MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-192

Total Repeats: 47021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020515	TAT	2	6	52678	52683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020515	ACTT	2	8	52725	52732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_020515	TGG	2	6	52832	52837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166045
1004	NC_020515	CGT	2	6	52860	52865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166045
1005	NC_020515	GGA	2	6	52880	52885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470166045
1006	NC_020515	ATT	2	6	52943	52948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166045
1007	NC_020515	GTAT	2	8	52999	53006	25 %	50 %	25 %	0 %	470166045
1008	NC_020515	TCG	2	6	53009	53014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166045
1009	NC_020515	GCT	2	6	53028	53033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166045
1010	NC_020515	AGC	2	6	53036	53041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166045
1011	NC_020515	GAG	2	6	53094	53099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470166045
1012	NC_020515	TCG	2	6	53291	53296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166045
1013	NC_020515	AT	3	6	53381	53386	50 %	50 %	0 %	0 %	470166045
1014	NC_020515	AAT	2	6	53406	53411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166045
1015	NC_020515	TTGG	2	8	53416	53423	0 %	50 %	50 %	0 %	470166045
1016	NC_020515	TAT	2	6	53561	53566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166045
1017	NC_020515	GGT	2	6	53580	53585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166045
1018	NC_020515	CT	3	6	53604	53609	0 %	50 %	0 %	50 %	470166045
1019	NC_020515	GTG	2	6	53697	53702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166045
1020	NC_020515	GTTT	2	8	53747	53754	0 %	75 %	25 %	0 %	470166045
1021	NC_020515	AATTT	2	10	53894	53903	40 %	60 %	0 %	0 %	470166045
1022	NC_020515	T	8	8	53939	53946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020515	T	6	6	53966	53971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020515	A	6	6	53973	53978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020515	TTA	2	6	53998	54003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020515	CAA	2	6	54030	54035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166046
1027	NC_020515	GAG	2	6	54178	54183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470166046
1028	NC_020515	TAA	2	6	54232	54237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166046
1029	NC_020515	CTTT	2	8	54240	54247	0 %	75 %	0 %	25 %	470166046
1030	NC_020515	GC	3	6	54350	54355	0 %	0 %	50 %	50 %	470166046
1031	NC_020515	TGC	2	6	54357	54362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166046
1032	NC_020515	TAC	2	6	54381	54386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166046
1033	NC_020515	TG	3	6	54390	54395	0 %	50 %	50 %	0 %	470166046
1034	NC_020515	TGG	2	6	54461	54466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166046
1035	NC_020515	ATT	2	6	54488	54493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166046
1036	NC_020515	TGG	2	6	54511	54516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166046
1037	NC_020515	CAA	2	6	54525	54530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166046
1038	NC_020515	TTGC	2	8	54716	54723	0 %	50 %	25 %	25 %	470166046
1039	NC_020515	GGCA	2	8	54795	54802	25 %	0 %	50 %	25 %	470166046
1040	NC_020515	TAT	2	6	54829	54834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166046
1041	NC_020515	ATA	2	6	54843	54848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166046
1042	NC_020515	CTC	3	9	54870	54878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470166046
1043	NC_020515	AGC	2	6	54916	54921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166046
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1045	NC_020515	ATT	2	6	55015	55020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166046
1046	NC_020515	TC	3	6	55062	55067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_020515	TTTTC	2	10	55068	55077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1048	NC_020515	TGTT	2	8	55105	55112	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020515	GAA	2	6	55139	55144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470166047
1050	NC_020515	CGG	2	6	55270	55275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470166047
1051	NC_020515	TAT	2	6	55309	55314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166047
1052	NC_020515	AAC	2	6	55381	55386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166047
1053	NC_020515	CAT	2	6	55394	55399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166047
1054	NC_020515	CAG	2	6	55416	55421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166047
1055	NC_020515	ACA	2	6	55466	55471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166047
1056	NC_020515	AGG	2	6	55556	55561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470166047
1057	NC_020515	TGA	2	6	55702	55707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166048
1058	NC_020515	AAG	2	6	55795	55800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470166048
1059	NC_020515	TAT	2	6	55811	55816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166048
1060	NC_020515	GGA	2	6	55896	55901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470166048
1061	NC_020515	TTG	2	6	55938	55943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470166048
1062	NC_020515	GAGT	2	8	55954	55961	25 %	25 %	50 %	0 %	470166048
1063	NC_020515	GATG	2	8	56057	56064	25 %	25 %	50 %	0 %	470166048
1064	NC_020515	GAT	2	6	56190	56195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166048
1065	NC_020515	TGC	2	6	56203	56208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166048
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1067	NC_020515	TTGA	2	8	56262	56269	25 %	50 %	25 %	0 %	470166048
1068	NC_020515	ATG	2	6	56271	56276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166048
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1070	NC_020515	GTG	2	6	56395	56400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166048
1071	NC_020515	GTG	2	6	56479	56484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166048
1072	NC_020515	GAA	2	6	56653	56658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470166048
1073	NC_020515	TGA	2	6	56677	56682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166048
1074	NC_020515	CAA	2	6	56763	56768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166048
1075	NC_020515	TGA	2	6	56791	56796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166048
1076	NC_020515	CGTGG	2	10	56832	56841	0 %	20 %	60 %	20 %	470166048
1077	NC_020515	A	6	6	56853	56858	100 %	0 %	0 %	0 %	470166048
1078	NC_020515	ATCA	2	8	56874	56881	50 %	25 %	0 %	25 %	470166048
1079	NC_020515	CTG	2	6	56983	56988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166048
1080	NC_020515	GCAA	2	8	57002	57009	50 %	0 %	25 %	25 %	470166048
1081	NC_020515	AGA	2	6	57016	57021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470166048
1082	NC_020515	AGA	2	6	57094	57099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020515	ACC	2	6	57149	57154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470166049
1084	NC_020515	CGA	2	6	57217	57222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166049
1085	NC_020515	TGA	2	6	57289	57294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166049
1086	NC_020515	GCAAA	2	10	57318	57327	60 %	0 %	20 %	20 %	470166049
1087	NC_020515	A	6	6	57503	57508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020515	A	7	7	57586	57592	100 %	0 %	0 %	0 %	470166050
1089	NC_020515	TAT	2	6	57613	57618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166050
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1093	NC_020515	T	6	6	57665	57670	0 %	100 %	0 %	0 %	470166050
1094	NC_020515	ATT	2	6	57719	57724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166050
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1097	NC_020515	AATGTT	2	12	57946	57957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470166050
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1099	NC_020515	GAT	2	6	57970	57975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166050
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1102	NC_020515	TG	3	6	58072	58077	0 %	50 %	50 %	0 %	470166050
1103	NC_020515	TTTAT	2	10	58085	58094	20 %	80 %	0 %	0 %	470166050
1104	NC_020515	GGT	2	6	58154	58159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166050
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1107	NC_020515	TGCT	2	8	58233	58240	0 %	50 %	25 %	25 %	470166050
1108	NC_020515	CTG	2	6	58290	58295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166050
1109	NC_020515	TGC	2	6	58321	58326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166050
1110	NC_020515	GTT	3	9	58328	58336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470166050
1111	NC_020515	TGG	2	6	58455	58460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166050
1112	NC_020515	GCA	2	6	58481	58486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166050
1113	NC_020515	A	6	6	58514	58519	100 %	0 %	0 %	0 %	470166050
1114	NC_020515	CA	3	6	58587	58592	50 %	0 %	0 %	50 %	470166051
1115	NC_020515	A	6	6	58614	58619	100 %	0 %	0 %	0 %	470166051
1116	NC_020515	TTC	2	6	58716	58721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166051
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1119	NC_020515	GTG	2	6	58942	58947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166051
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1122	NC_020515	A	6	6	59036	59041	100 %	0 %	0 %	0 %	470166051
1123	NC_020515	TGCT	2	8	59140	59147	0 %	50 %	25 %	25 %	470166051
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1125	NC_020515	GCCA	2	8	59205	59212	25 %	0 %	25 %	50 %	470166051
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1127	NC_020515	GGC	2	6	59279	59284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470166051
1128	NC_020515	A	6	6	59286	59291	100 %	0 %	0 %	0 %	470166051
1129	NC_020515	TGGT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	50 %	0 %	470166051
1130	NC_020515	TGA	2	6	59321	59326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166051
1131	NC_020515	GCA	2	6	59358	59363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166051
1132	NC_020515	CAA	2	6	59373	59378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166051
1133	NC_020515	A	6	6	59383	59388	100 %	0 %	0 %	0 %	470166051
1134	NC_020515	TTA	2	6	59470	59475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166051
1135	NC_020515	AAAT	2	8	59478	59485	75 %	25 %	0 %	0 %	470166051
1136	NC_020515	TTG	2	6	59492	59497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020515	TCA	2	6	59525	59530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_020515	CT	3	6	59578	59583	0 %	50 %	0 %	50 %	470166052
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1144	NC_020515	GAT	2	6	59855	59860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166052
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1158	NC_020515	ATT	2	6	60356	60361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166052
1159	NC_020515	GCA	2	6	60408	60413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166052
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1161	NC_020515	T	6	6	60554	60559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_020515	AAC	2	6	60611	60616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166053
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1198	NC_020515	T	9	9	62199	62207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1199	NC_020515	T	6	6	62211	62216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1204	NC_020515	AT	3	6	62329	62334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1205	NC_020515	TG	3	6	62344	62349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1206	NC_020515	TTG	2	6	62355	62360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1207	NC_020515	T	6	6	62379	62384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1208	NC_020515	TAGC	2	8	62456	62463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1212	NC_020515	GCTT	2	8	62569	62576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1233	NC_020515	AC	3	6	63879	63884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1234	NC_020515	G	6	6	63939	63944	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1235	NC_020515	CCT	2	6	64020	64025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1236	NC_020515	CA	3	6	64057	64062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1237	NC_020515	ATGA	2	8	64074	64081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1239	NC_020515	TGT	2	6	64190	64195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1240	NC_020515	CGG	2	6	64232	64237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1246	NC_020515	GTT	2	6	64421	64426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_020515	GAA	2	6	64527	64532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_020515	AAG	2	6	64570	64575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1249	NC_020515	GAA	2	6	64616	64621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_020515	CTA	2	6	64623	64628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_020515	TAG	2	6	64719	64724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_020515	GCGA	2	8	64727	64734	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1253	NC_020515	TGG	2	6	64830	64835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_020515	G	6	6	64887	64892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_020515	TCC	2	6	64897	64902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1256	NC_020515	GGA	2	6	65202	65207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_020515	AC	3	6	65419	65424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1258	NC_020515	GGTG	2	8	65425	65432	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_020515	AAC	2	6	65456	65461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_020515	AGC	2	6	65546	65551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_020515	AAAG	2	8	65560	65567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_020515	AGTCG	2	10	65582	65591	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1263	NC_020515	CGT	2	6	65671	65676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_020515	GAA	2	6	65684	65689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_020515	TAA	2	6	65883	65888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_020515	AGGTT	2	10	65909	65918	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_020515	TCT	2	6	65976	65981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_020515	GA	3	6	66124	66129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_020515	GCTG	2	8	66237	66244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1273	NC_020515	TTA	2	6	66252	66257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1276	NC_020515	ATG	2	6	66452	66457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1286	NC_020515	GACA	2	8	66827	66834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1287	NC_020515	GGT	2	6	66870	66875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1292	NC_020515	GCT	2	6	67119	67124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1374	NC_020515	CAG	2	6	71534	71539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166059
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1377	NC_020515	AAT	2	6	71729	71734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_020515	TGAA	2	8	71735	71742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1379	NC_020515	AC	3	6	71755	71760	50 %	0 %	0 %	50 %	470166060
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1388	NC_020515	ATC	2	6	72228	72233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166060
1389	NC_020515	AAT	2	6	72239	72244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166060
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