MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-192

Total Repeats: 47021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020515	CTTT	2	8	203969	203976	0 %	75 %	0 %	25 %	470166215
4003	NC_020515	TTGG	2	8	204040	204047	0 %	50 %	50 %	0 %	470166215
4004	NC_020515	T	7	7	204048	204054	0 %	100 %	0 %	0 %	470166215
4005	NC_020515	CGG	2	6	204066	204071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470166215
4006	NC_020515	AAAGG	2	10	204073	204082	60 %	0 %	40 %	0 %	470166215
4007	NC_020515	GTGAA	2	10	204101	204110	40 %	20 %	40 %	0 %	470166215
4008	NC_020515	TTAT	2	8	204146	204153	25 %	75 %	0 %	0 %	470166215
4009	NC_020515	CTT	2	6	204281	204286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166215
4010	NC_020515	A	6	6	204309	204314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020515	C	7	7	204334	204340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4012	NC_020515	T	7	7	204383	204389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4014	NC_020515	TTTTC	2	10	204474	204483	0 %	80 %	0 %	20 %	470166216
4015	NC_020515	ATT	2	6	204612	204617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166216
4016	NC_020515	A	6	6	204626	204631	100 %	0 %	0 %	0 %	470166216
4017	NC_020515	TA	3	6	204703	204708	50 %	50 %	0 %	0 %	470166216
4018	NC_020515	ATA	2	6	204715	204720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166216
4019	NC_020515	TCTA	2	8	204726	204733	25 %	50 %	0 %	25 %	470166216
4020	NC_020515	TAA	2	6	204734	204739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166216
4021	NC_020515	GAA	2	6	204775	204780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470166216
4022	NC_020515	AATC	2	8	204786	204793	50 %	25 %	0 %	25 %	470166216
4023	NC_020515	TAA	2	6	204909	204914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166216
4024	NC_020515	CATTA	2	10	204918	204927	40 %	40 %	0 %	20 %	470166217
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4033	NC_020515	AGCA	2	8	205244	205251	50 %	0 %	25 %	25 %	470166217
4034	NC_020515	ATA	2	6	205304	205309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166217
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4043	NC_020515	TTGA	2	8	205718	205725	25 %	50 %	25 %	0 %	470166218
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4056	NC_020515	ATT	2	6	206442	206447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166219
4057	NC_020515	TAC	2	6	206453	206458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166219
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4062	NC_020515	TTTG	2	8	206755	206762	0 %	75 %	25 %	0 %	470166220
4063	NC_020515	GCA	2	6	206763	206768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166220
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4065	NC_020515	TTC	2	6	207042	207047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166220
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4091	NC_020515	GCA	2	6	208353	208358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166220
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4097	NC_020515	ATGA	2	8	208555	208562	50 %	25 %	25 %	0 %	470166220
4098	NC_020515	TTTGA	2	10	208597	208606	20 %	60 %	20 %	0 %	470166220
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4106	NC_020515	CAG	2	6	208810	208815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166220
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4111	NC_020515	TGA	2	6	209106	209111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166220
4112	NC_020515	AGTT	2	8	209129	209136	25 %	50 %	25 %	0 %	470166220
4113	NC_020515	AT	3	6	209163	209168	50 %	50 %	0 %	0 %	470166220
4114	NC_020515	ATGA	2	8	209233	209240	50 %	25 %	25 %	0 %	470166220
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4121	NC_020515	A	6	6	209518	209523	100 %	0 %	0 %	0 %	470166220
4122	NC_020515	TAC	2	6	209541	209546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166220
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4124	NC_020515	CAG	2	6	209721	209726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166220
4125	NC_020515	CTG	2	6	209759	209764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166220
4126	NC_020515	TGA	2	6	209813	209818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166220
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4128	NC_020515	CAGTA	2	10	209900	209909	40 %	20 %	20 %	20 %	470166221
4129	NC_020515	GAAG	2	8	209948	209955	50 %	0 %	50 %	0 %	470166221
4130	NC_020515	GAT	2	6	210066	210071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166221
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4155	NC_020515	TGA	2	6	211193	211198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166221
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4235	NC_020515	CTAT	2	8	214703	214710	25 %	50 %	0 %	25 %	470166224
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4241	NC_020515	AG	3	6	215031	215036	50 %	0 %	50 %	0 %	470166224
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4246	NC_020515	GTTT	2	8	215179	215186	0 %	75 %	25 %	0 %	470166224
4247	NC_020515	CTT	2	6	215192	215197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166224
4248	NC_020515	TTG	2	6	215222	215227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470166224
4249	NC_020515	GAT	2	6	215254	215259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166224
4250	NC_020515	TA	3	6	215262	215267	50 %	50 %	0 %	0 %	470166224
4251	NC_020515	TCG	2	6	215328	215333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166224
4252	NC_020515	GCA	2	6	215395	215400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166224
4253	NC_020515	ATT	3	9	215455	215463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166224
4254	NC_020515	TGA	2	6	215465	215470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166224
4255	NC_020515	TGCT	2	8	215471	215478	0 %	50 %	25 %	25 %	470166224
4256	NC_020515	TCT	2	6	215479	215484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166224
4257	NC_020515	ATG	2	6	215491	215496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166224
4258	NC_020515	CATC	2	8	215558	215565	25 %	25 %	0 %	50 %	470166224
4259	NC_020515	ATT	2	6	215572	215577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166224
4260	NC_020515	TGG	2	6	215640	215645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166224
4261	NC_020515	TTA	2	6	215668	215673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166224
4262	NC_020515	GCA	2	6	215674	215679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166224
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4264	NC_020515	TTA	2	6	215732	215737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166224
4265	NC_020515	CTT	2	6	215783	215788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166224
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4270	NC_020515	ATT	2	6	215916	215921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166224
4271	NC_020515	GTTTT	2	10	215948	215957	0 %	80 %	20 %	0 %	470166224
4272	NC_020515	TAA	2	6	215974	215979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166224
4273	NC_020515	TAAAA	2	10	216016	216025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_020515	T	8	8	216037	216044	0 %	100 %	0 %	0 %	470166225
4275	NC_020515	T	6	6	216048	216053	0 %	100 %	0 %	0 %	470166225
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4279	NC_020515	T	6	6	216149	216154	0 %	100 %	0 %	0 %	470166225
4280	NC_020515	AT	3	6	216166	216171	50 %	50 %	0 %	0 %	470166225
4281	NC_020515	TG	3	6	216181	216186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4282	NC_020515	TTG	2	6	216192	216197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4283	NC_020515	T	6	6	216216	216221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_020515	TAGC	2	8	216293	216300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4285	NC_020515	TTGAA	2	10	216323	216332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4286	NC_020515	GGC	2	6	216362	216367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4287	NC_020515	GAA	2	6	216400	216405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4288	NC_020515	GCTT	2	8	216406	216413	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4289	NC_020515	ACT	2	6	216476	216481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4291	NC_020515	TGG	2	6	216577	216582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4292	NC_020515	GCCA	2	8	216630	216637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4293	NC_020515	GCA	2	6	216675	216680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4299	NC_020515	AGGG	2	8	216987	216994	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4300	NC_020515	GGA	2	6	217034	217039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4303	NC_020515	TGC	2	6	217371	217376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4309	NC_020515	AC	3	6	217716	217721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4310	NC_020515	G	6	6	217776	217781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4313	NC_020515	GGT	2	6	217953	217958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4314	NC_020515	GGT	2	6	217988	217993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4322	NC_020515	GA	3	6	218252	218257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4323	NC_020515	AGT	2	6	218312	218317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4325	NC_020515	GTT	2	6	218353	218358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4371	NC_020515	GCT	2	6	221051	221056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4373	NC_020515	GTT	2	6	221215	221220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_020515	ACG	2	6	221228	221233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4375	NC_020515	GT	3	6	221246	221251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4376	NC_020515	AAAACA	2	12	221328	221339	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4378	NC_020515	GAA	2	6	221390	221395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_020515	GAA	2	6	221424	221429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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