MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 52756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021008	TGT	2	6	24430	24435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021008	GGC	2	6	24530	24535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021008	GTA	2	6	24569	24574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021008	GCC	2	6	24590	24595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_021008	AAC	2	6	24618	24623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_021008	AGA	2	6	24632	24637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021008	CAA	2	6	24652	24657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021008	CT	3	6	24666	24671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_021008	TCC	2	6	24812	24817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_021008	AC	3	6	24840	24845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_021008	GCA	3	9	24891	24899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021008	CATACG	2	12	24944	24955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_021008	GCA	2	6	24967	24972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_021008	GGT	2	6	25077	25082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021008	TCGT	2	8	25097	25104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_021008	AC	3	6	25282	25287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_021008	AAC	2	6	25353	25358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021008	GCTC	2	8	25421	25428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
519	NC_021008	GAT	2	6	25430	25435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021008	AT	3	6	25473	25478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021008	CTG	2	6	25532	25537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021008	CAA	2	6	25549	25554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_021008	GCG	2	6	25827	25832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021008	AAT	2	6	25879	25884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021008	GTC	2	6	25907	25912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021008	ATG	2	6	25923	25928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021008	ACCA	2	8	25982	25989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_021008	CGAA	2	8	26060	26067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_021008	TCT	2	6	26068	26073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021008	TTG	2	6	26124	26129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021008	CTT	2	6	26429	26434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021008	AGT	2	6	26465	26470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021008	CA	3	6	26482	26487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_021008	CAT	2	6	26539	26544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_021008	ACCA	2	8	26588	26595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_021008	GGC	2	6	26729	26734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021008	CCA	2	6	26770	26775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_021008	GCA	2	6	26779	26784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_021008	TGA	2	6	26817	26822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021008	AGCA	2	8	26831	26838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_021008	CAT	2	6	26857	26862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021008	CAA	2	6	26872	26877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021008	CAT	2	6	26978	26983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021008	TGAT	2	8	26986	26993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021008	TCA	2	6	27037	27042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_021008	GC	3	6	27141	27146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_021008	ATCA	2	8	27236	27243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_021008	TCA	2	6	27255	27260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021008	CTCG	2	8	27265	27272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_021008	CAA	2	6	27345	27350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_021008	GTA	2	6	27406	27411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021008	CA	4	8	27429	27436	50 %	0 %	0 %	50 %	479134932
553	NC_021008	GAC	2	6	27526	27531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134932
554	NC_021008	TGC	2	6	27607	27612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134932
555	NC_021008	ACG	2	6	27748	27753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134932
556	NC_021008	TTA	2	6	27788	27793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479134932
557	NC_021008	TCT	2	6	27809	27814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
558	NC_021008	ATA	2	6	27910	27915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134932
559	NC_021008	GATT	2	8	27920	27927	25 %	50 %	25 %	0 %	479134932
560	NC_021008	TTC	2	6	27967	27972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
561	NC_021008	CTG	2	6	28165	28170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134932
562	NC_021008	TCCA	2	8	28189	28196	25 %	25 %	0 %	50 %	479134932
563	NC_021008	AC	3	6	28239	28244	50 %	0 %	0 %	50 %	479134932
564	NC_021008	CAC	2	6	28324	28329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134932
565	NC_021008	TCA	2	6	28376	28381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134932
566	NC_021008	TTG	2	6	28457	28462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134932
567	NC_021008	AT	3	6	28498	28503	50 %	50 %	0 %	0 %	479134932
568	NC_021008	CTT	2	6	28531	28536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
569	NC_021008	CAG	2	6	28653	28658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134932
570	NC_021008	CCGTT	2	10	28717	28726	0 %	40 %	20 %	40 %	479134932
571	NC_021008	TTC	2	6	28915	28920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
572	NC_021008	GAA	2	6	29025	29030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134932
573	NC_021008	TGC	2	6	29063	29068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134932
574	NC_021008	ATA	2	6	29194	29199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134932
575	NC_021008	CTC	2	6	29200	29205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134932
576	NC_021008	CCAT	2	8	29231	29238	25 %	25 %	0 %	50 %	479134932
577	NC_021008	CAT	2	6	29268	29273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134932
578	NC_021008	TCA	2	6	29285	29290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134932
579	NC_021008	TCA	2	6	29465	29470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021008	CAA	2	6	29482	29487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021008	ATG	2	6	29544	29549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021008	AGACC	2	10	29583	29592	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
583	NC_021008	CAC	2	6	29679	29684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_021008	CAT	2	6	29691	29696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021008	CA	3	6	29710	29715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_021008	CTT	2	6	29723	29728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021008	CT	3	6	29738	29743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_021008	CCG	2	6	29870	29875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_021008	TCAG	2	8	29888	29895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_021008	GCTG	2	8	29903	29910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_021008	TCA	2	6	29931	29936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021008	GCTC	2	8	29937	29944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
593	NC_021008	TTCGAA	2	12	30039	30050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
594	NC_021008	ATG	2	6	30141	30146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134933
595	NC_021008	CAA	2	6	30159	30164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134933
596	NC_021008	CTG	2	6	30207	30212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134933
597	NC_021008	CT	3	6	30366	30371	0 %	50 %	0 %	50 %	479134933
598	NC_021008	ACA	2	6	30571	30576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134933
599	NC_021008	CAA	2	6	30587	30592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134933
600	NC_021008	ACGA	2	8	30622	30629	50 %	0 %	25 %	25 %	479134933
601	NC_021008	CGC	2	6	30681	30686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134933
602	NC_021008	AAC	2	6	30744	30749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134933
603	NC_021008	TC	3	6	30788	30793	0 %	50 %	0 %	50 %	479134933
604	NC_021008	GAG	2	6	30831	30836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134933
605	NC_021008	GCA	2	6	30942	30947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134933
606	NC_021008	ACG	2	6	31039	31044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134933
607	NC_021008	TGG	2	6	31077	31082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134933
608	NC_021008	TGC	2	6	31144	31149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134933
609	NC_021008	CTAG	2	8	31187	31194	25 %	25 %	25 %	25 %	479134933
610	NC_021008	GGC	2	6	31248	31253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021008	CGA	2	6	31274	31279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021008	GCA	3	9	31451	31459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021008	AAC	2	6	31465	31470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_021008	CTG	2	6	31537	31542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021008	GCC	2	6	31548	31553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_021008	GCA	2	6	31559	31564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_021008	GCC	2	6	31578	31583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_021008	GCGATG	2	12	31624	31635	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
619	NC_021008	CGA	3	9	31661	31669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021008	TCG	2	6	31678	31683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021008	GTC	2	6	31689	31694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_021008	CCA	2	6	31746	31751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_021008	CTG	2	6	31875	31880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021008	CAAT	2	8	31882	31889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_021008	A	6	6	31941	31946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021008	CAG	2	6	31953	31958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021008	CAG	2	6	31980	31985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021008	GTT	2	6	32109	32114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021008	ATTCA	2	10	32210	32219	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
630	NC_021008	CAG	2	6	32238	32243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021008	GCC	2	6	32276	32281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_021008	CACG	2	8	32405	32412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_021008	GC	3	6	32413	32418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_021008	GTA	2	6	32475	32480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021008	CGCC	2	8	32485	32492	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
636	NC_021008	GAG	2	6	32589	32594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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