MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Beta proteobacterium CB

Total Repeats: 1346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020417	ACCAC	2	10	1352	1361	40 %	0 %	0 %	60 %	456062338
2	NC_020417	TCAAC	2	10	1410	1419	40 %	20 %	0 %	40 %	456062338
3	NC_020417	ATTTA	2	10	2834	2843	40 %	60 %	0 %	0 %	456062339
4	NC_020417	ACCCC	2	10	11626	11635	20 %	0 %	0 %	80 %	456062348
5	NC_020417	CAAGG	2	10	12214	12223	40 %	0 %	40 %	20 %	456062348
6	NC_020417	GCTTG	2	10	12390	12399	0 %	40 %	40 %	20 %	456062348
7	NC_020417	AACAA	2	10	19009	19018	80 %	0 %	0 %	20 %	456062357
8	NC_020417	GCGTT	2	10	21378	21387	0 %	40 %	40 %	20 %	456062359
9	NC_020417	GTTGT	2	10	21680	21689	0 %	60 %	40 %	0 %	456062359
10	NC_020417	ATTGC	2	10	23252	23261	20 %	40 %	20 %	20 %	456062361
11	NC_020417	GAAAA	2	10	24631	24640	80 %	0 %	20 %	0 %	456062362
12	NC_020417	CAAGC	2	10	27500	27509	40 %	0 %	20 %	40 %	456062365
13	NC_020417	GCCAA	2	10	27873	27882	40 %	0 %	20 %	40 %	456062365
14	NC_020417	GGTGT	2	10	28265	28274	0 %	40 %	60 %	0 %	456062365
15	NC_020417	GTGCA	2	10	29904	29913	20 %	20 %	40 %	20 %	456062367
16	NC_020417	AATGT	2	10	29917	29926	40 %	40 %	20 %	0 %	456062367
17	NC_020417	AGGCC	2	10	31026	31035	20 %	0 %	40 %	40 %	456062369
18	NC_020417	CAAGG	2	10	31354	31363	40 %	0 %	40 %	20 %	456062369
19	NC_020417	TCGTG	2	10	33995	34004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020417	GGGAG	2	10	35456	35465	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020417	CTCAT	2	10	37450	37459	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_020417	AAAAG	2	10	38504	38513	80 %	0 %	20 %	0 %	456062372
23	NC_020417	TGTTT	2	10	38825	38834	0 %	80 %	20 %	0 %	456062373
24	NC_020417	CAGTT	2	10	40373	40382	20 %	40 %	20 %	20 %	456062376
25	NC_020417	ATTTC	2	10	42297	42306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020417	ATGAA	2	10	42446	42455	60 %	20 %	20 %	0 %	456062379
27	NC_020417	TGATT	2	10	43932	43941	20 %	60 %	20 %	0 %	456062379
28	NC_020417	GGTAA	2	10	45115	45124	40 %	20 %	40 %	0 %	456062379
29	NC_020417	GAAGC	2	10	45556	45565	40 %	0 %	40 %	20 %	456062379
30	NC_020417	AAGGC	2	10	47892	47901	40 %	0 %	40 %	20 %	456062380
31	NC_020417	ACTTG	2	10	51294	51303	20 %	40 %	20 %	20 %	456062382
32	NC_020417	AACTG	2	10	51502	51511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020417	AAAAG	2	10	54179	54188	80 %	0 %	20 %	0 %	456062385
34	NC_020417	AAGCA	2	10	57230	57239	60 %	0 %	20 %	20 %	456062388
35	NC_020417	ACGCG	2	10	57385	57394	20 %	0 %	40 %	40 %	456062389
36	NC_020417	AGTTG	2	10	57418	57427	20 %	40 %	40 %	0 %	456062389
37	NC_020417	TGCAA	2	10	59470	59479	40 %	20 %	20 %	20 %	456062393
38	NC_020417	AATGC	2	10	59480	59489	40 %	20 %	20 %	20 %	456062393
39	NC_020417	GTCGT	2	10	60562	60571	0 %	40 %	40 %	20 %	456062396
40	NC_020417	TTGCC	2	10	62000	62009	0 %	40 %	20 %	40 %	456062399
41	NC_020417	TTGCA	2	10	65520	65529	20 %	40 %	20 %	20 %	456062407
42	NC_020417	CTTGG	2	10	70803	70812	0 %	40 %	40 %	20 %	456062416
43	NC_020417	AGATC	2	10	72816	72825	40 %	20 %	20 %	20 %	456062417
44	NC_020417	CGGAG	2	10	73512	73521	20 %	0 %	60 %	20 %	456062418
45	NC_020417	CCAAT	2	10	74043	74052	40 %	20 %	0 %	40 %	456062419
46	NC_020417	ATTGG	2	10	77744	77753	20 %	40 %	40 %	0 %	456062423
47	NC_020417	GCAAA	2	10	79650	79659	60 %	0 %	20 %	20 %	456062425
48	NC_020417	AAGAT	2	10	80598	80607	60 %	20 %	20 %	0 %	456062426
49	NC_020417	ACCCA	2	10	81299	81308	40 %	0 %	0 %	60 %	456062426
50	NC_020417	GGCAA	2	10	82372	82381	40 %	0 %	40 %	20 %	456062427
51	NC_020417	AGCCA	2	10	84594	84603	40 %	0 %	20 %	40 %	456062428
52	NC_020417	CACTC	2	10	85789	85798	20 %	20 %	0 %	60 %	456062428
53	NC_020417	GACGT	2	10	86717	86726	20 %	20 %	40 %	20 %	456062428
54	NC_020417	CAAAA	2	10	87991	88000	80 %	0 %	0 %	20 %	456062428
55	NC_020417	ACCAA	2	10	89394	89403	60 %	0 %	0 %	40 %	456062429
56	NC_020417	CCTTT	2	10	89920	89929	0 %	60 %	0 %	40 %	456062430
57	NC_020417	CCGTT	2	10	91833	91842	0 %	40 %	20 %	40 %	456062433
58	NC_020417	ACTGC	2	10	91969	91978	20 %	20 %	20 %	40 %	456062433
59	NC_020417	TTTGG	2	10	92047	92056	0 %	60 %	40 %	0 %	456062433
60	NC_020417	TGATG	2	10	92662	92671	20 %	40 %	40 %	0 %	456062434
61	NC_020417	GAAAA	2	10	92735	92744	80 %	0 %	20 %	0 %	456062434
62	NC_020417	CAAAT	2	10	93087	93096	60 %	20 %	0 %	20 %	456062434
63	NC_020417	TGGCA	2	10	93355	93364	20 %	20 %	40 %	20 %	456062435
64	NC_020417	TTTGA	2	10	96911	96920	20 %	60 %	20 %	0 %	456062440
65	NC_020417	TGGTT	2	10	97165	97174	0 %	60 %	40 %	0 %	456062440
66	NC_020417	AACTG	2	10	99412	99421	40 %	20 %	20 %	20 %	456062442
67	NC_020417	CAGGG	2	10	100650	100659	20 %	0 %	60 %	20 %	456062444
68	NC_020417	ATCAA	2	10	101383	101392	60 %	20 %	0 %	20 %	456062445
69	NC_020417	CCTTG	2	10	101982	101991	0 %	40 %	20 %	40 %	456062446
70	NC_020417	GTTTG	2	10	103508	103517	0 %	60 %	40 %	0 %	456062448
71	NC_020417	ATCCC	2	10	103704	103713	20 %	20 %	0 %	60 %	456062449
72	NC_020417	GGTTT	2	10	104686	104695	0 %	60 %	40 %	0 %	456062451
73	NC_020417	TGGCA	2	10	105189	105198	20 %	20 %	40 %	20 %	456062452
74	NC_020417	ATTAA	2	10	108501	108510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020417	AGATG	2	10	109444	109453	40 %	20 %	40 %	0 %	456062456
76	NC_020417	CCATG	2	10	109736	109745	20 %	20 %	20 %	40 %	456062456
77	NC_020417	CTTGC	2	10	110535	110544	0 %	40 %	20 %	40 %	456062457
78	NC_020417	GATAA	2	10	114484	114493	60 %	20 %	20 %	0 %	456062461
79	NC_020417	AAAGA	2	10	116317	116326	80 %	0 %	20 %	0 %	456062463
80	NC_020417	GAAAT	2	10	117504	117513	60 %	20 %	20 %	0 %	456062465
81	NC_020417	ATCGG	2	10	119037	119046	20 %	20 %	40 %	20 %	456062466
82	NC_020417	GAGAA	2	10	119762	119771	60 %	0 %	40 %	0 %	456062466
83	NC_020417	CAGCC	2	10	123346	123355	20 %	0 %	20 %	60 %	456062470
84	NC_020417	CTTGC	2	10	123747	123756	0 %	40 %	20 %	40 %	456062471
85	NC_020417	AGTTC	2	10	125061	125070	20 %	40 %	20 %	20 %	456062474
86	NC_020417	TTGGA	2	10	125521	125530	20 %	40 %	40 %	0 %	456062475
87	NC_020417	TGGAT	2	10	129784	129793	20 %	40 %	40 %	0 %	456062478
88	NC_020417	CATCA	2	10	135666	135675	40 %	20 %	0 %	40 %	456062485
89	NC_020417	GAAGT	2	10	137925	137934	40 %	20 %	40 %	0 %	456062489
90	NC_020417	GTGTT	2	10	139261	139270	0 %	60 %	40 %	0 %	456062490
91	NC_020417	ATGTC	2	10	140259	140268	20 %	40 %	20 %	20 %	456062491
92	NC_020417	TGCTG	2	10	140637	140646	0 %	40 %	40 %	20 %	456062492
93	NC_020417	CCAGT	2	10	141110	141119	20 %	20 %	20 %	40 %	456062492
94	NC_020417	AATTT	2	10	145294	145303	40 %	60 %	0 %	0 %	456062496
95	NC_020417	TGTCT	2	10	153042	153051	0 %	60 %	20 %	20 %	456062503
96	NC_020417	TTGGT	2	10	154274	154283	0 %	60 %	40 %	0 %	456062504
97	NC_020417	TGGTG	2	10	155052	155061	0 %	40 %	60 %	0 %	456062504
98	NC_020417	TACAT	2	10	155658	155667	40 %	40 %	0 %	20 %	456062505
99	NC_020417	ACATG	2	10	156991	157000	40 %	20 %	20 %	20 %	456062506
100	NC_020417	TGATG	2	10	158684	158693	20 %	40 %	40 %	0 %	456062507
101	NC_020417	GGGGC	2	10	159270	159279	0 %	0 %	80 %	20 %	456062508
102	NC_020417	CAAGG	2	10	161669	161678	40 %	0 %	40 %	20 %	456062510
103	NC_020417	AGTAA	2	10	162086	162095	60 %	20 %	20 %	0 %	456062510
104	NC_020417	CAATA	2	10	162362	162371	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020417	GCATC	2	10	163648	163657	20 %	20 %	20 %	40 %	456062512
106	NC_020417	TTTGC	2	10	163918	163927	0 %	60 %	20 %	20 %	456062513
107	NC_020417	TTGCA	2	10	164741	164750	20 %	40 %	20 %	20 %	456062514
108	NC_020417	AAAGA	2	10	165731	165740	80 %	0 %	20 %	0 %	456062514
109	NC_020417	AGATC	2	10	165747	165756	40 %	20 %	20 %	20 %	456062514
110	NC_020417	AAATC	2	10	171121	171130	60 %	20 %	0 %	20 %	456062519
111	NC_020417	TCGAT	2	10	174598	174607	20 %	40 %	20 %	20 %	456062523
112	NC_020417	ATTTC	2	10	175999	176008	20 %	60 %	0 %	20 %	456062525
113	NC_020417	GGTTG	2	10	177246	177255	0 %	40 %	60 %	0 %	456062526
114	NC_020417	GTCTT	2	10	177277	177286	0 %	60 %	20 %	20 %	456062526
115	NC_020417	CAATC	2	10	179026	179035	40 %	20 %	0 %	40 %	456062527
116	NC_020417	GGATG	2	10	180129	180138	20 %	20 %	60 %	0 %	456062528
117	NC_020417	TTTGG	2	10	181138	181147	0 %	60 %	40 %	0 %	456062529
118	NC_020417	AAATT	2	10	184612	184621	60 %	40 %	0 %	0 %	456062534
119	NC_020417	TGATT	2	10	186178	186187	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020417	GCAAG	2	10	187499	187508	40 %	0 %	40 %	20 %	456062537
121	NC_020417	GCATC	2	10	188661	188670	20 %	20 %	20 %	40 %	456062538
122	NC_020417	AATTT	2	10	189173	189182	40 %	60 %	0 %	0 %	456062538
123	NC_020417	CAACA	2	10	191756	191765	60 %	0 %	0 %	40 %	456062541
124	NC_020417	CATGA	2	10	192793	192802	40 %	20 %	20 %	20 %	456062541
125	NC_020417	TCCAA	2	10	196400	196409	40 %	20 %	0 %	40 %	456062545
126	NC_020417	TGCGT	2	10	196946	196955	0 %	40 %	40 %	20 %	456062545
127	NC_020417	CAAAA	2	10	198137	198146	80 %	0 %	0 %	20 %	456062546
128	NC_020417	ATGGC	2	10	199209	199218	20 %	20 %	40 %	20 %	456062547
129	NC_020417	CAGTC	2	10	204202	204211	20 %	20 %	20 %	40 %	456062553
130	NC_020417	TTTGG	2	10	204402	204411	0 %	60 %	40 %	0 %	456062553
131	NC_020417	CCCAT	2	10	205983	205992	20 %	20 %	0 %	60 %	456062553
132	NC_020417	TCAAA	2	10	207166	207175	60 %	20 %	0 %	20 %	456062555
133	NC_020417	AACCC	2	10	208710	208719	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_020417	CAATT	2	10	212199	212208	40 %	40 %	0 %	20 %	456062561
135	NC_020417	CCAGC	2	10	212532	212541	20 %	0 %	20 %	60 %	456062561
136	NC_020417	AACCC	2	10	213735	213744	40 %	0 %	0 %	60 %	456062562
137	NC_020417	TTGAT	2	10	215271	215280	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020417	AGACA	2	10	218784	218793	60 %	0 %	20 %	20 %	456062565
139	NC_020417	GAATG	2	10	218835	218844	40 %	20 %	40 %	0 %	456062566
140	NC_020417	CAAGC	2	10	219282	219291	40 %	0 %	20 %	40 %	456062566
141	NC_020417	AGCCA	2	10	220264	220273	40 %	0 %	20 %	40 %	456062567
142	NC_020417	GCGTC	2	10	220837	220846	0 %	20 %	40 %	40 %	456062568
143	NC_020417	GCACT	2	10	221754	221763	20 %	20 %	20 %	40 %	456062569
144	NC_020417	GGTGC	2	10	223495	223504	0 %	20 %	60 %	20 %	456062570
145	NC_020417	ATCTT	2	10	225034	225043	20 %	60 %	0 %	20 %	456062571
146	NC_020417	TGGCT	2	10	228594	228603	0 %	40 %	40 %	20 %	456062575
147	NC_020417	TAAAA	2	10	229787	229796	80 %	20 %	0 %	0 %	456062575
148	NC_020417	GGGTG	2	10	230091	230100	0 %	20 %	80 %	0 %	456062577
149	NC_020417	TTGAT	2	10	230201	230210	20 %	60 %	20 %	0 %	456062577
150	NC_020417	AATTG	2	10	230319	230328	40 %	40 %	20 %	0 %	456062577
151	NC_020417	TGCCA	2	10	234773	234782	20 %	20 %	20 %	40 %	456062581
152	NC_020417	TCAAT	2	10	236277	236286	40 %	40 %	0 %	20 %	456062584
153	NC_020417	CGTTT	2	10	237433	237442	0 %	60 %	20 %	20 %	456062585
154	NC_020417	GGTTT	2	10	237504	237513	0 %	60 %	40 %	0 %	456062585
155	NC_020417	AAGGT	2	10	237622	237631	40 %	20 %	40 %	0 %	456062585
156	NC_020417	GCATT	2	10	237864	237873	20 %	40 %	20 %	20 %	456062585
157	NC_020417	CTGGA	2	10	238470	238479	20 %	20 %	40 %	20 %	456062585
158	NC_020417	CATGG	2	10	241326	241335	20 %	20 %	40 %	20 %	456062588
159	NC_020417	ACGTT	2	10	242682	242691	20 %	40 %	20 %	20 %	456062590
160	NC_020417	AGATA	2	10	243130	243139	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020417	GCTAA	2	10	244745	244754	40 %	20 %	20 %	20 %	456062592
162	NC_020417	GCGGG	2	10	245794	245803	0 %	0 %	80 %	20 %	456062592
163	NC_020417	CAAAC	2	10	246326	246335	60 %	0 %	0 %	40 %	456062593
164	NC_020417	ACTTT	2	10	246600	246609	20 %	60 %	0 %	20 %	456062593
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166	NC_020417	CTTGC	2	10	249289	249298	0 %	40 %	20 %	40 %	456062596
167	NC_020417	GAAGT	2	10	253396	253405	40 %	20 %	40 %	0 %	456062604
168	NC_020417	AAAAG	2	10	254777	254786	80 %	0 %	20 %	0 %	456062605
169	NC_020417	TTGAT	2	10	255718	255727	20 %	60 %	20 %	0 %	456062606
170	NC_020417	ACGCT	2	10	258200	258209	20 %	20 %	20 %	40 %	456062611
171	NC_020417	ATTGA	2	10	258483	258492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020417	AGCCA	2	10	261268	261277	40 %	0 %	20 %	40 %	456062615
173	NC_020417	TGCGC	2	10	261498	261507	0 %	20 %	40 %	40 %	456062615
174	NC_020417	GGCAA	2	10	264047	264056	40 %	0 %	40 %	20 %	456062619
175	NC_020417	TTCTT	2	10	264057	264066	0 %	80 %	0 %	20 %	456062619
176	NC_020417	TCTTG	2	10	264178	264187	0 %	60 %	20 %	20 %	456062619
177	NC_020417	GTTCC	2	10	264842	264851	0 %	40 %	20 %	40 %	456062620
178	NC_020417	AGCCT	2	10	265783	265792	20 %	20 %	20 %	40 %	456062621
179	NC_020417	GGGTC	2	10	266059	266068	0 %	20 %	60 %	20 %	456062623
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182	NC_020417	CAGAA	2	10	272025	272034	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_020417	ATTTG	2	10	275867	275876	20 %	60 %	20 %	0 %	456062636
184	NC_020417	TGGCT	2	10	275922	275931	0 %	40 %	40 %	20 %	456062636
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188	NC_020417	TTGGT	2	10	288808	288817	0 %	60 %	40 %	0 %	456062651
189	NC_020417	ATTTT	2	10	289878	289887	20 %	80 %	0 %	0 %	456062652
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192	NC_020417	CATTT	2	10	290261	290270	20 %	60 %	0 %	20 %	456062652
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196	NC_020417	TGGTA	2	10	293191	293200	20 %	40 %	40 %	0 %	456062654
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199	NC_020417	AGCTG	2	10	293860	293869	20 %	20 %	40 %	20 %	456062654
200	NC_020417	TAGCT	2	10	294154	294163	20 %	40 %	20 %	20 %	456062654
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208	NC_020417	TCGCT	2	10	309266	309275	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
209	NC_020417	GCATC	2	10	309619	309628	20 %	20 %	20 %	40 %	456062672
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212	NC_020417	CGTTA	2	10	312709	312718	20 %	40 %	20 %	20 %	456062680
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214	NC_020417	TTGGC	2	10	320290	320299	0 %	40 %	40 %	20 %	456062687
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222	NC_020417	ATTGC	2	10	329930	329939	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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226	NC_020417	TTTGG	2	10	337150	337159	0 %	60 %	40 %	0 %	456062707
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236	NC_020417	TGGCA	2	10	361758	361767	20 %	20 %	40 %	20 %	456062732
237	NC_020417	GAAAA	2	10	362004	362013	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
238	NC_020417	AATGC	2	10	363377	363386	40 %	20 %	20 %	20 %	456062733
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245	NC_020417	ATTTA	2	10	371374	371383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_020417	ATTAT	2	10	371388	371397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_020417	GAAGG	2	10	371675	371684	40 %	0 %	60 %	0 %	456062741
248	NC_020417	CTTTA	2	10	381688	381697	20 %	60 %	0 %	20 %	456062755
249	NC_020417	TCAGA	2	10	382757	382766	40 %	20 %	20 %	20 %	456062755
250	NC_020417	TCCAT	2	10	385526	385535	20 %	40 %	0 %	40 %	456062757
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253	NC_020417	TGGAT	2	10	388805	388814	20 %	40 %	40 %	0 %	456062759
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257	NC_020417	GTCAG	2	10	394008	394017	20 %	20 %	40 %	20 %	456062763
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259	NC_020417	GCAAC	2	10	395561	395570	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
260	NC_020417	AATTA	2	10	396389	396398	60 %	40 %	0 %	0 %	456062766
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262	NC_020417	CTTGG	2	10	398522	398531	0 %	40 %	40 %	20 %	456062767
263	NC_020417	AAATG	2	10	399600	399609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_020417	TAATT	2	10	399971	399980	40 %	60 %	0 %	0 %	456062770
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