MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020410	CAT	2	6	26362	26367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854080
502	NC_020410	TCG	2	6	26390	26395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854080
503	NC_020410	TC	3	6	26438	26443	0 %	50 %	0 %	50 %	452854080
504	NC_020410	CGT	2	6	26451	26456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854080
505	NC_020410	CA	3	6	26470	26475	50 %	0 %	0 %	50 %	452854080
506	NC_020410	TGA	2	6	26496	26501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854080
507	NC_020410	ATC	2	6	26587	26592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854080
508	NC_020410	TGT	2	6	26631	26636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854080
509	NC_020410	TGC	2	6	26637	26642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854080
510	NC_020410	TCC	2	6	26645	26650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854080
511	NC_020410	ATAA	2	8	26698	26705	75 %	25 %	0 %	0 %	452854080
512	NC_020410	CTT	2	6	26731	26736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854080
513	NC_020410	T	6	6	26769	26774	0 %	100 %	0 %	0 %	452854080
514	NC_020410	TTG	2	6	26807	26812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854080
515	NC_020410	TGT	2	6	26838	26843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854080
516	NC_020410	CTG	2	6	26873	26878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_020410	A	6	6	26911	26916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020410	AAG	2	6	26920	26925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020410	AG	3	6	26924	26929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020410	ATGA	2	8	26939	26946	50 %	25 %	25 %	0 %	452854081
521	NC_020410	GA	3	6	26959	26964	50 %	0 %	50 %	0 %	452854081
522	NC_020410	GAA	2	6	26980	26985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854081
523	NC_020410	ATG	2	6	27033	27038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854081
524	NC_020410	CGT	2	6	27202	27207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854081
525	NC_020410	G	6	6	27253	27258	0 %	0 %	100 %	0 %	452854081
526	NC_020410	TGA	2	6	27273	27278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854081
527	NC_020410	ACC	2	6	27303	27308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854081
528	NC_020410	GTG	2	6	27317	27322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854081
529	NC_020410	GCG	2	6	27324	27329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854081
530	NC_020410	T	6	6	27364	27369	0 %	100 %	0 %	0 %	452854081
531	NC_020410	AAAG	2	8	27388	27395	75 %	0 %	25 %	0 %	452854081
532	NC_020410	AGT	2	6	27417	27422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854081
533	NC_020410	TG	3	6	27458	27463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020410	CAT	2	6	27464	27469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_020410	ATTT	2	8	27496	27503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020410	TAAG	2	8	27602	27609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020410	GGAA	2	8	27664	27671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020410	GCA	2	6	27672	27677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_020410	ATCA	2	8	27774	27781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
540	NC_020410	T	6	6	27817	27822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020410	TAA	2	6	27867	27872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020410	ATG	2	6	27875	27880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020410	AGG	2	6	27889	27894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020410	CAG	2	6	27940	27945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854082
545	NC_020410	AGA	2	6	28110	28115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854082
546	NC_020410	AATG	2	8	28123	28130	50 %	25 %	25 %	0 %	452854082
547	NC_020410	GCG	2	6	28132	28137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854082
548	NC_020410	GCG	2	6	28186	28191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854082
549	NC_020410	TA	3	6	28268	28273	50 %	50 %	0 %	0 %	452854082
550	NC_020410	CT	3	6	28294	28299	0 %	50 %	0 %	50 %	452854082
551	NC_020410	GAA	2	6	28333	28338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854082
552	NC_020410	CCG	2	6	28339	28344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854082
553	NC_020410	TCG	2	6	28472	28477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854082
554	NC_020410	AGC	2	6	28484	28489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854082
555	NC_020410	GAA	2	6	28498	28503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854082
556	NC_020410	TGC	2	6	28527	28532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854082
557	NC_020410	GGA	2	6	28537	28542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854082
558	NC_020410	GCG	2	6	28586	28591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854082
559	NC_020410	TGAA	2	8	28706	28713	50 %	25 %	25 %	0 %	452854082
560	NC_020410	CAG	2	6	28720	28725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854082
561	NC_020410	GAAGGT	2	12	28821	28832	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452854082
562	NC_020410	GAT	2	6	28887	28892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854082
563	NC_020410	ACC	2	6	28934	28939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854082
564	NC_020410	T	6	6	28948	28953	0 %	100 %	0 %	0 %	452854082
565	NC_020410	CCG	2	6	28994	28999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854082
566	NC_020410	TGA	2	6	29024	29029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854082
567	NC_020410	CAG	2	6	29038	29043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854082
568	NC_020410	AAG	2	6	29108	29113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854082
569	NC_020410	GAA	2	6	29162	29167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854082
570	NC_020410	GAAG	2	8	29181	29188	50 %	0 %	50 %	0 %	452854082
571	NC_020410	AGC	2	6	29218	29223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854082
572	NC_020410	GCT	2	6	29232	29237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854082
573	NC_020410	CAG	2	6	29251	29256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854082
574	NC_020410	GCT	3	9	29302	29310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854082
575	NC_020410	TTAAAT	2	12	29327	29338	50 %	50 %	0 %	0 %	452854082
576	NC_020410	AGA	2	6	29364	29369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854082
577	NC_020410	AGA	2	6	29472	29477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854082
578	NC_020410	CAG	2	6	29494	29499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854082
579	NC_020410	GAA	2	6	29527	29532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854082
580	NC_020410	A	6	6	29554	29559	100 %	0 %	0 %	0 %	452854082
581	NC_020410	TAA	2	6	29593	29598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854082
582	NC_020410	AG	3	6	29605	29610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020410	A	6	6	29645	29650	100 %	0 %	0 %	0 %	452854083
584	NC_020410	TGA	2	6	29651	29656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854083
585	NC_020410	A	6	6	29666	29671	100 %	0 %	0 %	0 %	452854083
586	NC_020410	AGG	2	6	29696	29701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854083
587	NC_020410	CAG	2	6	29729	29734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854083
588	NC_020410	GCG	2	6	29735	29740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854083
589	NC_020410	AAG	2	6	29771	29776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854083
590	NC_020410	AGA	2	6	29796	29801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854083
591	NC_020410	TGC	2	6	29847	29852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854083
592	NC_020410	ACG	2	6	29858	29863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854083
593	NC_020410	A	6	6	29869	29874	100 %	0 %	0 %	0 %	452854083
594	NC_020410	ATGAC	2	10	29879	29888	40 %	20 %	20 %	20 %	452854083
595	NC_020410	ATAA	2	8	29948	29955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020410	T	7	7	30044	30050	0 %	100 %	0 %	0 %	452854084
597	NC_020410	AGA	2	6	30065	30070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854084
598	NC_020410	TA	3	6	30165	30170	50 %	50 %	0 %	0 %	452854084
599	NC_020410	AAG	2	6	30182	30187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854084
600	NC_020410	TTC	2	6	30274	30279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854084
601	NC_020410	GGA	2	6	30314	30319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854084
602	NC_020410	GCT	2	6	30335	30340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854084
603	NC_020410	GAT	2	6	30354	30359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854084
604	NC_020410	CAAC	2	8	30382	30389	50 %	0 %	0 %	50 %	452854084
605	NC_020410	TA	3	6	30420	30425	50 %	50 %	0 %	0 %	452854084
606	NC_020410	CGG	2	6	30485	30490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854084
607	NC_020410	TGA	2	6	30506	30511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854084
608	NC_020410	GAAG	2	8	30534	30541	50 %	0 %	50 %	0 %	452854084
609	NC_020410	AGGCA	2	10	30564	30573	40 %	0 %	40 %	20 %	452854085
610	NC_020410	TTC	2	6	30580	30585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854085
611	NC_020410	TGA	2	6	30611	30616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854085
612	NC_020410	AGA	2	6	30647	30652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854085
613	NC_020410	ACAG	2	8	30658	30665	50 %	0 %	25 %	25 %	452854085
614	NC_020410	T	7	7	30741	30747	0 %	100 %	0 %	0 %	452854085
615	NC_020410	GAAGC	2	10	30756	30765	40 %	0 %	40 %	20 %	452854085
616	NC_020410	TCT	2	6	30816	30821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_020410	T	6	6	30866	30871	0 %	100 %	0 %	0 %	452854086
618	NC_020410	TTGCT	2	10	30898	30907	0 %	60 %	20 %	20 %	452854086
619	NC_020410	T	7	7	30907	30913	0 %	100 %	0 %	0 %	452854086
620	NC_020410	CTG	2	6	30984	30989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854086
621	NC_020410	TCA	2	6	31111	31116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854086
622	NC_020410	ATT	2	6	31129	31134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020410	GGT	2	6	31154	31159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020410	TGA	2	6	31177	31182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020410	A	6	6	31197	31202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020410	GAC	2	6	31222	31227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020410	AAT	2	6	31247	31252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020410	TAAA	2	8	31329	31336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020410	AGTC	2	8	31355	31362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_020410	ACT	2	6	31365	31370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020410	GGC	2	6	31408	31413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_020410	GCG	2	6	31468	31473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_020410	CCTG	2	8	31498	31505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
634	NC_020410	CGA	2	6	31653	31658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_020410	GCA	2	6	31727	31732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_020410	CGC	2	6	31774	31779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_020410	GTGA	2	8	31780	31787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020410	TGT	2	6	31813	31818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020410	GAA	2	6	31823	31828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020410	GGC	2	6	31847	31852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_020410	CAG	2	6	31896	31901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_020410	ATT	2	6	31937	31942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_020410	GGA	2	6	32087	32092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
645	NC_020410	CT	3	6	32112	32117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
646	NC_020410	GAG	2	6	32135	32140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
647	NC_020410	TGC	2	6	32232	32237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_020410	GAA	2	6	32351	32356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
649	NC_020410	GGT	2	6	32425	32430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
650	NC_020410	GTC	2	6	32439	32444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_020410	TCGTG	2	10	32448	32457	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
652	NC_020410	GGA	2	6	32551	32556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
653	NC_020410	ATC	2	6	32575	32580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_020410	AC	3	6	32602	32607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
655	NC_020410	AC	3	6	32771	32776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
656	NC_020410	CAC	2	6	32786	32791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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662	NC_020410	GGACG	2	10	33149	33158	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
663	NC_020410	AAGC	2	8	33185	33192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
664	NC_020410	CAC	2	6	33224	33229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
665	NC_020410	GGA	2	6	33309	33314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
666	NC_020410	GCG	2	6	33343	33348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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670	NC_020410	GGA	2	6	33549	33554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_020410	AGC	2	6	34212	34217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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687	NC_020410	GA	3	6	35126	35131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
688	NC_020410	TAGG	2	8	35244	35251	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
689	NC_020410	TAC	2	6	35298	35303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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700	NC_020410	GA	3	6	36059	36064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
701	NC_020410	TGG	2	6	36080	36085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
702	NC_020410	C	6	6	36165	36170	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
703	NC_020410	CGC	2	6	36184	36189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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705	NC_020410	T	6	6	36231	36236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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707	NC_020410	ATGA	2	8	36369	36376	50 %	25 %	25 %	0 %	452854087
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710	NC_020410	A	7	7	36417	36423	100 %	0 %	0 %	0 %	452854087
711	NC_020410	GAA	2	6	36470	36475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854087
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714	NC_020410	T	9	9	36578	36586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
715	NC_020410	AAG	2	6	36637	36642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
716	NC_020410	ATA	2	6	36673	36678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
717	NC_020410	AATA	2	8	36691	36698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
718	NC_020410	AT	3	6	36730	36735	50 %	50 %	0 %	0 %	452854088
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722	NC_020410	A	7	7	36892	36898	100 %	0 %	0 %	0 %	452854088
723	NC_020410	AAGAA	2	10	36910	36919	80 %	0 %	20 %	0 %	452854088
724	NC_020410	ATC	2	6	36962	36967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854088
725	NC_020410	AT	3	6	37049	37054	50 %	50 %	0 %	0 %	452854088
726	NC_020410	TAT	2	6	37103	37108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854088
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729	NC_020410	TCA	2	6	37157	37162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854088
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732	NC_020410	TGA	2	6	37260	37265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854088
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735	NC_020410	GAA	2	6	37333	37338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
736	NC_020410	CGA	2	6	37360	37365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854089
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738	NC_020410	A	6	6	37425	37430	100 %	0 %	0 %	0 %	452854089
739	NC_020410	CAGGCG	2	12	37502	37513	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	452854089
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741	NC_020410	GAT	2	6	37537	37542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854089
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743	NC_020410	GA	3	6	37569	37574	50 %	0 %	50 %	0 %	452854089
744	NC_020410	TGA	2	6	37624	37629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854089
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748	NC_020410	CTG	2	6	38003	38008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854089
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750	NC_020410	TCC	2	6	38093	38098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854089
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754	NC_020410	TGC	2	6	38211	38216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854089
755	NC_020410	TTG	2	6	38280	38285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854089
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757	NC_020410	GAA	2	6	38333	38338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854089
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759	NC_020410	GAG	3	9	38384	38392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854089
760	NC_020410	A	6	6	38416	38421	100 %	0 %	0 %	0 %	452854089
761	NC_020410	GCT	2	6	38425	38430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854089
762	NC_020410	CCGG	2	8	38442	38449	0 %	0 %	50 %	50 %	452854089
763	NC_020410	ATA	2	6	38504	38509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
764	NC_020410	AC	3	6	38543	38548	50 %	0 %	0 %	50 %	452854090
765	NC_020410	TA	3	6	38552	38557	50 %	50 %	0 %	0 %	452854090
766	NC_020410	TGA	2	6	38564	38569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854090
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768	NC_020410	TGA	2	6	38697	38702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854090
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783	NC_020410	TCT	2	6	39433	39438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854090
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