51862	0 %	0 %	50 %	50 %	507518348
1519	NC_021289	CGCC	2	8	51863	51870	0 %	0 %	25 %	75 %	507518348
1520	NC_021289	GCGCC	2	10	51890	51899	0 %	0 %	40 %	60 %	507518348
1521	NC_021289	AGCGCG	2	12	51922	51933	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507518348
1522	NC_021289	GGC	2	6	51942	51947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518348
1523	NC_021289	TGCG	2	8	51976	51983	0 %	25 %	50 %	25 %	507518348
1524	NC_021289	CA	3	6	51997	52002	50 %	0 %	0 %	50 %	507518348
1525	NC_021289	GAG	2	6	52125	52130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021289	CGAA	2	8	52133	52140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_021289	GC	3	6	52157	52162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_021289	ACCGG	2	10	52210	52219	20 %	0 %	40 %	40 %	507518349
1529	NC_021289	CCG	2	6	52240	52245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518349
1530	NC_021289	GCG	2	6	52301	52306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518349
1531	NC_021289	TCG	2	6	52316	52321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518349
1532	NC_021289	GTTG	2	8	52325	52332	0 %	50 %	50 %	0 %	507518349
1533	NC_021289	CGG	2	6	52368	52373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518349
1534	NC_021289	CGT	2	6	52389	52394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518349
1535	NC_021289	ACG	2	6	52429	52434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518349
1536	NC_021289	ACGT	2	8	52449	52456	25 %	25 %	25 %	25 %	507518349
1537	NC_021289	GCG	2	6	52477	52482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518349
1538	NC_021289	CGA	2	6	52505	52510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518349
1539	NC_021289	GCC	2	6	52528	52533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518349
1540	NC_021289	GCG	2	6	52547	52552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518349
1541	NC_021289	CAGC	2	8	52617	52624	25 %	0 %	25 %	50 %	507518349
1542	NC_021289	CAGGCT	2	12	52629	52640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518349
1543	NC_021289	CCA	2	6	52644	52649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518349
1544	NC_021289	GCGG	2	8	52656	52663	0 %	0 %	75 %	25 %	507518349
1545	NC_021289	CGG	2	6	52699	52704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518349
1546	NC_021289	GCG	2	6	52727	52732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518349
1547	NC_021289	GCG	2	6	52757	52762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518349
1548	NC_021289	GCG	2	6	52801	52806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518349
1549	NC_021289	CG	3	6	52808	52813	0 %	0 %	50 %	50 %	507518349
1550	NC_021289	GCC	2	6	52819	52824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518349
1551	NC_021289	GCGCA	2	10	52873	52882	20 %	0 %	40 %	40 %	507518349
1552	NC_021289	TCG	2	6	52891	52896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518349
1553	NC_021289	GCG	2	6	52946	52951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518350
1554	NC_021289	GAA	2	6	53021	53026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518350
1555	NC_021289	CG	3	6	53039	53044	0 %	0 %	50 %	50 %	507518350
1556	NC_021289	TGC	2	6	53049	53054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518350
1557	NC_021289	GCC	3	9	53083	53091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518350
1558	NC_021289	TTC	2	6	53093	53098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518350
1559	NC_021289	GCG	3	9	53112	53120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518350
1560	NC_021289	CGT	2	6	53131	53136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518350
1561	NC_021289	TCG	3	9	53154	53162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518350
1562	NC_021289	TGA	2	6	53221	53226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518350
1563	NC_021289	CG	3	6	53245	53250	0 %	0 %	50 %	50 %	507518350
1564	NC_021289	GC	3	6	53268	53273	0 %	0 %	50 %	50 %	507518350
1565	NC_021289	CCT	2	6	53293	53298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507518350
1566	NC_021289	CGC	2	6	53317	53322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518350
1567	NC_021289	CAT	2	6	53330	53335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518350
1568	NC_021289	CGT	2	6	53458	53463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518350
1569	NC_021289	TGC	2	6	53491	53496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518350
1570	NC_021289	ACGG	2	8	53643	53650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_021289	ACTT	2	8	53671	53678	25 %	50 %	0 %	25 %	507518351
1572	NC_021289	GGC	2	6	53745	53750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518351
1573	NC_021289	CG	3	6	53820	53825	0 %	0 %	50 %	50 %	507518351
1574	NC_021289	GC	3	6	53867	53872	0 %	0 %	50 %	50 %	507518351
1575	NC_021289	GC	3	6	53889	53894	0 %	0 %	50 %	50 %	507518351
1576	NC_021289	GCC	2	6	53901	53906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518351
1577	NC_021289	GC	3	6	53907	53912	0 %	0 %	50 %	50 %	507518351
1578	NC_021289	CGT	2	6	53930	53935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518351
1579	NC_021289	GAA	3	9	53943	53951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518351
1580	NC_021289	CGG	2	6	53966	53971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518351
1581	NC_021289	GC	3	6	53986	53991	0 %	0 %	50 %	50 %	507518351
1582	NC_021289	CG	3	6	54013	54018	0 %	0 %	50 %	50 %	507518351
1583	NC_021289	AGC	2	6	54031	54036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518351
1584	NC_021289	CGG	2	6	54045	54050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518351
1585	NC_021289	GGC	2	6	54122	54127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_021289	AG	3	6	54142	54147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021289	ATG	2	6	54174	54179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021289	TCG	2	6	54284	54289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518352
1589	NC_021289	GC	3	6	54304	54309	0 %	0 %	50 %	50 %	507518352
1590	NC_021289	TGA	2	6	54320	54325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518352
1591	NC_021289	ACG	2	6	54338	54343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518352
1592	NC_021289	CCGCA	2	10	54357	54366	20 %	0 %	20 %	60 %	507518352
1593	NC_021289	CTG	2	6	54382	54387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518352
1594	NC_021289	GTT	2	6	54402	54407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518352
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1596	NC_021289	GCG	3	9	54445	54453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518353
1597	NC_021289	GGC	2	6	54467	54472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518353
1598	NC_021289	TCG	3	9	54514	54522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518353
1599	NC_021289	GC	3	6	54561	54566	0 %	0 %	50 %	50 %	507518353
1600	NC_021289	GCA	2	6	54569	54574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518353
1601	NC_021289	GC	4	8	54605	54612	0 %	0 %	50 %	50 %	507518353
1602	NC_021289	GCG	2	6	54620	54625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518353
1603	NC_021289	CCG	2	6	54644	54649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518353
1604	NC_021289	GTC	2	6	54697	54702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_021289	GTCGC	2	10	54717	54726	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1606	NC_021289	GAACCC	2	12	54788	54799	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_021289	GAC	2	6	54815	54820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_021289	GGC	2	6	54825	54830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
1609	NC_021289	GC	3	6	54866	54871	0 %	0 %	50 %	50 %	507518354
1610	NC_021289	CGA	2	6	54888	54893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518354
1611	NC_021289	GCG	2	6	54903	54908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
1612	NC_021289	CGAC	2	8	54968	54975	25 %	0 %	25 %	50 %	507518354
1613	NC_021289	AGC	2	6	55013	55018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518354
1614	NC_021289	GGT	2	6	55020	55025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518354
1615	NC_021289	GGC	2	6	55033	55038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
1616	NC_021289	TCG	2	6	55049	55054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518354
1617	NC_021289	GCG	2	6	55055	55060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
1618	NC_021289	CGG	2	6	55071	55076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
1619	NC_021289	CAT	2	6	55110	55115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518354
1620	NC_021289	CCA	2	6	55136	55141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518354
1621	NC_021289	CGC	2	6	55160	55165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518354
1622	NC_021289	AGG	2	6	55178	55183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518354
1623	NC_021289	CGGC	2	8	55193	55200	0 %	0 %	50 %	50 %	507518354
1624	NC_021289	GC	4	8	55223	55230	0 %	0 %	50 %	50 %	507518354
1625	NC_021289	CGG	2	6	55245	55250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
1626	NC_021289	CGA	2	6	55259	55264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518354
1627	NC_021289	GGC	2	6	55270	55275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
1628	NC_021289	TCA	2	6	55283	55288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518354
1629	NC_021289	ATG	2	6	55297	55302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518354
1630	NC_021289	GCG	2	6	55340	55345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
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1632	NC_021289	GAT	2	6	55368	55373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518354
1633	NC_021289	AAC	2	6	55378	55383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518354
1634	NC_021289	TCA	2	6	55436	55441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518354
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1643	NC_021289	CGG	2	6	55725	55730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
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1645	NC_021289	GCG	2	6	55759	55764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518354
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1648	NC_021289	CGC	2	6	55848	55853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518354
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1658	NC_021289	CG	3	6	56128	56133	0 %	0 %	50 %	50 %	507518354
1659	NC_021289	GC	3	6	56151	56156	0 %	0 %	50 %	50 %	507518354
1660	NC_021289	GCT	2	6	56184	56189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518354
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1663	NC_021289	CG	3	6	56296	56301	0 %	0 %	50 %	50 %	507518355
1664	NC_021289	GAG	2	6	56369	56374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518355
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1667	NC_021289	GC	3	6	56516	56521	0 %	0 %	50 %	50 %	507518356
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1670	NC_021289	CGC	2	6	56564	56569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518356
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1673	NC_021289	CG	3	6	56638	56643	0 %	0 %	50 %	50 %	507518356
1674	NC_021289	GCG	2	6	56663	56668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518356
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1676	NC_021289	GC	3	6	56736	56741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1677	NC_021289	CGC	2	6	56807	56812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518357
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1691	NC_021289	CGC	2	6	57341	57346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518358
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1701	NC_021289	ACG	2	6	57691	57696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518358
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1713	NC_021289	AC	3	6	58154	58159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1740	NC_021289	GC	3	6	59052	59057	0 %	0 %	50 %	50 %	507518359
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1744	NC_021289	CAA	2	6	59309	59314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518360
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1746	NC_021289	TGC	2	6	59389	59394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518360
1747	NC_021289	TTC	2	6	59494	59499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518360
1748	NC_021289	CGA	2	6	59528	59533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518360
1749	NC_021289	GAT	2	6	59543	59548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518360
1750	NC_021289	GGC	2	6	59550	59555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518360
1751	NC_021289	CCGGC	2	10	59569	59578	0 %	0 %	40 %	60 %	507518360
1752	NC_021289	GC	3	6	59591	59596	0 %	0 %	50 %	50 %	507518360
1753	NC_021289	CAT	2	6	59615	59620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518360
1754	NC_021289	GGC	2	6	59622	59627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518360
1755	NC_021289	CGC	2	6	59651	59656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518360
1756	NC_021289	GC	3	6	59701	59706	0 %	0 %	50 %	50 %	507518360
1757	NC_021289	GCA	2	6	59744	59749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518360
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1759	NC_021289	CG	3	6	59788	59793	0 %	0 %	50 %	50 %	507518360
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1762	NC_021289	CG	4	8	59912	59919	0 %	0 %	50 %	50 %	507518360
1763	NC_021289	CGA	2	6	59932	59937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518360
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1787	NC_021289	TTC	2	6	60569	60574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518361
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1789	NC_021289	CGC	2	6	60668	60673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518361
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1793	NC_021289	GGCGTG	2	12	60779	60790	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	507518361
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1822	NC_021289	CGC	2	6	61872	61877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1823	NC_021289	CAG	2	6	61894	61899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1824	NC_021289	CTGCG	2	10	61958	61967	0 %	20 %	40 %	40 %	507518362
1825	NC_021289	TTGC	2	8	61971	61978	0 %	50 %	25 %	25 %	507518362
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1832	NC_021289	TCA	2	6	62185	62190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518362
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1853	NC_021289	CGG	2	6	62996	63001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518362
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1855	NC_021289	AGCG	2	8	63171	63178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1856	NC_021289	CGCT	2	8	63230	63237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1857	NC_021289	CGC	2	6	63244	63249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1858	NC_021289	CGC	2	6	63262	63267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1859	NC_021289	CGC	2	6	63549	63554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518363
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1861	NC_021289	CG	4	8	63581	63588	0 %	0 %	50 %	50 %	507518363
1862	NC_021289	CTT	2	6	63594	63599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518363
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1868	NC_021289	CGT	2	6	63724	63729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1869	NC_021289	GA	3	6	63761	63766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1870	NC_021289	CGT	2	6	63819	63824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1871	NC_021289	CGC	2	6	63988	63993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518364
1872	NC_021289	TGA	2	6	64045	64050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518364
1873	NC_021289	GC	3	6	64051	64056	0 %	0 %	50 %	50 %	507518364
1874	NC_021289	GCG	2	6	64062	64067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518364
1875	NC_021289	CG	4	8	64066	64073	0 %	0 %	50 %	50 %	507518364
1876	NC_021289	CGA	2	6	64079	64084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518364
1877	NC_021289	GGC	3	9	64114	64122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518365
1878	NC_021289	GC	3	6	64141	64146	0 %	0 %	50 %	50 %	507518365
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