MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 5622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	TCCT	2	8	144	151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021008	GACC	2	8	338	345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021008	GAGT	2	8	670	677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021008	CGGG	2	8	836	843	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021008	GGTG	2	8	1860	1867	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021008	GCCG	2	8	1955	1962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021008	TTGC	2	8	2177	2184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021008	ACCG	2	8	2303	2310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021008	GCGA	2	8	2399	2406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021008	GCCG	2	8	2496	2503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021008	GCCG	2	8	3776	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021008	ATCA	2	8	6242	6249	50 %	25 %	0 %	25 %	479134918
13	NC_021008	GATG	2	8	6495	6502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021008	GCCG	2	8	6842	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
15	NC_021008	GTCG	2	8	6932	6939	0 %	25 %	50 %	25 %	479134919
16	NC_021008	ATGC	2	8	8305	8312	25 %	25 %	25 %	25 %	479134919
17	NC_021008	CGGC	2	8	8326	8333	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
18	NC_021008	CTGC	2	8	8772	8779	0 %	25 %	25 %	50 %	479134920
19	NC_021008	CGAT	2	8	8836	8843	25 %	25 %	25 %	25 %	479134920
20	NC_021008	TGGA	2	8	9497	9504	25 %	25 %	50 %	0 %	479134921
21	NC_021008	CGGT	2	8	10675	10682	0 %	25 %	50 %	25 %	479134921
22	NC_021008	CATG	2	8	12516	12523	25 %	25 %	25 %	25 %	479134921
23	NC_021008	ACCG	2	8	12541	12548	25 %	0 %	25 %	50 %	479134921
24	NC_021008	AAAC	2	8	12819	12826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021008	AGAT	2	8	14235	14242	50 %	25 %	25 %	0 %	479134925
26	NC_021008	ATTT	2	8	14725	14732	25 %	75 %	0 %	0 %	479134925
27	NC_021008	CCAG	2	8	17083	17090	25 %	0 %	25 %	50 %	479134926
28	NC_021008	GGAA	2	8	17099	17106	50 %	0 %	50 %	0 %	479134926
29	NC_021008	GACG	2	8	17692	17699	25 %	0 %	50 %	25 %	479134927
30	NC_021008	GCCA	2	8	17855	17862	25 %	0 %	25 %	50 %	479134927
31	NC_021008	AACT	2	8	17930	17937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021008	GAGC	2	8	18717	18724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021008	AGCG	2	8	18837	18844	25 %	0 %	50 %	25 %	479134929
34	NC_021008	ATTC	2	8	19083	19090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021008	ATGT	2	8	19644	19651	25 %	50 %	25 %	0 %	479134930
36	NC_021008	CTTG	2	8	19724	19731	0 %	50 %	25 %	25 %	479134930
37	NC_021008	TCAA	2	8	20236	20243	50 %	25 %	0 %	25 %	479134931
38	NC_021008	CAGC	2	8	20648	20655	25 %	0 %	25 %	50 %	479134931
39	NC_021008	CCGT	2	8	20800	20807	0 %	25 %	25 %	50 %	479134931
40	NC_021008	TCAT	2	8	20812	20819	25 %	50 %	0 %	25 %	479134931
41	NC_021008	CACG	2	8	20923	20930	25 %	0 %	25 %	50 %	479134931
42	NC_021008	AATC	2	8	21233	21240	50 %	25 %	0 %	25 %	479134931
43	NC_021008	CAAC	2	8	21284	21291	50 %	0 %	0 %	50 %	479134931
44	NC_021008	CAAG	2	8	21590	21597	50 %	0 %	25 %	25 %	479134931
45	NC_021008	CAGA	2	8	21686	21693	50 %	0 %	25 %	25 %	479134931
46	NC_021008	GCAA	2	8	21754	21761	50 %	0 %	25 %	25 %	479134931
47	NC_021008	AGCC	2	8	21835	21842	25 %	0 %	25 %	50 %	479134931
48	NC_021008	CAAC	2	8	21905	21912	50 %	0 %	0 %	50 %	479134931
49	NC_021008	GCTT	2	8	22288	22295	0 %	50 %	25 %	25 %	479134931
50	NC_021008	CGAT	2	8	22401	22408	25 %	25 %	25 %	25 %	479134931
51	NC_021008	GAAT	2	8	22559	22566	50 %	25 %	25 %	0 %	479134931
52	NC_021008	CAAT	2	8	22754	22761	50 %	25 %	0 %	25 %	479134931
53	NC_021008	GGAT	2	8	23810	23817	25 %	25 %	50 %	0 %	479134931
54	NC_021008	GGCA	2	8	24202	24209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021008	TCGT	2	8	25097	25104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021008	GCTC	2	8	25421	25428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021008	ACCA	2	8	25982	25989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021008	CGAA	2	8	26060	26067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021008	ACCA	2	8	26588	26595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021008	AGCA	2	8	26831	26838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021008	TGAT	2	8	26986	26993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021008	ATCA	2	8	27236	27243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021008	CTCG	2	8	27265	27272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021008	GATT	2	8	27920	27927	25 %	50 %	25 %	0 %	479134932
65	NC_021008	TCCA	2	8	28189	28196	25 %	25 %	0 %	50 %	479134932
66	NC_021008	CCAT	2	8	29231	29238	25 %	25 %	0 %	50 %	479134932
67	NC_021008	TCAG	2	8	29888	29895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021008	GCTG	2	8	29903	29910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021008	GCTC	2	8	29937	29944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021008	ACGA	2	8	30622	30629	50 %	0 %	25 %	25 %	479134933
71	NC_021008	CTAG	2	8	31187	31194	25 %	25 %	25 %	25 %	479134933
72	NC_021008	CAAT	2	8	31882	31889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021008	CACG	2	8	32405	32412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021008	CGCC	2	8	32485	32492	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_021008	GCCG	2	8	33435	33442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021008	AGAT	2	8	34161	34168	50 %	25 %	25 %	0 %	479134934
77	NC_021008	GAAA	2	8	34286	34293	75 %	0 %	25 %	0 %	479134934
78	NC_021008	GGCG	2	8	34693	34700	0 %	0 %	75 %	25 %	479134935
79	NC_021008	CTTC	2	8	34879	34886	0 %	50 %	0 %	50 %	479134935
80	NC_021008	CTGG	2	8	35159	35166	0 %	25 %	50 %	25 %	479134935
81	NC_021008	CCTT	2	8	35925	35932	0 %	50 %	0 %	50 %	479134935
82	NC_021008	GTCA	2	8	36552	36559	25 %	25 %	25 %	25 %	479134936
83	NC_021008	CACG	2	8	36666	36673	25 %	0 %	25 %	50 %	479134936
84	NC_021008	GGAT	2	8	36806	36813	25 %	25 %	50 %	0 %	479134936
85	NC_021008	GCTG	2	8	37214	37221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021008	GGTC	2	8	37446	37453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021008	GTGG	2	8	38419	38426	0 %	25 %	75 %	0 %	479134937
88	NC_021008	ACGC	2	8	38476	38483	25 %	0 %	25 %	50 %	479134937
89	NC_021008	CGGC	2	8	38794	38801	0 %	0 %	50 %	50 %	479134937
90	NC_021008	GCGG	2	8	39856	39863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021008	GGTG	2	8	40788	40795	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021008	CCAC	2	8	41001	41008	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_021008	GAAG	2	8	43777	43784	50 %	0 %	50 %	0 %	479134938
94	NC_021008	CGCC	2	8	43972	43979	0 %	0 %	25 %	75 %	479134938
95	NC_021008	CTCG	2	8	45520	45527	0 %	25 %	25 %	50 %	479134939
96	NC_021008	AATC	2	8	45847	45854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021008	GCGT	2	8	46112	46119	0 %	25 %	50 %	25 %	479134940
98	NC_021008	TCGC	2	8	47632	47639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021008	CTGC	2	8	48516	48523	0 %	25 %	25 %	50 %	479134942
100	NC_021008	TGCG	2	8	49336	49343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021008	GTCT	2	8	49995	50002	0 %	50 %	25 %	25 %	479134944
102	NC_021008	GAGC	2	8	50173	50180	25 %	0 %	50 %	25 %	479134945
103	NC_021008	CGGC	2	8	50292	50299	0 %	0 %	50 %	50 %	479134945
104	NC_021008	GAAC	2	8	50524	50531	50 %	0 %	25 %	25 %	479134945
105	NC_021008	CAGG	2	8	51784	51791	25 %	0 %	50 %	25 %	479134946
106	NC_021008	CGGA	2	8	52321	52328	25 %	0 %	50 %	25 %	479134946
107	NC_021008	AACC	2	8	52836	52843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021008	TCCT	2	8	52898	52905	0 %	50 %	0 %	50 %	479134947
109	NC_021008	TCTG	2	8	53228	53235	0 %	50 %	25 %	25 %	479134947
110	NC_021008	GAAG	2	8	53465	53472	50 %	0 %	50 %	0 %	479134947
111	NC_021008	CTGC	2	8	53882	53889	0 %	25 %	25 %	50 %	479134947
112	NC_021008	TGAC	2	8	54215	54222	25 %	25 %	25 %	25 %	479134948
113	NC_021008	CGAC	2	8	54725	54732	25 %	0 %	25 %	50 %	479134948
114	NC_021008	ATGG	2	8	55339	55346	25 %	25 %	50 %	0 %	479134948
115	NC_021008	CCTC	2	8	55779	55786	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_021008	GAGG	2	8	55791	55798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021008	GTGG	2	8	56042	56049	0 %	25 %	75 %	0 %	479134949
118	NC_021008	ATTC	2	8	56605	56612	25 %	50 %	0 %	25 %	479134949
119	NC_021008	AGCG	2	8	56688	56695	25 %	0 %	50 %	25 %	479134949
120	NC_021008	ACCA	2	8	57166	57173	50 %	0 %	0 %	50 %	479134950
121	NC_021008	TTTG	2	8	58374	58381	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021008	GCGG	2	8	59066	59073	0 %	0 %	75 %	25 %	479134952
123	NC_021008	CGAA	2	8	60356	60363	50 %	0 %	25 %	25 %	479134954
124	NC_021008	CAAC	2	8	60397	60404	50 %	0 %	0 %	50 %	479134954
125	NC_021008	AGCG	2	8	60855	60862	25 %	0 %	50 %	25 %	479134954
126	NC_021008	TAAA	2	8	61107	61114	75 %	25 %	0 %	0 %	479134955
127	NC_021008	CGGA	2	8	61272	61279	25 %	0 %	50 %	25 %	479134955
128	NC_021008	GATG	2	8	61634	61641	25 %	25 %	50 %	0 %	479134955
129	NC_021008	GATT	2	8	61727	61734	25 %	50 %	25 %	0 %	479134955
130	NC_021008	CGCA	2	8	61943	61950	25 %	0 %	25 %	50 %	479134955
131	NC_021008	TTCG	2	8	62108	62115	0 %	50 %	25 %	25 %	479134955
132	NC_021008	GCCG	2	8	62405	62412	0 %	0 %	50 %	50 %	479134955
133	NC_021008	GGTG	2	8	62821	62828	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021008	CGGC	2	8	63349	63356	0 %	0 %	50 %	50 %	479134956
135	NC_021008	CAGG	2	8	63419	63426	25 %	0 %	50 %	25 %	479134956
136	NC_021008	GGCC	2	8	63451	63458	0 %	0 %	50 %	50 %	479134956
137	NC_021008	CTTC	2	8	63592	63599	0 %	50 %	0 %	50 %	479134956
138	NC_021008	GCCC	2	8	64932	64939	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_021008	CCGC	2	8	65222	65229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_021008	CGGC	2	8	66188	66195	0 %	0 %	50 %	50 %	479134957
141	NC_021008	ATTG	2	8	67500	67507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021008	CGGC	2	8	68159	68166	0 %	0 %	50 %	50 %	479134959
143	NC_021008	TGGG	2	8	68753	68760	0 %	25 %	75 %	0 %	479134959
144	NC_021008	TGAG	2	8	69483	69490	25 %	25 %	50 %	0 %	479134960
145	NC_021008	CGGC	2	8	69801	69808	0 %	0 %	50 %	50 %	479134960
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