MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 52756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021008	TCT	3	9	277930	277938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_021008	AGG	2	6	277980	277985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021008	AAT	2	6	277986	277991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479135110
6004	NC_021008	GC	3	6	278010	278015	0 %	0 %	50 %	50 %	479135110
6005	NC_021008	GCG	2	6	278030	278035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135110
6006	NC_021008	A	6	6	278036	278041	100 %	0 %	0 %	0 %	479135110
6007	NC_021008	CG	4	8	278168	278175	0 %	0 %	50 %	50 %	479135110
6008	NC_021008	GAG	2	6	278224	278229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135110
6009	NC_021008	TGG	2	6	278231	278236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135110
6010	NC_021008	TGG	2	6	278330	278335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135110
6011	NC_021008	GGCA	2	8	278360	278367	25 %	0 %	50 %	25 %	479135110
6012	NC_021008	TGGCCG	2	12	278378	278389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479135110
6013	NC_021008	TCA	2	6	278450	278455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135110
6014	NC_021008	GCG	2	6	278494	278499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135110
6015	NC_021008	GC	3	6	278564	278569	0 %	0 %	50 %	50 %	479135110
6016	NC_021008	CCG	2	6	278666	278671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135110
6017	NC_021008	CCA	2	6	278696	278701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135110
6018	NC_021008	CCA	2	6	278735	278740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135110
6019	NC_021008	TCC	2	6	278755	278760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135110
6020	NC_021008	CGG	2	6	278766	278771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135110
6021	NC_021008	TG	3	6	278775	278780	0 %	50 %	50 %	0 %	479135110
6022	NC_021008	TGG	2	6	278798	278803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135110
6023	NC_021008	CAA	2	6	278814	278819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135110
6024	NC_021008	GCA	2	6	278864	278869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135110
6025	NC_021008	GCC	2	6	278877	278882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135110
6026	NC_021008	TATGAG	2	12	278896	278907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135110
6027	NC_021008	GCT	2	6	278928	278933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135110
6028	NC_021008	CAT	2	6	278982	278987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135110
6029	NC_021008	GATG	2	8	278994	279001	25 %	25 %	50 %	0 %	479135110
6030	NC_021008	ATT	2	6	279075	279080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135111
6031	NC_021008	CAA	2	6	279102	279107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135111
6032	NC_021008	TCG	2	6	279134	279139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135111
6033	NC_021008	GCCA	2	8	279183	279190	25 %	0 %	25 %	50 %	479135111
6034	NC_021008	AGT	2	6	279239	279244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135111
6035	NC_021008	CATG	2	8	279300	279307	25 %	25 %	25 %	25 %	479135111
6036	NC_021008	TAC	2	6	279355	279360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135111
6037	NC_021008	GCG	2	6	279555	279560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135111
6038	NC_021008	GAAC	2	8	279574	279581	50 %	0 %	25 %	25 %	479135111
6039	NC_021008	CCGT	2	8	279597	279604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_021008	CAA	2	6	279620	279625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_021008	ATGAC	2	10	279669	279678	40 %	20 %	20 %	20 %	479135112
6042	NC_021008	CGG	2	6	279693	279698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135112
6043	NC_021008	CGA	2	6	279715	279720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135112
6044	NC_021008	CTG	2	6	279722	279727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135112
6045	NC_021008	CAT	2	6	279746	279751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135112
6046	NC_021008	GCCG	2	8	279752	279759	0 %	0 %	50 %	50 %	479135112
6047	NC_021008	CAG	2	6	279944	279949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135112
6048	NC_021008	GAT	2	6	279995	280000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135112
6049	NC_021008	CCA	2	6	280027	280032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135112
6050	NC_021008	ACTC	2	8	280153	280160	25 %	25 %	0 %	50 %	479135112
6051	NC_021008	GCC	2	6	280194	280199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135113
6052	NC_021008	CAG	2	6	280204	280209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135113
6053	NC_021008	GAT	2	6	280213	280218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135113
6054	NC_021008	GAT	2	6	280222	280227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135113
6055	NC_021008	ACG	2	6	280325	280330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135113
6056	NC_021008	CGA	2	6	280338	280343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135113
6057	NC_021008	CAG	2	6	280357	280362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135113
6058	NC_021008	GCT	2	6	280367	280372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135113
6059	NC_021008	ACC	2	6	280394	280399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135113
6060	NC_021008	GCC	2	6	280406	280411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135113
6061	NC_021008	ACC	2	6	280505	280510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135113
6062	NC_021008	CAA	2	6	280533	280538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135113
6063	NC_021008	ACA	2	6	280561	280566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135113
6064	NC_021008	CAC	2	6	280576	280581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135113
6065	NC_021008	AATG	2	8	280630	280637	50 %	25 %	25 %	0 %	479135113
6066	NC_021008	CAATAT	2	12	280671	280682	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6067	NC_021008	CTGCA	2	10	280695	280704	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6068	NC_021008	CCA	2	6	280712	280717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_021008	ATA	2	6	280720	280725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_021008	AAG	2	6	280830	280835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_021008	CAG	2	6	280847	280852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_021008	GAG	2	6	280856	280861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_021008	TCG	2	6	280929	280934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_021008	GCAA	2	8	280935	280942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_021008	GGCG	2	8	280960	280967	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_021008	GCTC	2	8	280969	280976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_021008	TTC	2	6	281003	281008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_021008	CCA	2	6	281023	281028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_021008	TCGG	2	8	281072	281079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6080	NC_021008	GCG	3	9	281094	281102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_021008	CCA	2	6	281105	281110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_021008	AGGC	2	8	281185	281192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_021008	CGA	2	6	281215	281220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_021008	CTT	3	9	281231	281239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_021008	GTA	2	6	281261	281266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_021008	GATCA	2	10	281297	281306	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6087	NC_021008	CTT	2	6	281339	281344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_021008	CA	3	6	281354	281359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_021008	CCA	2	6	281365	281370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_021008	GGC	2	6	281381	281386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_021008	CAG	2	6	281420	281425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_021008	GCA	2	6	281435	281440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_021008	CTT	2	6	281500	281505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_021008	GCT	2	6	281533	281538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_021008	TGA	2	6	281644	281649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_021008	CCA	2	6	281656	281661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_021008	GCG	2	6	281709	281714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_021008	TGC	2	6	281731	281736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_021008	AGC	2	6	281802	281807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_021008	CGG	2	6	281890	281895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_021008	GTG	2	6	281925	281930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_021008	ATC	2	6	281996	282001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_021008	GCA	2	6	282013	282018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_021008	TGA	2	6	282031	282036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_021008	CCA	3	9	282103	282111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6106	NC_021008	GCC	2	6	282299	282304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_021008	GAT	2	6	282407	282412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_021008	TCG	2	6	282420	282425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_021008	GCT	3	9	282535	282543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_021008	CGC	2	6	282592	282597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_021008	CGG	2	6	282680	282685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_021008	TCA	2	6	282690	282695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_021008	CCA	2	6	282712	282717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_021008	TGG	2	6	282752	282757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_021008	GTG	2	6	282789	282794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_021008	ACGA	2	8	282842	282849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6117	NC_021008	GTG	2	6	282855	282860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_021008	CGAT	2	8	282867	282874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6119	NC_021008	T	6	6	282896	282901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_021008	CG	3	6	282912	282917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_021008	TGA	2	6	282945	282950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_021008	GGC	2	6	282953	282958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_021008	TCA	2	6	283164	283169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_021008	CAGC	2	8	283213	283220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_021008	ACCA	2	8	283256	283263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_021008	GCGT	2	8	283276	283283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_021008	AATC	2	8	283367	283374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6128	NC_021008	CTG	2	6	283402	283407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_021008	CCA	2	6	283429	283434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_021008	CCGG	2	8	283449	283456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_021008	GCC	2	6	283490	283495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_021008	CGC	2	6	283569	283574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6133	NC_021008	CCA	2	6	283602	283607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6134	NC_021008	CTG	2	6	283757	283762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6139	NC_021008	AGCCG	2	10	283946	283955	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6141	NC_021008	CGA	3	9	284157	284165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6142	NC_021008	ATC	2	6	284267	284272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6143	NC_021008	TGG	2	6	284413	284418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6144	NC_021008	GAT	2	6	284458	284463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6145	NC_021008	TGG	2	6	284491	284496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6146	NC_021008	GC	3	6	284504	284509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6147	NC_021008	CGAG	2	8	284523	284530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6148	NC_021008	CGA	2	6	284540	284545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6149	NC_021008	TCG	2	6	284637	284642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6151	NC_021008	CCA	2	6	284712	284717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6152	NC_021008	CTG	2	6	284730	284735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6154	NC_021008	CCG	2	6	284793	284798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6242	NC_021008	GACG	2	8	289150	289157	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6243	NC_021008	CG	3	6	289295	289300	0 %	0 %	50 %	50 %	479135118
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6249	NC_021008	CG	4	8	289514	289521	0 %	0 %	50 %	50 %	479135118
6250	NC_021008	GGC	3	9	289581	289589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135118
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6498	NC_021008	CCGGG	2	10	301735	301744	0 %	0 %	60 %	40 %	479135124
6499	NC_021008	GTA	2	6	301769	301774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135124
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