MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020410	A	7	7	267421	267427	100 %	0 %	0 %	0 %	452854304
5503	NC_020410	GCG	2	6	267533	267538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854304
5504	NC_020410	ATC	2	6	267593	267598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854304
5505	NC_020410	GATCT	2	10	267632	267641	20 %	40 %	20 %	20 %	452854304
5506	NC_020410	TGA	2	6	267649	267654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854304
5507	NC_020410	GC	3	6	267665	267670	0 %	0 %	50 %	50 %	452854304
5508	NC_020410	TA	3	6	267673	267678	50 %	50 %	0 %	0 %	452854304
5509	NC_020410	A	7	7	267678	267684	100 %	0 %	0 %	0 %	452854304
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5511	NC_020410	CTG	2	6	267704	267709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_020410	AAG	2	6	267746	267751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854305
5513	NC_020410	ATC	2	6	267779	267784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854305
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5516	NC_020410	CTG	2	6	267931	267936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854305
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5522	NC_020410	TG	3	6	268045	268050	0 %	50 %	50 %	0 %	452854305
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5544	NC_020410	CT	3	6	269159	269164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_020410	TC	3	6	269180	269185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_020410	CAG	2	6	269200	269205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854306
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5625	NC_020410	TCCG	2	8	272292	272299	0 %	25 %	25 %	50 %	452854309
5626	NC_020410	GGC	2	6	272306	272311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854309
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5875	NC_020410	CAT	2	6	283334	283339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854320
5876	NC_020410	GA	3	6	283369	283374	50 %	0 %	50 %	0 %	452854320
5877	NC_020410	T	7	7	283454	283460	0 %	100 %	0 %	0 %	452854320
5878	NC_020410	ATA	2	6	283470	283475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854320
5879	NC_020410	TAC	2	6	283482	283487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854320
5880	NC_020410	T	6	6	283488	283493	0 %	100 %	0 %	0 %	452854320
5881	NC_020410	CAA	2	6	283523	283528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854320
5882	NC_020410	GAT	2	6	283536	283541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854320
5883	NC_020410	T	6	6	283541	283546	0 %	100 %	0 %	0 %	452854320
5884	NC_020410	A	7	7	283560	283566	100 %	0 %	0 %	0 %	452854320
5885	NC_020410	ATCT	2	8	283571	283578	25 %	50 %	0 %	25 %	452854320
5886	NC_020410	TCA	2	6	283684	283689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854320
5887	NC_020410	TA	3	6	283700	283705	50 %	50 %	0 %	0 %	452854320
5888	NC_020410	T	7	7	283708	283714	0 %	100 %	0 %	0 %	452854320
5889	NC_020410	AAT	2	6	283807	283812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5890	NC_020410	ATA	2	6	283816	283821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5891	NC_020410	TGT	2	6	283836	283841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5892	NC_020410	TAA	2	6	283854	283859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5893	NC_020410	T	6	6	283865	283870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5894	NC_020410	TAA	2	6	283939	283944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5895	NC_020410	AAT	2	6	283954	283959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5896	NC_020410	TGG	2	6	284000	284005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854321
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5898	NC_020410	TA	3	6	284102	284107	50 %	50 %	0 %	0 %	452854321
5899	NC_020410	ATC	2	6	284187	284192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854321
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5904	NC_020410	GAA	2	6	284441	284446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854321
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5907	NC_020410	A	7	7	284602	284608	100 %	0 %	0 %	0 %	452854321
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5910	NC_020410	GTCG	2	8	284740	284747	0 %	25 %	50 %	25 %	452854321
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5920	NC_020410	GCT	3	9	285439	285447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854321
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5922	NC_020410	AGA	2	6	285526	285531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854321
5923	NC_020410	GCT	2	6	285577	285582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854321
5924	NC_020410	CGG	2	6	285604	285609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854321
5925	NC_020410	A	6	6	285734	285739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5926	NC_020410	TAT	2	6	285768	285773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5927	NC_020410	TCA	2	6	285817	285822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854322
5928	NC_020410	A	6	6	285858	285863	100 %	0 %	0 %	0 %	452854322
5929	NC_020410	TCATTG	2	12	285874	285885	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452854322
5930	NC_020410	CGG	2	6	285904	285909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854322
5931	NC_020410	TTC	2	6	285944	285949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854322
5932	NC_020410	CGT	2	6	285968	285973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854322
5933	NC_020410	GAC	2	6	285974	285979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854322
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5936	NC_020410	A	6	6	286165	286170	100 %	0 %	0 %	0 %	452854322
5937	NC_020410	GAAGAG	2	12	286239	286250	50 %	0 %	50 %	0 %	452854322
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5942	NC_020410	ACA	2	6	286446	286451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854322
5943	NC_020410	TAAA	2	8	286453	286460	75 %	25 %	0 %	0 %	452854322
5944	NC_020410	GCG	2	6	286461	286466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854322
5945	NC_020410	A	6	6	286467	286472	100 %	0 %	0 %	0 %	452854322
5946	NC_020410	CA	3	6	286481	286486	50 %	0 %	0 %	50 %	452854322
5947	NC_020410	GAA	2	6	286557	286562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854322
5948	NC_020410	ATG	2	6	286612	286617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854322
5949	NC_020410	ATC	2	6	286623	286628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854322
5950	NC_020410	GAA	2	6	286635	286640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854322
5951	NC_020410	AAGG	2	8	286853	286860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5952	NC_020410	TTACA	2	10	286876	286885	40 %	40 %	0 %	20 %	452854323
5953	NC_020410	GCG	2	6	286948	286953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854323
5954	NC_020410	TCG	2	6	286957	286962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854323
5955	NC_020410	TGA	2	6	286999	287004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854323
5956	NC_020410	GGAA	2	8	287033	287040	50 %	0 %	50 %	0 %	452854323
5957	NC_020410	A	8	8	287055	287062	100 %	0 %	0 %	0 %	452854323
5958	NC_020410	GCA	2	6	287099	287104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854323
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5962	NC_020410	CGG	2	6	287282	287287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854323
5963	NC_020410	CTG	2	6	287337	287342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854323
5964	NC_020410	TGA	2	6	287348	287353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854323
5965	NC_020410	CGT	2	6	287435	287440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854323
5966	NC_020410	AC	3	6	287448	287453	50 %	0 %	0 %	50 %	452854323
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5971	NC_020410	CGG	2	6	287700	287705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854324
5972	NC_020410	GTC	2	6	287717	287722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854324
5973	NC_020410	GCG	2	6	287752	287757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854324
5974	NC_020410	CGTAC	2	10	287760	287769	20 %	20 %	20 %	40 %	452854324
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5976	NC_020410	GGC	2	6	287800	287805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854324
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5978	NC_020410	ATTT	2	8	287874	287881	25 %	75 %	0 %	0 %	452854324
5979	NC_020410	CAGC	2	8	287899	287906	25 %	0 %	25 %	50 %	452854324
5980	NC_020410	TAT	2	6	287917	287922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854324
5981	NC_020410	CTG	2	6	287936	287941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854324
5982	NC_020410	CTG	2	6	288032	288037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854324
5983	NC_020410	ATT	2	6	288080	288085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854324
5984	NC_020410	TGC	2	6	288099	288104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854324
5985	NC_020410	CTC	2	6	288116	288121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854324
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5987	NC_020410	GT	3	6	288204	288209	0 %	50 %	50 %	0 %	452854324
5988	NC_020410	TTCTGC	2	12	288279	288290	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452854324
5989	NC_020410	A	6	6	288326	288331	100 %	0 %	0 %	0 %	452854324
5990	NC_020410	A	6	6	288343	288348	100 %	0 %	0 %	0 %	452854324
5991	NC_020410	CCG	2	6	288349	288354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854324
5992	NC_020410	GCA	2	6	288364	288369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5993	NC_020410	CTG	2	6	288377	288382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5994	NC_020410	T	8	8	288397	288404	0 %	100 %	0 %	0 %	452854325
5995	NC_020410	AT	3	6	288411	288416	50 %	50 %	0 %	0 %	452854325
5996	NC_020410	T	7	7	288439	288445	0 %	100 %	0 %	0 %	452854325
5997	NC_020410	CAT	2	6	288475	288480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854325
5998	NC_020410	TCT	2	6	288566	288571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854325
5999	NC_020410	TCC	2	6	288584	288589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854325
6000	NC_020410	TCC	2	6	288614	288619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854325

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