MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020410	GAA	2	6	72814	72819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854127
1502	NC_020410	GGA	2	6	72925	72930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854127
1503	NC_020410	GAG	2	6	72979	72984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854127
1504	NC_020410	GTTCG	2	10	73044	73053	0 %	40 %	40 %	20 %	452854127
1505	NC_020410	GGC	3	9	73099	73107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854127
1506	NC_020410	ATG	2	6	73132	73137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854127
1507	NC_020410	GCT	2	6	73227	73232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854127
1508	NC_020410	A	6	6	73235	73240	100 %	0 %	0 %	0 %	452854127
1509	NC_020410	TGA	2	6	73257	73262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854127
1510	NC_020410	A	6	6	73262	73267	100 %	0 %	0 %	0 %	452854127
1511	NC_020410	GAC	2	6	73305	73310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854127
1512	NC_020410	CAT	2	6	73455	73460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854127
1513	NC_020410	ATG	2	6	73519	73524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854127
1514	NC_020410	AT	3	6	73628	73633	50 %	50 %	0 %	0 %	452854127
1515	NC_020410	TCA	2	6	73646	73651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854127
1516	NC_020410	GGT	2	6	73686	73691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854127
1517	NC_020410	TGT	2	6	73692	73697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854127
1518	NC_020410	CGG	2	6	73742	73747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854127
1519	NC_020410	ATGT	2	8	73838	73845	25 %	50 %	25 %	0 %	452854128
1520	NC_020410	CTG	2	6	73871	73876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854128
1521	NC_020410	GCT	2	6	73887	73892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854128
1522	NC_020410	GGC	2	6	73921	73926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854128
1523	NC_020410	GAA	2	6	73973	73978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854128
1524	NC_020410	GAAG	2	8	74002	74009	50 %	0 %	50 %	0 %	452854128
1525	NC_020410	GGC	2	6	74033	74038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854128
1526	NC_020410	A	6	6	74093	74098	100 %	0 %	0 %	0 %	452854128
1527	NC_020410	GTC	2	6	74123	74128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854128
1528	NC_020410	TGA	2	6	74215	74220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854128
1529	NC_020410	AAG	2	6	74301	74306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854128
1530	NC_020410	GATC	2	8	74311	74318	25 %	25 %	25 %	25 %	452854128
1531	NC_020410	CGGGC	2	10	74339	74348	0 %	0 %	60 %	40 %	452854128
1532	NC_020410	CGG	2	6	74461	74466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854128
1533	NC_020410	GCA	2	6	74503	74508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854128
1534	NC_020410	GA	3	6	74513	74518	50 %	0 %	50 %	0 %	452854128
1535	NC_020410	AAG	2	6	74527	74532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854128
1536	NC_020410	GAT	2	6	74546	74551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854128
1537	NC_020410	ACG	2	6	74554	74559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854128
1538	NC_020410	AGC	2	6	74715	74720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854129
1539	NC_020410	CTT	2	6	74794	74799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854129
1540	NC_020410	T	7	7	74798	74804	0 %	100 %	0 %	0 %	452854129
1541	NC_020410	GAC	2	6	74811	74816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854129
1542	NC_020410	CTT	2	6	74880	74885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854129
1543	NC_020410	AT	3	6	74891	74896	50 %	50 %	0 %	0 %	452854129
1544	NC_020410	CAG	2	6	74897	74902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854129
1545	NC_020410	CTT	2	6	74940	74945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854129
1546	NC_020410	TCA	2	6	74963	74968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854129
1547	NC_020410	GGGT	2	8	74973	74980	0 %	25 %	75 %	0 %	452854129
1548	NC_020410	ACC	2	6	75020	75025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854129
1549	NC_020410	CG	3	6	75072	75077	0 %	0 %	50 %	50 %	452854129
1550	NC_020410	ATGATC	2	12	75168	75179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452854129
1551	NC_020410	AGA	2	6	75190	75195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854129
1552	NC_020410	AAG	2	6	75273	75278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854129
1553	NC_020410	CGG	2	6	75343	75348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854129
1554	NC_020410	GCC	3	9	75375	75383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854129
1555	NC_020410	GCC	2	6	75392	75397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854129
1556	NC_020410	GTTT	2	8	75472	75479	0 %	75 %	25 %	0 %	452854129
1557	NC_020410	ACA	2	6	75483	75488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854129
1558	NC_020410	T	6	6	75534	75539	0 %	100 %	0 %	0 %	452854129
1559	NC_020410	GCCG	2	8	75550	75557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_020410	CTT	3	9	75574	75582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_020410	A	6	6	75623	75628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020410	T	6	6	75670	75675	0 %	100 %	0 %	0 %	452854130
1563	NC_020410	ATC	2	6	75684	75689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854130
1564	NC_020410	GGAG	2	8	75697	75704	25 %	0 %	75 %	0 %	452854130
1565	NC_020410	ATT	2	6	75710	75715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854130
1566	NC_020410	TTC	2	6	75781	75786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854130
1567	NC_020410	GCG	2	6	75797	75802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854130
1568	NC_020410	GAA	2	6	75836	75841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854130
1569	NC_020410	AGA	2	6	75924	75929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854130
1570	NC_020410	CG	3	6	75952	75957	0 %	0 %	50 %	50 %	452854130
1571	NC_020410	TGA	2	6	75987	75992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854130
1572	NC_020410	TCA	2	6	76024	76029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854130
1573	NC_020410	GGCT	2	8	76127	76134	0 %	25 %	50 %	25 %	452854130
1574	NC_020410	CCTCT	2	10	76142	76151	0 %	40 %	0 %	60 %	452854130
1575	NC_020410	AAG	2	6	76188	76193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854130
1576	NC_020410	T	6	6	76270	76275	0 %	100 %	0 %	0 %	452854130
1577	NC_020410	GTGA	2	8	76316	76323	25 %	25 %	50 %	0 %	452854130
1578	NC_020410	AGA	2	6	76333	76338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854130
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1580	NC_020410	TTA	2	6	76383	76388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854130
1581	NC_020410	CAAG	2	8	76389	76396	50 %	0 %	25 %	25 %	452854130
1582	NC_020410	TTGC	2	8	76430	76437	0 %	50 %	25 %	25 %	452854130
1583	NC_020410	AGA	2	6	76457	76462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854130
1584	NC_020410	TCG	2	6	76505	76510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854130
1585	NC_020410	CCGC	2	8	76515	76522	0 %	0 %	25 %	75 %	452854130
1586	NC_020410	CAG	2	6	76529	76534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854130
1587	NC_020410	GGT	2	6	76597	76602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854130
1588	NC_020410	TGTT	2	8	76619	76626	0 %	75 %	25 %	0 %	452854130
1589	NC_020410	A	6	6	76650	76655	100 %	0 %	0 %	0 %	452854130
1590	NC_020410	AGCTGC	2	12	76665	76676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452854130
1591	NC_020410	CTG	2	6	76695	76700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854130
1592	NC_020410	AT	3	6	76878	76883	50 %	50 %	0 %	0 %	452854130
1593	NC_020410	A	6	6	76973	76978	100 %	0 %	0 %	0 %	452854130
1594	NC_020410	AGA	2	6	77100	77105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854131
1595	NC_020410	CAG	2	6	77113	77118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854131
1596	NC_020410	GT	3	6	77183	77188	0 %	50 %	50 %	0 %	452854131
1597	NC_020410	TTC	2	6	77289	77294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854131
1598	NC_020410	ATC	2	6	77308	77313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854131
1599	NC_020410	GAA	2	6	77465	77470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854131
1600	NC_020410	TGT	2	6	77520	77525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854131
1601	NC_020410	CTGC	2	8	77612	77619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_020410	GAG	2	6	77692	77697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020410	GAAT	2	8	77703	77710	50 %	25 %	25 %	0 %	452854132
1604	NC_020410	T	6	6	77730	77735	0 %	100 %	0 %	0 %	452854132
1605	NC_020410	TTATT	2	10	77742	77751	20 %	80 %	0 %	0 %	452854132
1606	NC_020410	AGT	2	6	77752	77757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854132
1607	NC_020410	TGA	2	6	77836	77841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854132
1608	NC_020410	A	6	6	77906	77911	100 %	0 %	0 %	0 %	452854132
1609	NC_020410	GACG	2	8	77989	77996	25 %	0 %	50 %	25 %	452854132
1610	NC_020410	GGGT	2	8	78026	78033	0 %	25 %	75 %	0 %	452854132
1611	NC_020410	ACG	2	6	78044	78049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854132
1612	NC_020410	TCA	2	6	78063	78068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854132
1613	NC_020410	TTC	2	6	78083	78088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854132
1614	NC_020410	GCG	2	6	78108	78113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854132
1615	NC_020410	GAA	2	6	78161	78166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854132
1616	NC_020410	GAG	2	6	78206	78211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854132
1617	NC_020410	TTG	2	6	78222	78227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854132
1618	NC_020410	GTT	2	6	78230	78235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854132
1619	NC_020410	GCT	2	6	78328	78333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854132
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1621	NC_020410	TGTCGG	2	12	78406	78417	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	452854132
1622	NC_020410	TGA	2	6	78481	78486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854132
1623	NC_020410	GCG	2	6	78510	78515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854132
1624	NC_020410	GGC	2	6	78524	78529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854132
1625	NC_020410	ATG	2	6	78534	78539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854132
1626	NC_020410	GCT	2	6	78562	78567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854132
1627	NC_020410	ATT	2	6	78605	78610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854132
1628	NC_020410	TCCG	2	8	78654	78661	0 %	25 %	25 %	50 %	452854132
1629	NC_020410	AAAC	2	8	78739	78746	75 %	0 %	0 %	25 %	452854132
1630	NC_020410	TGA	2	6	78751	78756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854132
1631	NC_020410	CTT	2	6	78821	78826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854132
1632	NC_020410	TGC	2	6	78844	78849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854132
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1634	NC_020410	TGA	2	6	78886	78891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854132
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1636	NC_020410	A	6	6	78944	78949	100 %	0 %	0 %	0 %	452854132
1637	NC_020410	GA	3	6	79081	79086	50 %	0 %	50 %	0 %	452854132
1638	NC_020410	TCT	2	6	79135	79140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854132
1639	NC_020410	AGA	2	6	79226	79231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854132
1640	NC_020410	CAA	2	6	79321	79326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854132
1641	NC_020410	CAT	2	6	79381	79386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854132
1642	NC_020410	CTGA	2	8	79418	79425	25 %	25 %	25 %	25 %	452854132
1643	NC_020410	ATTG	2	8	79444	79451	25 %	50 %	25 %	0 %	452854132
1644	NC_020410	AGA	2	6	79591	79596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854132
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1646	NC_020410	CCG	2	6	79645	79650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1647	NC_020410	T	7	7	79667	79673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1648	NC_020410	GTG	2	6	79762	79767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1649	NC_020410	GTT	2	6	79774	79779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854133
1650	NC_020410	AACACC	2	12	79799	79810	50 %	0 %	0 %	50 %	452854133
1651	NC_020410	ATG	2	6	79827	79832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854133
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1653	NC_020410	TGC	2	6	79896	79901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854133
1654	NC_020410	ATC	2	6	79955	79960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854133
1655	NC_020410	GTG	2	6	79967	79972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854133
1656	NC_020410	CCG	2	6	79973	79978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854133
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1658	NC_020410	AAG	2	6	80085	80090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854133
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1665	NC_020410	GCG	2	6	80214	80219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854133
1666	NC_020410	GCG	2	6	80267	80272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854133
1667	NC_020410	ATC	2	6	80309	80314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854133
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1675	NC_020410	ATT	2	6	80938	80943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854134
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1679	NC_020410	TCA	2	6	81085	81090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854134
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1681	NC_020410	TGA	2	6	81110	81115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854134
1682	NC_020410	CAA	2	6	81127	81132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854134
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1686	NC_020410	AGA	3	9	81335	81343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854134
1687	NC_020410	ATTT	2	8	81385	81392	25 %	75 %	0 %	0 %	452854134
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1689	NC_020410	AAC	2	6	81425	81430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854134
1690	NC_020410	GTT	2	6	81449	81454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1691	NC_020410	ATT	2	6	81507	81512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854135
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1696	NC_020410	ACA	2	6	81841	81846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854135
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1702	NC_020410	GAT	2	6	81939	81944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854135
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1710	NC_020410	TGAAG	2	10	82250	82259	40 %	20 %	40 %	0 %	452854135
1711	NC_020410	A	6	6	82357	82362	100 %	0 %	0 %	0 %	452854135
1712	NC_020410	A	6	6	82379	82384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1722	NC_020410	GAC	2	6	82950	82955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854136
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1728	NC_020410	GATCA	2	10	83163	83172	40 %	20 %	20 %	20 %	452854136
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1733	NC_020410	ATC	2	6	83319	83324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854136
1734	NC_020410	AC	3	6	83382	83387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1735	NC_020410	T	7	7	83410	83416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1736	NC_020410	A	6	6	83439	83444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1737	NC_020410	T	6	6	83479	83484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1738	NC_020410	TAAAA	2	10	83502	83511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1739	NC_020410	ATG	2	6	83540	83545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854137
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1741	NC_020410	CGTC	2	8	83697	83704	0 %	25 %	25 %	50 %	452854137
1742	NC_020410	AAG	2	6	83757	83762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854137
1743	NC_020410	CGGAA	2	10	83803	83812	40 %	0 %	40 %	20 %	452854137
1744	NC_020410	AT	3	6	83878	83883	50 %	50 %	0 %	0 %	452854137
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1746	NC_020410	TGA	2	6	83947	83952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854137
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1749	NC_020410	CGG	2	6	84075	84080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854137
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1752	NC_020410	AT	3	6	84178	84183	50 %	50 %	0 %	0 %	452854137
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1754	NC_020410	GAA	2	6	84367	84372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854137
1755	NC_020410	TGA	2	6	84442	84447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854137
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1758	NC_020410	G	6	6	84661	84666	0 %	0 %	100 %	0 %	452854137
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1877	NC_020410	T	6	6	90947	90952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1878	NC_020410	T	6	6	90975	90980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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