MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 81862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021287	GA	3	6	111114	111119	50 %	0 %	50 %	0 %	507514636
3002	NC_021287	CGCC	2	8	111135	111142	0 %	0 %	25 %	75 %	507514636
3003	NC_021287	GC	4	8	111153	111160	0 %	0 %	50 %	50 %	507514636
3004	NC_021287	CGG	2	6	111162	111167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514636
3005	NC_021287	CGAT	2	8	111194	111201	25 %	25 %	25 %	25 %	507514636
3006	NC_021287	ACG	2	6	111222	111227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514636
3007	NC_021287	GAT	2	6	111244	111249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507514636
3008	NC_021287	AGC	2	6	111332	111337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514636
3009	NC_021287	CGG	2	6	111351	111356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514636
3010	NC_021287	GTTCG	2	10	111403	111412	0 %	40 %	40 %	20 %	507514636
3011	NC_021287	ATC	2	6	111436	111441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507514636
3012	NC_021287	TGA	2	6	111459	111464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507514636
3013	NC_021287	GAC	2	6	111562	111567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514636
3014	NC_021287	GTC	2	6	111568	111573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514636
3015	NC_021287	AGT	2	6	111600	111605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507514636
3016	NC_021287	GCT	2	6	111661	111666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514636
3017	NC_021287	CGAG	2	8	111684	111691	25 %	0 %	50 %	25 %	507514636
3018	NC_021287	TTC	2	6	111701	111706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507514636
3019	NC_021287	TCG	2	6	111713	111718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514636
3020	NC_021287	CGA	2	6	111723	111728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514636
3021	NC_021287	CGG	2	6	111747	111752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514636
3022	NC_021287	CGTT	2	8	111756	111763	0 %	50 %	25 %	25 %	507514636
3023	NC_021287	ACG	2	6	111785	111790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514636
3024	NC_021287	ACA	2	6	111854	111859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507514636
3025	NC_021287	GGC	2	6	111865	111870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514636
3026	NC_021287	GCG	2	6	111872	111877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514636
3027	NC_021287	GTT	2	6	111938	111943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514636
3028	NC_021287	TGGCG	2	10	111951	111960	0 %	20 %	60 %	20 %	507514636
3029	NC_021287	GCA	2	6	111962	111967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514636
3030	NC_021287	GCG	2	6	111969	111974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514636
3031	NC_021287	ATG	2	6	112056	112061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021287	CCTT	2	8	112099	112106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_021287	CTG	2	6	112142	112147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_021287	ATC	2	6	112256	112261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_021287	ACA	2	6	112276	112281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_021287	CTT	2	6	112286	112291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021287	CG	4	8	112293	112300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_021287	TG	3	6	112303	112308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021287	TCG	2	6	112327	112332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_021287	ATC	2	6	112390	112395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507514637
3041	NC_021287	GTT	2	6	112410	112415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514637
3042	NC_021287	CGG	2	6	112484	112489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514637
3043	NC_021287	GAC	2	6	112509	112514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514637
3044	NC_021287	ATC	2	6	112522	112527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507514637
3045	NC_021287	CGG	2	6	112536	112541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514637
3046	NC_021287	CG	3	6	112552	112557	0 %	0 %	50 %	50 %	507514637
3047	NC_021287	GAG	2	6	112564	112569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507514637
3048	NC_021287	TCGGCG	2	12	112571	112582	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507514637
3049	NC_021287	GC	3	6	112592	112597	0 %	0 %	50 %	50 %	507514637
3050	NC_021287	CG	3	6	112652	112657	0 %	0 %	50 %	50 %	507514637
3051	NC_021287	CG	3	6	112697	112702	0 %	0 %	50 %	50 %	507514637
3052	NC_021287	CTT	2	6	112710	112715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507514637
3053	NC_021287	CAT	2	6	112759	112764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507514637
3054	NC_021287	GC	3	6	112776	112781	0 %	0 %	50 %	50 %	507514637
3055	NC_021287	GTT	2	6	112782	112787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514637
3056	NC_021287	TCG	2	6	112799	112804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514637
3057	NC_021287	TCG	2	6	112853	112858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514637
3058	NC_021287	GTT	2	6	112890	112895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514637
3059	NC_021287	CG	3	6	112901	112906	0 %	0 %	50 %	50 %	507514637
3060	NC_021287	CGA	2	6	112916	112921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514637
3061	NC_021287	ATC	2	6	112933	112938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507514637
3062	NC_021287	TGG	2	6	112967	112972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507514637
3063	NC_021287	GCG	2	6	112973	112978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514637
3064	NC_021287	TTCA	2	8	112987	112994	25 %	50 %	0 %	25 %	507514637
3065	NC_021287	TGC	2	6	113036	113041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514637
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3067	NC_021287	GC	3	6	113104	113109	0 %	0 %	50 %	50 %	507514637
3068	NC_021287	TGC	2	6	113171	113176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514637
3069	NC_021287	CAT	2	6	113187	113192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507514637
3070	NC_021287	CG	3	6	113210	113215	0 %	0 %	50 %	50 %	507514637
3071	NC_021287	CGCGGC	2	12	113247	113258	0 %	0 %	50 %	50 %	507514637
3072	NC_021287	GTT	2	6	113304	113309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514637
3073	NC_021287	CCG	2	6	113402	113407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_021287	AGC	2	6	113427	113432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_021287	GC	3	6	113431	113436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_021287	GCG	2	6	113443	113448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_021287	GTT	2	6	113450	113455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021287	TTG	2	6	113457	113462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021287	AGA	2	6	113468	113473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021287	GC	3	6	113505	113510	0 %	0 %	50 %	50 %	507514638
3081	NC_021287	TGA	2	6	113515	113520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507514638
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3083	NC_021287	GC	3	6	113537	113542	0 %	0 %	50 %	50 %	507514638
3084	NC_021287	CGT	2	6	113562	113567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514638
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3086	NC_021287	CG	7	14	113588	113601	0 %	0 %	50 %	50 %	507514638
3087	NC_021287	GAT	2	6	113634	113639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507514638
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3090	NC_021287	CG	3	6	113688	113693	0 %	0 %	50 %	50 %	507514638
3091	NC_021287	CGG	2	6	113708	113713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514638
3092	NC_021287	CG	3	6	113714	113719	0 %	0 %	50 %	50 %	507514638
3093	NC_021287	CTT	2	6	113741	113746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507514638
3094	NC_021287	GC	3	6	113849	113854	0 %	0 %	50 %	50 %	507514639
3095	NC_021287	TGT	2	6	113861	113866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514639
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3099	NC_021287	GAT	2	6	114045	114050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507514639
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3104	NC_021287	AGC	2	6	114310	114315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514639
3105	NC_021287	GC	3	6	114314	114319	0 %	0 %	50 %	50 %	507514639
3106	NC_021287	TCGAA	2	10	114344	114353	40 %	20 %	20 %	20 %	507514639
3107	NC_021287	TGA	2	6	114377	114382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507514639
3108	NC_021287	GTT	2	6	114384	114389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514639
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3110	NC_021287	TCT	2	6	114419	114424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507514639
3111	NC_021287	ACCG	2	8	114465	114472	25 %	0 %	25 %	50 %	507514639
3112	NC_021287	GGCC	2	8	114572	114579	0 %	0 %	50 %	50 %	507514639
3113	NC_021287	GCCG	2	8	114594	114601	0 %	0 %	50 %	50 %	507514639
3114	NC_021287	TGT	2	6	114602	114607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514639
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3117	NC_021287	GTG	2	6	114628	114633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507514639
3118	NC_021287	GTC	2	6	114682	114687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514639
3119	NC_021287	GCT	2	6	114717	114722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514639
3120	NC_021287	GTC	2	6	114723	114728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514639
3121	NC_021287	CGA	2	6	114768	114773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514639
3122	NC_021287	GCA	2	6	114779	114784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514639
3123	NC_021287	GC	3	6	114791	114796	0 %	0 %	50 %	50 %	507514639
3124	NC_021287	GTT	2	6	114879	114884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514639
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3134	NC_021287	CTG	2	6	115524	115529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3136	NC_021287	TGC	2	6	115545	115550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3234	NC_021287	GCG	2	6	119457	119462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514641
3235	NC_021287	GCTTCG	2	12	119484	119495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514641
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3237	NC_021287	GGC	2	6	119573	119578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514641
3238	NC_021287	TCGA	2	8	119598	119605	25 %	25 %	25 %	25 %	507514641
3239	NC_021287	GCC	2	6	119654	119659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3240	NC_021287	CATT	2	8	119661	119668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3241	NC_021287	ACC	2	6	119697	119702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3242	NC_021287	CG	3	6	119707	119712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3243	NC_021287	GCC	3	9	119739	119747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3244	NC_021287	CA	3	6	119785	119790	50 %	0 %	0 %	50 %	507514642
3245	NC_021287	CGC	2	6	119830	119835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507514642
3246	NC_021287	CGG	2	6	119843	119848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514642
3247	NC_021287	CCG	2	6	119866	119871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507514642
3248	NC_021287	CGT	2	6	119881	119886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514642
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3252	NC_021287	ATC	2	6	119991	119996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507514642
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3271	NC_021287	CG	3	6	120512	120517	0 %	0 %	50 %	50 %	507514642
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3275	NC_021287	CG	3	6	120602	120607	0 %	0 %	50 %	50 %	507514642
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3277	NC_021287	CGA	2	6	120713	120718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514642
3278	NC_021287	AAAT	2	8	120779	120786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3279	NC_021287	GGT	2	6	120816	120821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3280	NC_021287	CGC	2	6	120888	120893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3282	NC_021287	CGG	2	6	120976	120981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3287	NC_021287	GTC	2	6	121088	121093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3319	NC_021287	TCG	2	6	122397	122402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3321	NC_021287	CGG	2	6	122455	122460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3324	NC_021287	A	7	7	122684	122690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3325	NC_021287	TGT	2	6	122740	122745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3332	NC_021287	CTG	2	6	123052	123057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514646
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3350	NC_021287	CTCGGC	2	12	123629	123640	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507514648
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3352	NC_021287	CG	3	6	123680	123685	0 %	0 %	50 %	50 %	507514648
3353	NC_021287	GCC	2	6	123692	123697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507514648
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3358	NC_021287	CGG	2	6	123850	123855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514648
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3365	NC_021287	CG	3	6	124025	124030	0 %	0 %	50 %	50 %	507514648
3366	NC_021287	CG	3	6	124047	124052	0 %	0 %	50 %	50 %	507514648
3367	NC_021287	CG	3	6	124060	124065	0 %	0 %	50 %	50 %	507514648
3368	NC_021287	TCG	2	6	124092	124097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514648
3369	NC_021287	ATC	2	6	124164	124169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507514648
3370	NC_021287	CG	3	6	124177	124182	0 %	0 %	50 %	50 %	507514648
3371	NC_021287	TCG	2	6	124218	124223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514648
3372	NC_021287	GCG	2	6	124263	124268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514648
3373	NC_021287	CGC	2	6	124273	124278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507514648
3374	NC_021287	TGCG	2	8	124320	124327	0 %	25 %	50 %	25 %	507514648
3375	NC_021287	CG	3	6	124329	124334	0 %	0 %	50 %	50 %	507514648
3376	NC_021287	CCG	3	9	124341	124349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507514648
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3379	NC_021287	CG	4	8	124579	124586	0 %	0 %	50 %	50 %	507514649
3380	NC_021287	GC	4	8	124683	124690	0 %	0 %	50 %	50 %	507514649
3381	NC_021287	CGA	2	6	124705	124710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514649
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3383	NC_021287	CGC	2	6	124738	124743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507514649
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3385	NC_021287	CGA	2	6	124810	124815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514649
3386	NC_021287	ATCG	2	8	124826	124833	25 %	25 %	25 %	25 %	507514649
3387	NC_021287	CTG	2	6	124847	124852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514649
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3391	NC_021287	TGCGT	2	10	125111	125120	0 %	40 %	40 %	20 %	507514649
3392	NC_021287	ACA	2	6	125127	125132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507514649
3393	NC_021287	CTG	2	6	125147	125152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514649
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3395	NC_021287	ATG	2	6	125174	125179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507514649
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3399	NC_021287	CAA	2	6	125233	125238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507514649
3400	NC_021287	GGCG	2	8	125245	125252	0 %	0 %	75 %	25 %	507514649
3401	NC_021287	CGA	2	6	125287	125292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514649
3402	NC_021287	CGAG	2	8	125359	125366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3403	NC_021287	GTT	2	6	125428	125433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507514650
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3408	NC_021287	GCG	2	6	125523	125528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514650
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3410	NC_021287	GC	3	6	125607	125612	0 %	0 %	50 %	50 %	507514650
3411	NC_021287	TGAGCC	2	12	125642	125653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507514650
3412	NC_021287	CGA	2	6	125685	125690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514650
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3419	NC_021287	CGGA	2	8	125866	125873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3420	NC_021287	CGG	2	6	125878	125883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3421	NC_021287	CG	4	8	125892	125899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3422	NC_021287	GCA	2	6	125912	125917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3432	NC_021287	GTC	2	6	126284	126289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514651
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3441	NC_021287	GCGG	2	8	126951	126958	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3442	NC_021287	CAA	2	6	126968	126973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3443	NC_021287	GCA	2	6	127008	127013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514652
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3445	NC_021287	GC	3	6	127143	127148	0 %	0 %	50 %	50 %	507514652
3446	NC_021287	GATC	2	8	127194	127201	25 %	25 %	25 %	25 %	507514652
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3453	NC_021287	TGCGGC	2	12	127547	127558	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507514652
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3464	NC_021287	CGC	2	6	128199	128204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3468	NC_021287	CTG	2	6	128329	128334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3469	NC_021287	A	6	6	128471	128476	100 %	0 %	0 %	0 %	507514653
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3481	NC_021287	CTCG	2	8	129000	129007	0 %	25 %	25 %	50 %	507514654
3482	NC_021287	GACAAG	2	12	129010	129021	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	507514654
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3486	NC_021287	GCC	2	6	129105	129110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3487	NC_021287	CGA	2	6	129116	129121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514655
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3489	NC_021287	CG	3	6	129218	129223	0 %	0 %	50 %	50 %	507514655
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3492	NC_021287	CGC	2	6	129263	129268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507514655
3493	NC_021287	TGC	2	6	129278	129283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514655
3494	NC_021287	TCG	2	6	129328	129333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514655
3495	NC_021287	GGC	2	6	129370	129375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514655
3496	NC_021287	CGA	2	6	129453	129458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507514655
3497	NC_021287	CG	3	6	129476	129481	0 %	0 %	50 %	50 %	507514655
3498	NC_021287	GCG	2	6	129542	129547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507514655
3499	NC_021287	TCG	2	6	129554	129559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507514655
3500	NC_021287	GCAT	2	8	129561	129568	25 %	25 %	25 %	25 %	507514655

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