MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020410	GAA	2	6	288657	288662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854325
6002	NC_020410	TTC	2	6	288688	288693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854325
6003	NC_020410	GCG	2	6	288857	288862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854325
6004	NC_020410	TCAA	2	8	288914	288921	50 %	25 %	0 %	25 %	452854325
6005	NC_020410	GAT	2	6	288980	288985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854325
6006	NC_020410	TCG	2	6	289056	289061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854325
6007	NC_020410	GCC	2	6	289063	289068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854325
6008	NC_020410	GCA	3	9	289161	289169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854325
6009	NC_020410	CGC	2	6	289170	289175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854325
6010	NC_020410	GCG	2	6	289205	289210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854325
6011	NC_020410	CGG	2	6	289328	289333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854325
6012	NC_020410	ATCA	2	8	289390	289397	50 %	25 %	0 %	25 %	452854325
6013	NC_020410	TC	3	6	289480	289485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_020410	ATA	2	6	289562	289567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_020410	TAA	2	6	289582	289587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_020410	GCG	2	6	289631	289636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_020410	GATT	2	8	289703	289710	25 %	50 %	25 %	0 %	452854326
6018	NC_020410	CTG	2	6	289740	289745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854326
6019	NC_020410	ATC	2	6	289769	289774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854326
6020	NC_020410	CGG	2	6	289799	289804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854326
6021	NC_020410	GACA	2	8	289862	289869	50 %	0 %	25 %	25 %	452854326
6022	NC_020410	GCG	2	6	289909	289914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854326
6023	NC_020410	GAT	2	6	289959	289964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854326
6024	NC_020410	TAA	2	6	290006	290011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854326
6025	NC_020410	GTC	2	6	290022	290027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854326
6026	NC_020410	CGT	2	6	290090	290095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854326
6027	NC_020410	GAA	2	6	290112	290117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854326
6028	NC_020410	CGC	2	6	290207	290212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854326
6029	NC_020410	CA	3	6	290289	290294	50 %	0 %	0 %	50 %	452854327
6030	NC_020410	ACAA	2	8	290384	290391	75 %	0 %	0 %	25 %	452854327
6031	NC_020410	ACG	2	6	290394	290399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854327
6032	NC_020410	TGATTT	2	12	290407	290418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452854327
6033	NC_020410	TGA	2	6	290467	290472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854327
6034	NC_020410	TCA	2	6	290619	290624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854327
6035	NC_020410	GAAGCG	2	12	290633	290644	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	452854327
6036	NC_020410	CG	3	6	290643	290648	0 %	0 %	50 %	50 %	452854327
6037	NC_020410	GAG	2	6	290708	290713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854327
6038	NC_020410	GA	3	6	290896	290901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_020410	GGGCGA	2	12	291153	291164	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	452854328
6040	NC_020410	TCG	2	6	291185	291190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854328
6041	NC_020410	ATG	2	6	291245	291250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854328
6042	NC_020410	GC	3	6	291256	291261	0 %	0 %	50 %	50 %	452854328
6043	NC_020410	CGT	2	6	291300	291305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854328
6044	NC_020410	CGG	2	6	291368	291373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854328
6045	NC_020410	CGG	2	6	291441	291446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854328
6046	NC_020410	AGG	2	6	291512	291517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_020410	A	6	6	291518	291523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_020410	CAT	2	6	291537	291542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854329
6049	NC_020410	CTAC	2	8	291550	291557	25 %	25 %	0 %	50 %	452854329
6050	NC_020410	T	6	6	291564	291569	0 %	100 %	0 %	0 %	452854329
6051	NC_020410	CTGA	2	8	291594	291601	25 %	25 %	25 %	25 %	452854329
6052	NC_020410	CTG	2	6	291636	291641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854329
6053	NC_020410	GCT	2	6	291647	291652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854329
6054	NC_020410	GAA	2	6	291713	291718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854329
6055	NC_020410	AT	3	6	291746	291751	50 %	50 %	0 %	0 %	452854329
6056	NC_020410	TTTATC	2	12	291759	291770	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452854329
6057	NC_020410	TGC	2	6	291781	291786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854329
6058	NC_020410	TGG	2	6	291798	291803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854329
6059	NC_020410	GC	3	6	291817	291822	0 %	0 %	50 %	50 %	452854329
6060	NC_020410	TGGCT	2	10	291829	291838	0 %	40 %	40 %	20 %	452854329
6061	NC_020410	TGA	2	6	291869	291874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854329
6062	NC_020410	GAA	2	6	291890	291895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854329
6063	NC_020410	ATGG	2	8	291902	291909	25 %	25 %	50 %	0 %	452854329
6064	NC_020410	CGG	2	6	292031	292036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854329
6065	NC_020410	ATG	2	6	292053	292058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854329
6066	NC_020410	GGC	2	6	292154	292159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854329
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6069	NC_020410	ATC	3	9	292203	292211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854329
6070	NC_020410	TAT	2	6	292232	292237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854329
6071	NC_020410	CAA	2	6	292247	292252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854329
6072	NC_020410	AGA	2	6	292289	292294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854329
6073	NC_020410	A	6	6	292302	292307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_020410	GGAG	2	8	292308	292315	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_020410	TCCT	2	8	292324	292331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_020410	T	6	6	292331	292336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_020410	ATC	2	6	292343	292348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_020410	AGG	2	6	292359	292364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_020410	ATG	2	6	292368	292373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854330
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6081	NC_020410	ATG	2	6	292525	292530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854330
6082	NC_020410	TCT	2	6	292563	292568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854330
6083	NC_020410	GCA	2	6	292637	292642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854330
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6085	NC_020410	TCAA	2	8	292654	292661	50 %	25 %	0 %	25 %	452854330
6086	NC_020410	GCT	2	6	292715	292720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854330
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6088	NC_020410	ATC	2	6	292816	292821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854330
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6091	NC_020410	TAT	2	6	292965	292970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854330
6092	NC_020410	TTGA	2	8	293031	293038	25 %	50 %	25 %	0 %	452854330
6093	NC_020410	GGC	2	6	293082	293087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854330
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6095	NC_020410	ACG	2	6	293127	293132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854330
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6098	NC_020410	ACG	2	6	293241	293246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854330
6099	NC_020410	ATG	2	6	293248	293253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854330
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6101	NC_020410	AC	3	6	293415	293420	50 %	0 %	0 %	50 %	452854330
6102	NC_020410	GAA	2	6	293493	293498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854330
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6107	NC_020410	TGT	2	6	293800	293805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854330
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6109	NC_020410	ATC	2	6	293829	293834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854330
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6112	NC_020410	GGA	2	6	293906	293911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854330
6113	NC_020410	AAAATC	2	12	294007	294018	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452854331
6114	NC_020410	GCA	2	6	294113	294118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854331
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6118	NC_020410	A	6	6	294391	294396	100 %	0 %	0 %	0 %	452854331
6119	NC_020410	ACA	2	6	294469	294474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854331
6120	NC_020410	ACT	2	6	294478	294483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854331
6121	NC_020410	CTT	2	6	294550	294555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854331
6122	NC_020410	GAA	2	6	294558	294563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854331
6123	NC_020410	TGG	2	6	294667	294672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854331
6124	NC_020410	CCT	2	6	294698	294703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854331
6125	NC_020410	CAT	2	6	294779	294784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854331
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6127	NC_020410	CCG	2	6	294842	294847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854331
6128	NC_020410	CATTGA	2	12	294929	294940	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452854331
6129	NC_020410	GAAAC	2	10	294984	294993	60 %	0 %	20 %	20 %	452854331
6130	NC_020410	GAA	2	6	294999	295004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854331
6131	NC_020410	AGA	2	6	295022	295027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854331
6132	NC_020410	ATA	2	6	295057	295062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854331
6133	NC_020410	AC	4	8	295088	295095	50 %	0 %	0 %	50 %	452854331
6134	NC_020410	GCTT	2	8	295099	295106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6135	NC_020410	T	7	7	295120	295126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_020410	A	6	6	295130	295135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_020410	TGC	2	6	295196	295201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6139	NC_020410	GCTG	2	8	295259	295266	0 %	25 %	50 %	25 %	452854332
6140	NC_020410	GATG	2	8	295275	295282	25 %	25 %	50 %	0 %	452854332
6141	NC_020410	TAT	2	6	295299	295304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854332
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6143	NC_020410	AAATG	2	10	295343	295352	60 %	20 %	20 %	0 %	452854332
6144	NC_020410	A	6	6	295429	295434	100 %	0 %	0 %	0 %	452854332
6145	NC_020410	ATC	2	6	295609	295614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854332
6146	NC_020410	TGC	2	6	295616	295621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854332
6147	NC_020410	CTT	2	6	295648	295653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854332
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6151	NC_020410	TGC	2	6	295853	295858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854332
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6156	NC_020410	TGA	2	6	295973	295978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854332
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6171	NC_020410	GAAAC	2	10	296377	296386	60 %	0 %	20 %	20 %	452854332
6172	NC_020410	T	7	7	296424	296430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6173	NC_020410	CTGT	2	8	296437	296444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6175	NC_020410	CTT	2	6	296495	296500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6176	NC_020410	A	6	6	296520	296525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6177	NC_020410	A	7	7	296539	296545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6178	NC_020410	GCA	2	6	296563	296568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6179	NC_020410	AGG	2	6	296633	296638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6180	NC_020410	AG	3	6	296642	296647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6181	NC_020410	ATG	2	6	296721	296726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6182	NC_020410	TTTG	2	8	296727	296734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6183	NC_020410	TTA	2	6	296737	296742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6184	NC_020410	TTA	2	6	296770	296775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6185	NC_020410	A	7	7	296856	296862	100 %	0 %	0 %	0 %	452854333
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6187	NC_020410	A	6	6	296893	296898	100 %	0 %	0 %	0 %	452854333
6188	NC_020410	TCAA	2	8	296933	296940	50 %	25 %	0 %	25 %	452854333
6189	NC_020410	ATG	2	6	296957	296962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854333
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6201	NC_020410	TGA	2	6	297512	297517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854333
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6233	NC_020410	CTTT	2	8	298938	298945	0 %	75 %	0 %	25 %	452854335
6234	NC_020410	CTGC	2	8	298948	298955	0 %	25 %	25 %	50 %	452854335
6235	NC_020410	GTC	2	6	299088	299093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854335
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6241	NC_020410	A	7	7	299223	299229	100 %	0 %	0 %	0 %	452854335
6242	NC_020410	GAA	2	6	299361	299366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854335
6243	NC_020410	GCT	2	6	299388	299393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854335
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6245	NC_020410	TCAAT	2	10	299746	299755	40 %	40 %	0 %	20 %	452854335
6246	NC_020410	GAA	2	6	299765	299770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854335
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6248	NC_020410	AGC	2	6	299783	299788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6251	NC_020410	TCG	2	6	299934	299939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854336
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6274	NC_020410	T	6	6	300960	300965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6324	NC_020410	AG	4	8	303167	303174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6361	NC_020410	CAA	2	6	305411	305416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6362	NC_020410	T	7	7	305437	305443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6363	NC_020410	GGA	2	6	305543	305548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6364	NC_020410	ATG	2	6	305558	305563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854340
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6366	NC_020410	TTG	2	6	305604	305609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854340
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6492	NC_020410	AGG	2	6	312349	312354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6493	NC_020410	ATGA	2	8	312386	312393	50 %	25 %	25 %	0 %	452854347
6494	NC_020410	A	8	8	312466	312473	100 %	0 %	0 %	0 %	452854347
6495	NC_020410	G	6	6	312506	312511	0 %	0 %	100 %	0 %	452854347
6496	NC_020410	GGC	2	6	312547	312552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854347
6497	NC_020410	AGA	2	6	312565	312570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854347
6498	NC_020410	CA	3	6	312613	312618	50 %	0 %	0 %	50 %	452854347
6499	NC_020410	AGGATG	2	12	312621	312632	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452854347
6500	NC_020410	A	6	6	312722	312727	100 %	0 %	0 %	0 %	452854347

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