MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020410	GAT	2	6	219472	219477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854254
4502	NC_020410	TTA	2	6	219702	219707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854254
4503	NC_020410	GAAA	2	8	219780	219787	75 %	0 %	25 %	0 %	452854254
4504	NC_020410	ATC	2	6	219803	219808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854254
4505	NC_020410	ATTC	2	8	219821	219828	25 %	50 %	0 %	25 %	452854254
4506	NC_020410	TGA	2	6	219832	219837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854254
4507	NC_020410	ATG	2	6	219843	219848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854254
4508	NC_020410	GCC	2	6	219869	219874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854254
4509	NC_020410	TTC	2	6	219961	219966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854255
4510	NC_020410	TCC	2	6	219971	219976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854255
4511	NC_020410	G	6	6	219982	219987	0 %	0 %	100 %	0 %	452854255
4512	NC_020410	T	7	7	219997	220003	0 %	100 %	0 %	0 %	452854255
4513	NC_020410	TGA	2	6	220015	220020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854255
4514	NC_020410	CTGC	2	8	220037	220044	0 %	25 %	25 %	50 %	452854255
4515	NC_020410	TA	3	6	220051	220056	50 %	50 %	0 %	0 %	452854255
4516	NC_020410	TTA	2	6	220183	220188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854255
4517	NC_020410	GCC	2	6	220227	220232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854255
4518	NC_020410	CGG	2	6	220256	220261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854255
4519	NC_020410	GCC	2	6	220283	220288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854255
4520	NC_020410	TCA	2	6	220294	220299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854255
4521	NC_020410	ATTT	2	8	220311	220318	25 %	75 %	0 %	0 %	452854255
4522	NC_020410	AC	3	6	220387	220392	50 %	0 %	0 %	50 %	452854255
4523	NC_020410	GAAA	2	8	220433	220440	75 %	0 %	25 %	0 %	452854255
4524	NC_020410	TC	3	6	220470	220475	0 %	50 %	0 %	50 %	452854255
4525	NC_020410	GCT	2	6	220488	220493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854255
4526	NC_020410	TCAT	2	8	220558	220565	25 %	50 %	0 %	25 %	452854255
4527	NC_020410	TGC	3	9	220618	220626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854255
4528	NC_020410	CGGGG	2	10	220639	220648	0 %	0 %	80 %	20 %	452854255
4529	NC_020410	A	7	7	220840	220846	100 %	0 %	0 %	0 %	452854255
4530	NC_020410	ATA	2	6	220873	220878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854255
4531	NC_020410	GGAA	2	8	220975	220982	50 %	0 %	50 %	0 %	452854255
4532	NC_020410	AGG	2	6	221017	221022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854255
4533	NC_020410	AAT	2	6	221023	221028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854255
4534	NC_020410	GAC	2	6	221050	221055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854256
4535	NC_020410	GA	3	6	221067	221072	50 %	0 %	50 %	0 %	452854256
4536	NC_020410	CTT	2	6	221126	221131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854256
4537	NC_020410	GCG	2	6	221132	221137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854256
4538	NC_020410	GCT	2	6	221151	221156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854256
4539	NC_020410	TCCG	2	8	221247	221254	0 %	25 %	25 %	50 %	452854256
4540	NC_020410	TCA	2	6	221261	221266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854256
4541	NC_020410	GAT	2	6	221284	221289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854256
4542	NC_020410	GAT	2	6	221394	221399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854256
4543	NC_020410	CGT	2	6	221424	221429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854256
4544	NC_020410	GA	3	6	221505	221510	50 %	0 %	50 %	0 %	452854256
4545	NC_020410	CTGA	2	8	221575	221582	25 %	25 %	25 %	25 %	452854256
4546	NC_020410	CTC	2	6	221689	221694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_020410	TC	3	6	221693	221698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_020410	TGC	2	6	221808	221813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_020410	AAG	2	6	221842	221847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854257
4550	NC_020410	AT	3	6	221873	221878	50 %	50 %	0 %	0 %	452854257
4551	NC_020410	GA	3	6	221897	221902	50 %	0 %	50 %	0 %	452854257
4552	NC_020410	CAA	2	6	221939	221944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854257
4553	NC_020410	GAT	2	6	221952	221957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854257
4554	NC_020410	CCG	2	6	221971	221976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854257
4555	NC_020410	AGC	2	6	222017	222022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854257
4556	NC_020410	A	7	7	222033	222039	100 %	0 %	0 %	0 %	452854257
4557	NC_020410	GTC	2	6	222049	222054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854257
4558	NC_020410	T	6	6	222105	222110	0 %	100 %	0 %	0 %	452854257
4559	NC_020410	TGA	2	6	222156	222161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854257
4560	NC_020410	CAT	2	6	222171	222176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854257
4561	NC_020410	GGC	2	6	222220	222225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854257
4562	NC_020410	AATG	2	8	222258	222265	50 %	25 %	25 %	0 %	452854257
4563	NC_020410	ACCG	2	8	222291	222298	25 %	0 %	25 %	50 %	452854257
4564	NC_020410	GCG	2	6	222424	222429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854257
4565	NC_020410	ATG	3	9	222530	222538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854257
4566	NC_020410	A	7	7	222544	222550	100 %	0 %	0 %	0 %	452854257
4567	NC_020410	CCG	2	6	222552	222557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854257
4568	NC_020410	GCT	2	6	222577	222582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854257
4569	NC_020410	CAGC	2	8	222585	222592	25 %	0 %	25 %	50 %	452854257
4570	NC_020410	GAT	2	6	222646	222651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854257
4571	NC_020410	CATT	2	8	222681	222688	25 %	50 %	0 %	25 %	452854257
4572	NC_020410	TCC	2	6	222716	222721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854257
4573	NC_020410	ATT	2	6	222770	222775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854258
4574	NC_020410	TTA	2	6	222786	222791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854258
4575	NC_020410	TA	3	6	222825	222830	50 %	50 %	0 %	0 %	452854258
4576	NC_020410	TGA	2	6	222853	222858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854258
4577	NC_020410	TTTTA	2	10	222860	222869	20 %	80 %	0 %	0 %	452854258
4578	NC_020410	AAAC	2	8	222978	222985	75 %	0 %	0 %	25 %	452854258
4579	NC_020410	AAG	2	6	223021	223026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854258
4580	NC_020410	A	6	6	223108	223113	100 %	0 %	0 %	0 %	452854258
4581	NC_020410	CAA	2	6	223137	223142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854258
4582	NC_020410	ATG	2	6	223170	223175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854258
4583	NC_020410	GAA	2	6	223215	223220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854258
4584	NC_020410	ATC	2	6	223272	223277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854258
4585	NC_020410	CGGC	2	8	223321	223328	0 %	0 %	50 %	50 %	452854258
4586	NC_020410	GATGC	2	10	223347	223356	20 %	20 %	40 %	20 %	452854258
4587	NC_020410	TAT	2	6	223359	223364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854258
4588	NC_020410	GTC	2	6	223377	223382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854258
4589	NC_020410	AG	3	6	223430	223435	50 %	0 %	50 %	0 %	452854258
4590	NC_020410	CAG	2	6	223437	223442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854258
4591	NC_020410	AATCA	2	10	223457	223466	60 %	20 %	0 %	20 %	452854258
4592	NC_020410	TCA	2	6	223546	223551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854258
4593	NC_020410	AGC	2	6	223557	223562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854258
4594	NC_020410	TTTG	2	8	223589	223596	0 %	75 %	25 %	0 %	452854258
4595	NC_020410	CTT	2	6	223647	223652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854258
4596	NC_020410	A	6	6	223667	223672	100 %	0 %	0 %	0 %	452854258
4597	NC_020410	GGC	2	6	223694	223699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854258
4598	NC_020410	T	6	6	223721	223726	0 %	100 %	0 %	0 %	452854258
4599	NC_020410	GCA	2	6	223829	223834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854258
4600	NC_020410	GCC	2	6	223875	223880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854258
4601	NC_020410	AGG	2	6	223927	223932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854258
4602	NC_020410	TGC	2	6	223983	223988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
4603	NC_020410	CGA	2	6	224010	224015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
4604	NC_020410	CTTTTC	2	12	224044	224055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854259
4605	NC_020410	CAG	2	6	224069	224074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
4606	NC_020410	GGA	2	6	224173	224178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854259
4607	NC_020410	ATC	2	6	224199	224204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854259
4608	NC_020410	GAA	2	6	224243	224248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854259
4609	NC_020410	ATT	2	6	224251	224256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854259
4610	NC_020410	GAA	2	6	224294	224299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854259
4611	NC_020410	AGC	2	6	224322	224327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
4612	NC_020410	GCA	2	6	224335	224340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
4613	NC_020410	GGCG	2	8	224341	224348	0 %	0 %	75 %	25 %	452854259
4614	NC_020410	A	7	7	224354	224360	100 %	0 %	0 %	0 %	452854259
4615	NC_020410	CCG	2	6	224451	224456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854259
4616	NC_020410	TTG	2	6	224538	224543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854259
4617	NC_020410	CATA	2	8	224585	224592	50 %	25 %	0 %	25 %	452854259
4618	NC_020410	GCG	3	9	224648	224656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854259
4619	NC_020410	TGC	2	6	224709	224714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
4620	NC_020410	TGC	2	6	224740	224745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
4621	NC_020410	CTG	2	6	224781	224786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
4622	NC_020410	GCTT	2	8	224836	224843	0 %	50 %	25 %	25 %	452854259
4623	NC_020410	TTC	2	6	224882	224887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854259
4624	NC_020410	GCA	2	6	224979	224984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854259
4625	NC_020410	TGC	2	6	225013	225018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854259
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4627	NC_020410	GCT	2	6	225090	225095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854260
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4641	NC_020410	AGGG	2	8	225920	225927	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4673	NC_020410	AT	3	6	227435	227440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4750	NC_020410	A	8	8	230575	230582	100 %	0 %	0 %	0 %	452854266
4751	NC_020410	A	7	7	230713	230719	100 %	0 %	0 %	0 %	452854266
4752	NC_020410	A	6	6	230748	230753	100 %	0 %	0 %	0 %	452854266
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4772	NC_020410	TAA	2	6	231237	231242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4872	NC_020410	T	6	6	235818	235823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4874	NC_020410	CAT	2	6	235846	235851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4875	NC_020410	A	7	7	235852	235858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4876	NC_020410	GTT	2	6	235901	235906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854272
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4878	NC_020410	GGCC	2	8	236018	236025	0 %	0 %	50 %	50 %	452854272
4879	NC_020410	TCAA	2	8	236053	236060	50 %	25 %	0 %	25 %	452854272
4880	NC_020410	A	8	8	236080	236087	100 %	0 %	0 %	0 %	452854272
4881	NC_020410	AT	3	6	236089	236094	50 %	50 %	0 %	0 %	452854272
4882	NC_020410	TGA	2	6	236099	236104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854272
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4885	NC_020410	TCC	2	6	236309	236314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4886	NC_020410	CTC	2	6	236417	236422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854273
4887	NC_020410	ACAATA	2	12	236461	236472	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452854273
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4889	NC_020410	GTT	2	6	236587	236592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854273
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4908	NC_020410	CTG	2	6	238089	238094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854273
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4915	NC_020410	CAT	2	6	238646	238651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4917	NC_020410	ACA	2	6	238723	238728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4945	NC_020410	GA	3	6	240165	240170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4946	NC_020410	AAGG	2	8	240224	240231	50 %	0 %	50 %	0 %	452854276
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4995	NC_020410	TA	3	6	242541	242546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_020410	CAT	2	6	242673	242678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4998	NC_020410	A	6	6	242789	242794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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